; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC10G192910 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC10G192910
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionChlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
Genome locationCiama_Chr10:27660361..27661158
RNA-Seq ExpressionCaUC10G192910
SyntenyCaUC10G192910
Gene Ontology termsGO:0009416 - response to light stimulus (biological process)
GO:0009768 - photosynthesis, light harvesting in photosystem I (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
GO:0009522 - photosystem I (cellular component)
GO:0009523 - photosystem II (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001344 - Chlorophyll A-B binding protein, plant and chromista
IPR022796 - Chlorophyll A-B binding protein
IPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008447450.1 PREDICTED: chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Cucumis melo]3.0e-14797.36Show/hide
Query:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAMALSSTFTGK VPLNAPTELSSSVRSNGR+SMR+SGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGV FGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_022948926.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Cucurbita moschata]5.2e-14796.98Show/hide
Query:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTEL SSVRSNGRVSMR+SGKPA+SSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_022983188.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Cucurbita maxima]1.5e-14697.36Show/hide
Query:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MA MALSSTFTGKA+PLNAPTELSSSVRSN RVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_022998479.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1 [Cucurbita maxima]3.0e-14796.98Show/hide
Query:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTEL SSVRSNGRVSMR+SGKPA+SSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA Q+VLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_038903667.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Benincasa hispida]1.5e-14999.62Show/hide
Query:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BHH5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic1.5e-14797.36Show/hide
Query:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAMALSSTFTGK VPLNAPTELSSSVRSNGR+SMR+SGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGV FGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A5D3DAB9 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic1.5e-14797.36Show/hide
Query:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAMALSSTFTGK VPLNAPTELSSSVRSNGR+SMR+SGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGV FGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A6J1GAK0 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic2.5e-14796.98Show/hide
Query:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTEL SSVRSNGRVSMR+SGKPA+SSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A6J1J722 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic7.3e-14797.36Show/hide
Query:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MA MALSSTFTGKA+PLNAPTELSSSVRSN RVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A6J1KEF6 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic1.5e-14796.98Show/hide
Query:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTEL SSVRSNGRVSMR+SGKPA+SSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA Q+VLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P07369 Chlorophyll a-b binding protein 3C, chloroplastic3.7e-13287.64Show/hide
Query:  AAMAL-SSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPA--ASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        + MAL SSTF GKAV L+     SS +  NGRV+MR++   A  ASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
Subjt:  AAMAL-SSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPA--ASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLG
        VIH RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLGEV DP+YPGGSFDPLG
Subjt:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LADDPEAFA LKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P08221 Chlorophyll a-b binding protein of LHCII type I, chloroplastic (Fragment)1.7e-13288.8Show/hide
Query:  TFTGKAVPL--NAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAM
        T  G+AV L  NAP      ++ N + +MR++   + SSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAM
Subjt:  TFTGKAVPL--NAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAM

Query:  LGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAF
        LGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAF
Subjt:  LGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAF

Query:  AVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        A LKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  AVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P09756 Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic2.2e-13288.68Show/hide
Query:  AAMALSS-TFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        ++MALSS +  GKAV      +L  S    GRVSMR++     SSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  AAMALSS-TFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLA PVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P27492 Chlorophyll a-b binding protein 16, chloroplastic3.2e-13187.07Show/hide
Query:  ALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPA--ASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHS
        ALSS F GKAV L+     SS V  NG+V+MR++   A   SSGSPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH 
Subjt:  ALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPA--ASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHS

Query:  RWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADD
        RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYR+AGGPLGEV DP+YPGGSFDPLGLA+D
Subjt:  RWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADD

Query:  PEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        PEAFA LKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAW+YATNFVPGK
Subjt:  PEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P27497 Chlorophyll a-b binding protein M9, chloroplastic3.2e-13187.31Show/hide
Query:  AAMALSST-FTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRS---GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNREL
        + MALSST F GKAV  N P    SS+    RV+MR++    KPAASSGSPWYGPDRV YLGP SGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNREL
Subjt:  AAMALSST-FTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRS---GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNREL

Query:  EVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPL
        EVIHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWA QVVLMGA+EGYR+AGGPLGEV DP+YPGG+FDPL
Subjt:  EVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPL

Query:  GLADDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        GLADDPEAFA +KVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  GLADDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G29910.1 chlorophyll A/B binding protein 38.3e-12783.9Show/hide
Query:  AAMALSS-TFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        + MALSS  F GKAV L   +  +S V  +GRV+MR++  KP   SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  AAMALSS-TFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT1G29920.1 chlorophyll A/B-binding protein 28.3e-12783.9Show/hide
Query:  AAMALSS-TFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        + MALSS  F GKAV L   +  +S V  +GRV+MR++  KP   SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  AAMALSS-TFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT1G29930.1 chlorophyll A/B binding protein 16.4e-12783.9Show/hide
Query:  AAMALSS-TFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        + MALSS  F GKAV L   +  +S V  +GRV+MR++  KP   SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  AAMALSS-TFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT2G34420.1 photosystem II light harvesting complex gene B1B22.9e-12784.27Show/hide
Query:  AAMALSS-TFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        + MALSS  F GKAV        +S V  +GRV+MR++  KP   SGSPWYG DRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  AAMALSS-TFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT2G34430.1 light-harvesting chlorophyll-protein complex II subunit B14.0e-12984.59Show/hide
Query:  AAMALSS-TFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        + MALSS   TGKAV L   +  +S V   GR++MR++ KP   SGSPWYG DRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEVI
Subjt:  AAMALSS-TFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLGL
        HSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLGL
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        A DPEAFA LKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAVLKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGCCATGGCTCTTTCATCTACATTCACAGGAAAAGCTGTTCCTTTGAATGCACCGACCGAGCTCTCATCCTCGGTTCGCAGCAATGGTAGAGTCTCAATGAGAAG
ATCTGGAAAGCCAGCGGCTTCCTCAGGCAGCCCATGGTATGGTCCGGACCGTGTCAAGTACCTTGGACCATTCTCTGGTGAGCCTCCATCTTACCTCACAGGGGAATTCC
CTGGTGATTATGGTTGGGACACTGCAGGTCTATCTGCCGATCCTGAGACCTTTGCCAAGAACCGAGAGCTCGAAGTGATTCACAGTAGATGGGCCATGCTTGGGGCTCTA
GGATGTGTATTCCCAGAGCTTCTTTCCAGAAATGGAGTCAAGTTTGGTGAAGCAGTTTGGTTCAAGGCTGGTTCACAGATCTTCAGTGAGGGTGGCCTAGACTATCTTGG
AAACCCAAGTCTTATTCATGCACAGAGTATTTTGGCCATTTGGGCATCTCAAGTAGTGCTAATGGGTGCAGTTGAAGGTTACCGTATTGCCGGAGGACCACTCGGAGAAG
TTACCGATCCCATCTACCCAGGTGGTAGCTTTGATCCCCTCGGACTGGCTGATGATCCAGAGGCATTTGCAGTGCTTAAGGTGAAAGAACTTAAGAATGGCCGTCTTGCA
ATGTTTTCCATGTTCGGGTTTTTTGTACAAGCCATTGTAACAGGAAAGGGTCCTTTGGAGAACCTCGCAGATCATCTTGCTGATCCTGTCAACAACAATGCATGGGCTTA
TGCTACCAACTTTGTACCTGGGAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAGCCATGGCTCTTTCATCTACATTCACAGGAAAAGCTGTTCCTTTGAATGCACCGACCGAGCTCTCATCCTCGGTTCGCAGCAATGGTAGAGTCTCAATGAGAAG
ATCTGGAAAGCCAGCGGCTTCCTCAGGCAGCCCATGGTATGGTCCGGACCGTGTCAAGTACCTTGGACCATTCTCTGGTGAGCCTCCATCTTACCTCACAGGGGAATTCC
CTGGTGATTATGGTTGGGACACTGCAGGTCTATCTGCCGATCCTGAGACCTTTGCCAAGAACCGAGAGCTCGAAGTGATTCACAGTAGATGGGCCATGCTTGGGGCTCTA
GGATGTGTATTCCCAGAGCTTCTTTCCAGAAATGGAGTCAAGTTTGGTGAAGCAGTTTGGTTCAAGGCTGGTTCACAGATCTTCAGTGAGGGTGGCCTAGACTATCTTGG
AAACCCAAGTCTTATTCATGCACAGAGTATTTTGGCCATTTGGGCATCTCAAGTAGTGCTAATGGGTGCAGTTGAAGGTTACCGTATTGCCGGAGGACCACTCGGAGAAG
TTACCGATCCCATCTACCCAGGTGGTAGCTTTGATCCCCTCGGACTGGCTGATGATCCAGAGGCATTTGCAGTGCTTAAGGTGAAAGAACTTAAGAATGGCCGTCTTGCA
ATGTTTTCCATGTTCGGGTTTTTTGTACAAGCCATTGTAACAGGAAAGGGTCCTTTGGAGAACCTCGCAGATCATCTTGCTGATCCTGTCAACAACAATGCATGGGCTTA
TGCTACCAACTTTGTACCTGGGAAGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAMALSSTFTGKAVPLNAPTELSSSVRSNGRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGAL
GCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAVLKVKELKNGRLA
MFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK