; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC10G193600 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC10G193600
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
Descriptionprotein SRC1
Genome locationCiama_Chr10:28380242..28380562
RNA-Seq ExpressionCaUC10G193600
SyntenyCaUC10G193600
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR039285 - Dehydrin HIRD11-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596975.1 Protein SRC1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.5e-2374.07Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGD-HDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGGH-
        M+G +EKIGEKLHIGGDH KGE    HK +HH+  K EH  E KKHG+  EHHGEGHKEGL++KIKDKIHGD HDDKGEKKKKKEKKKK E  HH+GGH 
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGD-HDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGGH-

Query:  SSSDSDSD
        SSSDSDSD
Subjt:  SSSDSDSD

KAG7028450.1 Protein SRC1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.2e-2370.37Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGD-HDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGGH-
        M+G +EKIGEKLHIGGDH KGEHH+  K +H        H+  KKHG+  EHHGEGHKEGL++KIKDKIHGD HD+KGEKKKKKEKKKK E  HH+GGH 
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGD-HDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGGH-

Query:  SSSDSDSD
        SSSDSDSD
Subjt:  SSSDSDSD

XP_008443295.1 PREDICTED: protein SRC1 [Cucumis melo]1.6e-2775.23Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIH---GDHDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGG
        MSGFIEKIGEKLHIGGDH KGE        HHDAHKGEHHDEHKKH K EEHHGEGHKEG+I+KIKDKIH   G HD+KGEKKKK++KKK +  H H GG
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIH---GDHDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGG

Query:  HSSSDSDSD
         SSSDSDSD
Subjt:  HSSSDSDSD

XP_011652200.1 protein SRC1 [Cucumis sativus]5.3e-2675.23Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEG-HKEGLIDKIKDKIHG--DHDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGG
        MSGFIEKIGEKLHIGGDH KGEHHDAHK +    HKGEHHDEHKKH   EEHHGEG HKEG++DKIKDKIHG   H++KGEKKKK++KKK +  H H+GG
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEG-HKEGLIDKIKDKIHG--DHDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGG

Query:  HSSSDSDSD
         SSSDSDSD
Subjt:  HSSSDSDSD

XP_038903205.1 protein SRC1 [Benincasa hispida]1.3e-3787.04Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDDKGEKKK--KKEKKKKDEHHHHDGGH
        MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGE        HHD HKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLI+KIKDKIHGDHD+KGEKKK  KKEKKKK EHHHHDGGH
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDDKGEKKK--KKEKKKKDEHHHHDGGH

Query:  SSSDSDSD
        SSSDSDSD
Subjt:  SSSDSDSD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B8E4 protein SRC18.0e-2875.23Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIH---GDHDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGG
        MSGFIEKIGEKLHIGGDH KGE        HHDAHKGEHHDEHKKH K EEHHGEGHKEG+I+KIKDKIH   G HD+KGEKKKK++KKK +  H H GG
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIH---GDHDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGG

Query:  HSSSDSDSD
         SSSDSDSD
Subjt:  HSSSDSDSD

A0A5A7UF86 Zinc transporter ZIP68.0e-2875.23Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIH---GDHDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGG
        MSGFIEKIGEKLHIGGDH KGE        HHDAHKGEHHDEHKKH K EEHHGEGHKEG+I+KIKDKIH   G HD+KGEKKKK++KKK +  H H GG
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIH---GDHDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGG

Query:  HSSSDSDSD
         SSSDSDSD
Subjt:  HSSSDSDSD

A0A6J1FQD3 protein SRC1-like1.0e-2272.22Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGD-HDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGGH-
        M+G +EKIGEKLHIGGDH KGE    HK +HH+  K EH    KKHG+  EHHGEGHKEGL++KIKDKIHGD HD+KGEKKKKKEKKKK E  HH+GGH 
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGD-HDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGGH-

Query:  SSSDSDSD
        SSSDSDSD
Subjt:  SSSDSDSD

A0A6J1I7B7 protein SRC1-like4.7e-2066.97Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHG---DHDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGG
        MSG +EKIGEKLHIGGDH KGE    HK DHH+  K EH    KKHG+  EHHGEGHKEGL++KIKDKIHG    HD+KGEKKKKK++KKK   H   G 
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHG---DHDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGG

Query:  HSSSDSDSD
         SSSDSDSD
Subjt:  HSSSDSDSD

A0A6J1J3L9 protein SRC1-like3.6e-2068.52Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHH--DAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGD--HDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDG
        MSGFIEKIGEKLHI G+H    HH+AHK +HH  DAHKGEHH           H GE HK GL+ KIKDKIHGD  H DKG+KKKKK+KKKKD  HHHDG
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHH--DAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGD--HDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDG

Query:  GHSSSDSD
        GHSSSDSD
Subjt:  GHSSSDSD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04132 Protein SRC14.8e-2266.35Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGGHSS
        MSG I KI E LH+GG H K EH   H  +H   HKGEHH EHK   K E+HHGE HKEGL+DKIKDKIHGD  DKGEKKKKK+KKKK+  H H G  SS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGGHSS

Query:  SDSD
        SDSD
Subjt:  SDSD

Q9SLJ2 Dehydrin HIRD112.2e-1149.57Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHG----DHDDK-----GEKKKKKEKKKKDEH
        M+G I KIG+ LHIGG + +GEH              +  +EHKKH   +EH    HKEG++DKIKDKIHG     HD +     GEKKKKK+KK+K   
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHG----DHDDK-----GEKKKKKEKKKKDEH

Query:  HHHDGGHSSSDSDSD
         HHD GH SS SDSD
Subjt:  HHHDGGHSSSDSDSD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G54410.1 dehydrin family protein1.6e-1249.57Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHG----DHDDK-----GEKKKKKEKKKKDEH
        M+G I KIG+ LHIGG + +GEH              +  +EHKKH   +EH    HKEG++DKIKDKIHG     HD +     GEKKKKK+KK+K   
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHG----DHDDK-----GEKKKKKEKKKKDEH

Query:  HHHDGGHSSSDSDSD
         HHD GH SS SDSD
Subjt:  HHHDGGHSSSDSDSD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTGGATTCATCGAGAAAATTGGTGAGAAGCTCCACATTGGAGGAGACCACAACAAAGGGGAGCATCACGATGCTCATAAAGTCGACCATCACGATGCCCACAAAGG
AGAGCATCACGATGAACACAAGAAGCACGGCAAATCGGAGGAGCACCATGGAGAAGGCCACAAGGAAGGGCTGATTGACAAGATCAAGGACAAGATCCATGGAGATCATG
ATGACAAAGGGGAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGAAGGATGAGCACCACCACCACGACGGCGGCCATAGCAGCAGCGATAGCGACAGCGACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTGGATTCATCGAGAAAATTGGTGAGAAGCTCCACATTGGAGGAGACCACAACAAAGGGGAGCATCACGATGCTCATAAAGTCGACCATCACGATGCCCACAAAGG
AGAGCATCACGATGAACACAAGAAGCACGGCAAATCGGAGGAGCACCATGGAGAAGGCCACAAGGAAGGGCTGATTGACAAGATCAAGGACAAGATCCATGGAGATCATG
ATGACAAAGGGGAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGAAGGATGAGCACCACCACCACGACGGCGGCCATAGCAGCAGCGATAGCGACAGCGACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKGEHHDAHKVDHHDAHKGEHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDDKGEKKKKKEKKKKDEHHHHDGGHSSSDSDSD