CuGenDBv2

Gene ID	CaUC10G197870
Organism	Citrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
Description	60S ribosomal protein L12
Genome location	Ciama_Chr10:33397738..33398238
RNA-Seq Expression	CaUC10G197870
Synteny	CaUC10G197870
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0070180 - large ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000911 - Ribosomal protein L11/L12 IPR020783 - Ribosomal protein L11, C-terminal IPR020784 - Ribosomal protein L11, N-terminal IPR020785 - Ribosomal protein L11, conserved site IPR036769 - Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily IPR036796 - Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004137822.1 60S ribosomal protein L12-1 [Cucumis sativus]

4.3e-83

98.8

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+VEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

XP_004143249.1 60S ribosomal protein L12-1 [Cucumis sativus]

9.6e-83

98.19

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+VEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

XP_022935531.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Cucurbita moschata]

2.8e-82

97.59

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+V+VFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

XP_022950157.1 60S ribosomal protein L12-3 [Cucurbita moschata]

8.2e-82

96.39

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+V+VFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

XP_038883892.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Benincasa hispida]

6.2e-82

96.99

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+V+VFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KF33 Uncharacterized protein

4.7e-83

98.19

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+VEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

A0A0A0LAX8 Uncharacterized protein

2.1e-83

98.8

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+VEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

A0A1S3BLM0 60S ribosomal protein L12-1

4.7e-83

98.19

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+VEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

A0A5D3DNF2 60S ribosomal protein L12

4.7e-83

98.19

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+VEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

A0A6J1J2K8 60S ribosomal protein L12-1-like

1.4e-82

97.59

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+V+VFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O50003 60S ribosomal protein L12

1.3e-77

88.55

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETA +WKGLRVTVKL+VQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        H+G+ISLDDVIEIA++M+ RSMAK+L+G+VKEIL TCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIP D
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

P0CT83 60S ribosomal protein L12-A

4.0e-63

71.08

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DP+++  +F+R  GGEV   S+LAPKIGPLGLSPKK+GEDIAK T K+WKGLRVTVKL++QNRQA VSVVPSA+ALVIKALKEP RDRKK KN+ 
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        H+GN+SLD++IE+AR MR +S+AK+LSG+VKEILGT  SVGCTVDGK+P D+Q+EI +G++EIPQ+
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

P50883 60S ribosomal protein L12-1

3.0e-79

88.55

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKD+QQEI DG+VEIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

Q9FF52 60S ribosomal protein L12-3

5.1e-79

87.95

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDVIEIA++MRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQ+EI+ GD++IP +
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

Q9LFH5 60S ribosomal protein L12-2

6.7e-79

87.95

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI +G++EIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G37190.1 Ribosomal protein L11 family protein

2.1e-80

88.55

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKD+QQEI DG+VEIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

AT3G53430.1 Ribosomal protein L11 family protein

4.8e-80

87.95

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI +G++EIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

AT5G60670.1 Ribosomal protein L11 family protein

3.7e-80

87.95

Show/hide

Query:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKLDPSQ+V+V+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKL+VQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDVIEIA++MRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQ+EI+ GD++IP +
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCCTCCGAAATTGGACCCAAGTCAGCTGGTTGAAGTCTTCGTTCGCGTTACTGGAGGTGAGGTCGGAGCCGCCAGTTCTCTCGCTCCCAAGATCGGTCCTCTT
GGTCTTTCCCCTAAGAAGATCGGAGAAGACATTGCCAAAGAGACCGCAAAGGAATGGAAAGGTCTTAGGGTTACTGTAAAGCTTTCCGTCCAAAATCGTCAGGCG
AAGGTCTCCGTTGTGCCTTCCGCGGCGGCTTTGGTAATTAAGGCCTTGAAGGAGCCGGAACGTGACCGGAAGAAAACTAAGAACATCAAGCACAATGGTAATATT
TCTCTCGATGATGTGATTGAGATTGCTAGGGTTATGCGGCCCAGATCGATGGCTAAGGACCTCTCTGGCTCCGTCAAGGAGATCCTTGGTACTTGTGTGTCTGTT
GGTTGTACTGTTGATGGCAAGGACCCGAAGGATCTTCAACAGGAGATTTCTGATGGCGACGTTGAAATCCCCCAAGATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MPPKLDPSQLVEVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLSVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIKHNGNI
SLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

CaUC10G197870 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome