; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC11G201600 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC11G201600
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionVQ motif-containing protein 4
Genome locationCiama_Chr11:1173744..1174481
RNA-Seq ExpressionCaUC11G201600
SyntenyCaUC11G201600
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039828 - VQ motif-containing protein 33


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK20262.1 VQ motif-containing protein 4 [Cucumis melo var. makuwa]3.7e-11593.55Show/hide
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XP_038896819.1 VQ motif-containing protein 4 [Benincasa hispida]8.3e-11594.02Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L3E4 VQ domain-containing protein4.7e-11694.33Show/hide
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A0A1S3BTW1 VQ motif-containing protein 46.2e-11693.95Show/hide
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A0A5A7VAR6 VQ motif-containing protein 46.2e-11693.95Show/hide
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A0A5D3D9L9 VQ motif-containing protein 41.8e-11593.55Show/hide
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A0A6J1IMJ9 VQ motif-containing protein 4-like3.8e-10589.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 135.0e-2240.89Show/hide
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        YL PSP  TPR  + P+LLSLFP T
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Q5M750 VQ motif-containing protein 42.0e-4251.01Show/hide
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        R  N + +   +S++ ++ PP  P   +  RS+S NPYPTTFVQADTS+FK VVQMLTGS+E P+           H P P S PSS             
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          F IPPIK  P K+QS      F+LYERRN +KN L IN L P F+   +   FSPR  EILSPSILDFPSL LSPVTPL  DP     SS+ S    +
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         EE+A+ E+GFYLHPSP  TP   + P+LL LFP TSPRVSGSSS S
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 335.7e-3448.08Show/hide
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        STS+  S  E+ +NP P        + S+P   P+++        +  SNPYPTTFVQADTS FK VVQMLTGSS         T ++       PSP  
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        +     +F IPPI    KK  SFKLYERR +      KN LMINTL + N       GG         FSPRN+      +LSPS+LDFP L L SPVTP
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        L  NDDP F+KSS   SLG+SSEE++AIA+KGFYLHPSP++TPR +  P LL LFP  SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 313.0e-1133.51Show/hide
Query:  TTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPHPPTPSSKPSSIPPPSPQESFQSSKNFPIPPIKTAPKKQQSFKLYERRNHLKNSLMINTLIPNFSGSGAVGG
        TTFVQ DT+ F+ +VQ LTG          PT ++  ++ P  +               IKTA +K+ + KL+ERR  ++  L I     +F  +G    
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Query:  FSPRNAEILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRTADPPQLLSLFPETSPRVSG
            N  +L+ S +  PS   S ++ +  +P  D  ++     +  EEE+AI E+ FYLHPSP + P   + P+LL+LFP TSP  SG
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 191.5e-3952.16Show/hide
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        E   NP  ++S + ++   N      ++ RSD   YPTTFVQAD+S+FK VVQMLTGSS SPR P  P P + PS               NF IPPIKTA
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Query:  -PKKQQSFKLYERRNH------LKNSLMINTLIPNFSGSGAVGGFSPRNAEILSPSILDFPSLAL-SPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEK
         PKK    KLYERR+H      LKNSLMINTL+    G+G+   FSPRN EILSPS LDFP LAL SPVTPL      ++      +   SEEER IA+K
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Query:  GFYLHPSPMNTPRTADPPQLLSLFPETSPRVS
        G+YLH SP++TPR ++ PQLL LFP TSPR+S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein1.4e-4351.01Show/hide
Query:  RERNPSPNTSPNSTTINSNPPPPP--KLLPRSDS-NPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPR---------PPHPPTPSSKPSSIPPPSPQESFQSS
        R  N + +   +S++ ++ PP  P   +  RS+S NPYPTTFVQADTS+FK VVQMLTGS+E P+           H P P S PSS             
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          F IPPIK  P K+QS      F+LYERRN +KN L IN L P F+   +   FSPR  EILSPSILDFPSL LSPVTPL  DP     SS+ S    +
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         EE+A+ E+GFYLHPSP  TP   + P+LL LFP TSPRVSGSSS S
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein1.7e-4150.21Show/hide
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          F IPPIK  P K+QS      F+LYERRN +KN L IN L P F+   +   FSPR  EILSPSILDFPSL LSPVTPL  DP     SS+ S    +
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AT2G33780.1 VQ motif-containing protein3.6e-2340.89Show/hide
Query:  RERNPSPNTSPNSTTINSNPPPPPKLLPRSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPHPPTPSSKPSSIPPPSPQESFQSSKNFPIPPIKTAP
        R R+ + N  P+ ++  + P    K       + Y TTF++ D S+FK VVQ+LTG  ++  P H P P   P           F S     IPPIK   
Subjt:  RERNPSPNTSPNSTTINSNPPPPPKLLPRSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPHPPTPSSKPSSIPPPSPQESFQSSKNFPIPPIKTAP

Query:  KKQQ--SFKLYERRNHLKNSLMINTLIPNFSGSGAVGGFSPRNAEILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSS-----SEEERAIAEKGF
         K+Q  SF+L ERRN +K+ L IN   P  SG            EIL+P+IL+FP+L LSP TPL  DP +   S S S   S      ++ER+I EKGF
Subjt:  KKQQ--SFKLYERRNHLKNSLMINTLIPNFSGSGAVGGFSPRNAEILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSS-----SEEERAIAEKGF

Query:  YLHPSPMNTPRTADPPQLLSLFPET
        YL PSP  TPR  + P+LLSLFP T
Subjt:  YLHPSPMNTPRTADPPQLLSLFPET

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein1.1e-4052.16Show/hide
Query:  ERERNPSPNTSPNSTTINSNPPPPPKLLPRSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPHPPTPSSKPSSIPPPSPQESFQSSKNFPIPPIKTA
        E   NP  ++S + ++   N      ++ RSD   YPTTFVQAD+S+FK VVQMLTGSS SPR P  P P + PS               NF IPPIKTA
Subjt:  ERERNPSPNTSPNSTTINSNPPPPPKLLPRSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPHPPTPSSKPSSIPPPSPQESFQSSKNFPIPPIKTA

Query:  -PKKQQSFKLYERRNH------LKNSLMINTLIPNFSGSGAVGGFSPRNAEILSPSILDFPSLAL-SPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEK
         PKK    KLYERR+H      LKNSLMINTL+    G+G+   FSPRN EILSPS LDFP LAL SPVTPL      ++      +   SEEER IA+K
Subjt:  -PKKQQSFKLYERRNH------LKNSLMINTLIPNFSGSGAVGGFSPRNAEILSPSILDFPSLAL-SPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEK

Query:  GFYLHPSPMNTPRTADPPQLLSLFPETSPRVS
        G+YLH SP++TPR ++ PQLL LFP TSPR+S
Subjt:  GFYLHPSPMNTPRTADPPQLLSLFPETSPRVS

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein4.0e-3548.08Show/hide
Query:  STSTTRSSHERERNPSPNTSPNSTTINSNPPPPPKLLP-------RSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPHPPTPSSKPSSIPPPSPQE
        STS+  S  E+ +NP P        + S+P   P+++        +  SNPYPTTFVQADTS FK VVQMLTGSS         T ++       PSP  
Subjt:  STSTTRSSHERERNPSPNTSPNSTTINSNPPPPPKLLP-------RSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPHPPTPSSKPSSIPPPSPQE

Query:  SFQSSKNFPIPPIKTAPKKQQSFKLYERRNH-----LKNSLMINTL-IPNFSGSGAVGG---------FSPRNAE-----ILSPSILDFPSLAL-SPVTP
        +     +F IPPI    KK  SFKLYERR +      KN LMINTL + N       GG         FSPRN+      +LSPS+LDFP L L SPVTP
Subjt:  SFQSSKNFPIPPIKTAPKKQQSFKLYERRNH-----LKNSLMINTL-IPNFSGSGAVGG---------FSPRNAE-----ILSPSILDFPSLAL-SPVTP

Query:  L--NDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRTADPPQLLSLFPETSP
        L  NDDP F+KSS   SLG+SSEE++AIA+KGFYLHPSP++TPR +  P LL LFP  SP
Subjt:  L--NDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRTADPPQLLSLFPETSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAATCACTTCTTCTTCAACCTCAACAACAAGATCATCTCATGAAAGAGAAAGAAACCCTTCTCCAAATACTTCCCCAAACAGCACCACCATCAACTCCAATCCTCC
TCCTCCTCCTAAGCTCCTCCCCAGATCTGATTCCAATCCTTATCCCACCACTTTCGTTCAAGCCGATACCTCCAATTTCAAGCACGTTGTTCAAATGCTCACTGGCTCAT
CGGAATCTCCCCGGCCACCACATCCACCAACGCCCTCCTCCAAGCCCTCTTCTATTCCTCCGCCGTCTCCCCAAGAATCCTTTCAATCCTCCAAAAACTTCCCGATTCCT
CCTATCAAAACCGCCCCCAAGAAACAGCAGAGTTTCAAGCTCTATGAAAGAAGAAATCATCTCAAGAATAGCCTCATGATCAATACCCTAATCCCCAATTTCTCCGGTTC
CGGTGCGGTGGGGGGATTTTCTCCTCGTAACGCTGAGATTCTCTCTCCGAGTATCCTCGATTTTCCTTCGCTTGCTCTCAGCCCTGTTACGCCTTTGAACGATGACCCGT
TGTTTGATAAATCGTCGTCATCGCCGTCACTTGGGAGCTCGTCGGAGGAGGAGAGAGCGATTGCCGAGAAGGGGTTTTATTTGCATCCGTCGCCGATGAATACCCCCAGA
ACCGCCGACCCGCCGCAGCTTCTGTCTCTGTTCCCGGAAACGTCGCCTAGGGTTTCTGGATCCTCGTCTACTTCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEITSSSTSTTRSSHERERNPSPNTSPNSTTINSNPPPPPKLLPRSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPHPPTPSSKPSSIPPPSPQESFQSSKNFPIP
PIKTAPKKQQSFKLYERRNHLKNSLMINTLIPNFSGSGAVGGFSPRNAEILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPR
TADPPQLLSLFPETSPRVSGSSSTS