CuGenDBv2

Gene ID	CaUC11G201770
Organism	Citrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
Description	Protein yippee-like
Genome location	Ciama_Chr11:1364045..1367027
RNA-Seq Expression	CaUC11G201770
Synteny	CaUC11G201770
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR004910 - Yippee/Mis18/Cereblon IPR034751 - Yippee domain IPR039058 - Yippee family

Homology

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GenBank top hits

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KAE8649834.1 hypothetical protein Csa_012456 [Cucumis sativus]

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XP_038899427.1 protein yippee-like At5g53940 [Benincasa hispida]

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A0A0A0L050 Protein yippee-like

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A0A1S4E4C9 Protein yippee-like

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A0A6J1CDY9 Protein yippee-like

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A0A6J1F692 Protein yippee-like

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A0A6J1IP05 Protein yippee-like

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P59234 Protein yippee-like

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Q9C777 Protein yippee-like At3g11230

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        MGR+F+V  EG+SY CK+C T LAL DD+ S+                                              SF  R GKAYLF+         
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                                    +N+  G  E+RMM++G+HTV DI+C  CG  VGWKYE A EK+QKYKEGK VLER ++
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Q9FN32 Protein yippee-like At5g53940

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46.19

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        MGRIF VE EGRSYRC++C T LAL DDL SR                                              SFHCRRGKAYLFN +       
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                                    +NIS G LEER+MLSG+HTVADIFCC CGQ VGWKYE+AHEK+QKYKEGK+VLERGRIVD+I+ ST  +ID+
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Q9LY56 Protein yippee-like At3g55890

2.8e-21

33.01

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        MGR+F+V+ EG  Y CK C T L+   D+ S+                                              SF C+ G+AYLFNN        
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                                    +N+S G  E+RMM++GLH V DIFC  CG  VGWKYE AHEKSQKYKEGK VLE  +I            DS
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           +SD +D
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Q9SR97 Protein yippee-like At3g08990

4.6e-24

30.62

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        MGR+FV++ EG  Y CKYC T  A+ +D+ S+                                              SFHC+ G+AYLF+N        
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                                    +N++ G  E R+M++G HTVADIFC +CG +VGWKYE A++KSQKYKEGK++LER +++    +  G+ ++ 
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Arabidopsis top hits

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Alignment

AT2G40110.1 Yippee family putative zinc-binding protein

2.7e-27

37.1

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        MGR+FVV  EG+ Y CK+C T LA ++D+ S+                                              SFHC+ GKAYLFN         
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                                     N+S G  EER+M++G HTVADIFC +CG IVGWKYE AHEK+QKYKEGK VLER +I
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AT2G40110.2 Yippee family putative zinc-binding protein

5.9e-27

37.16

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        MGR+FVV  EG+ Y CK+C T LA ++D+ S+                                              SFHC+ GKAYLFN         
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                                     N+S G  EER+M++G HTVADIFC +CG IVGWKYE AHEK+QKYKEGK VLER
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AT3G08990.1 Yippee family putative zinc-binding protein

3.3e-25

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        MGR+FV++ EG  Y CKYC T  A+ +D+ S+                                              SFHC+ G+AYLF+N        
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Query:  RQLPNDPTPKLLSLLEAPTSLRESSSYRINISYGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDDIEFSTGFFIDS
                                    +N++ G  E R+M++G HTVADIFC +CG +VGWKYE A++KSQKYKEGK++LER +++    +  G+ ++ 
Subjt:  RQLPNDPTPKLLSLLEAPTSLRESSSYRINISYGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDDIEFSTGFFIDS

Query:  RSSISDSED
           ++ S+D
Subjt:  RSSISDSED

AT3G08990.2 Yippee family putative zinc-binding protein

3.3e-25

30.62

Show/hide

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        MGR+FV++ EG  Y CKYC T  A+ +D+ S+                                              SFHC+ G+AYLF+N        
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCKYCNTQLALFDDLASRFFEHSVFELEFTPHGLVIRDGKTISIAVNRYAFAESRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAEMVTGLR

Query:  RQLPNDPTPKLLSLLEAPTSLRESSSYRINISYGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDDIEFSTGFFIDS
                                    +N++ G  E R+M++G HTVADIFC +CG +VGWKYE A++KSQKYKEGK++LER +++    +  G+ ++ 
Subjt:  RQLPNDPTPKLLSLLEAPTSLRESSSYRINISYGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDDIEFSTGFFIDS

Query:  RSSISDSED
           ++ S+D
Subjt:  RSSISDSED

AT5G53940.1 Yippee family putative zinc-binding protein

7.7e-43

46.19

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCKYCNTQLALFDDLASRFFEHSVFELEFTPHGLVIRDGKTISIAVNRYAFAESRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAEMVTGLR
        MGRIF VE EGRSYRC++C T LAL DDL SR                                              SFHCRRGKAYLFN +       
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCKYCNTQLALFDDLASRFFEHSVFELEFTPHGLVIRDGKTISIAVNRYAFAESRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAEMVTGLR

Query:  RQLPNDPTPKLLSLLEAPTSLRESSSYRINISYGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDDIEFSTGFFIDS
                                    +NIS G LEER+MLSG+HTVADIFCC CGQ VGWKYE+AHEK+QKYKEGK+VLERGRIVD+I+ ST  +ID+
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Query:  RSSISDSEDN
          S SD+ED+
Subjt:  RSSISDSEDN

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGACGGATTTTTGTTGTGGAAAGGGAAGGGAGGTCCTATAGATGCAAGTACTGCAACACGCAGTTAGCTCTCTTCGACGACCTTGCGTCTCGGTTTTTTGAACATTC
AGTCTTTGAGCTTGAATTCACTCCTCATGGTCTTGTAATCCGAGATGGGAAAACAATTTCAATAGCTGTTAATAGATATGCTTTTGCTGAAAGTCGTCTAACTTTTTCGC
TCTTATTTGATCAGTCCTTTCATTGCCGCCGTGGAAAAGCCTACCTTTTCAATAATGCCGAAATGGTCACTGGTCTGCGGAGGCAACTTCCAAATGACCCCACTCCAAAA
TTGTTGAGTCTTTTGGAGGCTCCAACTTCTTTGCGGGAGAGTTCTTCATATAGGATAAACATTTCTTATGGAGCGTTGGAAGAGAGGATGATGCTTTCAGGATTGCACAC
TGTAGCAGATATATTTTGTTGCACTTGTGGACAAATTGTCGGGTGGAAATATGAGGCAGCACATGAGAAGAGCCAAAAGTACAAGGAGGGGAAGTATGTTCTTGAAAGGG
GGAGGATAGTCGATGACATTGAATTCTCGACAGGCTTCTTTATAGACTCTCGGTCTAGTATCAGTGATAGCGAAGATAATTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CAATGGGCCAAATCTTAATCTTAGAGCTTCTTCTCACGTCAACAATGGCAGTGATCGTGTCCTTTCCGTACTGGAAGATGGACGAATTTAGGGGCAAAAGGCGGTTTCCA
TTTCTCAATTCAAGCTTACTTCAACTGTGGTGGAATCATTTACCCGTTGAAGCTGAGGCGGAAGACGGGAGCTAAGAGCGTGAAAGCGATGGGACGGATTTTTGTTGTGG
AAAGGGAAGGGAGGTCCTATAGATGCAAGTACTGCAACACGCAGTTAGCTCTCTTCGACGACCTTGCGTCTCGGTTTTTTGAACATTCAGTCTTTGAGCTTGAATTCACT
CCTCATGGTCTTGTAATCCGAGATGGGAAAACAATTTCAATAGCTGTTAATAGATATGCTTTTGCTGAAAGTCGTCTAACTTTTTCGCTCTTATTTGATCAGTCCTTTCA
TTGCCGCCGTGGAAAAGCCTACCTTTTCAATAATGCCGAAATGGTCACTGGTCTGCGGAGGCAACTTCCAAATGACCCCACTCCAAAATTGTTGAGTCTTTTGGAGGCTC
CAACTTCTTTGCGGGAGAGTTCTTCATATAGGATAAACATTTCTTATGGAGCGTTGGAAGAGAGGATGATGCTTTCAGGATTGCACACTGTAGCAGATATATTTTGTTGC
ACTTGTGGACAAATTGTCGGGTGGAAATATGAGGCAGCACATGAGAAGAGCCAAAAGTACAAGGAGGGGAAGTATGTTCTTGAAAGGGGGAGGATAGTCGATGACATTGA
ATTCTCGACAGGCTTCTTTATAGACTCTCGGTCTAGTATCAGTGATAGCGAAGATAATTAGAGTGCGGTATTATCATGTAGCATACAGTAAATCATAATAATTACCAAAT
GATGATGTTCGGGTTTGCATATAATCTAATAATGTCTGAACTATGTAAATGCAGAGTTATCTAGATGAGCATGCCTTTTTTTTCTTAATTCTTCCACCCTTCTAGTTCAT
CACTCCATTTTGTCATTTATTTTCAGTGCAACAATTTCGCTAACTTTCTGTTGTTGGCCGATTCTCCCTTTCTAACTCTTTCGACCCGTTTGACTCTGTAGTTGAGTGAA
TGACTGTAGTCATATAAAGCTGCTGCCGGCACCCAAACTGTGCTGTAAGTTTTTGGTCATTGATATTGTTGTTGAGACTGAACTTTCAGAATGATCAGCAAGTGTATTAC
TTTTTTTCAACGTCAGCAAACATGTGGAGTTGAAATATAACCTTAAACTTTTTAGTCGATGATATATGCTTTAACTAGTTGATGATATATACTTTAACC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGRIFVVEREGRSYRCKYCNTQLALFDDLASRFFEHSVFELEFTPHGLVIRDGKTISIAVNRYAFAESRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAEMVTGLRRQLPNDPTPK
LLSLLEAPTSLRESSSYRINISYGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN

CaUC11G201770 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome