CuGenDBv2

Gene ID	CaUC11G201800
Organism	Citrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
Description	ARM repeat superfamily protein
Genome location	Ciama_Chr11:1386207..1397646
RNA-Seq Expression	CaUC11G201800
Synteny	CaUC11G201800
Gene Ontology terms	GO:0043248 - proteasome assembly (biological process)
InterPro domains	IPR011989 - Armadillo-like helical IPR016024 - Armadillo-type fold IPR019538 - 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG7037420.1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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XP_008463698.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501781 isoform X1 [Cucumis melo]

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A0A0A0L246 Uncharacterized protein

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        DGILGSSEG+DVNV EAA EALGQIGSS WGATLLLSSFPTCV+  IY AFDRHEH KQLAAMHALGNIFGE+RSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIAS+S
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         KM PSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCL EICSKQ+I+NIV DAS+ETTKIGMEARY CCL+IHKAFMSS RLTGDPALAGIASKLQEAVR
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        NGPYLNRRN+ETQPAIMTAERF
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A0A5D3DVV9 Armadillo-like helical

1.1e-232

73.31

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        ME+FSV+DP+QLL+AAANFANYPGVR DASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAE PG+E+TLVACL RIFKTK  +G   +     PH              
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                                PFVQVGL+ADSQTVR+LACKTVTRLLQESDET   AIQLIIDYG+YPLLL+CLLNGNE+VA+SSMD+IKTLAAFPQ
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        GM II P+NKTEATHL  VASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASAVYNANLLSLLESEI+NS DTL                               
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                            VT ++  L   L +LVE+EHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESI+RSRAMVI GRLLSKENI SLVDESCVRNLISA+
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        DGILGSSEG+DVNV EAA EALGQIGSS WGATLLLSSFPTCV+  IY AFDRHEH KQLAAMHALGNIFGE+RSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIAS+S
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         KM PSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCL EICSKQ+I+NIV DAS+ETTKIGMEARY CCL+IHKAFMSS RLTGDPALAGIASK  EAVR
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        NGPYLNRRN+ETQPAIMTAERF
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A0A6J1FJQ7 uncharacterized protein LOC111446360

1.4e-235

73.63

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        MEEF+VDDP+QLLEAAA+FANYPGVRTDASVKEF  RFPLP +INALQ KAEIPGLENTLVACL RIFKTK  +G   +     PH              
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                                PFVQVGL+ADSQ VRSLACKTVTRLL+E+D T  LA QLI+DY +YPLL+ECLLNGNE+VA+SSMDAIK LAAFP+
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        GM IIFPTNKTEATHL TVASTCSSLGRVRVMAL+VKLFSVSSSVASAVYN+NLL+LLESEISNSNDTL                               
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                            VT ++  L   L +LVE+EHGT FLPRTSFLQLLSSIISN SAESI+RSRAMVISGRLLSKENI SLVDESCVR LISAI
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        D ILGSSEGQDVNVCE+AFEALGQIGSSKWGATLLLSS+PTCV+ VI AAFDRHEH KQLAAMHALGNIFGETRSENDI+LNDNAEENLRDLIYQ AS+S
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        PKM PSGL LAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIV+DASTETTKIGMEARY CCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAV+
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        NGPYL+RR LETQPAIMTAERF
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A0A6J1IVZ7 uncharacterized protein LOC111480433

3.9e-233

72.83

Show/hide

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        MEEF+VDDP+QLLEAAA+FANYPGVRTD SVKEF  RFPLP +INALQ KAEIPGLENTLVACL RIFKTK  +G   +     PH              
Subjt:  MEEFSVDDPSQLLEAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEIPGLENTLVACLHRIFKTKGCHGGGFVRIWFFPHSSDTYGSVEFSENP

Query:  CTCVSSALAFPFSSSYSPVLLTTRPFVQVGLRADSQTVRSLACKTVTRLLQESDETALLAIQLIIDYGLYPLLLECLLNGNEEVASSSMDAIKTLAAFPQ
                                PFVQVGL+ADSQ VRSLACKTVTRLL+E+D T  LA QLI+DY +YPLL+ECLLNGNE+VA+SSMDA+K LAAFP+
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Query:  GMAIIFPTNKTEATHLETVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASAVYNANLLSLLESEISNSNDTLPFPMSVNLHKMGYCDLSYKSRNMKVRCCKDN
        GM IIFPTNKTEATHL TVASTCSSLGRVRVMAL+VKLFSVSSSVASAVYN+NLL+LLESEISNSNDTL                               
Subjt:  GMAIIFPTNKTEATHLETVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASAVYNANLLSLLESEISNSNDTLPFPMSVNLHKMGYCDLSYKSRNMKVRCCKDN

Query:  LTQTSMALVGHYRNINSIYNVTCNICSLYFQLMKLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKENICSLVDESCVRNLISAI
                            VT ++  L   L +LVE+EHGT FLPRTSFLQLLSSIISN SAESI+RSRAMVISGRLLSKENI SLVDESCVR LIS+I
Subjt:  LTQTSMALVGHYRNINSIYNVTCNICSLYFQLMKLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKENICSLVDESCVRNLISAI

Query:  DGILGSSEGQDVNVCEAAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVELVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASKS
        D ILGSSEGQDVNVCE+AFEALGQIGSSKWGATLLLSS+PTCV+ VI AAFDRHEH KQLAAMHALGNIFGETRSENDI+LNDNAEENL DLIYQ AS+S
Subjt:  DGILGSSEGQDVNVCEAAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVELVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASKS

Query:  PKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIGMEARYKCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVR
        PK+ PSGL LAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIV+DASTETTKIGMEARY CCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAV+
Subjt:  PKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIGMEARYKCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVR

Query:  NGPYLNRRNLETQPAIMTAERF
        NGPYL+RR LETQPAIMTAERF
Subjt:  NGPYLNRRNLETQPAIMTAERF

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G15180.1 ARM repeat superfamily protein

1.4e-142

Show/hide

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        ++D +QL +AA  FA+YPG + + SVKEFLDRFPLP I NALQT  +IPG ENTLV CL R+FKTK                   YG+            
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Query:  SALAFPFSSSYSPVLLTTRPFVQVGLRADSQTVRSLACKTVTRLLQESDETALLAIQLIIDYGLYPLLLECLLNGNEEVASSSMDAIKTLAAFPQGMAII
                  Y PVL       QVGL+ADS  V+SLACKTV  LL++ D   + ++QL+++ G+YPLLL+ ++N ++EVA+++ + IK+LA FP  M++I
Subjt:  SALAFPFSSSYSPVLLTTRPFVQVGLRADSQTVRSLACKTVTRLLQESDETALLAIQLIIDYGLYPLLLECLLNGNEEVASSSMDAIKTLAAFPQGMAII

Query:  FPTNKTEATHLETVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASAVYNANLLSLLESEISNSNDTLPFPMSVNLHKMGYCDLSYKSRNMKVRCCKDNLTQTS
        FP+   + THL  +A+ CSSL RVRV++L+VKLFS+S  VAS V  + LL LLE+E+  + DTL                                    
Subjt:  FPTNKTEATHLETVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASAVYNANLLSLLESEISNSNDTLPFPMSVNLHKMGYCDLSYKSRNMKVRCCKDNLTQTS

Query:  MALVGHYRNINSIYNVTCNICSLYFQLMKLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKENICSLVDESCVRNLISAIDGILG
                       V  N+  LY++LM   EVEH ++F+P+TS +QLL SIIS +S     + RAM+ISGRLLSKENI  +V+E+ V+ LISAIDG L 
Subjt:  MALVGHYRNINSIYNVTCNICSLYFQLMKLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKENICSLVDESCVRNLISAIDGILG

Query:  SSEGQDVNVCEAAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVELVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASKSPKMMP
        S E  D +  EAA +ALGQ+GS+  GA L+LS+ P     V+ +AFDR+ H KQLAA+HAL NI GETR +++ +++  AEE+LR LIY  A++S K+ P
Subjt:  SSEGQDVNVCEAAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVELVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASKSPKMMP

Query:  SGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIGMEARYKCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYL
        SGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL+EI +K++IINIVTDA+TET KI MEARY CC AIH+AF+ S     DP       KLQEAVR+GPY+
Subjt:  SGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIGMEARYKCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYL

Query:  NRRNLETQPAIMTAERF
        ++++   +P +MT E F
Subjt:  NRRNLETQPAIMTAERF

AT3G15180.2 ARM repeat superfamily protein

9.5e-139

44.84

Show/hide

Query:  VDDPSQLLEAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEIPGLENTLVACLHRIFKTKGCHGGGFVRIWFFPHSSDTYGSVEFSENPCTCVS
        ++D +QL +AA  FA+YPG + + SVKEFLDRFPLP I NALQT  +IPG ENTLV CL R+FKTK                   YG+            
Subjt:  VDDPSQLLEAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEIPGLENTLVACLHRIFKTKGCHGGGFVRIWFFPHSSDTYGSVEFSENPCTCVS

Query:  SALAFPFSSSYSPVLLTTRPFVQVGLRADSQTVRSLACKTVTRLLQESDETALLAIQLIIDYGLYPLLLECLLNGNEEVASSSMDAIKTLAAFPQGMAII
                  Y PVL       QVGL+ADS  V+SLACKTV  LL++ D   + ++QL+++ G+YPLLL+ ++N ++EVA+++ + IK+LA FP  M++I
Subjt:  SALAFPFSSSYSPVLLTTRPFVQVGLRADSQTVRSLACKTVTRLLQESDETALLAIQLIIDYGLYPLLLECLLNGNEEVASSSMDAIKTLAAFPQGMAII

Query:  FPTNKTEATHLETVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASAVYNANLLSLLESEISNSNDTLPFPMSVNLHKMGYCDLSYKSRNMKVRCCKDNLTQTS
        FP+   + THL  +A+ CSSL RVRV++L+VKLFS+S  VAS V  + LL LLE+E+  + DTL                                    
Subjt:  FPTNKTEATHLETVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASAVYNANLLSLLESEISNSNDTLPFPMSVNLHKMGYCDLSYKSRNMKVRCCKDNLTQTS

Query:  MALVGHYRNINSIYNVTCNICSLYFQLMKLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKENICSLVDES--------------
                       V  N+  LY++LM   EVEH ++F+P+TS +QLL SIIS +S     + RAM+ISGRLLSKENI  +V+E+              
Subjt:  MALVGHYRNINSIYNVTCNICSLYFQLMKLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKENICSLVDES--------------

Query:  ------------------CVRNLISAIDGILGSSEGQDVNVCEAAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVELVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGET
                          CV+ LISAIDG L S E  D +  EAA +ALGQ+GS+  GA L+LS+ P     V+ +AFDR+ H KQLAA+HAL NI GET
Subjt:  ------------------CVRNLISAIDGILGSSEGQDVNVCEAAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVELVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGET

Query:  RSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASKSPKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIGMEARYKCCLAIH
        R +++ +++  AEE+LR LIY  A++S K+ PSGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL+EI +K++IINIVTDA+TET KI MEARY CC AIH
Subjt:  RSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASKSPKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIGMEARYKCCLAIH

Query:  KAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLNRRNLETQPAIMTAERF
        +AF+ S     DP       KLQEAVR+GPY+++++   +P +MT E F
Subjt:  KAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLNRRNLETQPAIMTAERF

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGATTGACGTAAAAGAAGGCAAAATCGAACAAGACAAAGGAGCAGAAACCGAAAGAGAAAAAGAAGAAGACGATTCGTCAAATGGTTTTGAGCTTACTACAGTGGAAAC
TCCAGATGTTGCAATATCGAAGAAGGAGACCGTTGGACAAATATCCAAGATGTTTGTTATCGTAGTGTCGGAAGAGCAATCGGAGAGGAAAAAGAAACCAGTTCGTGGCT
GGAGGAGAATGACTAAACCGCCGCAGTTTGGCCGGAGGAGCGTTTGCTCACTACCGTGGCTTCGTCGGAACACCTTTGGACCACCGCGGTGCTCTTCGTCTTCCATAGAA
TGTGACGAACAAGAAAAGTTGAAACCGACTGAAAATACTCTCTCACACTCCCACTCTCCGATTCTCTCCTTCTTTTCCCATTTTCACACTCATACCAAAAACTCTGGGAG
CGAAGAAATGGAGGAATTTTCTGTGGATGATCCGTCTCAGCTACTCGAAGCAGCTGCAAACTTCGCAAATTATCCCGGTGTTCGGACTGATGCGTCGGTTAAGGAATTTC
TCGACCGCTTCCCCCTTCCCGCCATCATCAATGCTTTACAAACAAAAGCAGAAATTCCTGGTCTAGAGAACACTCTGGTTGCATGTCTTCACAGGATATTCAAAACCAAA
GGGTGTCATGGTGGAGGCTTTGTCAGGATTTGGTTCTTTCCGCATTCGTCAGATACTTACGGCTCAGTTGAATTCAGTGAAAACCCCTGTACTTGTGTTTCAAGTGCTTT
AGCATTTCCCTTCTCTTCTTCCTATTCCCCTGTTCTCTTGACTACACGACCTTTTGTACAGGTTGGACTACGGGCAGATTCTCAAACAGTTAGAAGCTTAGCTTGTAAAA
CGGTCACTCGCCTTTTACAGGAGTCTGATGAAACTGCTCTTTTGGCTATACAACTAATTATTGACTACGGCCTCTATCCACTTTTGCTCGAGTGCCTTCTCAATGGTAAT
GAAGAAGTTGCTAGCTCATCAATGGATGCAATTAAGACATTGGCTGCATTTCCACAGGGGATGGCGATCATCTTCCCAACAAATAAAACAGAAGCAACCCACCTAGAAAC
TGTAGCTTCAACATGTTCATCTCTGGGCAGAGTTCGAGTCATGGCTTTGGTAGTGAAACTATTTTCAGTTTCTAGCTCTGTGGCATCGGCAGTATACAATGCAAATTTAC
TAAGCCTACTGGAAAGTGAAATCAGCAATTCAAATGATACACTTCCTTTTCCAATGTCAGTAAACTTGCACAAGATGGGTTATTGTGATCTCAGTTACAAGAGTCGTAAC
ATGAAAGTAAGATGCTGTAAGGACAATTTGACACAAACCAGTATGGCCTTGGTTGGCCATTATAGAAATATAAATTCAATTTATAATGTAACTTGTAACATATGTTCATT
ATATTTCCAATTGATGAAGCTAGTGGAGGTTGAACATGGTACAAAGTTCTTGCCAAGGACCAGCTTTCTCCAACTTCTAAGCTCTATAATCAGCAACTCATCGGCAGAGT
CTATTGTACGATCAAGAGCCATGGTCATTAGTGGAAGACTTTTGTCTAAAGAGAACATTTGCTCACTTGTAGATGAATCATGTGTACGGAATTTGATATCTGCTATAGAT
GGAATTCTTGGGTCATCTGAAGGACAAGATGTAAACGTATGCGAAGCTGCATTTGAAGCACTGGGTCAAATTGGGTCAAGCAAATGGGGAGCCACTTTACTGCTGTCAAG
TTTTCCAACTTGTGTGGAGCTTGTAATTTATGCAGCATTTGATCGGCATGAGCACAGCAAACAGTTGGCAGCCATGCATGCTCTTGGTAACATCTTTGGAGAAACTCGAT
CTGAGAATGATATTGTACTAAATGATAATGCCGAAGAAAATTTGCGGGATTTGATATATCAAATTGCATCCAAAAGTCCAAAAATGATGCCCTCGGGTCTTTTTCTAGCT
GTCCTCCAACAGGACTCTGAGATTCGCTTGGCGAGTTACAGAATGATAACTGGGTTGGTCGCTCGACCTTGGTGCCTAATGGAAATCTGCTCAAAACAAGACATAATAAA
TATAGTTACTGATGCAAGTACTGAGACTACTAAAATAGGAATGGAAGCTAGATATAAGTGTTGTTTGGCTATCCATAAGGCCTTCATGTCTTCAACTAGGCTTACTGGCG
ATCCTGCTCTTGCTGGAATAGCTTCAAAGCTGCAGGAAGCTGTTAGAAATGGTCCATATCTTAATAGAAGGAATCTTGAAACTCAACCAGCAATAATGACAGCTGAGAGA
TTTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MIDVKEGKIEQDKGAETEREKEEDDSSNGFELTTVETPDVAISKKETVGQISKMFVIVVSEEQSERKKKPVRGWRRMTKPPQFGRRSVCSLPWLRRNTFGPPRCSSSSIE
CDEQEKLKPTENTLSHSHSPILSFFSHFHTHTKNSGSEEMEEFSVDDPSQLLEAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEIPGLENTLVACLHRIFKTK
GCHGGGFVRIWFFPHSSDTYGSVEFSENPCTCVSSALAFPFSSSYSPVLLTTRPFVQVGLRADSQTVRSLACKTVTRLLQESDETALLAIQLIIDYGLYPLLLECLLNGN
EEVASSSMDAIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLETVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASAVYNANLLSLLESEISNSNDTLPFPMSVNLHKMGYCDLSYKSRN
MKVRCCKDNLTQTSMALVGHYRNINSIYNVTCNICSLYFQLMKLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKENICSLVDESCVRNLISAID
GILGSSEGQDVNVCEAAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVELVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASKSPKMMPSGLFLA
VLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIGMEARYKCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLNRRNLETQPAIMTAER
F

CaUC11G201800 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome