; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC11G202580 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC11G202580
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
Descriptionpersulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial
Genome locationCiama_Chr11:2111814..2116662
RNA-Seq ExpressionCaUC11G202580
SyntenyCaUC11G202580
Gene Ontology termsGO:0006749 - glutathione metabolic process (biological process)
GO:0009793 - embryo development ending in seed dormancy (biological process)
GO:0009960 - endosperm development (biological process)
GO:0070813 - hydrogen sulfide metabolic process (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0016788 - hydrolase activity, acting on ester bonds (molecular function)
GO:0050313 - sulfur dioxygenase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001279 - Metallo-beta-lactamase
IPR036866 - Ribonuclease Z/Hydroxyacylglutathione hydrolase-like
IPR044528 - Persulfide dioxygenase-like, MBL-fold metallo-hydrolase domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6591786.1 Persulfide dioxygenase ETHE1-like, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-15192.83Show/hide
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XP_022976826.1 persulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial-like [Cucurbita maxima]7.8e-15292.83Show/hide
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XP_038900177.1 persulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial [Benincasa hispida]1.0e-15694.22Show/hide
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A0A6J1IHY8 persulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial-like3.8e-15292.83Show/hide
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A0A6J1J3V1 persulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial-like2.2e-14488.74Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O95571 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial1.0e-7761.13Show/hide
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         EE   NPRLT   EEF KIM NLNLP P+ +D AVPAN+ CG+Q P
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Q3T094 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial3.2e-7659.11Show/hide
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        S  + S + +L RQ+FE +S TYTYLL D     + A+LIDPV +T  RD  L+ ELGL+L+YA+NTH HADHITG+GL++S  PG +SVISR SG++AD
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         EE   NPRLT   EEF K+M+ LNLP P+ +D AVPAN+ CG+Q P
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Q8UAA9 Beta-lactamase hydrolase-like protein1.4e-2335.59Show/hide
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        D  L+ +   GL + + ++TH HADH +    +K K+ GAK+ I                    +  GS+ D L E GDR S G L   V  +PGHT   
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Query:  VTYVTGDEPDQPHPRMAFTGDTLLI--RGCGRTDFQGGSSKQLYESVHSQIFTLPKDTLIYPAHDYKGFS-----VSTVGEEMAYNPRLTKDLEE-FKKI
        VTYV G+         AF  DTL +   G  R DF GGS+KQL+ S+   I  LP DT ++  HDY+         STVGE+   NP L    EE F ++
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         E  +  LP PK++  A+  N+
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Q9C8L4 Persulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial1.8e-11977.82Show/hide
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        FLS  P     +P+   P     S MGSS   SSSSSKLLFRQLFE ESST+TYLLAD+SHPDKPALLIDPVDKTVDRDL LI ELGLKL+YAMNTHVHA
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        DH+TGTGL+K+K PG KSVIS+ASGSKAD+ +EPGD++S GD++LEVRATPGHT+GCVTYVTG+  DQP PRMAFTGD +LIRGCGRTDFQ GSS QLYE
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        SVHSQIFTLPKDTLIYPAHDYKGF VSTVGEEM +NPRLTKD E FK IM NLNL YPKM+D AVPAN+VCGLQD
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Q9DCM0 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial5.9e-7860.73Show/hide
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        S  S+S + +L RQ+FE +S TYTYLL D     + A+LIDPV +T  RD  LI ELGLKL+YA+NTH HADHITGTG+++S  PG +SVISR SG++AD
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Query:  VLIEPGDRISFGDLFLEVRATPGHTSGCVTYVTGDEPDQPHPRMAFTGDTLLIRGCGRTDFQGGSSKQLYESVHSQIFTLPKDTLIYPAHDYKGFSVSTV
        + I  GD I FG   LE RA+PGHT GCVT+V  D+       MAFTGD LLIRGCGRTDFQ G +K LY SVH +IFTLP + LIYPAHDY G +VSTV
Subjt:  VLIEPGDRISFGDLFLEVRATPGHTSGCVTYVTGDEPDQPHPRMAFTGDTLLIRGCGRTDFQGGSSKQLYESVHSQIFTLPKDTLIYPAHDYKGFSVSTV

Query:  GEEMAYNPRLTKDLEEFKKIMENLNLPYPKMMDKAVPANLVCGLQDP
         EE   NPRLT   EEF K+M+NLNLP P+ +D AVPAN+ CG+Q P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G53580.1 glyoxalase II 31.3e-12077.82Show/hide
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        FLS  P     +P+   P     S MGSS   SSSSSKLLFRQLFE ESST+TYLLAD+SHPDKPALLIDPVDKTVDRDL LI ELGLKL+YAMNTHVHA
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Query:  DHITGTGLIKSKSPGAKSVISRASGSKADVLIEPGDRISFGDLFLEVRATPGHTSGCVTYVTGDEPDQPHPRMAFTGDTLLIRGCGRTDFQGGSSKQLYE
        DH+TGTGL+K+K PG KSVIS+ASGSKAD+ +EPGD++S GD++LEVRATPGHT+GCVTYVTG+  DQP PRMAFTGD +LIRGCGRTDFQ GSS QLYE
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        SVHSQIFTLPKDTLIYPAHDYKGF VSTVGEEM +NPRLTKD E FK IM NLNL YPKM+D AVPAN+VCGLQD
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AT1G53580.2 glyoxalase II 36.4e-12077.45Show/hide
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        FLS  P     +P+   P     S MGSS   SSSSSKLLFRQLFE ESST+TYLLAD+SHPDKPALLIDPVDKTVDRDL LI ELGLKL+YAMNTHVHA
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        DH+TGTGL+K+K PG KSVIS+ASGSKAD+ +EPGD++S GD++LEVRATPGHT+GCVTYVTG+  DQP PRMAFTGD +LIRGCGRTDFQ GSS QLYE
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        SVHSQIFTLPKDTLIYPAHDYKGF V TVGEEM +NPRLTKD E FK IM NLNL YPKM+D AVPAN+VCGLQD
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAAGCTTTCGATTCTTACGAATTCCTTTATTTCCCCCCAATGCTCTATTCTTCCTCTCTCAAACTCCTCATCTTCTTCCTGTGAAACCCGTTTCCAGAATTCCCAC
CAAGAATTTCAGTTCCCAAATGGGGTCATCGCCATCTTCTTCCTCGTCTAAGCTCTTGTTCCGCCAATTGTTCGAGAAGGAATCTTCTACTTATACTTACCTTCTTGCTG
ATATTTCCCACCCTGATAAACCAGCGCTTTTGATTGACCCGGTTGACAAGACTGTAGATAGGGATCTAAATCTTATAGGAGAATTGGGACTGAAGCTTGTATATGCCATG
AATACTCATGTGCATGCTGATCATATCACTGGAACTGGACTCATCAAGAGTAAATCTCCAGGAGCGAAATCTGTTATCTCGAGAGCAAGTGGTTCAAAAGCTGATGTGTT
GATTGAACCTGGGGATAGAATTTCTTTTGGTGATCTATTCCTGGAGGTTCGAGCAACTCCAGGGCACACATCAGGATGTGTCACCTACGTAACAGGGGATGAACCTGATC
AACCTCATCCTAGGATGGCATTCACTGGGGATACTCTGTTGATACGTGGATGTGGGAGGACAGATTTTCAGGGTGGAAGTTCAAAGCAGCTCTATGAATCTGTACACTCG
CAGATTTTCACTCTGCCAAAGGACACATTGATCTATCCAGCTCATGATTACAAGGGATTTAGTGTTAGTACTGTAGGTGAAGAGATGGCATACAATCCCCGGCTTACCAA
GGATCTGGAAGAATTCAAGAAAATTATGGAAAATTTGAACCTGCCTTATCCAAAGATGATGGACAAAGCAGTTCCAGCAAACTTGGTGTGTGGATTGCAAGATCCAGCTT
GCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCAAAGATGGACACCTGTTAAGAAATTATATGGAATGCCATCGTGTAGAAGCACTCTGTCTTGTTATGGGCAAAAGCAAAACCAGGAGCGGCGAGCGATACACAAATGGA
GAGAGGACGGATGAGGCAAACTGCAAAGCTTGCAAAATGGGTACCTGACAAATCTTCCATTACATATCCATTAACCAAGATTGTCCCATTTGCCATAAACAATTCACTAA
ATTACTATTATCCTTCGCCACGTTCCAATCCAGTTTGAGTCAATAACAAAGCGCGATGCAAAGCTTTCGATTCTTACGAATTCCTTTATTTCCCCCCAATGCTCTATTCT
TCCTCTCTCAAACTCCTCATCTTCTTCCTGTGAAACCCGTTTCCAGAATTCCCACCAAGAATTTCAGTTCCCAAATGGGGTCATCGCCATCTTCTTCCTCGTCTAAGCTC
TTGTTCCGCCAATTGTTCGAGAAGGAATCTTCTACTTATACTTACCTTCTTGCTGATATTTCCCACCCTGATAAACCAGCGCTTTTGATTGACCCGGTTGACAAGACTGT
AGATAGGGATCTAAATCTTATAGGAGAATTGGGACTGAAGCTTGTATATGCCATGAATACTCATGTGCATGCTGATCATATCACTGGAACTGGACTCATCAAGAGTAAAT
CTCCAGGAGCGAAATCTGTTATCTCGAGAGCAAGTGGTTCAAAAGCTGATGTGTTGATTGAACCTGGGGATAGAATTTCTTTTGGTGATCTATTCCTGGAGGTTCGAGCA
ACTCCAGGGCACACATCAGGATGTGTCACCTACGTAACAGGGGATGAACCTGATCAACCTCATCCTAGGATGGCATTCACTGGGGATACTCTGTTGATACGTGGATGTGG
GAGGACAGATTTTCAGGGTGGAAGTTCAAAGCAGCTCTATGAATCTGTACACTCGCAGATTTTCACTCTGCCAAAGGACACATTGATCTATCCAGCTCATGATTACAAGG
GATTTAGTGTTAGTACTGTAGGTGAAGAGATGGCATACAATCCCCGGCTTACCAAGGATCTGGAAGAATTCAAGAAAATTATGGAAAATTTGAACCTGCCTTATCCAAAG
ATGATGGACAAAGCAGTTCCAGCAAACTTGGTGTGTGGATTGCAAGATCCAGCTTGCTAACTCTGTCATCCCTGTAATTCATTGTGTATAATTGGCCTTTCTTGCTATAG
AAAAACAAAATAAAAACAAAAATAAAACAAAGATCAATCAAAACTATAGGCTGAGAGGTGTGAACCACAAATAAAAATAAGAATACATGTACAAATGACATTATCTACTA
GCCTTCTGCTATACTTGCCTTTGGGTTTACAAAATGGTCTGTGTGATGATTTCTCTCACTGAAGTTTTTGTTTTTGTTTGCCAACTCATGACTTCTATAAGGTCAATTTG
ATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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NTHVHADHITGTGLIKSKSPGAKSVISRASGSKADVLIEPGDRISFGDLFLEVRATPGHTSGCVTYVTGDEPDQPHPRMAFTGDTLLIRGCGRTDFQGGSSKQLYESVHS
QIFTLPKDTLIYPAHDYKGFSVSTVGEEMAYNPRLTKDLEEFKKIMENLNLPYPKMMDKAVPANLVCGLQDPAC