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| A0A0A0KZM9 RRM domain-containing protein | 5.2e-190 | 91.61 | Show/hide |
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| A0A1S3CPA3 serine/arginine-rich splicing factor SR45 | 8.3e-188 | 91.38 | Show/hide |
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| A0A6J1C2C4 serine/arginine-rich splicing factor SR45 isoform X1 | 3.5e-178 | 88.22 | Show/hide |
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| A0A6J1C2D4 serine/arginine-rich splicing factor SR45 isoform X2 | 4.9e-180 | 89.21 | Show/hide |
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| A0A6J1FJN7 serine/arginine-rich splicing factor SR45-like isoform X2 | 2.3e-174 | 87.05 | Show/hide |
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YS SPSPRKVARRVSRSPRRPLRGRSSSRSSSSSSPPRKP
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
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| Q15287 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 8.4e-20 | 42.25 | Show/hide |
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+R RRS SGS SS+ SRS S S S SS+ + S S S S S S SRS SSS+S S S SS S SP P R+ + RR+R+ S P KR ++ SP
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+ +HI L+RNV + H+ EIF +G++ +++ ++R +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P PP + P+R
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P P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
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| Q28E41 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 9.9e-21 | 43.41 | Show/hide |
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+R RRS SGS SSS SRS S S S S S S S S S S S S SRS SSSSS S S SS S SP P R+ + RR+R+ S KR ++ SP
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Query: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
+HI L+RNV + H+ EIF +G++ +++ +DR +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P P R +P+R
Subjt: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
Query: DGPKPENVGPDADKDDMKRQREPSPRRKPLSPRRRSPVGRRGGSPRRQPDSPRRRPES
P + P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
Subjt: DGPKPENVGPDADKDDMKRQREPSPRRKPLSPRRRSPVGRRGGSPRRQPDSPRRRPES
|
|
| Q3KPW1 RNA-binding protein with serine-rich domain 1-B | 6.4e-20 | 42.64 | Show/hide |
Query: SRGRRSPPSGSGSSSHSRSFSGSDSRSSSRSRSRSASVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPPRKSSPVR
++ RRS SGS SSS SR S S S SSS S S S+S S S + SRS SSSSS S S SS S SP P R+ + RR+R+ S KR ++ SP
Subjt: SRGRRSPPSGSGSSSHSRSFSGSDSRSSSRSRSRSASVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPPRKSSPVR
Query: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
+HI L+RNV + H+ EIF +G++ +++ +DR +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P P R +P+R
Subjt: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
Query: DGPKPENVGPDADKDDMKRQREPSPRRKPLSPRRRSPVGRRGGSPRRQPDSPRRRPES
P + P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
Subjt: DGPKPENVGPDADKDDMKRQREPSPRRKPLSPRRRSPVGRRGGSPRRQPDSPRRRPES
|
|
| Q5XG24 RNA-binding protein with serine-rich domain 1-A | 3.4e-21 | 43.02 | Show/hide |
Query: SRGRRSPPSGSGSSSHSRSFSGSDSRSSSRSRSRSASVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPPRKSSPVR
++ RRS SGS SSSHSR S S S SSS S S S+S S S + SRS SSSSS S S SS S SP P R+ + RR+R+ S KR ++ SP
Subjt: SRGRRSPPSGSGSSSHSRSFSGSDSRSSSRSRSRSASVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPPRKSSPVR
Query: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
+HI L+RNV + H+ EIF +G++ +++ +DR +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P P R + P+R
Subjt: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
Query: DGPKPENVGPDADKDDMKRQREPSPRRKPLSPRRRSPVGRRGGSPRRQPDSPRRRPES
P P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
Subjt: DGPKPENVGPDADKDDMKRQREPSPRRKPLSPRRRSPVGRRGGSPRRQPDSPRRRPES
|
|
| Q9SEE9 Serine/arginine-rich splicing factor SR45 | 7.4e-109 | 64.67 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSHSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSHSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPP
Query: RKSSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIFGNFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKSSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVPKRDGPKPENVGPDADKD-DMKRQREPSPRRKP-LSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSP
+ PKRD PK +N DA+KD +R RE SP+RK LSPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RR R D+PPRRRPASP RG SP
Subjt: ATVPKRDGPKPENVGPDADKD-DMKRQREPSPRRKP-LSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSP
Query: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRTPPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAG
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P+RRRSP PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR AG
Subjt: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRTPPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAG
Query: RRGRSSSYSGSPSPRKVARRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
RRGRSSSYS SPSPR++ R++ SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: RRGRSSSYSGSPSPRKVARRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G16610.1 arginine/serine-rich 45 | 5.3e-110 | 64.67 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSHSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSHSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPP
Query: RKSSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIFGNFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKSSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVPKRDGPKPENVGPDADKD-DMKRQREPSPRRKP-LSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSP
+ PKRD PK +N DA+KD +R RE SP+RK LSPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RR R D+PPRRRPASP RG SP
Subjt: ATVPKRDGPKPENVGPDADKD-DMKRQREPSPRRKP-LSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSP
Query: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRTPPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAG
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P+RRRSP PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR AG
Subjt: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRTPPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAG
Query: RRGRSSSYSGSPSPRKVARRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
RRGRSSSYS SPSPR++ R++ SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: RRGRSSSYSGSPSPRKVARRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
|
|
| AT1G16610.2 arginine/serine-rich 45 | 4.9e-108 | 64.06 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSHSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSHSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPP
Query: RKSSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIFGNFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKSSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVPKRDGPKPENVGPDADKDDMKRQREPSPRRKPLSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSPLA
+ PKRD PK +N DA+KD R+ PR + LSPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RR R D+PPRRRPASP RG SP
Subjt: ATVPKRDGPKPENVGPDADKDDMKRQREPSPRRKPLSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSPLA
Query: RRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRTPPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRR
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P+RRRSP PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR AGRR
Subjt: RRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRTPPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRR
Query: GRSSSYSGSPSPRKVARRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
GRSSSYS SPSPR++ R++ SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: GRSSSYSGSPSPRKVARRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
|
|
| AT1G16610.3 arginine/serine-rich 45 | 8.4e-108 | 63.04 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSHSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSHSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPP
Query: RKSSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIFGNFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKSSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVPKRDGPKPENVGPDADKD-DMKRQREPSPRRKP-LSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSP
+ PKRD PK +N DA+KD +R RE SP+RK LSPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RR R D+PPRRRPASP RG SP
Subjt: ATVPKRDGPKPENVGPDADKD-DMKRQREPSPRRKP-LSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSP
Query: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRTPPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRR-------
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P+RRRSP PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+
Subjt: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRTPPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRR-------
Query: ---GRPAAAGRRGRSSSYSGSPSPRKVARRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
G AGRRGRSSSYS SPSPR++ R++ SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: ---GRPAAAGRRGRSSSYSGSPSPRKVARRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
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