; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC11G205960 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC11G205960
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionELMO domain-containing protein
Genome locationCiama_Chr11:5721348..5724840
RNA-Seq ExpressionCaUC11G205960
SyntenyCaUC11G205960
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR006816 - ELMO domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8648680.1 hypothetical protein Csa_008024 [Cucumis sativus]4.4e-7478.01Show/hide
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XP_004135318.1 ELMO domain-containing protein A [Cucumis sativus]4.4e-7478.01Show/hide
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XP_008446042.1 PREDICTED: ELMO domain-containing protein A [Cucumis melo]3.4e-7478.01Show/hide
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XP_022956718.1 ELMO domain-containing protein B isoform X2 [Cucurbita moschata]6.0e-7176.32Show/hide
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XP_038892731.1 ELMO domain-containing protein C [Benincasa hispida]6.8e-7578.01Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVA2 ELMO domain-containing protein2.1e-7478.01Show/hide
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A0A1S3BE42 ELMO domain-containing protein A1.6e-7478.01Show/hide
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A0A6J1GX58 ELMO domain-containing protein B isoform X12.9e-7176.32Show/hide
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A0A6J1GXX7 ELMO domain-containing protein B isoform X22.9e-7176.32Show/hide
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A0A6J1KAA5 ELMO domain-containing protein C1.2e-6974.21Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q08DZ3 ELMO domain-containing protein 22.5e-1139.08Show/hide
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        P ++L+A +S QW ++G+QG DP TDFRG G + L NL++F++ + S + Q+L R    K     Y +A+ G+N+T M   +L  +A
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Q54VR8 ELMO domain-containing protein B1.7e-1236.78Show/hide
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        +A  P     A +S +W  +G+QG DP+TDFRG G + L+NL++F+   S   + +L+    K     YPFA+ G+NIT +++ ++D
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Q54YW1 ELMO domain-containing protein A1.1e-1446.15Show/hide
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        TYPG +L++ VS+QWK+MG+QG DP TDFR  G   L+NL++FA+ ++  F+ ++  Q  +    EYP A AG+ +TF
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Q8BGF6 ELMO domain-containing protein 24.2e-1139.08Show/hide
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        P ++L A +S QW ++G+QG DP TDFRG G + L NL++F++ + S + Q+L R    K     Y +A+ G+N+T M   +L  +A
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Q8IZ81 ELMO domain-containing protein 21.5e-1140.23Show/hide
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        P ++L A +S QW E+G+QG DP TDFRG G + L NL++F++ + S + Q+L R    K     Y +A+ G+N+T M   +L  +A
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G67400.1 ELMO/CED-12 family protein4.7e-5059.06Show/hide
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        S S     +  + D     TP+W I K +TC+CF RK  +ERIC NLTP+Q                               ATYP  +LQ L+SDQWK 
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AT2G44770.1 ELMO/CED-12 family protein1.4e-3844.2Show/hide
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          L+S+QWKEMGWQG+DPSTDFRG GFISLENLL+FA+ F  SFQ LLRKQ G  + WEYPFAVAG+N+TFM++QMLDL+A
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AT3G60260.1 ELMO/CED-12 family protein1.1e-3845.3Show/hide
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        GS  ++   S  + R +  H+SS++ V  G+  W+G+G++C+C + +    R   +LTP Q                                 +P  EL
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          +VSDQWKEMGWQG+DPSTDFRG GFISLENLL+FA+ F  SF  LLRKQ G  + WEYPFAVAG+NITFM++QMLDL+A
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AT3G60260.2 ELMO/CED-12 family protein1.1e-3845.3Show/hide
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        GS  ++   S  + R +  H+SS++ V  G+  W+G+G++C+C + +    R   +LTP Q                                 +P  EL
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Query:  QALVSDQWKEMGWQGRDPSTDFRGAGFISLENLLFFAKTFSTSFQLLLRKQGGKPAAWEYPFAVAGVNITFMIMQMLDLDA
          +VSDQWKEMGWQG+DPSTDFRG GFISLENLL+FA+ F  SF  LLRKQ G  + WEYPFAVAG+NITFM++QMLDL+A
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AT3G60260.4 ELMO/CED-12 family protein1.1e-3845.3Show/hide
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        GS  ++   S  + R +  H+SS++ V  G+  W+G+G++C+C + +    R   +LTP Q                                 +P  EL
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Query:  QALVSDQWKEMGWQGRDPSTDFRGAGFISLENLLFFAKTFSTSFQLLLRKQGGKPAAWEYPFAVAGVNITFMIMQMLDLDA
          +VSDQWKEMGWQG+DPSTDFRG GFISLENLL+FA+ F  SF  LLRKQ G  + WEYPFAVAG+NITFM++QMLDL+A
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TTTGAAAGTCTAAAATGGTATTTAAATTCCTATTGGTTTCTCATAATCTCATTTGAGTTGCATCAGTGGGATGTTATAAGCGCCGGAGAATCGCAGAGATCATTGGGCGG
TGAGATGAGTTTAGTCAACACTCACACAAGCTCCGGCTCAATTCCTTCCCTCTCTCCTTCTTCATCCTCCATTTCCCGCTGTGCTTTCACTCACACTTCCTCCTCTGATT
ATGTGACGTGTGGGACACCAACTTGGATTGGGAAGGGAATCACTTGCATTTGCTTCAAGCGGAAGGGAACTTTTGAACGAATTTGTATCAACCTGACTCCTGTACAGGCA
ACTTATCCTGGTCGAGAGCTTCAGGCGTTGGTATCAGATCAATGGAAAGAAATGGGATGGCAGGGAAGAGACCCATCAACTGATTTTAGAGGAGCTGGATTTATCTCTTT
GGAGAATTTGTTGTTCTTTGCAAAGACATTCTCAACATCTTTCCAACTTCTGTTGAGAAAACAAGGAGGAAAGCCAGCTGCTTGGGAATATCCCTTTGCTGTTGCTGGTG
TAAATATCACATTTATGATCATGCAAATGCTTGATCTGGATGCTTGTGAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
FESLKWYLNSYWFLIISFELHQWDVISAGESQRSLGGEMSLVNTHTSSGSIPSLSPSSSSISRCAFTHTSSSDYVTCGTPTWIGKGITCICFKRKGTFERICINLTPVQA
TYPGRELQALVSDQWKEMGWQGRDPSTDFRGAGFISLENLLFFAKTFSTSFQLLLRKQGGKPAAWEYPFAVAGVNITFMIMQMLDLDACE