; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC11G207560 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC11G207560
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionOSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B, putative
Genome locationCiama_Chr11:7997940..7998518
RNA-Seq ExpressionCaUC11G207560
SyntenyCaUC11G207560
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7029810.1 hypothetical protein SDJN02_08153, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.2e-7478.87Show/hide
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TYK01355.1 putative OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B [Cucumis melo var. makuwa]4.4e-7178.79Show/hide
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XP_022929606.1 uncharacterized protein LOC111436141 [Cucurbita moschata]9.5e-7478.65Show/hide
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XP_022997465.1 uncharacterized protein LOC111492375 [Cucurbita maxima]2.9e-7578.65Show/hide
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XP_023546389.1 uncharacterized protein LOC111805512 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.1e-7377.6Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UK88 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B8.1e-7178.28Show/hide
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A0A5D3BQA0 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B2.1e-7178.79Show/hide
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A0A6J1DGF8 uncharacterized protein LOC1110208301.0e-6571.73Show/hide
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A0A6J1ENL5 uncharacterized protein LOC1114361414.6e-7478.65Show/hide
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A0A6J1K9Q8 uncharacterized protein LOC1114923751.4e-7578.65Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G40475.1 unknown protein2.9e-0434.48Show/hide
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        + SK+I + SS   SS  IYY G A  VPF WET+PGTPK     +   LPPL+PPP+  S             + R   + RF K ++     R     
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          A+ +++  YS+  P
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AT4G25845.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B (TAIR:AT4G25850.2)9.0e-1450Show/hide
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AT4G25850.2 OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B9.0e-1450Show/hide
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AT5G01790.1 unknown protein9.0e-0652.94Show/hide
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        S  C S  I YY G A  VPF+WE+ PGTPK P  +   LPPL+PPP+  S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGGGAAATTTCATTGGGATATGAAGAGCAAAGTGATATCAAGAACATCTTCAATTGGTTGTTCTTCTCATAGCATTTATTACTCTGGTACAGCTGAAGGAGTCCC
TTTCAAATGGGAAACACAACCAGGAACTCCCAAAGATCCTCCCCCTCAAGACTTGCTTCCACCCCTCAGCCCTCCGCCGGCGGTTCTCAGCCTCGGGGTACCGAAACCGT
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GACATCGTCATCTTCTTCATCGCCATCGTCTTTTCTAGATTCGTTAACCGTGCGAAATATGGGGAGGGTGTCGTTTGGAAGGCCTTCAAGTTGTAGTGCTGGGCAAATTA
ATAGAATTATGGCTTGTTACCATTCCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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YSNGDPFCHNDKLETFSFLSSDCEFMASPRDSMSSSTTSSSSSSPSSFLDSLTVRNMGRVSFGRPSSCSAGQINRIMACYHS