; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC11G215200 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC11G215200
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionProtein of unknown function (DUF1068)
Genome locationCiama_Chr11:28452113..28455524
RNA-Seq ExpressionCaUC11G215200
SyntenyCaUC11G215200
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR010471 - Protein of unknown function DUF1068


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004139277.1 uncharacterized protein LOC101212944 [Cucumis sativus]2.1e-8278.6Show/hide
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XP_008457359.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103497063 [Cucumis melo]9.6e-8379.07Show/hide
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XP_022143173.1 uncharacterized protein LOC111013108 [Momordica charantia]2.1e-8278.6Show/hide
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XP_023547119.1 uncharacterized protein LOC111806024 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.6e-7775.47Show/hide
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XP_038890751.1 uncharacterized protein LOC120080238 [Benincasa hispida]4.3e-8379.07Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LG38 Uncharacterized protein1.0e-8278.6Show/hide
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A0A1S3C6L6 uncharacterized protein LOC1034970634.6e-8379.07Show/hide
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A0A5A7VC79 DUF1068 domain-containing protein4.6e-8379.07Show/hide
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A0A6J1CQ21 uncharacterized protein LOC1110131081.0e-8278.6Show/hide
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A0A6J1FI57 uncharacterized protein LOC1114443448.4e-7773.36Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G05070.1 Protein of unknown function (DUF1068)1.5e-2535.41Show/hide
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        R  A L+  L +  +  A  + GP LYW   +A     S +SCP C C+C             S ++ V +                             
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             L+N S  DC  +DP++ ++ EK + +LLTEELKL+EA S E  +  ++ L EAK+  S YQ+EA+KC +  ETCEEARE+AE  + +++KLTS W
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        E RARQ GW
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AT2G24290.1 Protein of unknown function (DUF1068)2.6e-6259.17Show/hide
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        M+RRSG C+R CLVIF+VVSAL VCGPALYW+  K F +G ++++   CPPC+CD PPPLSLL+I+P                                 
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                  GLANLS+T CGS+DP+LK+EMEK FVDLLTEELKLQEAV+ EH+RHMN+TL EAKR ASQYQ+EAEKC AATE CE ARERA+AL++KER
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        K+T LWERRARQ+GWEGE
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AT2G32580.1 Protein of unknown function (DUF1068)4.6e-2736.23Show/hide
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        A L+  L + A+     + GP LYW   +A  L  S  SC  C+CDC                                    LL +P            
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        +GL+N S TDC   DP++ ++ EK + +LLTEELK +EA S E  + ++  L EAK+  S YQ+EA+KC +  ETCEEARE+AE  +++++KLTS+WE+R
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        ARQ G++
Subjt:  ARQMGWE

AT2G32580.2 Protein of unknown function (DUF1068)2.6e-2248.51Show/hide
Query:  SVTDCGSNDPDLKQEMEKQFVDLLTEELKLQEAVSGEHTRHMNITLFEAKRAASQYQREAEKCIAATETCEEARERAEALMIKERKLTSLWERRARQMGW
        S+ +C   DP++ ++ EK + +LLTEELK +EA S E  + ++  L EAK+  S YQ+EA+KC +  ETCEEARE+AE  +++++KLTS+WE+RARQ G+
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Query:  E
        +
Subjt:  E

AT4G30996.1 Protein of unknown function (DUF1068)2.1e-6763.59Show/hide
Query:  MSRRSGACLRCCLVIFAVVSALAVCGPALYWRFKKAFQLGDSKAS--CPPCICDCPPPLSLLKISPAVSFFACVLLLMAMENLTHIRFGFVLLLLPSVGV
        M RRSG C+R CLVIFAVVSAL VCGPALYW+F K F +G ++A+  CPPC+CDCPPPLSLL+I+P                                  
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                 GLANLS+TDCGS+DP+LKQEMEKQFVDLLTEELKLQEAV+ EH+RHMN+TL EAKR ASQYQ+EAEKC AATE CE ARERAEAL+IKERK
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        +TSLWE+RARQ GWEGE
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCACGCCGATCTGGGGCTTGCCTAAGGTGTTGTCTCGTAATTTTTGCTGTAGTATCTGCTTTGGCTGTTTGTGGACCGGCTTTGTATTGGAGATTCAAGAAG
GCTTTCCAATTGGGAGATTCCAAAGCCTCCTGTCCTCCTTGCATCTGCGATTGTCCACCCCCATTATCCCTTTTGAAGATTTCTCCTGCTGTTTCTTTCTTTGCT
TGTGTGTTGCTGTTAATGGCTATGGAAAACTTGACCCATATTAGATTTGGATTTGTACTCCTTTTGTTACCTTCTGTTGGGGTTAATGGAGCTAGATTAAGCCCA
TTCTCAGGTCTGGCCAATCTCTCTGTCACAGACTGTGGGAGTAATGACCCAGATCTCAAGCAGGAGATGGAAAAACAATTTGTGGACCTTTTGACAGAGGAATTG
AAGCTTCAAGAAGCAGTTTCTGGCGAACATACTCGTCATATGAACATCACTTTATTTGAGGCAAAAAGGGCAGCTTCTCAGTATCAGAGGGAGGCTGAAAAGTGC
ATTGCTGCAACAGAAACTTGCGAAGAGGCCCGAGAACGTGCTGAGGCATTGATGATCAAGGAGAGAAAGCTTACATCATTGTGGGAGCGACGAGCCCGTCAAATG
GGTTGGGAAGGGGAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTAGAAGCCCATTAAATATTGAATACACCGACTCCTCCAGAAGAAATTTTCTGAGCTAAAGTTTTTATTTTGATTTTCCATTCATTTCATTGGTTTCTTTCATA
CATACTTTCACTGCTGAAATTAGATCTCAGTTCCTCACTTTCTCAGTAACGCGGAAAGAGAGAGGAAGGAAAAATACGACGAAAAAGAAAAAACAAGAATCAAAA
GGAAGATCAGGGTGAGAAATGTCACGCCGATCTGGGGCTTGCCTAAGGTGTTGTCTCGTAATTTTTGCTGTAGTATCTGCTTTGGCTGTTTGTGGACCGGCTTTG
TATTGGAGATTCAAGAAGGCTTTCCAATTGGGAGATTCCAAAGCCTCCTGTCCTCCTTGCATCTGCGATTGTCCACCCCCATTATCCCTTTTGAAGATTTCTCCT
GCTGTTTCTTTCTTTGCTTGTGTGTTGCTGTTAATGGCTATGGAAAACTTGACCCATATTAGATTTGGATTTGTACTCCTTTTGTTACCTTCTGTTGGGGTTAAT
GGAGCTAGATTAAGCCCATTCTCAGGTCTGGCCAATCTCTCTGTCACAGACTGTGGGAGTAATGACCCAGATCTCAAGCAGGAGATGGAAAAACAATTTGTGGAC
CTTTTGACAGAGGAATTGAAGCTTCAAGAAGCAGTTTCTGGCGAACATACTCGTCATATGAACATCACTTTATTTGAGGCAAAAAGGGCAGCTTCTCAGTATCAG
AGGGAGGCTGAAAAGTGCATTGCTGCAACAGAAACTTGCGAAGAGGCCCGAGAACGTGCTGAGGCATTGATGATCAAGGAGAGAAAGCTTACATCATTGTGGGAG
CGACGAGCCCGTCAAATGGGTTGGGAAGGGGAATAAGTCTAATTTCAAAGGCCAACCTCTTAGTTCAACTAGTCCTCGAGTCCTTCAATCCATGAGATCAGTAGA
AACTGGCAAGCGAAGTGCTTGGTTCATCAATCTGTCAAGGCATAATGTTCTCTCTTTTCCCCATAAATTGTGTTGCACATTTCCTGGAAACATGTCAATTCTACA
TCATAATTCATACATGACAATGTTATAGATCCCACTCTTCTGCATTTGCCAATATATATATATATGATTATCTCCTCTTCAACCGTAGCTATGTGACTTGTTGGC
TAGGCGTTTCTGAGCCATCCACGAACTTGAATAGACTGTATTATTTGCATTCTCATAATCGAAAAACTATATTGTTCTCAGTTTTAGCACCAGGTTGATTCCCTT
GTGTAAGTGATGTTAGTAAAATCTGATGTTACCACTTTTGCATATTGGGAGTTTTCAGCTTGCTGTCTGCTATAAAGAAAAAATGGATTATTGGCATTTTTCAAC
TATGAAAAGCTACATGGTAACAGCTATATATACAAAATCCTCGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSRRSGACLRCCLVIFAVVSALAVCGPALYWRFKKAFQLGDSKASCPPCICDCPPPLSLLKISPAVSFFACVLLLMAMENLTHIRFGFVLLLLPSVGVNGARLSP
FSGLANLSVTDCGSNDPDLKQEMEKQFVDLLTEELKLQEAVSGEHTRHMNITLFEAKRAASQYQREAEKCIAATETCEEARERAEALMIKERKLTSLWERRARQM
GWEGE