; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg00011 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg00011
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionRAB GTPase 11C
Genome locationCarg_Chr04:4877467..4879468
RNA-Seq ExpressionCarg00011
SyntenyCarg00011
Gene Ontology termsGO:0005768 - endosome (cellular component)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600719.1 Ras-related protein RABA2a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.7e-114100Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEGNSKKACCSSS
        GESEGNSKKACCSSS
Subjt:  GESEGNSKKACCSSS

XP_022943001.1 ras-related protein RABA2a-like [Cucurbita moschata]3.0e-11399.53Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEGNSKKACCSSS
        GESE NSKKACCSSS
Subjt:  GESEGNSKKACCSSS

XP_022989944.1 ras-related protein RABA2a-like [Cucurbita maxima]4.4e-11298.14Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        DNVNRWLKELRDHAD+NIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSY+EKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPA ANIKEGKTIVV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEGNSKKACCSSS
        GESE NSKKACCSSS
Subjt:  GESEGNSKKACCSSS

XP_023517501.1 ras-related protein RABA2a-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.2e-11097.69Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEP-ATANIKEGKTIV
        DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLS IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEP A ANIKEGK+IV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEP-ATANIKEGKTIV

Query:  VGESEGNSKKACCSSS
        VGESE NSKKACCSSS
Subjt:  VGESEGNSKKACCSSS

XP_038905598.1 ras-related protein RABA2a [Benincasa hispida]2.8e-11197.21Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        DNV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS+EPA ANIKEGKTIVV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEGNSKKACCSSS
        GESE N+KKACCSSS
Subjt:  GESEGNSKKACCSSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6P8 Uncharacterized protein2.6e-11097.22Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATA-NIKEGKTIV
        DNV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS+EPA A NIKEGKTIV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATA-NIKEGKTIV

Query:  VGESEGNSKKACCSSS
        VGESE N+KKACCSSS
Subjt:  VGESEGNSKKACCSSS

A0A1S3BTD1 ras-related protein RABA2a5.8e-11096.76Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATA-NIKEGKTIV
        DNV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS+EP+ A NIKEGKTIV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATA-NIKEGKTIV

Query:  VGESEGNSKKACCSSS
        VGESE N+KKACCSSS
Subjt:  VGESEGNSKKACCSSS

A0A6J1EU78 ras-related protein RABA2a5.8e-11096.77Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEP--ATANIKEGKTI
        DNV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS+EP  A ANIKEGKTI
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEP--ATANIKEGKTI

Query:  VVGESEGNSKKACCSSS
        VVGESE NSKK CCSSS
Subjt:  VVGESEGNSKKACCSSS

A0A6J1FQI3 ras-related protein RABA2a-like1.5e-11399.53Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEGNSKKACCSSS
        GESE NSKKACCSSS
Subjt:  GESEGNSKKACCSSS

A0A6J1JQR7 ras-related protein RABA2a-like2.1e-11298.14Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        DNVNRWLKELRDHAD+NIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSY+EKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPA ANIKEGKTIVV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEGNSKKACCSSS
        GESE NSKKACCSSS
Subjt:  GESEGNSKKACCSSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04486 Ras-related protein RABA2a4.6e-10490.32Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPD++YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKP TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDE-PATANIKEGKTI-
        +NV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEA NVEKAFQTILSE+YRIISKKS++SD+  A ANIKEG+TI 
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDE-PATANIKEGKTI-

Query:  VVGESEGNSKKACCSSS
        V   SE N+KK CCSSS
Subjt:  VVGESEGNSKKACCSSS

Q39434 Ras-related protein Rab2BV3.8e-9076.64Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DLKHLRAV+ ED Q+ AEKEGLSF+ETSALEA N+EKAFQTIL+EIY IISKK+L + E ++    +G TI V
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEGNSKKACCSS
         ++  N +++CCS+
Subjt:  GESEGNSKKACCSS

Q40193 Ras-related protein Rab11C3.2e-8976.5Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLRAV+ +D  + +EKEGLSF+ETSALEATN+EKAFQTIL+EIY I+SKK+L + E ATA      +G T
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT

Query:  IVVGESEGNSKKACCSS
        I V ++ GN+KK CCS+
Subjt:  IVVGESEGNSKKACCSS

Q96283 Ras-related protein RABA2c9.9e-9177.88Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        M  R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT QVEG+T+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED QS AEKEGLSF+ETSALEATNVEKAFQTIL EIY IISKK+L + E A AN     +G T
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT

Query:  IVVGESEGNSKKACCSS
        I V ++ G +K+ACCSS
Subjt:  IVVGESEGNSKKACCSS

Q9FIF9 Ras-related protein RABA2d4.2e-8976.5Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MA R + DYDYLFK+VLIGDSGVGK+N+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK DL HLR+VA ED Q+ AE EGLSF+ETSALEATNVEKAFQT+L+EIY IISKK+L + E A AN     +G T
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT

Query:  IVVGESEGNSKKACCSS
        I V ++ G  K+ CCS+
Subjt:  IVVGESEGNSKKACCSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07410.1 RAB GTPase homolog A2B6.6e-9076.64Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        +NV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED +S AEKEGLSF+ETSALEATN+EKAFQTILSEIY IISKK+L + E A     +G  I +
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEGNSKKACCSS
         +S   ++K CCS+
Subjt:  GESEGNSKKACCSS

AT1G09630.1 RAB GTPase 11C3.3e-10590.32Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPD++YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKP TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDE-PATANIKEGKTI-
        +NV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEA NVEKAFQTILSE+YRIISKKS++SD+  A ANIKEG+TI 
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDE-PATANIKEGKTI-

Query:  VVGESEGNSKKACCSSS
        V   SE N+KK CCSSS
Subjt:  VVGESEGNSKKACCSSS

AT1G16920.1 RAB GTPase homolog A1B7.3e-8170.75Show/hide
Query:  RPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNV
        R +DDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFT+NEF LESKSTIGVEFATRTL+V+G+ VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVT+  TF+NV
Subjt:  RPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNV

Query:  NRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVVGES
        +RWLKEL++H D NIV+ML+GNK+DL+HL AV TED +SYAE+E L F+ETSALEATNVE AF  +L++IYRI SKK + + E   A++ +G+ I V   
Subjt:  NRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVVGES

Query:  EGNSKK-ACCSS
            KK  CCS+
Subjt:  EGNSKK-ACCSS

AT3G46830.1 RAB GTPase homolog A2C7.0e-9277.88Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        M  R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT QVEG+T+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED QS AEKEGLSF+ETSALEATNVEKAFQTIL EIY IISKK+L + E A AN     +G T
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT

Query:  IVVGESEGNSKKACCSS
        I V ++ G +K+ACCSS
Subjt:  IVVGESEGNSKKACCSS

AT5G59150.1 RAB GTPase homolog A2D3.0e-9076.5Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MA R + DYDYLFK+VLIGDSGVGK+N+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK DL HLR+VA ED Q+ AE EGLSF+ETSALEATNVEKAFQT+L+EIY IISKK+L + E A AN     +G T
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT

Query:  IVVGESEGNSKKACCSS
        I V ++ G  K+ CCS+
Subjt:  IVVGESEGNSKKACCSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCGGAGACCCGACGATGACTACGATTACCTCTTCAAAGTTGTGCTAATCGGCGATTCCGGCGTTGGAAAATCCAACCTTCTTTCCCGGTTCACTCGGAATGAGTT
TTGTTTGGAGTCCAAGTCCACCATTGGCGTCGAATTCGCCACTCGTACTCTTCAGGTTGAGGGAAGAACCGTGAAAGCTCAGATATGGGACACGGCCGGTCAAGAGCGTT
ACAGAGCAATAACCAGTGCTTACTATAGGGGTGCCCTCGGAGCCCTTCTAGTATACGATGTAACGAAACCGATGACATTCGACAATGTAAACCGTTGGTTGAAGGAACTT
AGGGACCATGCAGATTCCAACATAGTCATCATGTTAATCGGTAACAAGACCGATCTGAAACACCTCCGAGCAGTGGCAACAGAAGACGCACAGAGCTACGCCGAGAAAGA
AGGGCTGTCATTCATTGAAACTTCTGCTCTTGAAGCAACAAACGTGGAGAAGGCTTTCCAAACCATTCTCTCAGAGATATATAGGATAATCAGTAAGAAGTCCCTCAATT
CGGATGAGCCTGCTACTGCTAACATCAAGGAAGGAAAAACCATTGTGGTTGGTGAATCAGAGGGCAATTCGAAGAAGGCTTGTTGCTCCTCTTCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CATTTTCTAAGTGGGGCACCCGATTTGGGAGGGACAATTTCTTCAATTTTGCTTTCCGAGATTTCGGAAAGCTAAATCTTCAGAACCAGGAACCAGAGAGAGAGAGAGAC
CAGCGAGATAATATGGCCCGGAGACCCGACGATGACTACGATTACCTCTTCAAAGTTGTGCTAATCGGCGATTCCGGCGTTGGAAAATCCAACCTTCTTTCCCGGTTCAC
TCGGAATGAGTTTTGTTTGGAGTCCAAGTCCACCATTGGCGTCGAATTCGCCACTCGTACTCTTCAGGTTGAGGGAAGAACCGTGAAAGCTCAGATATGGGACACGGCCG
GTCAAGAGCGTTACAGAGCAATAACCAGTGCTTACTATAGGGGTGCCCTCGGAGCCCTTCTAGTATACGATGTAACGAAACCGATGACATTCGACAATGTAAACCGTTGG
TTGAAGGAACTTAGGGACCATGCAGATTCCAACATAGTCATCATGTTAATCGGTAACAAGACCGATCTGAAACACCTCCGAGCAGTGGCAACAGAAGACGCACAGAGCTA
CGCCGAGAAAGAAGGGCTGTCATTCATTGAAACTTCTGCTCTTGAAGCAACAAACGTGGAGAAGGCTTTCCAAACCATTCTCTCAGAGATATATAGGATAATCAGTAAGA
AGTCCCTCAATTCGGATGAGCCTGCTACTGCTAACATCAAGGAAGGAAAAACCATTGTGGTTGGTGAATCAGAGGGCAATTCGAAGAAGGCTTGTTGCTCCTCTTCTTAA
GTTCAGAAAAATATCCCCACAATTTTTTGTAACTCTCCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTGTTCTTGGTCATCTGCTTACGCATATCTTTCTAGTTACCAACTCTATTCTGTT
ATTCTTGTTTGCTTGGATTTTGTTGGTGTATAATTTTCATATAATTTATATTTTACTTAGATTTTTTTTTTCAAGAGATCATTGAGATCTCATGTCAGAAACACTATTGA
GCGGTTCATTTCAGAGTTTGTCTGTTTTTATGGAATCTCTATGTTGGAGAATCAAATGTGAATGTCTTATTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVNRWLKEL
RDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVVGESEGNSKKACCSSS