; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg00284 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg00284
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description50S ribosomal protein L23, chloroplastic
Genome locationCarg_Chr04:6372317..6375493
RNA-Seq ExpressionCarg00284
SyntenyCarg00284
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001014 - Ribosomal protein L23/L25, conserved site
IPR005633 - Ribosomal protein L23/L25, N-terminal
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR012678 - Ribosomal protein L23/L15e core domain superfamily
IPR013025 - Ribosomal protein L25/L23
IPR019985 - Ribosomal protein L23


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600068.1 60S ribosomal protein L23a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-7694.61Show/hide
Query:  FSSKVDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKK
        F  +V YSGPGSSAMAPKADS KKADPKAQALK AKAVK+GPTFK KAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKK
Subjt:  FSSKVDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKK

Query:  IEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        IEDNNTLVFIVDIRA+KKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  IEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

KAG6601015.1 60S ribosomal protein L23a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-8699.44Show/hide
Query:  RNPNSAATSVSPSFSSKVDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQI
        RNPNSAATSVSPSFSSKVDYSGPGSSAMAPKAD+IKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQI
Subjt:  RNPNSAATSVSPSFSSKVDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQI

Query:  LKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        LKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  LKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

KAG7031627.1 60S ribosomal protein L23a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.8e-91100Show/hide
Query:  MQASPRNPNSAATSVSPSFSSKVDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKL
        MQASPRNPNSAATSVSPSFSSKVDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKL
Subjt:  MQASPRNPNSAATSVSPSFSSKVDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKL

Query:  DQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        DQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  DQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

XP_022957518.1 60S ribosomal protein L23a-like [Cucurbita moschata]1.4e-74100Show/hide
Query:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

XP_022995723.1 60S ribosomal protein L23a [Cucurbita maxima]7.0e-7499.35Show/hide
Query:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADS KKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS61 50S ribosomal protein L23, chloroplastic3.0e-7893.6Show/hide
Query:  SVSPSFSSKVDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTE
        S+SP  SS+V +SG GSSAMAPKADS KKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRIS TPRNKLDQYQILKYPLTTE
Subjt:  SVSPSFSSKVDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTE

Query:  SAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        SAMKKIEDNNTLVFIVDIRA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  SAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A5D3C5W3 50S ribosomal protein L23, chloroplastic2.2e-7398.04Show/hide
Query:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADS KKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKK+RNPKYPRIS TPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A6J1DJ76 50S ribosomal protein L23, chloroplastic5.8e-7498.69Show/hide
Query:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKAD+ KKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A6J1H0G0 50S ribosomal protein L23, chloroplastic6.8e-75100Show/hide
Query:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A6J1K8U2 50S ribosomal protein L23, chloroplastic3.4e-7499.35Show/hide
Query:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADS KKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22644 60S ribosomal protein L23A1.1e-6690.26Show/hide
Query:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSG-PTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        MAP A   KK D KAQALK AKAVKSG  T +KKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISA PRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSG-PTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RADKKKIK AVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALD+ANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q07761 60S ribosomal protein L23a1.7e-6790.26Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        MAP KAD  KK+DPKAQA K AKAVKSG T KKK++KIRT VTFHRPKTLKKDRNPKYPRISA  RNKLDQY ILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        +ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q8LD46 60S ribosomal protein L23a-11.9e-6688.96Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D+ KKADPKA+ALK AKAVKSG  FKKK KKIRT VTFHRPKTL K R  KYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q9AT35 60S ribosomal protein L23a1.0e-6790.91Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D  KK+D KAQALKTAKAVKSG T  KK KKIRTSVTFHRP+TL KDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q9M3C3 60S ribosomal protein L23a-22.1e-6588.31Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D  KKADPKA+ALK AKAVKSG   KK AKKIRT VTFHRPKTL   R PKYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39460.1 ribosomal protein L23AA1.4e-6788.96Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D+ KKADPKA+ALK AKAVKSG  FKKK KKIRT VTFHRPKTL K R  KYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT2G39460.2 ribosomal protein L23AA1.4e-6788.96Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D+ KKADPKA+ALK AKAVKSG  FKKK KKIRT VTFHRPKTL K R  KYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT3G55280.1 ribosomal protein L23AB1.5e-6688.31Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D  KKADPKA+ALK AKAVKSG   KK AKKIRT VTFHRPKTL   R PKYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT3G55280.2 ribosomal protein L23AB1.5e-6688.31Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D  KKADPKA+ALK AKAVKSG   KK AKKIRT VTFHRPKTL   R PKYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT3G55280.3 ribosomal protein L23AB4.5e-6385.71Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D  KKADPKA+ALK AKAVKSG        KIRT VTFHRPKTL   R PKYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAGCTTCTCCAAGAAACCCTAATTCGGCTGCAACCTCCGTCTCACCATCATTCTCTTCGAAGGTTGATTATTCTGGTCCAGGATCTTCAGCAATGGCTCCTAAAGC
TGACAGTATCAAAAAGGCTGATCCCAAGGCTCAAGCCTTGAAGACTGCCAAGGCAGTGAAGTCTGGTCCAACATTCAAGAAGAAGGCTAAGAAGATTAGAACATCAGTCA
CATTCCATAGGCCAAAGACATTGAAGAAGGATAGGAATCCCAAGTATCCCAGGATCAGTGCTACTCCAAGGAACAAGTTGGACCAGTATCAAATTCTCAAATATCCACTG
ACCACAGAATCTGCAATGAAGAAAATTGAGGATAATAACACCCTTGTTTTTATTGTTGACATTCGTGCCGACAAGAAAAAGATCAAGGATGCCGTGAAGAAGATGTATGA
CATTCAGACCAAGAAAGTGAACACTTTAATCAGGCCAGACGGAACGAAGAAGGCGTATGTTAGGTTAACTCCAGATTATGATGCTCTGGATGTGGCGAACAAGATTGGTA
TCATATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAGCTTCTCCAAGAAACCCTAATTCGGCTGCAACCTCCGTCTCACCATCATTCTCTTCGAAGGTTGATTATTCTGGTCCAGGATCTTCAGCAATGGCTCCTAAAGC
TGACAGTATCAAAAAGGCTGATCCCAAGGCTCAAGCCTTGAAGACTGCCAAGGCAGTGAAGTCTGGTCCAACATTCAAGAAGAAGGCTAAGAAGATTAGAACATCAGTCA
CATTCCATAGGCCAAAGACATTGAAGAAGGATAGGAATCCCAAGTATCCCAGGATCAGTGCTACTCCAAGGAACAAGTTGGACCAGTATCAAATTCTCAAATATCCACTG
ACCACAGAATCTGCAATGAAGAAAATTGAGGATAATAACACCCTTGTTTTTATTGTTGACATTCGTGCCGACAAGAAAAAGATCAAGGATGCCGTGAAGAAGATGTATGA
CATTCAGACCAAGAAAGTGAACACTTTAATCAGGCCAGACGGAACGAAGAAGGCGTATGTTAGGTTAACTCCAGATTATGATGCTCTGGATGTGGCGAACAAGATTGGTA
TCATATAAACTGCAGAGCTTGAAGCTGCTAGTATTTTCATTGCAATTGTTACATGTTTAAATTTTGGAGAGCATTTTGCAGTAGGACCCAAGTTTTATTTAGCTTTTTTT
TTAGTATGTATTGGTATTTGTTTGCTCAGAATACATGGAATGATGGATTATGAATTCCGATAATTTTCTTTGTAGTTTGCTTCAGACTCCATTATGCCATTACTGAATTT
TGGTCTTTACAGCTTCTTTTTGGTTTCTTAATTTATGGAATGCAAGTCTTTGGGGATCAATATGTTCTATTAATACC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQASPRNPNSAATSVSPSFSSKVDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPL
TTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII