; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg00441 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg00441
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionU-box domain-containing protein 1-like
Genome locationCarg_Chr04:7325666..7326628
RNA-Seq ExpressionCarg00441
SyntenyCarg00441
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
InterPro domainsIPR011989 - Armadillo-like helical
IPR016024 - Armadillo-type fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6608146.1 U-box domain-containing protein 13, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-16499.69Show/hide
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KAG7031783.1 U-box domain-containing protein 13, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.1e-165100Show/hide
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XP_022940416.1 U-box domain-containing protein 1-like [Cucurbita moschata]2.1e-16399.06Show/hide
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XP_022982428.1 U-box domain-containing protein 1-like [Cucurbita maxima]7.4e-16499.06Show/hide
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XP_023524300.1 U-box domain-containing protein 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-16399.38Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGP7 Uncharacterized protein6.3e-14587.77Show/hide
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        IMN+D ++YSN+DSVYS W
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A0A1S3CR56 U-box domain-containing protein 8-like1.8e-13987.66Show/hide
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        VLGLLARFEEGLRALIK DRIV SMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESE CL DAL+ PEF GVVADLSVRGS KARERA+LLMNKIMN+D +TYSN
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        ADSVYS W
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A0A6J1CG09 U-box domain-containing protein 1-like3.6e-14085.94Show/hide
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A0A6J1FIE4 U-box domain-containing protein 1-like1.0e-16399.06Show/hide
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A0A6J1J4T3 U-box domain-containing protein 1-like3.6e-16499.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22193 U-box domain-containing protein 49.4e-1327.24Show/hide
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        + S  S+ + R +S       + + V + +S + D Q +A  +L  + + +   R ++    G+I +L+ L  S+ S  Q  +++ L NLS+N++ KK +
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        A    I  L  ++  GS E  + +++ + SL+++++NK K G +G I  LV  L   +         +L  L     N  + V+SGA+  L+D+++  +G
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          +   A+ VL  LA   EG  A+ +   I   +V V++      KE A   LL+L   S       L+      +VA LS  G+ +ARE+A  L++   
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Q681N2 U-box domain-containing protein 152.5e-1325.47Show/hide
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        Q +++K +  + + +P  R L+A   G+IP+L+ L     S +Q  +++ L NLS++   KKL+++   I ++  ++  G+ E  + +++ + SL+MLD+
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Query:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVN
        NK   G++  I  LV  L   ++      L +L  L     N   A+ +G +  L+++++      +   AL +L LLA   EG +A+ ++   + ++V 
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Query:  VLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIMNND
         ++     +KE AT +LL L   +   +  AL+F  +  +V +++  G+ +A+ +A  L+  I  ++
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Q8GUG9 U-box domain-containing protein 117.2e-1325.66Show/hide
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        +  A+ ++ ++++ S   R L+A+  G+IP+L+ L  S     Q  +++ + NLS+  + K+L+     +  +  ++  G+ E  + A++ + SL++ D+
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        NK   G +G I  LV  L   +         +L  L  +HGN   AVR+G ++ LV ++  ++   +   AL +L +LA  ++   A++K + +  +++ 
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Query:  VLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRFPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARERATLLM
        +L+     ++E A  ILL L      C RD  +      LG V    DLS  G+ + + +A  L+
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Q9C9A6 U-box domain-containing protein 106.1e-1227.72Show/hide
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        S  SF+  S   S   A   K  +Q + D R+        A+ ++ ++++ S   R L+A+  G+IP+L+ L  S   T  Q  +++ + NLS+    K+
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Query:  LLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVEST
        L+     +  +  ++  GS E  + A++ + SL++ D+NK   G +G I  LV  L   SV        +L  L  + GN   AVR+G +  LV ++  +
Subjt:  LLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVEST

Query:  SGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRFPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARERAT
        S E +A  AL +L +LA  +    A+++ + I   +++ L+     ++E A  ILL L      C RD  +      LG V    +LS  G+ +A+ +A 
Subjt:  SGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRFPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARERAT

Query:  LLM
         L+
Subjt:  LLM

Q9SNC6 U-box domain-containing protein 137.2e-1327Show/hide
Query:  GSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAA
        G+IP+L+ L  +  S +Q  S++ L NLS+  + K  + S   I  +  ++  GS E  + A++ + SL+++D+NK   G  G I  LV  L   +    
Subjt:  GSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAA

Query:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEG
             +L  L  + GN   A+R+G I  L  ++ +  G  +   AL +L +L+   EG +A+I     V S+V  ++     ++E A  +L+ L      
Subjt:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEG

Query:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKI
         L +A +    +G + DL+  G+ + + +A  L+ +I
Subjt:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23030.1 ARM repeat superfamily protein5.1e-1425.66Show/hide
Query:  QEKALKDLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDK
        +  A+ ++ ++++ S   R L+A+  G+IP+L+ L  S     Q  +++ + NLS+  + K+L+     +  +  ++  G+ E  + A++ + SL++ D+
Subjt:  QEKALKDLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDK

Query:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVN
        NK   G +G I  LV  L   +         +L  L  +HGN   AVR+G ++ LV ++  ++   +   AL +L +LA  ++   A++K + +  +++ 
Subjt:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVN

Query:  VLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRFPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARERATLLM
        +L+     ++E A  ILL L      C RD  +      LG V    DLS  G+ + + +A  L+
Subjt:  VLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRFPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARERATLLM

AT2G23140.1 RING/U-box superfamily protein with ARM repeat domain6.7e-1427.24Show/hide
Query:  VASFQSSSSMRSMSVATAHKNITQCVADARSDAHDVQEKALKDLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLL
        + S  S+ + R +S       + + V + +S + D Q +A  +L  + + +   R ++    G+I +L+ L  S+ S  Q  +++ L NLS+N++ KK +
Subjt:  VASFQSSSSMRSMSVATAHKNITQCVADARSDAHDVQEKALKDLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLL

Query:  ASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSG
        A    I  L  ++  GS E  + +++ + SL+++++NK K G +G I  LV  L   +         +L  L     N  + V+SGA+  L+D+++  +G
Subjt:  ASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSG

Query:  EDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIM
          +   A+ VL  LA   EG  A+ +   I   +V V++      KE A   LL+L   S       L+      +VA LS  G+ +ARE+A  L++   
Subjt:  EDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIM

Query:  N
        N
Subjt:  N

AT2G23140.2 RING/U-box superfamily protein with ARM repeat domain6.7e-1427.24Show/hide
Query:  VASFQSSSSMRSMSVATAHKNITQCVADARSDAHDVQEKALKDLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLL
        + S  S+ + R +S       + + V + +S + D Q +A  +L  + + +   R ++    G+I +L+ L  S+ S  Q  +++ L NLS+N++ KK +
Subjt:  VASFQSSSSMRSMSVATAHKNITQCVADARSDAHDVQEKALKDLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLL

Query:  ASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSG
        A    I  L  ++  GS E  + +++ + SL+++++NK K G +G I  LV  L   +         +L  L     N  + V+SGA+  L+D+++  +G
Subjt:  ASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSG

Query:  EDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIM
          +   A+ VL  LA   EG  A+ +   I   +V V++      KE A   LL+L   S       L+      +VA LS  G+ +ARE+A  L++   
Subjt:  EDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIM

Query:  N
        N
Subjt:  N

AT3G46510.1 plant U-box 135.1e-1427Show/hide
Query:  GSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAA
        G+IP+L+ L  +  S +Q  S++ L NLS+  + K  + S   I  +  ++  GS E  + A++ + SL+++D+NK   G  G I  LV  L   +    
Subjt:  GSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAA

Query:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEG
             +L  L  + GN   A+R+G I  L  ++ +  G  +   AL +L +L+   EG +A+I     V S+V  ++     ++E A  +L+ L      
Subjt:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEG

Query:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKI
         L +A +    +G + DL+  G+ + + +A  L+ +I
Subjt:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKI

AT5G42340.1 Plant U-Box 151.8e-1425.47Show/hide
Query:  QEKALKDLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDK
        Q +++K +  + + +P  R L+A   G+IP+L+ L     S +Q  +++ L NLS++   KKL+++   I ++  ++  G+ E  + +++ + SL+MLD+
Subjt:  QEKALKDLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDK

Query:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVN
        NK   G++  I  LV  L   ++      L +L  L     N   A+ +G +  L+++++      +   AL +L LLA   EG +A+ ++   + ++V 
Subjt:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVN

Query:  VLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIMNND
         ++     +KE AT +LL L   +   +  AL+F  +  +V +++  G+ +A+ +A  L+  I  ++
Subjt:  VLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIMNND


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAGTTGCATCTTTCCAATCATCATCGTCCATGAGGTCGATGAGTGTTGCAACTGCACATAAGAATATAACCCAGTGTGTAGCCGATGCTCGGTCGGACGCTCATGA
CGTTCAGGAAAAGGCTCTTAAAGACTTGGTTGCCATTACCCAGGTTAGTCCCCTATACAGGAACTTGCTTGCACAAGTAGATGGATCAATTCCAATTCTTATAGCTCTCT
CCAAATCCTCTTCCTCCACCGTCCAATCCCTTTCACTGTCTATTCTCTTCAATCTTTCTCTGAATAATGACATGAAAAAGCTTCTTGCATCAATGGAAACCATTTACCAT
CTCAATACGCTCATATCCTTGGGCTCGCCCGAGACCGTCAAGTTAGCGTCCTCATTGATTTGTAGTCTTGCAATGCTAGACAAGAACAAGGCTAAGTTTGGGGTAGCTGG
TACCATACAGTTGTTGGTTAGAGCACTTACTGTCCCTAGTGTTCCTGCTGCTCATCACCTTCTCTGTTCTCTAGCTGAACTAGGCCAGTTTCATGGAAACTGCACGGTGG
CTGTTCGATCAGGAGCCATCTCGGTTCTTGTCGACGTAGTGGAGAGTACCAGTGGAGAGGATCTCGCTGGCACTGCTCTTGTTGTTCTCGGTCTCTTGGCTAGATTCGAG
GAGGGGTTGAGGGCTTTGATAAAAATCGATCGGATCGTTTATTCAATGGTCAATGTGTTGAAAGGGAGGTGTATGTTGAGTAAAGAAGGTGCAACCGAGATCCTTTTGCG
TTTGTTCGACGAGAGTGAAGGTTGTTTGAGAGACGCATTGAGGTTCCCGGAGTTTTTAGGCGTCGTTGCAGATCTATCTGTGAGAGGATCCACAAAAGCTAGAGAAAGAG
CTACACTACTTATGAATAAGATCATGAATAATGACTTGGAGACGTATTCAAATGCCGACTCAGTGTATTCGCCATGGTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCAGTTGCATCTTTCCAATCATCATCGTCCATGAGGTCGATGAGTGTTGCAACTGCACATAAGAATATAACCCAGTGTGTAGCCGATGCTCGGTCGGACGCTCATGA
CGTTCAGGAAAAGGCTCTTAAAGACTTGGTTGCCATTACCCAGGTTAGTCCCCTATACAGGAACTTGCTTGCACAAGTAGATGGATCAATTCCAATTCTTATAGCTCTCT
CCAAATCCTCTTCCTCCACCGTCCAATCCCTTTCACTGTCTATTCTCTTCAATCTTTCTCTGAATAATGACATGAAAAAGCTTCTTGCATCAATGGAAACCATTTACCAT
CTCAATACGCTCATATCCTTGGGCTCGCCCGAGACCGTCAAGTTAGCGTCCTCATTGATTTGTAGTCTTGCAATGCTAGACAAGAACAAGGCTAAGTTTGGGGTAGCTGG
TACCATACAGTTGTTGGTTAGAGCACTTACTGTCCCTAGTGTTCCTGCTGCTCATCACCTTCTCTGTTCTCTAGCTGAACTAGGCCAGTTTCATGGAAACTGCACGGTGG
CTGTTCGATCAGGAGCCATCTCGGTTCTTGTCGACGTAGTGGAGAGTACCAGTGGAGAGGATCTCGCTGGCACTGCTCTTGTTGTTCTCGGTCTCTTGGCTAGATTCGAG
GAGGGGTTGAGGGCTTTGATAAAAATCGATCGGATCGTTTATTCAATGGTCAATGTGTTGAAAGGGAGGTGTATGTTGAGTAAAGAAGGTGCAACCGAGATCCTTTTGCG
TTTGTTCGACGAGAGTGAAGGTTGTTTGAGAGACGCATTGAGGTTCCCGGAGTTTTTAGGCGTCGTTGCAGATCTATCTGTGAGAGGATCCACAAAAGCTAGAGAAAGAG
CTACACTACTTATGAATAAGATCATGAATAATGACTTGGAGACGTATTCAAATGCCGACTCAGTGTATTCGCCATGGTATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVASFQSSSSMRSMSVATAHKNITQCVADARSDAHDVQEKALKDLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYH
LNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFE
EGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIMNNDLETYSNADSVYSPWY