; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg00479 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg00479
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionembryo defective 2410
Genome locationCarg_Chr04:7521418..7526551
RNA-Seq ExpressionCarg00479
SyntenyCarg00479
Gene Ontology termsGO:0009306 - protein secretion (biological process)
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GO:0009501 - amyloplast (cellular component)
InterPro domainsIPR007452 - Translocation and assembly module TamB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6608180.1 Translocon at the inner envelope membrane of chloroplasts 236, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]0.0e+0096.73Show/hide
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KAG7031820.1 hypothetical protein SDJN02_05861, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]0.0e+00100Show/hide
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        VFQSAPAQRTLVLVEY
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XP_022940944.1 uncharacterized protein LOC111446378 [Cucurbita moschata]0.0e+0097.45Show/hide
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XP_023524007.1 uncharacterized protein LOC111788077 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]0.0e+0095.33Show/hide
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XP_023524011.1 uncharacterized protein LOC111788077 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]0.0e+0095.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1F7B9 uncharacterized protein LOC1114427990.0e+0081.04Show/hide
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        AEFD  GEDWEWGT K QRVLA GAYSNNDGLRLE  FIQKDNATIHADGTLFGP+++LHFAVLN PV LVPTVVQVIESSAKDLVHSLRQLV PIRGIL
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        +MEGDLRGNLAKPECDVQVRLLDGAIGG+DLGRAE VASLTSSSR LFNAKF PI QNGHVHVQGSIPV+F QNS+ EVEELETD+SRATLIH+WGKE+V
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         DKFNDRK+SRE+NEE W TQL EGLKGLN NLL+VGEVR DADIKDGGMLLLT LSPHVNWLHGNADILL+V GTIEEPV DGSA+F+RAS+SSPVLPK
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        PL+N GG +HVRSNRLCI+SLE RVSR+GKL VKGNLPLRSSEASL DKIDLKCE LEVRAKNIFSGQVDSQMQITGSILQPNISG IQLSRGEAYLPHD
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        KGSGAAS NKV+ DQ                   FFS ESTALKTRF  PRDK+A++EK SRNV IKP VDV LSDLKLVLGPELRILYPLILNFAVSGE
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        LELNG AH+K I+PKG LTFDNGD+NLLATQVRLKREH N+A FEPENGLDPMLDLALVGSEWQI IQSRASKWQD LVV STRSVE+ ALSPTE     
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Query:  ----------SDGQLALNKLAASTLEKLMPRLEGKGEFGEARWRLVYAPQFPSVLSFPTTTDPFSSL----SFGTVVEVQLGKRIQASVVRQMRESEMGM
                  SDGQLAL KLA +TLEKLMPR+EGKGEFG+ARWRLVYAPQ PS+LSFP TTDP  SL    SFGTVVEVQLGKRIQAS+VRQM+ESEM M
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Query:  QWTLTYKLRSGLRLVFQS---APAQRTLVLVEY
        QWT TYKL S LR+V QS   APAQRTLVLVEY
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A0A6J1FLS4 uncharacterized protein LOC1114463780.0e+0097.45Show/hide
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A0A6J1III6 uncharacterized protein LOC1114765910.0e+0081.04Show/hide
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        AEFD  GEDWEWGT K QRVLA GAYSNNDGLRLE  FIQKDNATIHADGTLFGP+++LHFAVLN PV LVPTVVQVIESSAKDLVHSLRQLV PIRGIL
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        +MEGDLRGNLAKPECDVQVRLLDGAIGG+DLGRAE VASLTSSSR LFNAKF PI QNGHVHVQGSIPV+F QNS+ EVEELETD+SRATLIH+WGKE+V
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         DKFNDRK+SRE+NEE W TQL EGLKGLN NLL+VGEVR DADIKDGGMLLLT LSPHVNWLHGNADILL+V GTIEEPV DGSA+F+RAS+SSPVLPK
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        PL+N GG +HVRSNRLCI+SLE RVSR+GKL VKGNLPLRSSEASL DKIDLKCE LEVRAKNIFSGQVDSQMQITGSILQPNISG IQLSRGEAYLPHD
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        KGSGAAS NKV+ DQ                   FFS ESTALKTRF  PRDK+A++EK SRNV IKP VDV LSDLKLVLGPELRILYPLILNFAVSGE
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        LELNG AH+K I+PKG LTFDNGD+NLLATQVRLKREH N+A FEPENGLDPMLDLALVGSEWQI IQSRASKWQD LVV STRSVE+ ALSPTE     
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                  SDGQLAL KLA +TLEKLMPR+EGKGEFG+ARWRLVYAPQ PS+LSFP TTDP  SL    SFGTVVEVQLGKRIQAS+VRQM+ESEM M
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        QWT TYKL S LR+V QS   APAQRTLVLVEY
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A0A6J1IVS8 uncharacterized protein LOC111480396 isoform X10.0e+0094.34Show/hide
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        AEFDIRGEDWEWGTNKMQRVL VGAYSNNDGLRLENFFIQKDNATIHADGTLFGPLSSLHFAVLNCPVGLVPTV QVIESSAKDLVHSLRQL+API+GIL
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        YMEGDLRGNLAKPECDVQVRLLDGAIGGVDLGRAEAVASLTSSSRFLFNAKF PIFQNGHVHVQGSIPVMFVQNSMAEVEELETDSSRATLIHSWGKERV
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        MDKFNDRKNSREKN EDWTTQLTEGLKGLNSNLL+VGEVRFDADIKDGGMLLLT LSPHVNWLHGNADILLKVSGTIEEPVFDGSATF+ ASVSSPV PK
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        PLVNSGGMIHVRSNRLC DSLECRVSRKGKLTVKGNLPLRSSEASLSDKIDLKCE LEVRAKNIFSGQVDSQMQITGSILQP ISG IQLSRGEAYLPHD
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        FDNGD+NLLATQVRLKREHRNIAAFEPENGLDPMLDLALVGSEWQI IQSRASKWQDNLVVMS RSVERGALSPTE               S+GQLALNK
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        TLVLVEY
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A0A6J1IYQ8 uncharacterized protein LOC111480396 isoform X20.0e+0094.34Show/hide
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        AEFDIRGEDWEWGTNKMQRVL VGAYSNNDGLRLENFFIQKDNATIHADGTLFGPLSSLHFAVLNCPVGLVPTV QVIESSAKDLVHSLRQL+API+GIL
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        MDKFNDRKNSREKN EDWTTQLTEGLKGLNSNLL+VGEVRFDADIKDGGMLLLT LSPHVNWLHGNADILLKVSGTIEEPVFDGSATF+ ASVSSPV PK
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        PLVNSGGMIHVRSNRLC DSLECRVSRKGKLTVKGNLPLRSSEASLSDKIDLKCE LEVRAKNIFSGQVDSQMQITGSILQP ISG IQLSRGEAYLPHD
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        FDNGD+NLLATQVRLKREHRNIAAFEPENGLDPMLDLALVGSEWQI IQSRASKWQDNLVVMS RSVERGALSPTE               S+GQLALNK
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        LAASTLEKLMPR+EGKGEFGEARWRLVYAPQ PSVLSFPTTTDPFSSLSFGTVVEVQLGKRIQASVVRQMRESEMGMQWTLTYKLRSGLRLVFQSAPAQR
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Query:  TLVLVEY
        TLVLVEY
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4ISL7 Protein TIC236, chloroplastic6.3e-26764.55Show/hide
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        AEFD  G+DWEWGT K QRVLA G+Y+N+DGLRL+   IQK NAT+HADGTL GP ++LHFAVLN PV L+PT+V+V+ESSA D+VHSLR+L++PI+GIL
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Query:  YMEGDLRGNLAKPECDVQVRLLDGAIGGVDLGRAEAVASLTSSSRFLFNAKFVPIFQNGHVHVQGSIPVMFVQNSMAEVEELETDSSRATLIHSWGKERV
        +MEGDLRG+L KPECDVQVRLLDGA+GG+DLGRAE  ASLTS+SRFLFN+ F P  QNGHVH+QGS+PV F Q +M+E E  ETD   A  I SW KE+ 
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Query:  MDKFNDRKNSREKNEEDWTTQLTEGLKGLNSNLLNVGEVRFDADIKDGGMLLLTTLSPHVNWLHGNADILLKVSGTIEEPVFDGSATFYRASVSSPVLPK
         D   +++ SR+++EE W +QL E LKGL  N+L+ GEVR +ADIKDGGM LLT +SP+ NWL GNADI L+V GT++ PV DGSA+F+RAS+SSPVL K
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Query:  PLVNSGGMIHVRSNRLCIDSLECRVSRKGKLTVKGNLPLRSSEASLSDKIDLKCEDLEVRAKNIFSGQVDSQMQITGSILQPNISGTIQLSRGEAYLPHD
        PL N GG +HV+SNRLCI SLE RVSRKGKL VKGNLPLRS+EAS  D I+LKCE LEVRAKN  S QVD+Q+QITGS+LQP ISG I+LS+GEAYLPHD
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Query:  KGSGAASSNKVLPDQ-------------------FFSPESTALKTRFHQPRDKSAETEKASRNVYIKPCVDVCLSDLKLVLGPELRILYPLILNFAVSGE
        KG GAA  N++  +Q                   FF  E  +   +F Q   KS   EK    V +KP +D+ LSD+KLVLGPELRI+YPLILNFAVSGE
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Query:  LELNGCAHSKRIQPKGILTFDNGDINLLATQVRLKREHRNIAAFEPENGLDPMLDLALVGSEWQIIIQSRASKWQDNLVVMSTRSVERGALSPTEVI---
        LEL+G AH K I+PKG+LTF+NGD+NL+ATQVRLKREH N+A FEPE+GLDP+LDLALVGSEWQ  +QSRAS WQD LVV STRSVE+ ALSP+E     
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Query:  ----------SDGQLALNKLAASTLEKLMPRLEGKGEFGEARWRLVYAPQFPSVLSFPTTTDPFSSL----SFGTVVEVQLGKRIQASVVRQMRESEMGM
                   DGQLA  KLA +TL  +MPR+EGKGEFG+ARWRLVYAPQ PS+LS   T DP  SL    SFGT VEVQLGKR+QASVVRQM++SEM M
Subjt:  ----------SDGQLALNKLAASTLEKLMPRLEGKGEFGEARWRLVYAPQFPSVLSFPTTTDPFSSL----SFGTVVEVQLGKRIQASVVRQMRESEMGM

Query:  QWTLTYKLRSGLRLVFQSAPAQRTL
        QWTL Y+L S LR++ QSAP++R L
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W0RYD3 Protein SUBSTANDARD STARCH GRAIN 4, chloroplastic4.0e-24559.86Show/hide
Query:  AEFDIRGEDWEWGTNKMQRVLAVGAYSNNDGLRLENFFIQKDNATIHADGTLFGPLSSLHFAVLNCPVGLVPTVVQVIESSAKDLVHSLRQLVAPIRGIL
        A+FD  GEDWEWGT K QRVLA G++SNNDGLRL+  FIQKDNAT+HADG++ GPL++LHFAVLN PVGL+P +VQ IESS  D +H LRQ + PI+GIL
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Query:  YMEGDLRGNLAKPECDVQVRLLDGAIGGVDLGRAEAVASLTSSSRFLFNAKFVPIFQNGHVHVQGSIPVMFVQNSMAEVEELETDSSRATLIH--SWGKE
        +MEGDLRG LAKPECDVQ+RLLDG IGG+DLGRAE +AS+T +SRF+F+A F P  Q+GHV++QGS+PV +V ++  E E+LE    +  +I    W K+
Subjt:  YMEGDLRGNLAKPECDVQVRLLDGAIGGVDLGRAEAVASLTSSSRFLFNAKFVPIFQNGHVHVQGSIPVMFVQNSMAEVEELETDSSRATLIH--SWGKE

Query:  R-VMDKFNDRKNSREKNEEDWTTQLTEGLKGLNSNLLNVGEVRFDADIKDGGMLLLTTLSPHVNWLHGNADILLKVSGTIEEPVFDGSATFYRASVSSPV
        R + +  ++ +  R+K +E W  QL E LKGL+ N+L  GEVR +ADIKDGGM L+T LSP+ NWL G A++LL+V GT++ PV DGSA+F+RA+V+SP 
Subjt:  R-VMDKFNDRKNSREKNEEDWTTQLTEGLKGLNSNLLNVGEVRFDADIKDGGMLLLTTLSPHVNWLHGNADILLKVSGTIEEPVFDGSATFYRASVSSPV

Query:  LPKPLVNSGGMIHVRSNRLCIDSLECRVSRKGKLTVKGNLPLRSSEASLSDKIDLKCEDLEVRAKNIFSGQVDSQMQITGSILQPNISGTIQLSRGEAYL
        L  PL N  G +HV SNRLCI S+E RV RKG+L++KG LPL + E S +DKI+LKCE L++RAKNI SGQVDSQ+Q+TGSIL+P++SG I+LS GEAYL
Subjt:  LPKPLVNSGGMIHVRSNRLCIDSLECRVSRKGKLTVKGNLPLRSSEASLSDKIDLKCEDLEVRAKNIFSGQVDSQMQITGSILQPNISGTIQLSRGEAYL

Query:  PHDKGSGAA----SSNKVLPDQFFSPESTALKTRFH-------QPRDKSAETEKASRNVYIKPCVDVCLSDLKLVLGPELRILYPLILNFAVSGELELNG
        PHDKG+GA     SSNK +       + T  +   H        P  + +ETE+   +   KP +D  L+DLKL  GPELRI+YPLILNFAVSG+LELNG
Subjt:  PHDKGSGAA----SSNKVLPDQFFSPESTALKTRFH-------QPRDKSAETEKASRNVYIKPCVDVCLSDLKLVLGPELRILYPLILNFAVSGELELNG

Query:  CAHSKRIQPKGILTFDNGDINLLATQVRLKREHRNIAAFEPENGLDPMLDLALVGSEWQIIIQSRASKWQDNLVVMSTRSVERGALSPTEVI--------
          H K I+PKG+LTF+NG++NL+ATQVRLK +H N+A FEP+ GLDP+LDL LVGSEWQ  IQSRAS WQDNLVV STRSV++  LSP+E          
Subjt:  CAHSKRIQPKGILTFDNGDINLLATQVRLKREHRNIAAFEPENGLDPMLDLALVGSEWQIIIQSRASKWQDNLVVMSTRSVERGALSPTEVI--------

Query:  -----SDGQLALNKLAASTLEKLMPRLEGKGEFGEARWRLVYAPQFPSVLSFPTTTDPFSSL----SFGTVVEVQLGKRIQASVVRQMRESEMGMQWTLT
              DGQLA  KLA +TLE LMPR+EGKGEFG+ARWRLVYAPQ PS+LS   T DP  SL    SF T VEVQLGKR+QASVVRQM++SEM MQW+L 
Subjt:  -----SDGQLALNKLAASTLEKLMPRLEGKGEFGEARWRLVYAPQFPSVLSFPTTTDPFSSL----SFGTVVEVQLGKRIQASVVRQMRESEMGMQWTLT

Query:  YKLRSGLRLVFQSAPAQRTL
        Y+L S LR++FQS P+ R L
Subjt:  YKLRSGLRLVFQSAPAQRTL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G25660.1 embryo defective 24104.5e-26864.55Show/hide
Query:  AEFDIRGEDWEWGTNKMQRVLAVGAYSNNDGLRLENFFIQKDNATIHADGTLFGPLSSLHFAVLNCPVGLVPTVVQVIESSAKDLVHSLRQLVAPIRGIL
        AEFD  G+DWEWGT K QRVLA G+Y+N+DGLRL+   IQK NAT+HADGTL GP ++LHFAVLN PV L+PT+V+V+ESSA D+VHSLR+L++PI+GIL
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Query:  YMEGDLRGNLAKPECDVQVRLLDGAIGGVDLGRAEAVASLTSSSRFLFNAKFVPIFQNGHVHVQGSIPVMFVQNSMAEVEELETDSSRATLIHSWGKERV
        +MEGDLRG+L KPECDVQVRLLDGA+GG+DLGRAE  ASLTS+SRFLFN+ F P  QNGHVH+QGS+PV F Q +M+E E  ETD   A  I SW KE+ 
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Query:  MDKFNDRKNSREKNEEDWTTQLTEGLKGLNSNLLNVGEVRFDADIKDGGMLLLTTLSPHVNWLHGNADILLKVSGTIEEPVFDGSATFYRASVSSPVLPK
         D   +++ SR+++EE W +QL E LKGL  N+L+ GEVR +ADIKDGGM LLT +SP+ NWL GNADI L+V GT++ PV DGSA+F+RAS+SSPVL K
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Query:  PLVNSGGMIHVRSNRLCIDSLECRVSRKGKLTVKGNLPLRSSEASLSDKIDLKCEDLEVRAKNIFSGQVDSQMQITGSILQPNISGTIQLSRGEAYLPHD
        PL N GG +HV+SNRLCI SLE RVSRKGKL VKGNLPLRS+EAS  D I+LKCE LEVRAKN  S QVD+Q+QITGS+LQP ISG I+LS+GEAYLPHD
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Query:  KGSGAASSNKVLPDQ-------------------FFSPESTALKTRFHQPRDKSAETEKASRNVYIKPCVDVCLSDLKLVLGPELRILYPLILNFAVSGE
        KG GAA  N++  +Q                   FF  E  +   +F Q   KS   EK    V +KP +D+ LSD+KLVLGPELRI+YPLILNFAVSGE
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Query:  LELNGCAHSKRIQPKGILTFDNGDINLLATQVRLKREHRNIAAFEPENGLDPMLDLALVGSEWQIIIQSRASKWQDNLVVMSTRSVERGALSPTEVI---
        LEL+G AH K I+PKG+LTF+NGD+NL+ATQVRLKREH N+A FEPE+GLDP+LDLALVGSEWQ  +QSRAS WQD LVV STRSVE+ ALSP+E     
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Query:  ----------SDGQLALNKLAASTLEKLMPRLEGKGEFGEARWRLVYAPQFPSVLSFPTTTDPFSSL----SFGTVVEVQLGKRIQASVVRQMRESEMGM
                   DGQLA  KLA +TL  +MPR+EGKGEFG+ARWRLVYAPQ PS+LS   T DP  SL    SFGT VEVQLGKR+QASVVRQM++SEM M
Subjt:  ----------SDGQLALNKLAASTLEKLMPRLEGKGEFGEARWRLVYAPQFPSVLSFPTTTDPFSSL----SFGTVVEVQLGKRIQASVVRQMRESEMGM

Query:  QWTLTYKLRSGLRLVFQSAPAQRTL
        QWTL Y+L S LR++ QSAP++R L
Subjt:  QWTLTYKLRSGLRLVFQSAPAQRTL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATGTTCAAGGAAGCATTCCTGTGATGTTTGTCCAAAATAGCATGGCAGAGGTAGAAGAATTGGAAACAGATTCAAGTAGGGCAACTTTGATCCATTCTTGGGGGAAGGAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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PESTALKTRFHQPRDKSAETEKASRNVYIKPCVDVCLSDLKLVLGPELRILYPLILNFAVSGELELNGCAHSKRIQPKGILTFDNGDINLLATQVRLKREHRNIAAFEPE
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TVVEVQLGKRIQASVVRQMRESEMGMQWTLTYKLRSGLRLVFQSAPAQRTLVLVEY