; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg00689 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg00689
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionVQ domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr03:6274410..6275666
RNA-Seq ExpressionCarg00689
SyntenyCarg00689
Gene Ontology termsGO:0032259 - methylation (biological process)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039609 - VQ motif-containing protein 15/22


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604026.1 hypothetical protein SDJN03_04635, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-22798.8Show/hide
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KAG7034190.1 hypothetical protein SDJN02_03917, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.3e-232100Show/hide
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XP_022950817.1 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-79 specific-like [Cucurbita moschata]3.5e-21496.15Show/hide
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XP_022978502.1 kinesin-related protein 9-like [Cucurbita maxima]2.4e-20793.73Show/hide
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XP_023544542.1 rho GTPase-activating protein gacII-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.6e-20592.77Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGS8 VQ domain-containing protein7.0e-12867.27Show/hide
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A0A1S3B292 uncharacterized protein LOC1034849798.3e-12968.02Show/hide
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A0A5A7SYC9 Rho GTPase-activating protein gacF-like4.1e-12867.79Show/hide
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A0A6J1GFX4 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-79 specific-like1.7e-21496.15Show/hide
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A0A6J1IL93 kinesin-related protein 9-like1.2e-20793.73Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9LIE6 VQ motif-containing protein 221.1e-0573.53Show/hide
Query:  RKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTGIPA
        R+R+RASRR PTT+L TDTSNFRAMVQ++TG P+
Subjt:  RKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTGIPA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G35830.1 VQ motif-containing protein8.2e-2036.84Show/hide
Query:  ASARNPRKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTGIPAPPFTPASCFPRARVELFGGTSS--TSSPPYLLRPFPQKLPPFPFN-SPDTTTNTTTTTTS
        +S+RNPRKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTG+PA PF+        R ++F   S   T +P    RP PQK    P N S  +  N    TT+
Subjt:  ASARNPRKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTGIPAPPFTPASCFPRARVELFGGTSS--TSSPPYLLRPFPQKLPPFPFN-SPDTTTNTTTTTTS

Query:  SSTNTSLLSPSSHFLLPKQNHHLSSIFNLQPPPPLHQPNINLLASDLQVSLDTAQTTSEPRPNHHLHQTHLPE--EFLSGNILPPSWDIGGGGGGGGGAK
        S T   L  P        Q H +S+  +L      HQP ++ L     ++L   Q    P  +   HQ  + +  EF      PP               
Subjt:  SSTNTSLLSPSSHFLLPKQNHHLSSIFNLQPPPPLHQPNINLLASDLQVSLDTAQTTSEPRPNHHLHQTHLPE--EFLSGNILPPSWDIGGGGGGGGGAK

Query:  YCGGTRVNNNYSASSSSLDFHGDKGGSSENVTTRSEGMIESWICSSD
              ++NN S SSSS    G  G ++   TT     ++ WIC +D
Subjt:  YCGGTRVNNNYSASSSSLDFHGDKGGSSENVTTRSEGMIESWICSSD

AT3G22160.1 VQ motif-containing protein7.9e-0773.53Show/hide
Query:  RKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTGIPA
        R+R+RASRR PTT+L TDTSNFRAMVQ++TG P+
Subjt:  RKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTGIPA

AT4G15120.1 VQ motif-containing protein7.9e-0750Show/hide
Query:  ARNPRKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTGIP---APPFTPASCFPRARVELFGGTSST
        A+  R+R+RASRR PTT+  TDT+NFRAMVQ+FTG P   A   +P+S F     +   G SS+
Subjt:  ARNPRKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTGIP---APPFTPASCFPRARVELFGGTSST

AT4G39720.1 VQ motif-containing protein1.0e-1433.33Show/hide
Query:  MDSGSSASIQSSS----GGEEEYDSR-AEGGLSGFLNNPSRHVGPIATKPNPPPPSVHPPATHHPHSSSSLFDPFSNFAHHLPTRSPQNSLPNLDFLCSR
        M+SG+S+S+QSSS    GGEEEYDSR A+  +S F ++ + HV  I     P P   H    H  H++++   P + F ++  T  P N  P        
Subjt:  MDSGSSASIQSSS----GGEEEYDSR-AEGGLSGFLNNPSRHVGPIATKPNPPPPSVHPPATHHPHSSSSLFDPFSNFAHHLPTRSPQNSLPNLDFLCSR

Query:  NPRSDHDPIQLPASISMLPSSSQPQSFMTATNSQLQLQLPHQLTPTNVQAPRGLTLTADRTDVVHNHNNNNNNNNTGTGSNASARNPRKRTRASRRAPTT
              DPI   + + +  SS        AT+S         L PT                           NN G       +  +KR+RASRRAPTT
Subjt:  NPRSDHDPIQLPASISMLPSSSQPQSFMTATNSQLQLQLPHQLTPTNVQAPRGLTLTADRTDVVHNHNNNNNNNNTGTGSNASARNPRKRTRASRRAPTT

Query:  VLTTDTSNFRAMVQEFTGIPAPP-FTPASCFPRARVELFGGTSSTSSPPY-----LLRPFPQKL-PPFPFNSPDTTTNTTTTTTSSSTNTSLLSPSSHFL
        VLTTDTSNFRAMVQEFTGIPAPP F   S     R+  F G SS+S   Y     LLRPF QKL P  P  S                        +H  
Subjt:  VLTTDTSNFRAMVQEFTGIPAPP-FTPASCFPRARVELFGGTSSTSSPPY-----LLRPFPQKL-PPFPFNSPDTTTNTTTTTTSSSTNTSLLSPSSHFL

Query:  LPKQNHHLSSIFNLQPPPPLHQPNINLLAS
         P+ N H      +   P  + P     A+
Subjt:  LPKQNHHLSSIFNLQPPPPLHQPNINLLAS

AT5G65170.1 VQ motif-containing protein8.2e-2030.95Show/hide
Query:  MDSGSSASIQSSSGG-----EEEYDSRAEGGLSGFLNNPSRHVGPIATKPN-PPPPSVHPPATHHPHSSSSLFDPFSNFAHHLPTRSPQNSLPNLDFLCS
        M+SG+S+S+QSSSGG     +EEYDSRA+  +S   N+ + +  P    PN   P  +     ++ ++S S  +P  +     PT               
Subjt:  MDSGSSASIQSSSGG-----EEEYDSRAEGGLSGFLNNPSRHVGPIATKPN-PPPPSVHPPATHHPHSSSSLFDPFSNFAHHLPTRSPQNSLPNLDFLCS

Query:  RNPRSDHDPIQLPASISMLPSSSQPQSFMTATNSQLQLQLPHQLTPTNVQAPRGLTLTADRTDVVHNHNNNNNNNNTGTGSNASARNPRKRTRASRRAPT
                      S  + P  S  Q F T    Q    +P+    TN  +P     T  +  +                  A+ RNP+KR+R SRRAPT
Subjt:  RNPRSDHDPIQLPASISMLPSSSQPQSFMTATNSQLQLQLPHQLTPTNVQAPRGLTLTADRTDVVHNHNNNNNNNNTGTGSNASARNPRKRTRASRRAPT

Query:  TVLTTDTSNFRAMVQEFTGIPAPPFTP-ASCFPRARVELFGGTSSTSSPPYLLRPFPQKLPPFPFNSPDTTTNTTTTTTSSSTNTSLLSPSSHFLLPKQN
        TVLTTDTSNFRAMVQEFTG P+ PFT  +S FPR+R +LFG +SS+SS P  ++PFP KL                  + S+ N   L PSS +     +
Subjt:  TVLTTDTSNFRAMVQEFTGIPAPPFTP-ASCFPRARVELFGGTSSTSSPPYLLRPFPQKLPPFPFNSPDTTTNTTTTTTSSSTNTSLLSPSSHFLLPKQN

Query:  HHLSSIFNLQPPPPLHQPNINLLASD--LQVSLDTAQTTSEPRPNHHLHQTHLPEEFLSGNILPPSWDIGGGGGGGGGAKYCGG--TRVNNNYSASSSSL
         H + + N+   P +  P +N   +D     SL T+          +    H      S ++  P+ +   G      A+        +N N        
Subjt:  HHLSSIFNLQPPPPLHQPNINLLASD--LQVSLDTAQTTSEPRPNHHLHQTHLPEEFLSGNILPPSWDIGGGGGGGGGAKYCGG--TRVNNNYSASSSSL

Query:  DFHGDKG--GSSENVT-TRSEGMIE-SWICSSD
        D +   G  GS  N++  RSEGM+E SWI SSD
Subjt:  DFHGDKG--GSSENVT-TRSEGMIE-SWICSSD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATTCTGGGAGTAGTGCAAGTATACAAAGCTCGAGTGGCGGCGAAGAAGAGTACGATTCACGCGCGGAGGGGGGGCTCTCTGGTTTCTTAAACAATCCGTCACGGCA
TGTCGGCCCCATAGCTACTAAGCCCAATCCACCCCCACCATCCGTACATCCTCCAGCGACGCACCACCCTCATTCTTCCTCTTCCCTCTTCGACCCCTTCTCCAACTTCG
CCCATCATTTACCCACTCGATCACCTCAAAATTCCCTTCCCAATCTCGACTTCCTCTGTTCCAGAAACCCCAGGTCCGACCACGACCCGATCCAACTTCCCGCCTCCATT
TCCATGCTCCCTTCTTCCTCTCAACCCCAATCGTTTATGACGGCCACCAATAGTCAATTGCAATTGCAACTCCCTCATCAACTCACCCCAACTAATGTCCAAGCTCCACG
GGGTTTAACTCTCACCGCGGATCGAACCGACGTCGTTCATAATCATAACAACAACAACAACAACAACAACACTGGTACTGGTAGCAACGCCTCTGCTCGTAACCCGAGGA
AGCGAACCCGAGCGTCGAGGAGAGCCCCAACCACCGTCCTCACAACAGATACTTCCAATTTCAGAGCCATGGTCCAGGAATTCACTGGGATTCCAGCACCTCCCTTCACA
CCTGCATCCTGTTTCCCCAGAGCAAGAGTGGAGCTTTTTGGCGGCACCTCCTCCACCTCTTCCCCACCCTACCTACTCCGCCCATTTCCCCAAAAGCTACCTCCTTTTCC
TTTCAATTCCCCTGATACTACTACTAATACTACTACTACTACTACTTCTTCTTCTACAAATACTTCCCTTCTCTCACCATCCTCCCATTTTCTTCTCCCCAAACAGAATC
ATCATCTGTCCTCTATTTTCAATCTCCAGCCCCCTCCCCCTCTCCACCAACCTAATATAAATCTCCTCGCCTCCGACCTTCAAGTTTCCCTTGATACTGCCCAAACCACA
TCCGAGCCCCGTCCTAATCACCATCTTCATCAAACGCATCTCCCAGAAGAATTCCTTTCTGGGAATATTCTTCCGCCAAGTTGGGACATTGGCGGCGGCGGAGGAGGAGG
AGGAGGAGCCAAATACTGTGGCGGTACTAGAGTTAACAACAACTATTCAGCCTCTTCTTCTTCTTTGGATTTTCATGGTGATAAAGGGGGGTCCTCCGAGAATGTGACGA
CTAGGAGTGAAGGTATGATAGAATCTTGGATTTGTTCGTCAGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATTCTGGGAGTAGTGCAAGTATACAAAGCTCGAGTGGCGGCGAAGAAGAGTACGATTCACGCGCGGAGGGGGGGCTCTCTGGTTTCTTAAACAATCCGTCACGGCA
TGTCGGCCCCATAGCTACTAAGCCCAATCCACCCCCACCATCCGTACATCCTCCAGCGACGCACCACCCTCATTCTTCCTCTTCCCTCTTCGACCCCTTCTCCAACTTCG
CCCATCATTTACCCACTCGATCACCTCAAAATTCCCTTCCCAATCTCGACTTCCTCTGTTCCAGAAACCCCAGGTCCGACCACGACCCGATCCAACTTCCCGCCTCCATT
TCCATGCTCCCTTCTTCCTCTCAACCCCAATCGTTTATGACGGCCACCAATAGTCAATTGCAATTGCAACTCCCTCATCAACTCACCCCAACTAATGTCCAAGCTCCACG
GGGTTTAACTCTCACCGCGGATCGAACCGACGTCGTTCATAATCATAACAACAACAACAACAACAACAACACTGGTACTGGTAGCAACGCCTCTGCTCGTAACCCGAGGA
AGCGAACCCGAGCGTCGAGGAGAGCCCCAACCACCGTCCTCACAACAGATACTTCCAATTTCAGAGCCATGGTCCAGGAATTCACTGGGATTCCAGCACCTCCCTTCACA
CCTGCATCCTGTTTCCCCAGAGCAAGAGTGGAGCTTTTTGGCGGCACCTCCTCCACCTCTTCCCCACCCTACCTACTCCGCCCATTTCCCCAAAAGCTACCTCCTTTTCC
TTTCAATTCCCCTGATACTACTACTAATACTACTACTACTACTACTTCTTCTTCTACAAATACTTCCCTTCTCTCACCATCCTCCCATTTTCTTCTCCCCAAACAGAATC
ATCATCTGTCCTCTATTTTCAATCTCCAGCCCCCTCCCCCTCTCCACCAACCTAATATAAATCTCCTCGCCTCCGACCTTCAAGTTTCCCTTGATACTGCCCAAACCACA
TCCGAGCCCCGTCCTAATCACCATCTTCATCAAACGCATCTCCCAGAAGAATTCCTTTCTGGGAATATTCTTCCGCCAAGTTGGGACATTGGCGGCGGCGGAGGAGGAGG
AGGAGGAGCCAAATACTGTGGCGGTACTAGAGTTAACAACAACTATTCAGCCTCTTCTTCTTCTTTGGATTTTCATGGTGATAAAGGGGGGTCCTCCGAGAATGTGACGA
CTAGGAGTGAAGGTATGATAGAATCTTGGATTTGTTCGTCAGATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDSGSSASIQSSSGGEEEYDSRAEGGLSGFLNNPSRHVGPIATKPNPPPPSVHPPATHHPHSSSSLFDPFSNFAHHLPTRSPQNSLPNLDFLCSRNPRSDHDPIQLPASI
SMLPSSSQPQSFMTATNSQLQLQLPHQLTPTNVQAPRGLTLTADRTDVVHNHNNNNNNNNTGTGSNASARNPRKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTGIPAPPFT
PASCFPRARVELFGGTSSTSSPPYLLRPFPQKLPPFPFNSPDTTTNTTTTTTSSSTNTSLLSPSSHFLLPKQNHHLSSIFNLQPPPPLHQPNINLLASDLQVSLDTAQTT
SEPRPNHHLHQTHLPEEFLSGNILPPSWDIGGGGGGGGGAKYCGGTRVNNNYSASSSSLDFHGDKGGSSENVTTRSEGMIESWICSSD