; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg00778 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg00778
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionVQ domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr03:6696072..6696572
RNA-Seq ExpressionCarg00778
SyntenyCarg00778
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039610 - VQ motif-containing protein 29


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604115.1 VQ motif-containing protein 29, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.3e-8699.4Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KJR2 VQ domain-containing protein9.1e-6378.7Show/hide
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A0A1S3B142 uncharacterized protein LOC1034848691.6e-6277.65Show/hide
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A0A6J1GE45 uncharacterized protein LOC1114533301.2e-86100Show/hide
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A0A6J1IPH4 uncharacterized protein LOC1114776408.5e-7792.17Show/hide
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A0A6J1KTH5 uncharacterized protein LOC1114970901.2e-5776.83Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9SZG3 VQ motif-containing protein 294.0e-0739.47Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22880.1 VQ motif-containing protein8.0e-1133.33Show/hide
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        N++LH  RK  AKPWKKP         P+VY+V+P+NF+ LVQ+LTG  ++                      V  VEA   +P+ +  D      +   
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         +LSP +   W +FP LSP +L+
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AT4G37710.1 VQ motif-containing protein2.9e-0839.47Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TTATTCCAATAATAATCTTCACTGTGTTCGAAAGTCGATGGCGAAGCCATGGAAGAAGCCGGCGATTGCGCCACTGCCACCGACTCGGCCGAGGGTGTACAAAGTGGACC
CACTTAACTTCCGGAATTTGGTTCAGAAACTCACCGGTTTGGCTGAGCTTCGATCTCCACGCCTCCAAAAGATGGCGCCACCACCGCTTGATATTGCCCGCTGTCCAGTC
TCGAACGTTGCCGTCGTGGAAGCCTCCACGCTTCAGCCTTTGCCTGTGAGGCTGGACGAGGCGGTGGACGGTGGGAGCTTTCTCGAGCTCAACTTGTCGCCCTTCAACAA
AAATTGGTGCTCTTTCCCTGCTTTGAGCCCCGAAAGTCTTGCCCTTTTGGATGCAATTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AAATTGGTGCTCTTTCCCTGCTTTGAGCCCCGAAAGTCTTGCCCTTTTGGATGCAATTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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