; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg00921 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg00921
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionRibosome production factor 2 homolog
Genome locationCarg_Chr06:2110639..2114061
RNA-Seq ExpressionCarg00921
SyntenyCarg00921
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0000463 - maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0032774 - RNA biosynthetic process (biological process)
GO:0005730 - nucleolus (cellular component)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007109 - Brix domain
IPR039770 - Ribosome biogenesis protein Rpf2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596544.1 Ribosome production factor 2-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-17599.69Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVF+T
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE
        RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE

KAG7028079.1 Ribosome production factor 2-like protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.4e-176100Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE
        RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE

XP_022945126.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita moschata]9.7e-17298.14Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIARTYDHHIYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKH KEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRER EAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE
        RD+ PASKK KEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE

XP_023005644.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita maxima]2.7e-17499.38Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKH KEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDS
        RDD+PASKKPKEDSEKPKEDS
Subjt:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDS

XP_023540188.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.2e-17599.69Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKH KEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE
        RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LAR1 Ribosome production factor 2 homolog1.3e-16190.37Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        ML++RTPKN KVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTE+YHLKKESAVKYSR+N+GIKPFE+GGD+SLEFFSLKTDCSII+YGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        +NLVIARTY+ HIYD++EVGIENFKSMHSF YDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKH KEVLLD FRGEVVEN+NL+GLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+V+RRHRLP+DGLRKEAMKTAKD+AKKKEKNVS+D I GKIGRIYIPDQKVGD+A+ DKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE
        RDD PASKKPKEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE

A0A6J1F357 Ribosome production factor 2 homolog3.8e-16692.86Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES+VKYSR+N+GIKPFE+GGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDH IYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKH KEVLLD+FRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQKVGD+A+PDKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE
        +DD PASKKPKEDSEKPKE+SE
Subjt:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE

A0A6J1FZZ6 Ribosome production factor 2 homolog4.7e-17298.14Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIARTYDHHIYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKH KEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRER EAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE
        RD+ PASKK KEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE

A0A6J1J655 Ribosome production factor 2 homolog8.5e-16693.17Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES+VKYSR+N+GIKPFE+GGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDH IYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKH KEVLLD+FRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQKVGD+A+PDKSKGVKRERREAKMK+
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE
        +DD PASKKPKEDSEKPKE+SE
Subjt:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE

A0A6J1KZU6 Ribosome production factor 2 homolog1.3e-17499.38Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKH KEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDS
        RDD+PASKKPKEDSEKPKEDS
Subjt:  RDDVPASKKPKEDSEKPKEDS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2YDN6 Ribosome production factor 2 homolog1.2e-5542.44Show/hide
Query:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        +V  PK  + KR LEKR PKL E  K  +++ G   +  + +VL ++Y LKK   + Y ++N   +PFE+   +SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVI R YD+H+ D+IE+GIE F S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ +  K +L+D FRG  V NI LAGL+ V   TA++  K++    
Subjt:  LVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKNRD
         L +KKSG   PR+EL E+GPS+DLV+RR  L SD L K +MK  K    KK+KN+S D      GRI++  Q +  +    K KG+K  +R A+ K  D
Subjt:  ALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKNRD

Query:  DVPASKKPKED
        +   SK+ K++
Subjt:  DVPASKKPKED

Q9AWM9 Ribosome production factor 2 homolog1.8e-12068.59Show/hide
Query:  VRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNL
        +R P++ + KREL K APKLVETGKKTLILHGTKTS VLN VL +++HLK+++AVKYS++N+ I+PFE+GG++SLEFFSLKTDCS+IVYGSHSKKRP+NL
Subjt:  VRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNL

Query:  VIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCA
        V+ RTYDHHIYDL+EVG+EN+KS+ S+ YDKKL+P++GSKPF  FIGE FE+VEELKH KEVLLD+F+GEVVEN+NLAG+DRV+VCTAISP  V++ HCA
Subjt:  VIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCA

Query:  LRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKNRDD
        LR+K+SG+ +PR+ELVEVGPSMDLVVRRHR P + L+KEAMKTA D AKK  KNV++D +HGK+G++YIPDQ++  ++L +  KG+KRERREAK KN+D 
Subjt:  LRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKNRDD

Query:  VPASKKPKEDSE
           SKK K + E
Subjt:  VPASKKPKEDSE

Q9H7B2 Ribosome production factor 2 homolog2.6e-5542.77Show/hide
Query:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        +V  PK  + KR LEKR PKL E  K  +++ G   +  + +VL ++Y LKK   V Y ++N   +PFE+   +SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVI R YD+H+ D+IE+GIENF S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ +  K +L+D FRG  V NI LAGL+ V   TA++  K++    
Subjt:  LVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKNRD
         L +KKSG   PR+EL E+GPS+DLV+RR  L SD L K +MK  K    KK+KN+S D      GRI++  Q +  +    K KG+K  +R A+    D
Subjt:  ALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKNRD

Query:  DVPASKKPKED
            SK+ K++
Subjt:  DVPASKKPKED

Q9JJ80 Ribosome production factor 2 homolog1.5e-5543.09Show/hide
Query:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        KV  PK  + KR LEKR PKL E  K  +++ G   +  + +VL ++Y LKK   V Y ++N   +PFE+   +SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVI R YD+H+ D+IE+GIE F S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ +  K +L+D FRG  V N+ LAGL+ V   TA++  KV+    
Subjt:  LVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKNRD
         L +KKSG   PR+EL E+GPS+DLV+RR  L SD L K +MK  K    KK KN+SQD      GRI++  Q +  +    K KG+K  +R A+    D
Subjt:  ALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKNRD

Query:  DVPASKKPKED
            SK+ K++
Subjt:  DVPASKKPKED

Q9LUG5 Ribosome production factor 2 homolog2.3e-12871.75Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        M+++RTPK GK KR LE RAPKLVETGKKTLILHGTKTS  L+ V+TE+Y LKK  A++YSRRNE I+PFE+GG++SLEFFS KTDCSI VYGSH+KKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLV+ R YDH +YDLIEVGIENFKS+ +F+YDKK +P  G+KPFI FIGEGFENV ELKH KEVL D+FRGEVV+N+NL GLDR YVC+AISP KVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCAL++KKSGS+VPRMELVEVGPSMDLV+RR+RLP+D L KEAM+T+KD+ KKKEKNV QDA+ GK G+IY+PDQK+ ++ L DKSKG KRER++AK+K+
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDVPASKKPKEDSE
        +++  A KK K  SE
Subjt:  RDDVPASKKPKEDSE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23620.1 Ribosomal RNA processing Brix domain protein1.7e-12971.75Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        M+++RTPK GK KR LE RAPKLVETGKKTLILHGTKTS  L+ V+TE+Y LKK  A++YSRRNE I+PFE+GG++SLEFFS KTDCSI VYGSH+KKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLV+ R YDH +YDLIEVGIENFKS+ +F+YDKK +P  G+KPFI FIGEGFENV ELKH KEVL D+FRGEVV+N+NL GLDR YVC+AISP KVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCAL++KKSGS+VPRMELVEVGPSMDLV+RR+RLP+D L KEAM+T+KD+ KKKEKNV QDA+ GK G+IY+PDQK+ ++ L DKSKG KRER++AK+K+
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDVPASKKPKEDSE
        +++  A KK K  SE
Subjt:  RDDVPASKKPKEDSE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGAAAGTTAGAACTCCCAAGAATGGTAAAGTTAAACGAGAGCTTGAGAAACGTGCTCCCAAACTTGTTGAGACGGGGAAGAAGACGCTGATACTTCATGGCACTAA
AACGAGCGGCGTGTTGAATGAAGTATTGACGGAAATTTATCACCTGAAGAAAGAAAGTGCCGTGAAGTATTCTCGTAGGAATGAAGGAATTAAACCATTTGAAAATGGCG
GCGATTCATCTTTGGAATTTTTCTCTCTCAAAACTGATTGCAGTATTATCGTGTATGGTTCTCACTCAAAGAAACGACCCGATAATCTTGTAATAGCGAGAACCTACGAT
CATCACATCTATGATCTAATTGAGGTTGGGATTGAAAATTTCAAGTCAATGCATTCTTTCACATATGATAAGAAACTTTCTCCACGGGTCGGGTCAAAGCCTTTCATTAC
TTTCATTGGCGAAGGATTTGAGAATGTGGAAGAGCTGAAGCATTTTAAAGAAGTTTTGCTTGATATGTTCCGTGGAGAGGTTGTGGAGAATATAAATCTTGCTGGGTTGG
ACCGTGTATATGTATGTACTGCCATCTCACCAAATAAAGTATTTCTCACTCATTGTGCACTGCGAATGAAGAAGTCAGGTTCAGTAGTTCCTAGAATGGAACTAGTTGAA
GTCGGTCCTTCAATGGATTTGGTGGTTCGCCGGCACCGGCTGCCTAGTGATGGTCTAAGGAAGGAAGCCATGAAAACAGCCAAGGATCAGGCTAAGAAGAAGGAGAAAAA
TGTGAGTCAGGATGCAATTCATGGCAAGATTGGAAGGATATATATTCCTGATCAAAAGGTTGGAGATGTGGCTCTACCCGACAAATCAAAGGGAGTGAAGAGAGAACGAC
GCGAAGCGAAAATGAAAAACAGAGATGACGTGCCAGCCTCTAAAAAACCAAAAGAAGATTCAGAAAAACCAAAAGAAGATTCAGAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCAGGACGACCACCTCAAAAAGTTCACCAAAATCGGCGTCAGCTTGCAGTCGCCGGAACGGTCGATATTTCTCTGCTAGTTGAGCAACAAAACCCTAAATCTCATCTCTG
TTATCTAACCGGCCGTGGACCATGTTGAAAGTTAGAACTCCCAAGAATGGTAAAGTTAAACGAGAGCTTGAGAAACGTGCTCCCAAACTTGTTGAGACGGGGAAGAAGAC
GCTGATACTTCATGGCACTAAAACGAGCGGCGTGTTGAATGAAGTATTGACGGAAATTTATCACCTGAAGAAAGAAAGTGCCGTGAAGTATTCTCGTAGGAATGAAGGAA
TTAAACCATTTGAAAATGGCGGCGATTCATCTTTGGAATTTTTCTCTCTCAAAACTGATTGCAGTATTATCGTGTATGGTTCTCACTCAAAGAAACGACCCGATAATCTT
GTAATAGCGAGAACCTACGATCATCACATCTATGATCTAATTGAGGTTGGGATTGAAAATTTCAAGTCAATGCATTCTTTCACATATGATAAGAAACTTTCTCCACGGGT
CGGGTCAAAGCCTTTCATTACTTTCATTGGCGAAGGATTTGAGAATGTGGAAGAGCTGAAGCATTTTAAAGAAGTTTTGCTTGATATGTTCCGTGGAGAGGTTGTGGAGA
ATATAAATCTTGCTGGGTTGGACCGTGTATATGTATGTACTGCCATCTCACCAAATAAAGTATTTCTCACTCATTGTGCACTGCGAATGAAGAAGTCAGGTTCAGTAGTT
CCTAGAATGGAACTAGTTGAAGTCGGTCCTTCAATGGATTTGGTGGTTCGCCGGCACCGGCTGCCTAGTGATGGTCTAAGGAAGGAAGCCATGAAAACAGCCAAGGATCA
GGCTAAGAAGAAGGAGAAAAATGTGAGTCAGGATGCAATTCATGGCAAGATTGGAAGGATATATATTCCTGATCAAAAGGTTGGAGATGTGGCTCTACCCGACAAATCAA
AGGGAGTGAAGAGAGAACGACGCGAAGCGAAAATGAAAAACAGAGATGACGTGCCAGCCTCTAAAAAACCAAAAGAAGATTCAGAAAAACCAAAAGAAGATTCAGAATAG
TTCAACTAGTCTTAATACTGTTCGGTCCAATTCTCTTCTTACTAGAGTCGCTGTTATGAAATGCATAGTAGCTTGCCAATTATGTGGACAGAGCAGACACTATTTATTTG
CGTGTATACAATTTTGCCTATGGTTTCCAATTTGATTTTACATGCAAACCTGCCTTTTATCATCTTAAAGCCTTCAGGTTTTTGCGGAGTTTGGCTGTGAACCTCATTGG
TTAGCAGGACACAGAATTGTTGTAGCAAACAGAATGTGCCTTCAACCTCATTGGTTTCTCCCTCTCCTATCCTCTTACCCCAAGCTCTTCACATCTTACTGCAAAATCTT
TGATTCTCTGTGGCTGAGAAGTAAATCACAGCAGACTGAGGGCAGGCGTTCTACAACGCCCGTGTCATCGCGGTCGCCACATCGGTCTCATGGTTATTAGTCTCCTTCCA
TTCCTCCAGGAGCTCCAGTTTCTTGTTGGATAGGATGCCTGCACAATGCATCACTCTGTGTCCAATAGTTAAATGCCTGCAACTTCATGTATTGTTAGCAAGGTGAATTT
GAAATAAAAGCAGCTCACAAGGAACACACAACCAGCCTATATAAGCTCTGGAAATCAGAGAATGAAATAAGGGAAGATAAAATGGAAGTGCATAATCAATTCATTTTCCT
AGCAAATCATTCAATCTAAAGTTCCTTCATCTAGAGATAACTAAGATTCCTAGTGGCTGCAAATGTAATGGCTAATGAAATCTGTGATTATTTATCCTCAGAGTCGTCTG
TATTTTCGGGACAAGCTCGACTATCTGGATCATCAAATGGGAATCCAGAAGCTGACCATGTATTCGTGTGGGAATCTCCAGCCTGCAGTGAACCTAAGTCCCAGAATGGT
GACAATCCGCTAGAGCCTTGCAAAAATGGATCCTCGAAATCAACTGGATTGCTCCAAAACTCGGTGTTTGAACTGGACGTGCCAGTATCGACATTCAAACCCGTGCTCCA
AATTTCTTCTGGTTTAATGACATTTCCAGTTCCAAGATGTGAGAACTGTTGAATACTTTCTGCCAAAGAGACAAAGTAGTCAGGATTGACATCTTGTGAGGAACTCCCAA
TAGCCTTTCCCTTGGAATGTTGATCCTCCATTGACATGTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNLVIARTYD
HHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHFKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCALRMKKSGSVVPRMELVE
VGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERREAKMKNRDDVPASKKPKEDSEKPKEDSE