; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg01024 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg01024
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein ALUMINUM SENSITIVE 3
Genome locationCarg_Chr06:1597707..1599320
RNA-Seq ExpressionCarg01024
SyntenyCarg01024
Gene Ontology termsGO:0010044 - response to aluminum ion (biological process)
GO:0005887 - integral component of plasma membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR005226 - UPF0014 family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596436.1 Protein ALUMINUM SENSITIVE 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.2e-133100Show/hide
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XP_038903048.1 protein ALUMINUM SENSITIVE 3 [Benincasa hispida]9.2e-12895.45Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LA98 Uncharacterized protein1.4e-12694.32Show/hide
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A0A1S3B6R0 protein ALUMINUM SENSITIVE 38.4e-12794.32Show/hide
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A0A5A7TPN7 Protein ALUMINUM SENSITIVE 38.4e-12794.32Show/hide
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A0A6J1FCQ7 protein ALUMINUM SENSITIVE 33.9e-13299.24Show/hide
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A0A6J1L2R4 protein ALUMINUM SENSITIVE 33.3e-13198.86Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O34684 UPF0014 membrane protein YjkA9.8e-3234.17Show/hide
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        L    V +A+ LS   K G+E +MI A  RA +QL +IG+VL  IF   +  +ILL  L M+ VA     +R K+         A++     VT  +L+ 
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        L + PLT RY+IP++GM++GNSM ++ + + RL  ++  +   ++  L+LG TP+Q+  + +  A+ +++ P +++ KT+GL+ LPG MTG I+ GA PI
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        +A++ Q++++   + ++ ++ ++ + L +PS FT   QL+
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P77307 Probable iron export permease protein FetB3.5e-3735.12Show/hide
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        LA  +V VA+++S+ +KL LE ++++++ RA +QL ++G+VL++IF+  + +  LL  LF+   A + A +R+K++ +  + +  +I  G  +T+ +L++
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               P  +IP+AGM+ GN+M   G+    L   + ++   ++  L+LGATP+QA+   ++ ++  AL P VD+AKTVGL+SLPG M+GLI  G  P+
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Query:  EAIQLQIVVMNFLIGASTISSIMSTYLCWPSFFTAAYQLETT
        +AI+ QI+V   L+  +++S+I++ YL +  F+ + +QL  T
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Q58348 UPF0014 membrane protein MJ09384.7e-2633.05Show/hide
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        A   V +AV+++Y +KLG+E +++Y    A +QL ++GFVL +IF+   +   L+  + M+T+A Y   +      + KL     I  L  T V++ +L 
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Query:  VLKVFPLTPRYIIPVAGMMVGNSMTVTGVAMRRLRDDIRTQFSLVETALALGATPRQATHQQVKRALVLALSPVVDNAKTVGLISLPGAMTGLIMGGASP
        + KV    P Y+IP+ GM++GN+M    +A+ ++ D ++++  ++   LALGAT  +A    +K A+  A+ P ++  K+VG+I +PGAM G+++ GA+P
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Query:  IEAIQLQIVVMNFLIGASTISSIMSTYLCWPSFFTA
        I A ++QI++M  ++ ++ IS I+  YL +     A
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Q5W7C1 UPF0014 membrane protein STAR27.3e-10477.73Show/hide
Query:  DFLQGMTKPFLATAIVAVAVVLSYFQKLGLEGEMIYAISRAFLQLSVIGFVLQFIFNQQNLAWILLAYLFMVTVAGYTAGQRAKHVPRGKLVAGASILAG
        +FL GM KP  ATA+VA+AV LS+ Q+LGLEGEM+YA++RAFLQLSVIGFVLQFIF Q++ AWILLAYLFMVTVAGYTAGQRA+HVPRGK +A  SILAG
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Query:  TSVTMVMLVVLKVFPLTPRYIIPVAGMMVGNSMTVTGVAMRRLRDDIRTQFSLVETALALGATPRQATHQQVKRALVLALSPVVDNAKTVGLISLPGAMT
        TSVTM +LV L+VFP TPRYIIPVAGMMVGN+MTVTGV M++LR+D+  Q  +VETALALGATPRQAT +QV+R+LV+ALSPV+DNAKTVGLI+LPGAMT
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Query:  GLIMGGASPIEAIQLQIVVMNFLIGASTISSIMSTYLCWPSFFTAAYQLETTVFAA
        GLIMGGASP+EAIQLQIVVMN L+GAST+SSI+STYLCWP+FFT A+QL   VFAA
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Q9ZUT3 Protein ALUMINUM SENSITIVE 31.0e-10575.57Show/hide
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        D +WL+ FL+GM KP  A  +V +AV+LSY Q L LEGEMIY++SR+FLQLSVIGFVLQFIFNQ+N  WI+LAYLFMV+VAGYTAGQRA+HVPRGK VAG
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         SILAGTS+TM +LV+L VFP TPRY+IP+AGM+VGN+MTVTGV M++LRDDI+ Q +LVETALALGATPRQAT QQVKRALV++LSPV+D+ KTVGLIS
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        LPGAMTG+IMGGASP+EAIQLQIVVMN ++GA+T+SSI STYLCWPSFFT AYQL+T VF++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37330.1 aluminum sensitive 37.3e-10775.57Show/hide
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        D +WL+ FL+GM KP  A  +V +AV+LSY Q L LEGEMIY++SR+FLQLSVIGFVLQFIFNQ+N  WI+LAYLFMV+VAGYTAGQRA+HVPRGK VAG
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         SILAGTS+TM +LV+L VFP TPRY+IP+AGM+VGN+MTVTGV M++LRDDI+ Q +LVETALALGATPRQAT QQVKRALV++LSPV+D+ KTVGLIS
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCTTCAATGGCTTCTGGATTTCCTTCAAGGCATGACGAAGCCTTTTCTCGCCACCGCCATTGTTGCCGTCGCCGTCGTCCTCTCCTACTTCCAGAAGCTTGGCCT
CGAAGGCGAAATGATCTACGCCATTTCCAGAGCCTTTCTTCAGCTCTCTGTTATTGGCTTTGTTCTTCAGTTCATCTTCAACCAGCAAAACCTCGCTTGGATCCTCCTCG
CTTATCTCTTCATGGTGACGGTGGCGGGATACACAGCAGGGCAGCGTGCGAAGCACGTGCCTCGGGGGAAGTTGGTGGCCGGAGCTTCAATTTTGGCCGGCACTTCGGTG
ACAATGGTGATGCTAGTGGTGTTGAAAGTGTTTCCGTTAACTCCAAGGTACATAATCCCTGTCGCCGGAATGATGGTCGGAAATTCCATGACTGTTACCGGAGTCGCCAT
GAGAAGACTCCGGGACGATATCAGAACTCAATTCAGCCTCGTGGAGACTGCATTAGCTCTCGGAGCTACGCCGCGGCAAGCGACGCACCAGCAAGTGAAGAGGGCGCTGG
TGCTAGCGCTGTCGCCGGTGGTCGACAACGCGAAGACGGTGGGCCTGATCTCGCTGCCGGGGGCGATGACCGGACTGATAATGGGCGGAGCGTCGCCGATTGAAGCCATT
CAGCTGCAAATTGTGGTGATGAACTTTCTCATCGGGGCTTCCACGATCAGTAGCATTATGTCCACTTACCTCTGCTGGCCTTCCTTCTTCACCGCCGCCTACCAGTTGGA
AACCACCGTCTTTGCCGCCGCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CGAAGGCGAAATGATCTACGCCATTTCCAGAGCCTTTCTTCAGCTCTCTGTTATTGGCTTTGTTCTTCAGTTCATCTTCAACCAGCAAAACCTCGCTTGGATCCTCCTCG
CTTATCTCTTCATGGTGACGGTGGCGGGATACACAGCAGGGCAGCGTGCGAAGCACGTGCCTCGGGGGAAGTTGGTGGCCGGAGCTTCAATTTTGGCCGGCACTTCGGTG
ACAATGGTGATGCTAGTGGTGTTGAAAGTGTTTCCGTTAACTCCAAGGTACATAATCCCTGTCGCCGGAATGATGGTCGGAAATTCCATGACTGTTACCGGAGTCGCCAT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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TMVMLVVLKVFPLTPRYIIPVAGMMVGNSMTVTGVAMRRLRDDIRTQFSLVETALALGATPRQATHQQVKRALVLALSPVVDNAKTVGLISLPGAMTGLIMGGASPIEAI
QLQIVVMNFLIGASTISSIMSTYLCWPSFFTAAYQLETTVFAAA