; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg01453 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg01453
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiontranscription repressor KAN1-like isoform X3
Genome locationCarg_Chr15:3912500..3913155
RNA-Seq ExpressionCarg01453
SyntenyCarg01453
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0010158 - abaxial cell fate specification (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006447 - Myb domain, plants
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain
IPR044847 - Transcription repressor KANADI


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7016565.1 putative transcription factor KAN3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.0e-96100Show/hide
Query:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK
        MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK
Subjt:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK

Query:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
Subjt:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ

XP_022992744.1 probable transcription factor KAN2 isoform X1 [Cucurbita maxima]5.0e-8388.54Show/hide
Query:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK
        MPNTQSSSSSSSSS        FLDLSLQISPP NSTFPTSIEASNGVLGAHKFN +TNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQI+GFPIHPNNPSSFSWKHSK
Subjt:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK

Query:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        QM      SSSSSI YSNISSFRYQ+NAGRSS GARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKS+LELMDVKDLTLAHVKSHLQ
Subjt:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ

XP_022992745.1 probable transcription factor KAN2 isoform X2 [Cucurbita maxima]5.0e-8388.54Show/hide
Query:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK
        MPNTQSSSSSSSSS        FLDLSLQISPP NSTFPTSIEASNGVLGAHKFN +TNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQI+GFPIHPNNPSSFSWKHSK
Subjt:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK

Query:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        QM      SSSSSI YSNISSFRYQ+NAGRSS GARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKS+LELMDVKDLTLAHVKSHLQ
Subjt:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ

XP_022992746.1 probable transcription factor KAN2 isoform X3 [Cucurbita maxima]5.0e-8388.54Show/hide
Query:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK
        MPNTQSSSSSSSSS        FLDLSLQISPP NSTFPTSIEASNGVLGAHKFN +TNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQI+GFPIHPNNPSSFSWKHSK
Subjt:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK

Query:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        QM      SSSSSI YSNISSFRYQ+NAGRSS GARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKS+LELMDVKDLTLAHVKSHLQ
Subjt:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ

XP_023549836.1 probable transcription factor KAN2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.9e-8489.58Show/hide
Query:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK
        MPNTQS+SSSSSSSSS      FLDLSLQISPPINSTFPTSIE SNGVLGAHKFNQITN VWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK
Subjt:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK

Query:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        QM      S SSSISYSNISSFRYQ+NAGRSS GARGRGVRAPRMRWTR+LHAQFVHAVELLGGHERATPKS+LELMDVKDLTLAHVKSHLQ
Subjt:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CJ01 probable transcription factor KAN28.7e-4162.33Show/hide
Query:  MPNTQ-----SSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPP---IN-STFPT-SIEASNG---VLGAHKF-----NQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIH
        MPN Q      SSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPP   IN STFPT +IE SNG    L  H +     NQI NGV L  HH  P          I+
Subjt:  MPNTQ-----SSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPP---IN-STFPT-SIEASNG---VLGAHKF-----NQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIH

Query:  GFPIHPNNPSSFSWKHSKQMLSS---SSSSSSSSISYSNISS--FRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELM
        GFPIHP NPS F   + KQ L+S   S +SSSSSIS   +      Y +++ R S  ARGR +RAPRMRWT +LHAQFVHAVELLGGHERATPKS+LELM
Subjt:  GFPIHPNNPSSFSWKHSKQMLSS---SSSSSSSSISYSNISS--FRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELM

Query:  DVKDLTLAHVKSHLQ
        DVKDLTLAHVKSHLQ
Subjt:  DVKDLTLAHVKSHLQ

A0A6J1CIH2 probable transcription factor KAN22.1e-3957.62Show/hide
Query:  MPNT----QSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGA--------------HKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIH
        MPN         SSSSSSSSSSSSTP LDLSLQISPP N++  T+IE S+   GA               KFNQ  NGVWLL        DHHGLF  I+
Subjt:  MPNT----QSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGA--------------HKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIH

Query:  GFPIHPNNPSSFSWKHSKQMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDL
        GFPIH   PS  S        SSSS+S      +++    RYQ+++ R ++ ARGR  RAPRMRWT +LHAQFVHAVELLGGHERATPKS+LELMDVKDL
Subjt:  GFPIHPNNPSSFSWKHSKQMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDL

Query:  TLAHVKSHLQ
        TLAHVKSHLQ
Subjt:  TLAHVKSHLQ

A0A6J1JUE6 probable transcription factor KAN2 isoform X32.4e-8388.54Show/hide
Query:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK
        MPNTQSSSSSSSSS        FLDLSLQISPP NSTFPTSIEASNGVLGAHKFN +TNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQI+GFPIHPNNPSSFSWKHSK
Subjt:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK

Query:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        QM      SSSSSI YSNISSFRYQ+NAGRSS GARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKS+LELMDVKDLTLAHVKSHLQ
Subjt:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ

A0A6J1JWK5 probable transcription factor KAN2 isoform X22.4e-8388.54Show/hide
Query:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK
        MPNTQSSSSSSSSS        FLDLSLQISPP NSTFPTSIEASNGVLGAHKFN +TNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQI+GFPIHPNNPSSFSWKHSK
Subjt:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK

Query:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        QM      SSSSSI YSNISSFRYQ+NAGRSS GARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKS+LELMDVKDLTLAHVKSHLQ
Subjt:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ

A0A6J1JYC7 probable transcription factor KAN2 isoform X12.4e-8388.54Show/hide
Query:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK
        MPNTQSSSSSSSSS        FLDLSLQISPP NSTFPTSIEASNGVLGAHKFN +TNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQI+GFPIHPNNPSSFSWKHSK
Subjt:  MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSK

Query:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        QM      SSSSSI YSNISSFRYQ+NAGRSS GARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKS+LELMDVKDLTLAHVKSHLQ
Subjt:  QMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0J235 Probable transcription factor RL92.3e-2290.91Show/hide
Query:  RGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        R +RAPRMRWT TLHA+FVHAVELLGGHERATPKS+LELMDVKDLTLAHVKSHLQ
Subjt:  RGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ

Q93WJ9 Transcription repressor KAN16.1e-1535.9Show/hide
Query:  QSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSKQMLS
        +SS  SS   +++ SS   L LS    P             N     H  N I NGV    H      +   L   I G P++ N   SF +      L 
Subjt:  QSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSKQMLS

Query:  SSSSSSSSSISYSNISS-FRYQMNAGRSSMGARG---------------------------------------------RGVRAPRMRWTRTLHAQFVHA
        S        IS  N SS +     + +SS   +G                                             R +RAPRMRWT +LHA+FVHA
Subjt:  SSSSSSSSSISYSNISS-FRYQMNAGRSSMGARG---------------------------------------------RGVRAPRMRWTRTLHAQFVHA

Query:  VELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        VELLGGHERATPKS+LELMDVKDLTLAHVKSHLQ
Subjt:  VELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ

Q941I2 Probable transcription factor KAN31.8e-1948.03Show/hide
Query:  LFNQIHGFPIHPN-----------NPSSFSWKHSKQMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGH
        +   I G P++ N           +P+ F +       +S    ++ + S++  +  R Q         A+ RGVRAPRMRWT TLHA FVHAV+LLGGH
Subjt:  LFNQIHGFPIHPN-----------NPSSFSWKHSKQMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGH

Query:  ERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        ERATPKS+LELMDV+DLTLAHVKSHLQ
Subjt:  ERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ

Q9C616 Probable transcription factor KAN29.6e-2141.98Show/hide
Query:  SSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSL---------------QISPPINST-------FPTSIEASN--GVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIH
        +SS  S+S+S + + PF DLSL               Q+ P  NS+       FPT  +  +  G L AH  N     +  +  +  P   HH       
Subjt:  SSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSL---------------QISPPINST-------FPTSIEASN--GVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIH

Query:  GFPIHPNNPSSFSWKHSKQMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQ-MNAGR-SSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVK
         FP  P++    S   S  +  +++S ++SS+S  N  +  +Q +N  R        R +RAPRMRWT TLHA+FVHAVELLGGHERATPKS+LELMDVK
Subjt:  GFPIHPNNPSSFSWKHSKQMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQ-MNAGR-SSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVK

Query:  DLTLAHVKSHLQ
        DLTLAHVKSHLQ
Subjt:  DLTLAHVKSHLQ

Q9FJV5 Probable transcription factor KAN45.1e-2282.26Show/hide
Query:  SSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        SSM    R +RAPRMRWT TLHA FVHAV+LLGGHERATPKS+LELM+VKDLTLAHVKSHLQ
Subjt:  SSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32240.1 Homeodomain-like superfamily protein6.9e-2241.98Show/hide
Query:  SSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSL---------------QISPPINST-------FPTSIEASN--GVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIH
        +SS  S+S+S + + PF DLSL               Q+ P  NS+       FPT  +  +  G L AH  N     +  +  +  P   HH       
Subjt:  SSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSL---------------QISPPINST-------FPTSIEASN--GVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIH

Query:  GFPIHPNNPSSFSWKHSKQMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQ-MNAGR-SSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVK
         FP  P++    S   S  +  +++S ++SS+S  N  +  +Q +N  R        R +RAPRMRWT TLHA+FVHAVELLGGHERATPKS+LELMDVK
Subjt:  GFPIHPNNPSSFSWKHSKQMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQ-MNAGR-SSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVK

Query:  DLTLAHVKSHLQ
        DLTLAHVKSHLQ
Subjt:  DLTLAHVKSHLQ

AT4G17695.1 Homeodomain-like superfamily protein1.3e-2048.03Show/hide
Query:  LFNQIHGFPIHPN-----------NPSSFSWKHSKQMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGH
        +   I G P++ N           +P+ F +       +S    ++ + S++  +  R Q         A+ RGVRAPRMRWT TLHA FVHAV+LLGGH
Subjt:  LFNQIHGFPIHPN-----------NPSSFSWKHSKQMLSSSSSSSSSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGH

Query:  ERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        ERATPKS+LELMDV+DLTLAHVKSHLQ
Subjt:  ERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ

AT5G16560.1 Homeodomain-like superfamily protein4.3e-1635.9Show/hide
Query:  QSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSKQMLS
        +SS  SS   +++ SS   L LS    P             N     H  N I NGV    H      +   L   I G P++ N   SF +      L 
Subjt:  QSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSKQMLS

Query:  SSSSSSSSSISYSNISS-FRYQMNAGRSSMGARG---------------------------------------------RGVRAPRMRWTRTLHAQFVHA
        S        IS  N SS +     + +SS   +G                                             R +RAPRMRWT +LHA+FVHA
Subjt:  SSSSSSSSSISYSNISS-FRYQMNAGRSSMGARG---------------------------------------------RGVRAPRMRWTRTLHAQFVHA

Query:  VELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        VELLGGHERATPKS+LELMDVKDLTLAHVKSHLQ
Subjt:  VELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ

AT5G42630.1 Homeodomain-like superfamily protein3.6e-2382.26Show/hide
Query:  SSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        SSM    R +RAPRMRWT TLHA FVHAV+LLGGHERATPKS+LELM+VKDLTLAHVKSHLQ
Subjt:  SSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ

AT5G42630.2 Homeodomain-like superfamily protein3.6e-2382.26Show/hide
Query:  SSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ
        SSM    R +RAPRMRWT TLHA FVHAV+LLGGHERATPKS+LELM+VKDLTLAHVKSHLQ
Subjt:  SSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCCAACACTCAGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAACCCCATTTCTTGATCTTTCTCTTCAAATTAGTCCTCCCATTAATTCAAC
CTTCCCTACCTCTATTGAAGCCTCCAATGGAGTTCTTGGGGCTCATAAATTCAATCAAATAACTAATGGGGTTTGGCTTTTGGATCATCATCTTCCACCTTCTGAAGATC
ATCATGGCCTCTTCAACCAAATTCATGGCTTCCCAATTCATCCCAATAATCCTTCATCTTTCTCTTGGAAACACTCCAAACAAATGCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT
TCTTCTTCAATCTCGTACTCGAACATCTCTAGCTTCCGGTACCAGATGAACGCTGGCCGGTCGTCGATGGGGGCGAGAGGACGAGGCGTGAGGGCGCCGAGGATGCGGTG
GACGAGGACCCTCCATGCTCAGTTTGTTCATGCTGTTGAGCTTCTTGGCGGCCATGAAAGAGCTACGCCTAAATCAATTCTAGAGCTCATGGATGTGAAGGATCTAACAT
TGGCTCACGTCAAAAGCCATTTACAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCCAACACTCAGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAACCCCATTTCTTGATCTTTCTCTTCAAATTAGTCCTCCCATTAATTCAAC
CTTCCCTACCTCTATTGAAGCCTCCAATGGAGTTCTTGGGGCTCATAAATTCAATCAAATAACTAATGGGGTTTGGCTTTTGGATCATCATCTTCCACCTTCTGAAGATC
ATCATGGCCTCTTCAACCAAATTCATGGCTTCCCAATTCATCCCAATAATCCTTCATCTTTCTCTTGGAAACACTCCAAACAAATGCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT
TCTTCTTCAATCTCGTACTCGAACATCTCTAGCTTCCGGTACCAGATGAACGCTGGCCGGTCGTCGATGGGGGCGAGAGGACGAGGCGTGAGGGCGCCGAGGATGCGGTG
GACGAGGACCCTCCATGCTCAGTTTGTTCATGCTGTTGAGCTTCTTGGCGGCCATGAAAGAGCTACGCCTAAATCAATTCTAGAGCTCATGGATGTGAAGGATCTAACAT
TGGCTCACGTCAAAAGCCATTTACAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPNTQSSSSSSSSSSSSSSSTPFLDLSLQISPPINSTFPTSIEASNGVLGAHKFNQITNGVWLLDHHLPPSEDHHGLFNQIHGFPIHPNNPSSFSWKHSKQMLSSSSSSS
SSSISYSNISSFRYQMNAGRSSMGARGRGVRAPRMRWTRTLHAQFVHAVELLGGHERATPKSILELMDVKDLTLAHVKSHLQ