; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg01640 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg01640
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionalpha-(1,4)-fucosyltransferase-like
Genome locationCarg_Chr15:2801214..2804385
RNA-Seq ExpressionCarg01640
SyntenyCarg01640
Gene Ontology termsGO:0006486 - protein glycosylation (biological process)
GO:0036065 - fucosylation (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0032580 - Golgi cisterna membrane (cellular component)
GO:0008417 - fucosyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001503 - Glycosyl transferase family 10
IPR017177 - Alpha-(1, 3)-fucosyltransferase/alpha-(1, 4)-fucosyltransferase, plant
IPR038577 - GT10-like, C-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578850.1 Alpha-(1,4)-fucosyltransferase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-23297.78Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6A198 Alpha-(1,3)-fucosyltransferase 104.2e-1829.01Show/hide
Query:  ALFFETSTPPRQRLRGDPLRIYMDLEAGRKRSGFEDLFVSYHAEDDVQSTYAGALFHNGRNY----HDTLVYWSSSRCLP--QRNQLARKLLSLLPHHSF
        ALF E S     +L   P+    +  A   R     L   Y    +V ++    +    +N+       LVY  S  C P   R+   R+L++ +   S+
Subjt:  ALFFETSTPPRQRLRGDPLRIYMDLEAGRKRSGFEDLFVSYHAEDDVQSTYAGALFHNGRNY----HDTLVYWSSSRCLP--QRNQLARKLLSLLPHHSF

Query:  GKCLNNVGGLDMALDMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSHYKFVLAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSLEEL
        G+CL N         + P+ +N AS+     D     ++ YKF+LA EN + + Y+TEKL+  L  G VP+Y+G+P++ D++P + S I  S+FS   EL
Subjt:  GKCLNNVGGLDMALDMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSHYKFVLAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSLEEL

Query:  ASYVKRLADDPLAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS--------------LDTLPCRVCNAV
        ASY++ L  D   Y  Y  W+    + N R   A                +D   C VC  V
Subjt:  ASYVKRLADDPLAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS--------------LDTLPCRVCNAV

Q6A1G3 Alpha-(1,3)-fucosyltransferase 101.2e-1734.93Show/hide
Query:  SRCLP--QRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALDMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSHYKFVLAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGA
        S C P   R+   ++L+  +   S+G+CL+N        D+  +  N +S+    + H+   ++ YKF+LA EN + E Y+TEKL+  L  G+VP+YFGA
Subjt:  SRCLP--QRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALDMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSHYKFVLAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGA

Query:  PNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPLAYAEYHAWR
        PNV +++P + S I   +FS  +ELA+Y+K+L  +   Y ++  W+
Subjt:  PNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPLAYAEYHAWR

Q6NTZ6 Alpha-(1,3)-fucosyltransferase 101.9e-1832.09Show/hide
Query:  SRCLP--QRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALDMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSHYKFVLAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGA
        S C P   R+   ++L+  +   S+G+CL+N           P+  N+ S         H  +  YKF+LA EN + E Y+TEKL+  L  G+VP+YFGA
Subjt:  SRCLP--QRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALDMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSHYKFVLAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGA

Query:  PNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPLAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS--------------LDTLPCRVCNAV
        PNV D++P + S I  S+FS  ++LA+Y+K+L  +   Y ++  W+    + N R   A +              +D   C VC  V
Subjt:  PNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPLAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS--------------LDTLPCRVCNAV

Q6P4F1 Alpha-(1,3)-fucosyltransferase 102.5e-1832.64Show/hide
Query:  LVYWSSSRCLP--QRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALDMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSHYKFVLAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSV
        LVY  S  C P   R+   R+L++ +   S+G+CL N        D+  +  N AS+     D  +  ++ YKF+LA EN + + Y+TEK +  L  G V
Subjt:  LVYWSSSRCLP--QRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALDMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSHYKFVLAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSV

Query:  PIYFGAPNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPLAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS--------------LDTLPCRVCNAV
        P+Y+G+P++ D++P + S I  S+FS   ELASY++RL  D   Y  Y  W+    + N R   A                +D   C VC  V
Subjt:  PIYFGAPNVWDFVPPH-SIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPLAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS--------------LDTLPCRVCNAV

Q9C8W3 Alpha-(1,4)-fucosyltransferase4.4e-16167.41Show/hide
Query:  MLLKPFNTVAVVFMLAFVFFILFFTGFLEFPPASTSIVPAADDLNLSVAEFAFDPFSDLITAFKKWDSQVGCDRFREKISGGLGNGSSSTSLQLVGGESN
        M ++  N +A + M+ F   IL FTG LEFP ASTS+  + D     +++   DPFSD++ A+KKWD +VGC RFRE     +    SS SLQ  G    
Subjt:  MLLKPFNTVAVVFMLAFVFFILFFTGFLEFPPASTSIVPAADDLNLSVAEFAFDPFSDLITAFKKWDSQVGCDRFREKISGGLGNGSSSTSLQLVGGESN

Query:  SECGGLKLNHVSVLVKGWTWIPDNLDNLYSCSCGLSCLWTKSSVLADKPDALFFETSTPPRQRLRGDPLRIYMDLEAGRKRSGFEDLFVSYHAEDDVQST
          CG LK+ HV VLVKGWTWIPDNL+NLYSC CG++CLWTKSSVLAD PDAL FET+TPP QR  GDPLR+YM+LEAGRKRSG ED+F+SYHA+DDVQ+T
Subjt:  SECGGLKLNHVSVLVKGWTWIPDNLDNLYSCSCGLSCLWTKSSVLADKPDALFFETSTPPRQRLRGDPLRIYMDLEAGRKRSGFEDLFVSYHAEDDVQST

Query:  YAGALFHNGRNYH-------DTLVYWSSSRCLPQRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALDMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSHYKFVLAIEN
        YAG+LFHN RNYH       D LVYWSSSRCLP R++LA+ LL L+PHHSFGKCLNNVGGLD AL MYPEC  + +   KW+DHLHCAMSHYKFVLAIEN
Subjt:  YAGALFHNGRNYH-------DTLVYWSSSRCLPQRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALDMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSHYKFVLAIEN

Query:  TMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPLAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAASLDTLPCRVCNAVSR
        T  ESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGA NV DFVPPHS+IDGSKF S++ELA+YVKRL DDP+AY+EYHAWRRC  +GNY +TRA SLDTLPCR+C  +SR
Subjt:  TMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPLAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAASLDTLPCRVCNAVSR

Query:  RGGRN
        RGG+N
Subjt:  RGGRN

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G49710.1 fucosyltransferase 126.0e-1234.78Show/hide
Query:  AMSHYKFVLAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVP-PHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPLAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS
        A+  YKF LA ENT  E YVTEK F +L +GSVP+  G PN+ +F P   S +       +E +A  +K LA +P AY +   W+      +++     +
Subjt:  AMSHYKFVLAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVP-PHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPLAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS

Query:  LDTLPCRVCNAVSRR
             CR+C  ++ R
Subjt:  LDTLPCRVCNAVSRR

AT1G71990.1 fucosyltransferase 133.1e-16267.41Show/hide
Query:  MLLKPFNTVAVVFMLAFVFFILFFTGFLEFPPASTSIVPAADDLNLSVAEFAFDPFSDLITAFKKWDSQVGCDRFREKISGGLGNGSSSTSLQLVGGESN
        M ++  N +A + M+ F   IL FTG LEFP ASTS+  + D     +++   DPFSD++ A+KKWD +VGC RFRE     +    SS SLQ  G    
Subjt:  MLLKPFNTVAVVFMLAFVFFILFFTGFLEFPPASTSIVPAADDLNLSVAEFAFDPFSDLITAFKKWDSQVGCDRFREKISGGLGNGSSSTSLQLVGGESN

Query:  SECGGLKLNHVSVLVKGWTWIPDNLDNLYSCSCGLSCLWTKSSVLADKPDALFFETSTPPRQRLRGDPLRIYMDLEAGRKRSGFEDLFVSYHAEDDVQST
          CG LK+ HV VLVKGWTWIPDNL+NLYSC CG++CLWTKSSVLAD PDAL FET+TPP QR  GDPLR+YM+LEAGRKRSG ED+F+SYHA+DDVQ+T
Subjt:  SECGGLKLNHVSVLVKGWTWIPDNLDNLYSCSCGLSCLWTKSSVLADKPDALFFETSTPPRQRLRGDPLRIYMDLEAGRKRSGFEDLFVSYHAEDDVQST

Query:  YAGALFHNGRNYH-------DTLVYWSSSRCLPQRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALDMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSHYKFVLAIEN
        YAG+LFHN RNYH       D LVYWSSSRCLP R++LA+ LL L+PHHSFGKCLNNVGGLD AL MYPEC  + +   KW+DHLHCAMSHYKFVLAIEN
Subjt:  YAGALFHNGRNYH-------DTLVYWSSSRCLPQRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALDMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSHYKFVLAIEN

Query:  TMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPLAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAASLDTLPCRVCNAVSR
        T  ESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGA NV DFVPPHS+IDGSKF S++ELA+YVKRL DDP+AY+EYHAWRRC  +GNY +TRA SLDTLPCR+C  +SR
Subjt:  TMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPLAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAASLDTLPCRVCNAVSR

Query:  RGGRN
        RGG+N
Subjt:  RGGRN

AT3G19280.1 fucosyltransferase 112.6e-1538.26Show/hide
Query:  AMSHYKFVLAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVP-PHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPLAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS
        A+ HYKF LA ENT  E YVTEK F +L +GSVP+  GAPN+ +F P P S +   +   ++ +A  +K LAD+P AY +   W+      +++     +
Subjt:  AMSHYKFVLAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVP-PHSIIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPLAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAAS

Query:  LDTLPCRVCNAVSRR
             CR+C  V+ R
Subjt:  LDTLPCRVCNAVSRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTCTTGAAGCCCTTCAACACCGTTGCCGTCGTATTCATGCTCGCTTTCGTGTTCTTCATCCTTTTCTTCACTGGCTTTCTCGAATTTCCGCCGGCATCCACTTCCAT
CGTACCGGCCGCCGATGATCTGAATCTATCCGTAGCCGAGTTCGCTTTCGATCCTTTCTCCGATTTGATCACCGCCTTTAAGAAATGGGACTCTCAGGTTGGTTGCGATC
GATTTCGGGAGAAAATTAGCGGCGGTTTGGGAAATGGATCTTCGTCGACTTCGCTGCAGCTTGTCGGCGGCGAGTCTAATTCGGAATGTGGAGGGCTGAAACTGAATCAT
GTCTCTGTTTTGGTGAAAGGATGGACATGGATTCCTGATAATTTAGACAATTTGTATTCGTGTTCTTGTGGATTGAGCTGTCTTTGGACTAAATCTTCTGTTCTCGCCGA
TAAACCCGACGCCTTGTTCTTCGAGACCAGTACGCCTCCGCGTCAGAGGCTCAGGGGTGATCCTCTCCGTATTTATATGGATCTCGAGGCTGGTCGGAAGCGCTCAGGTT
TTGAGGATCTATTCGTTAGTTATCATGCGGAAGACGATGTTCAGTCAACCTATGCAGGAGCACTCTTTCACAATGGTCGAAACTATCACGATACGCTCGTTTATTGGTCG
TCGTCTCGTTGTCTTCCCCAACGAAATCAGCTTGCTAGGAAGCTTCTAAGCTTGCTGCCTCACCATTCATTTGGCAAGTGCTTGAACAATGTAGGCGGGCTTGACATGGC
CCTTGATATGTACCCTGAATGTGCAAACGATGCCAGTGTCACCCCAAAATGGTGGGATCACTTGCATTGTGCAATGTCTCATTACAAATTCGTTCTAGCAATCGAAAACA
CGATGACCGAGAGTTACGTGACGGAGAAGCTATTTTATGCGCTAGATTCCGGTTCGGTTCCGATCTATTTTGGTGCTCCCAATGTCTGGGACTTTGTCCCTCCACATTCC
ATAATTGATGGGTCTAAATTCAGCTCGTTGGAAGAGTTAGCTTCTTATGTAAAACGACTTGCTGATGATCCGCTAGCTTATGCTGAATACCATGCTTGGAGACGATGCCG
TGCGTTGGGCAACTATAGGAGGACCCGAGCTGCAAGCCTCGACACGCTGCCGTGCCGGGTATGTAATGCTGTGAGCAGAAGGGGTGGTAGAAATGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTCTTGAAGCCCTTCAACACCGTTGCCGTCGTATTCATGCTCGCTTTCGTGTTCTTCATCCTTTTCTTCACTGGCTTTCTCGAATTTCCGCCGGCATCCACTTCCAT
CGTACCGGCCGCCGATGATCTGAATCTATCCGTAGCCGAGTTCGCTTTCGATCCTTTCTCCGATTTGATCACCGCCTTTAAGAAATGGGACTCTCAGGTTGGTTGCGATC
GATTTCGGGAGAAAATTAGCGGCGGTTTGGGAAATGGATCTTCGTCGACTTCGCTGCAGCTTGTCGGCGGCGAGTCTAATTCGGAATGTGGAGGGCTGAAACTGAATCAT
GTCTCTGTTTTGGTGAAAGGATGGACATGGATTCCTGATAATTTAGACAATTTGTATTCGTGTTCTTGTGGATTGAGCTGTCTTTGGACTAAATCTTCTGTTCTCGCCGA
TAAACCCGACGCCTTGTTCTTCGAGACCAGTACGCCTCCGCGTCAGAGGCTCAGGGGTGATCCTCTCCGTATTTATATGGATCTCGAGGCTGGTCGGAAGCGCTCAGGTT
TTGAGGATCTATTCGTTAGTTATCATGCGGAAGACGATGTTCAGTCAACCTATGCAGGAGCACTCTTTCACAATGGTCGAAACTATCACGATACGCTCGTTTATTGGTCG
TCGTCTCGTTGTCTTCCCCAACGAAATCAGCTTGCTAGGAAGCTTCTAAGCTTGCTGCCTCACCATTCATTTGGCAAGTGCTTGAACAATGTAGGCGGGCTTGACATGGC
CCTTGATATGTACCCTGAATGTGCAAACGATGCCAGTGTCACCCCAAAATGGTGGGATCACTTGCATTGTGCAATGTCTCATTACAAATTCGTTCTAGCAATCGAAAACA
CGATGACCGAGAGTTACGTGACGGAGAAGCTATTTTATGCGCTAGATTCCGGTTCGGTTCCGATCTATTTTGGTGCTCCCAATGTCTGGGACTTTGTCCCTCCACATTCC
ATAATTGATGGGTCTAAATTCAGCTCGTTGGAAGAGTTAGCTTCTTATGTAAAACGACTTGCTGATGATCCGCTAGCTTATGCTGAATACCATGCTTGGAGACGATGCCG
TGCGTTGGGCAACTATAGGAGGACCCGAGCTGCAAGCCTCGACACGCTGCCGTGCCGGGTATGTAATGCTGTGAGCAGAAGGGGTGGTAGAAATGGATGAGCTTATCTAG
TTTTTTTTTTTTGGCTGCCATTGTTCCTCTGTTGTTTTTCACTGTGATGGGGTTTGTTTTTGTTGTCACCAGTAGACAGGGGAATGGGTTTGGCGTGTAAGGAAATGAAT
GTAGGTAGAAATATCATAAATAATCAGAGAAAAATATATTTTATTTATTATAATTACTCGGTCATATGTTATATTCGTGAGATCGATTGGAGACGGGAACAAAACATTCA
TTTTGAGGTTGACAGTGATATGTAATAGACAAAACCGTACAATATCTGCAAATGATAGGTTTGTGCTGTTATAGTGGTATCAGAAGCAGACATCGTTTCACCCTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLLKPFNTVAVVFMLAFVFFILFFTGFLEFPPASTSIVPAADDLNLSVAEFAFDPFSDLITAFKKWDSQVGCDRFREKISGGLGNGSSSTSLQLVGGESNSECGGLKLNH
VSVLVKGWTWIPDNLDNLYSCSCGLSCLWTKSSVLADKPDALFFETSTPPRQRLRGDPLRIYMDLEAGRKRSGFEDLFVSYHAEDDVQSTYAGALFHNGRNYHDTLVYWS
SSRCLPQRNQLARKLLSLLPHHSFGKCLNNVGGLDMALDMYPECANDASVTPKWWDHLHCAMSHYKFVLAIENTMTESYVTEKLFYALDSGSVPIYFGAPNVWDFVPPHS
IIDGSKFSSLEELASYVKRLADDPLAYAEYHAWRRCRALGNYRRTRAASLDTLPCRVCNAVSRRGGRNG