CuGenDBv2

Gene ID	Carg01664
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	Nuclear pore complex protein NUP1-like
Genome location	Carg_Chr15:2688029..2696205
RNA-Seq Expression	Carg01664
Synteny	Carg01664
Gene Ontology terms	GO:0016973 - poly(A)+ mRNA export from nucleus (biological process) GO:0071763 - nuclear membrane organization (biological process) GO:0005635 - nuclear envelope (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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KAG7016358.1 Nuclear pore complex protein NUP1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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        FGEK PSQKDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPAST TENGNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAKAGSA
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        SVFKSESSSSS LSFGVPKE +SEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNITNQNSSIK
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Query:  PSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSSSAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNK
        PSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPS+SAP+G GSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNK
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        +PEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGN+LVGSSAPASNLF SGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSSSFFN
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        WQASS PSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAASSS PMLFGSS+TGAASTTSMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDHANMEDSMAEDTVQ
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        TVA PTPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV TPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK
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XP_023550414.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

0.0e+00

98.38

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        MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSL ISREANDE EIKN EEVA
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        ADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMV  TPVISYDIQEGSPKFPAQEGVRPHMVPTH
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        VVNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDTFALGNP KSSTLSLVPRSPGNFDVENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRATPSI
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        KNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQGALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETS HL STKV+PFSST
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        AGKAPYSSETKRNL K+SA SENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENV
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        EDI SNDGRDLTSKKNDKFEDSSLLKSKVPSDKSISTGGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVAAKSFERR
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        EKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPS VSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTAN+IEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFG
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        FGEKLPSQKD VFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNS+AGSPFKFASSLVNEK GAKAGSA
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Query:  SVFKSESSSSSTLSFGVPKESISEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNITNQNSSIK
        SVFKSESSSSSTLSFGVPKESISEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNITNQNSSIK
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Query:  PSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSSSAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNK
        PSLNAATS+SEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSSSAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGA STTSDSNK
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Query:  QPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNTLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSSSFFN
        QPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGN+LVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSSSFFN
Subjt:  QPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNTLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSSSFFN

Query:  WQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAASSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDHANMEDSMAEDTVQT
        WQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAASSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDHANMEDSMAEDTVQT
Subjt:  WQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAASSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDHANMEDSMAEDTVQT

Query:  VASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK
        VASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK
Subjt:  VASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3C4Z3 nuclear pore complex protein NUP1-like

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        MATEREEV+YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFS+VFRKRLPPPPPS  +SREAN+E E +N EEVA
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Query:  ADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFP--AQEGVRPHMVP
        ADP GTQEGTN  FVPSINS+N  G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE V STPV S+ +QEGSPKFP  +Q+GV PHM P
Subjt:  ADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFP--AQEGVRPHMVP

Query:  THVVNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDTFALGNPTKSSTLSLVPRSPGNFD-VENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRAT
        THVVNANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSM             GNP+KSSTLSLVPRSPGNFD VEN FVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
Subjt:  THVVNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDTFALGNPTKSSTLSLVPRSPGNFD-VENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRAT

Query:  PSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQGALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVYPF
        PSIKNS+ATTD+YRAT +SSSQSAWEQG LL S QGALKRR+SVLDD++GSVGPIRR R KSN LFP GLSLPSSSTSIP SGI SET++HLQSTKV+PF
Subjt:  PSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQGALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVYPF

Query:  SSTAGKAPYSSETKRNLFKMSAVSENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL
        SS  GK  YSSET+RN  K SA S+N  TPSSSFP+IPLRSSEMA KILEQLD LTPPKEKSSELKL SVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE+VDSAKYL
Subjt:  SSTAGKAPYSSETKRNLFKMSAVSENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL

Query:  ENVEDIWSNDGRDLTSKKNDKFEDSSLLKSKVPSDKSISTGGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVAAKSF
        ENVE I SND  D TS+KNDKFE+SS  KS VP+DKSIST  GVGSSVP+KD  S SG+QVSFVGPS  TKCAFQMS  EDFVDMD+E +SNGPVA KSF
Subjt:  ENVEDIWSNDGRDLTSKKNDKFEDSSLLKSKVPSDKSISTGGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVAAKSF

Query:  ERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANMIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAP
        E REKVDDSLV+V KP +TEAITV K + SI+AKPS VS M KINDQ KSDVP TTEKS IFSFPT S  S+TAN+  PES+ RPEK+AS E+PKAA AP
Subjt:  ERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANMIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAP

Query:  IFGFGEKLPSQKDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAK-
        IFGFGEK PSQK+ +   PTF FG+K TT TNEQNA+P VTSE N  PT  AS PTTFKFGDKA+F IPA+ ATENGN  AGS FKF S LVNEKEGA  
Subjt:  IFGFGEKLPSQKDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAK-

Query:  AGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESISEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVS---STPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGS-TPSTFPSPSNTFPSNI
         GSASVFK+E+SSSS  SFGVPKES+SEKAGD KSSS GL  GTSGNL  SS S   STPTPSLFSFSSP+TNSNL NGSL S TPST P+P+ TF +N+
Subjt:  AGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESISEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVS---STPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGS-TPSTFPSPSNTFPSNI

Query:  TNQNSSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSS-----SAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVF
        T+QNSSIKPS  AATSNSEPVT+TS   SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPS+     SAPSGVGSVE KTK ETT FGN+SG+ PSDT+A KV STGSSVF
Subjt:  TNQNSSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSS-----SAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVF

Query:  QFGAASTTSDSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNTLVGSSAPASNLFTSGATFGF-GSSSSANN
        QFGAASTTSD+NK P  STFA  ++P+FGAPV  +SSG+ASSTQSTP   F SSSTSFGLTGNTGLASG++L GSSAPASN FTSGATFG   SSSSANN
Subjt:  QFGAASTTSDSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNTLVGSSAPASNLFTSGATFGF-GSSSSANN

Query:  SVSSGAGTSSSFFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAAS-SSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPA-NN
        SVSS AGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STP+GGFSFGL+SSS+AS S+PM+FGSS+TG AS  SMFSFTSAA+A +SQPAFGNSN+ FTFGSTPPA NN
Subjt:  SVSSGAGTSSSFFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAAS-SSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPA-NN

Query:  DHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNR
        + A+MEDSMAEDTVQT    +PMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV  PQNP+PFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNR
Subjt:  DHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNR

Query:  KFVKVKSKSRKK
        K+VKVKSKSRKK
Subjt:  KFVKVKSKSRKK

A0A6J1FF52 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1

0.0e+00

98.08

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Query:  MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISREANDETEIKNLEEVA
        MATERE V YEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPP ALRNS GKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISREANDE EIKN EEVA
Subjt:  MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISREANDETEIKNLEEVA

Query:  ADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGVRPHMVPTH
        ADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGVRPHMVPTH
Subjt:  ADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGVRPHMVPTH

Query:  VVNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDTFALGNPTKSSTLSLVPRSPGNFDVENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRATPSI
        V+NANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDTFALGNP+KSSTLSLVPRSPGNFDVENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRATPSI
Subjt:  VVNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDTFALGNPTKSSTLSLVPRSPGNFDVENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRATPSI

Query:  KNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQGALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVYPFSST
        KNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQGALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKV+PFSS 
Subjt:  KNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQGALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVYPFSST

Query:  AGKAPYSSETKRNLFKMSAVSENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENV
        AGKAPYSSETKRNL KMSA SENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENV
Subjt:  AGKAPYSSETKRNLFKMSAVSENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENV

Query:  EDIWSNDGRDLTSKKNDKFEDSSLLKSKVPSDKSISTGGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVAAKSFERR
        EDI SNDGRDLTSKK DKFEDSSLLKSKVPSDKSISTGGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPV+AKSFERR
Subjt:  EDIWSNDGRDLTSKKNDKFEDSSLLKSKVPSDKSISTGGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVAAKSFERR

Query:  EKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANMIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFG
        EKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTAN+IEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFG
Subjt:  EKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANMIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFG

Query:  FGEKLPSQKDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAKAGSA
        FGEKLPSQKDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAKAGSA
Subjt:  FGEKLPSQKDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAKAGSA

Query:  SVFKSESSSS----STLSFGVPKESISEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNITNQN
        SVFKSESSSS    STLSFGVPKES+SEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNITNQN
Subjt:  SVFKSESSSS----STLSFGVPKESISEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNITNQN

Query:  SSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSSSAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTS
        SSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSSSAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTS
Subjt:  SSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSSSAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTS

Query:  DSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNTLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSS
        DSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGN+LVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSS
Subjt:  DSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNTLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSS

Query:  SFFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAA-SSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDHANMEDSMAE
        SFFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAA SSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAA SQPAFG SNHGFTFGSTPPANNDHANMEDSMAE
Subjt:  SFFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAA-SSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDHANMEDSMAE

Query:  DTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRK
        DTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRK
Subjt:  DTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRK

Query:  K
        K
Subjt:  K

A0A6J1FKS9 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2

0.0e+00

98.38

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Query:  MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISREANDETEIKNLEEVA
        MATERE V YEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPP ALRNS GKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISREANDE EIKN EEVA
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        TVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK
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A0A6J1JQT4 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1

0.0e+00

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        AD PGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE V STPVISYDIQEGSPKFPAQE VRPHMVP H
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        EDI SNDGRDLTSKKNDKFEDSSLLKS+VPSDKSISTGGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVAAKSFERR
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        EKVDDSLVAVGKPSD EAI VDKPQASIQAKPS VSEMKKINDQAKSD+PVTTEKSSIFSFPTASPSSTTA +IEPESTTRPEKIA SEVPKAA APIFG
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        FGEK PSQKDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPAST TENGNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAKAGSA
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Query:  SVFKSESSSS----STLSFGVPKESISEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNITNQN
        SVFKSESSSS    S LSFGVPKE +SEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNITNQN
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        SSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPS+SAP+G GSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTS
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        DSNK+PEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGN+LVGSSAPASNLF SGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSS
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        SFFNWQASS PSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAASSS PMLFGSS+TGAASTTSMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDHANMEDSMAE
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        DTVQTVA PTPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV TPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRK
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        K
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A0A6J1K059 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2

0.0e+00

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Query:  ADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGVRPHMVPTH
        AD PGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE V STPVISYDIQEGSPKFPAQE VRPHMVP H
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        AGKAPYSSETKRNL KMSA SENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENV
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        EDI SNDGRDLTSKKNDKFEDSSLLKS+VPSDKSISTGGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVAAKSFERR
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        EKVDDSLVAVGKPSD EAI VDKPQASIQAKPS VSEMKKINDQAKSD+PVTTEKSSIFSFPTASPSSTTA +IEPESTTRPEKIA SEVPKAA APIFG
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        FGEK PSQKDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPAST TENGNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAKAGSA
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Query:  SVFKSESSSSSTLSFGVPKESISEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNITNQNSSIK
        SVFKSESSSSS LSFGVPKE +SEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNITNQNSSIK
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        PSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPS+SAP+G GSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNK
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Query:  QPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNTLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSSSFFN
        +PEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGN+LVGSSAPASNLF SGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSSSFFN
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        WQASS PSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAASSS PMLFGSS+TGAASTTSMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDHANMEDSMAEDTVQ
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Query:  TVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK
        TVA PTPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV TPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK
Subjt:  TVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q9CAF4 Nuclear pore complex protein NUP1

2.1e-103

34.13

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Query:  GRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------GKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRL---------PPPPPSLPISREANDETEIKNL
        G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+        G GWLSKLVDPAQ+LIT SA RLF S+ RKRL         P     LP  R  N ET++ + 
Subjt:  GRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------GKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRL---------PPPPPSLPISREANDETEIKNL

Query:  EEVA----ADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGV
        E+V+     +     E TN    P  +     G +DLEKIL+ KTFTR E+DRLT LL+S+ AD  +  E ++ E+     V+ +       +     G 
Subjt:  EEVA----ADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGV

Query:  RPHMVPTHVVNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDTFALGN----PTKSSTLSLVPRSPGNFDVENDFVTPRSRGRSALYSMAR
           +V T   +    DE +ASPA++AKA+MGSRP + TP  +    Q   +     N    P KS T+SLV +  G   +EN FVTPRSRGRSA+YSMAR
Subjt:  RPHMVPTHVVNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDTFALGN----PTKSSTLSLVPRSPGNFDVENDFVTPRSRGRSALYSMAR

Query:  MPYSRVRATPSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQG---ALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSET
         PYSR +++  I            ++  +S S WE+     S QG    LKRRSSVLD++IGSVGP+RRIR KSN L  + L+LP S + + V   G E 
Subjt:  MPYSRVRATPSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQG---ALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSET

Query:  SQHLQSTKVYPFSSTAGKAPYSSETKRNLFKMSAVSENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPAL
        + H                             ++    +  P SSF  +P +SSEMA KIL+QLDKL   +EK            SP KLSPSML GPAL
Subjt:  SQHLQSTKVYPFSSTAGKAPYSSETKRNLFKMSAVSENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPAL

Query:  RSLEDVDSAKYLENVEDIWSNDGRDLTSKKNDKFEDSSLLKSKVPSDKSISTGGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSL-----TKCAFQMSVQEDFV
        +SL++V++ K+L N+ +  +N   D + +K +   +S   +    S+K+     G   +  SKD     G  V     +SL      K +F+MS  EDF+
Subjt:  RSLEDVDSAKYLENVEDIWSNDGRDLTSKKNDKFEDSSLLKSKVPSDKSISTGGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSL-----TKCAFQMSVQEDFV

Query:  DMDDE-EYSNGPVAAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANMI-EPES
        ++DD+   ++ P      +   +V+ S +++           +KP    +A PS          Q  S+  + TE++   +FP  +     +NM  EP S
Subjt:  DMDDE-EYSNGPVAAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANMI-EPES

Query:  TTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQ--KDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPA-VTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGN
            + I  +E    ++       +++P +  K P    P  +F    T   N+ +   A +  E   +     S         K TF   AS A E+  
Subjt:  TTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQ--KDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPA-VTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGN

Query:  SEA----GSPFKFASSLVN--EKEGAKAGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESISEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTP--TPSLFSFSSPTT--
        S A    GS F   ++ V      G+   S S   S S+  S  S G    ++   A    SSS    + TS +    S S++P  + S F F  P    
Subjt:  SEA----GSPFKFASSLVN--EKEGAKAGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESISEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTP--TPSLFSFSSPTT--

Query:  NSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNIT---------NQNSSIKPSLNAATSNSEP------VTTTSLSTSSPMPSFSAAP------IFKFGSSSVPSSS
        ++  ++ S G         + TF +  T         +Q++ I     +A + S P       +    ST +P  + ++AP      IF   SSS P + 
Subjt:  NSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNIT---------NQNSSIKPSLNAATSNSEP------VTTTSLSTSSPMPSFSAAP------IFKFGSSSVPSSS

Query:  APSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSA---AKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSS-
          S + +    T    + FG  S    S  S+       STGSSVF F A S+ S ++ Q + S          G       SG  +STQS P    SS 
Subjt:  APSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSA---AKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSS-

Query:  SSTSFGLTGNTGLASGNTLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSSSFF--NWQA-----SSAPSFSSGF--GSTPTGGFSFGLASSSAA
        S+ SFGL+GN+ LAS ++  G S     +FTS +T      SS N+S SS +  SS  F  +WQA     +S P FSS F   STPT  FSFG +S++  
Subjt:  SSTSFGLTGNTGLASGNTLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSSSFF--NWQA-----SSAPSFSSGF--GSTPTGGFSFGLASSSAA

Query:  SSSPM-LFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAASSQPA-----------FGNSNHGFTFGSTPPA----NNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPL
        SS+   +FG+ST    S + +F F S       QP            FGNS  GF FG+        NN   +MEDSMAEDT Q   +    P FGQ  +
Subjt:  SSSPM-LFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAASSQPA-----------FGNSNHGFTFGSTPPA----NNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPL

Query:  T-PPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGA-GGGDKSNRKFVKVKSKSRKK
        + P P+  F  G+    P  ANPFQFGG Q    T QN +PFQAS SL+F    GGSFSLG+ GGGDKS R+  K K  +RKK
Subjt:  T-PPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGA-GGGDKSNRKFVKVKSKSRKK

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G10650.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.1)

1.5e-104

34.13

Show/hide

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        G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+        G GWLSKLVDPAQ+LIT SA RLF S+ RKRL         P     LP  R  N ET++ + 
Subjt:  GRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------GKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRL---------PPPPPSLPISREANDETEIKNL

Query:  EEVA----ADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGV
        E+V+     +     E TN    P  +     G +DLEKIL+ KTFTR E+DRLT LL+S+ AD  +  E ++ E+     V+ +       +     G 
Subjt:  EEVA----ADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGV

Query:  RPHMVPTHVVNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDTFALGN----PTKSSTLSLVPRSPGNFDVENDFVTPRSRGRSALYSMAR
           +V T   +    DE +ASPA++AKA+MGSRP + TP  +    Q   +     N    P KS T+SLV +  G   +EN FVTPRSRGRSA+YSMAR
Subjt:  RPHMVPTHVVNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDTFALGN----PTKSSTLSLVPRSPGNFDVENDFVTPRSRGRSALYSMAR

Query:  MPYSRVRATPSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQG---ALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSET
         PYSR +++  I            ++  +S S WE+     S QG    LKRRSSVLD++IGSVGP+RRIR KSN L  + L+LP S + + V   G E 
Subjt:  MPYSRVRATPSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQG---ALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSET

Query:  SQHLQSTKVYPFSSTAGKAPYSSETKRNLFKMSAVSENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPAL
        + H                             ++    +  P SSF  +P +SSEMA KIL+QLDKL   +EK            SP KLSPSML GPAL
Subjt:  SQHLQSTKVYPFSSTAGKAPYSSETKRNLFKMSAVSENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPAL

Query:  RSLEDVDSAKYLENVEDIWSNDGRDLTSKKNDKFEDSSLLKSKVPSDKSISTGGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSL-----TKCAFQMSVQEDFV
        +SL++V++ K+L N+ +  +N   D + +K +   +S   +    S+K+     G   +  SKD     G  V     +SL      K +F+MS  EDF+
Subjt:  RSLEDVDSAKYLENVEDIWSNDGRDLTSKKNDKFEDSSLLKSKVPSDKSISTGGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSL-----TKCAFQMSVQEDFV

Query:  DMDDE-EYSNGPVAAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANMI-EPES
        ++DD+   ++ P      +   +V+ S +++           +KP    +A PS          Q  S+  + TE++   +FP  +     +NM  EP S
Subjt:  DMDDE-EYSNGPVAAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANMI-EPES

Query:  TTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQ--KDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPA-VTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGN
            + I  +E    ++       +++P +  K P    P  +F    T   N+ +   A +  E   +     S         K TF   AS A E+  
Subjt:  TTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQ--KDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPA-VTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGN

Query:  SEA----GSPFKFASSLVN--EKEGAKAGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESISEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTP--TPSLFSFSSPTT--
        S A    GS F   ++ V      G+   S S   S S+  S  S G    ++   A    SSS    + TS +    S S++P  + S F F  P    
Subjt:  SEA----GSPFKFASSLVN--EKEGAKAGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESISEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTP--TPSLFSFSSPTT--

Query:  NSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNIT---------NQNSSIKPSLNAATSNSEP------VTTTSLSTSSPMPSFSAAP------IFKFGSSSVPSSS
        ++  ++ S G         + TF +  T         +Q++ I     +A + S P       +    ST +P  + ++AP      IF   SSS P + 
Subjt:  NSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNIT---------NQNSSIKPSLNAATSNSEP------VTTTSLSTSSPMPSFSAAP------IFKFGSSSVPSSS

Query:  APSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSA---AKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSS-
          S + +    T    + FG  S    S  S+       STGSSVF F A S+ S ++ Q + S          G       SG  +STQS P    SS 
Subjt:  APSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSA---AKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSS-

Query:  SSTSFGLTGNTGLASGNTLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSSSFF--NWQA-----SSAPSFSSGF--GSTPTGGFSFGLASSSAA
        S+ SFGL+GN+ LAS ++  G S     +FTS +T      SS N+S SS +  SS  F  +WQA     +S P FSS F   STPT  FSFG +S++  
Subjt:  SSTSFGLTGNTGLASGNTLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSSSFF--NWQA-----SSAPSFSSGF--GSTPTGGFSFGLASSSAA

Query:  SSSPM-LFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAASSQPA-----------FGNSNHGFTFGSTPPA----NNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPL
        SS+   +FG+ST    S + +F F S       QP            FGNS  GF FG+        NN   +MEDSMAEDT Q   +    P FGQ  +
Subjt:  SSSPM-LFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAASSQPA-----------FGNSNHGFTFGSTPPA----NNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPL

Query:  T-PPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGA-GGGDKSNRKFVKVKSKSRKK
        + P P+  F  G+    P  ANPFQFGG Q    T QN +PFQAS SL+F    GGSFSLG+ GGGDKS R+  K K  +RKK
Subjt:  T-PPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGA-GGGDKSNRKFVKVKSKSRKK

AT5G20200.1 nucleoporin-related

4.2e-14

24.46

Show/hide

Query:  GGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPP----PP--------SLPISREANDE--TEIKNLE
        GG GGK +++  RR   TPY RP         + W+S++VDPA ++I+  A R+    F      P    PP         L  + + ND   T I N  
Subjt:  GGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPP----PP--------SLPISREANDE--TEIKNLE

Query:  EVAA----DPPGTQEGTNNDFVPSINS------NNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFP
        E A+     P GT      +F  S         N+   +S+LE++++ KTF++ EIDRL E++ SR  D+P                +  D  E + + P
Subjt:  EVAA----DPPGTQEGTNNDFVPSINS------NNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFP

Query:  AQEGVRPHM---------------------VPTHVVNA------NVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQK--FGDTFALGNPTKSSTLSL
         +EG + +M                      PT +  +       + DE   SPAE+AKA+MG +   ++    VA ++K     +  +G  + +S  S 
Subjt:  AQEGVRPHM---------------------VPTHVVNA------NVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQK--FGDTFALGNPTKSSTLSL

Query:  VPRS-PG-NFDVENDFVTPRSRGRS-ALYSMARMPYSR-VRATPSIKNSVATTDS--YRATVTSSSQSAWEQ-GRLLESNQGALKRRSSVLDDEIGSVGP
             PG     ++ F TP+SR  S  L +  R PYSR + +    K      DS  + + + S SQS   + G+L +   G             G  GP
Subjt:  VPRS-PG-NFDVENDFVTPRSRGRS-ALYSMARMPYSR-VRATPSIKNSVATTDS--YRATVTSSSQSAWEQ-GRLLESNQGALKRRSSVLDDEIGSVGP

Query:  IRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVYPFSSTAGKAPYSSETKRNLFKMSAVSENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDK
         RR R  +        S PS   S              +++ +   SS AG++ Y S ++   +     +E           +P  SS++A  IL+ L++
Subjt:  IRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVYPFSSTAGKAPYSSETKRNLFKMSAVSENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDK

Query:  L---TPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIWSNDGRDLTSKKNDKFEDSSLLKSKVPSDKSISTGGGVGSSVPS-
            + PK K++ELKL +     P            + +++   SAK  E++++I+S +            + SS+LK    +   I  G    +S  + 
Subjt:  L---TPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIWSNDGRDLTSKKNDKFEDSSLLKSKVPSDKSISTGGGVGSSVPS-

Query:  ----KDTVSSSG--LQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDE-----------EYSNGPVAAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQA
                SS G  LQ  F  P    K +   S+ ++      +           E +N P          K     ++V KP    A+    P  S   
Subjt:  ----KDTVSSSG--LQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDE-----------EYSNGPVAAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQA

Query:  KPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANMIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGF-GEKLPSQKDP-VFSSPT
           PVS     +D   S  P T    SI  F T+ P ++   +     T   E     E+P+      F F G      K P VFS P+
Subjt:  KPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANMIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGF-GEKLPSQKDP-VFSSPT

Sequences

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CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGACAGAGCGTGAGGAGGTTCGTTATGAAGGAGGAAGAGGTGGGAAGTTCCAGAAAAGGCCTCTCAGAAGGTCGCATACGACGCCGTATGATCGGCCGCCGACTGC
TCTGAGAAACTCTGCTGGAAAAGGATGGCTCTCTAAGCTTGTCGATCCGGCGCAGAAGCTCATCACCTCCAGTGCGCATAGGCTGTTTTCTAGCGTGTTTCGTAAACGCC
TTCCCCCTCCGCCGCCGTCATTGCCAATTTCTCGAGAGGCTAACGATGAGACGGAAATTAAGAACCTGGAAGAAGTTGCAGCTGATCCTCCTGGAACTCAAGAAGGGACT
AATAATGATTTTGTTCCAAGCATCAATTCTAATAACATACATGGGGTGAGTGACCTCGAGAAAATTTTGAAGGAGAAGACCTTTACAAGATTTGAGATTGATCGCTTGAC
TGAACTTCTGAAATCAAGAGTTGCTGATGTTCCAAGCGGGGTTGAATCGAGGAAATTTGAAATGGTTTCTTCAACACCTGTTATCAGTTATGACATACAGGAAGGGTCTC
CAAAATTTCCAGCTCAAGAGGGAGTTAGGCCTCATATGGTTCCAACTCATGTCGTGAATGCAAATGTCCCTGATGAGGATGTTGCTTCACCTGCAGAGATTGCAAAGGCG
TTCATGGGTAGCAGGCCTCCAAAAGCAACTCCGTTGAGTATGGTGGCCCATAGTCAAAAGTTTGGGGATACTTTTGCTTTAGGCAATCCCACAAAGTCCTCTACTTTATC
TCTTGTGCCAAGGTCTCCTGGAAATTTTGATGTTGAAAATGATTTTGTCACCCCAAGATCTCGTGGCAGATCTGCTCTATACAGTATGGCTCGAATGCCATATTCAAGAG
TTCGTGCAACCCCCAGCATAAAGAATAGTGTAGCAACAACAGATTCTTACAGGGCCACTGTGACCTCATCATCTCAGTCAGCATGGGAGCAAGGGAGACTTTTGGAGTCT
AATCAAGGGGCTTTGAAACGCCGAAGCTCAGTTTTAGATGATGAAATAGGATCTGTTGGTCCTATTCGAAGAATTCGCCATAAATCCAATCTCCTTTTCCCAAAAGGTTT
GAGTTTACCAAGCAGTTCCACTTCTATTCCAGTTAGTGGAATTGGTTCCGAGACTTCTCAGCATTTGCAGTCCACAAAAGTTTATCCATTTTCGTCTACTGCTGGGAAGG
CACCTTATTCAAGTGAGACCAAGCGTAATTTGTTCAAAATGTCTGCAGTGTCTGAAAATGATAGGACACCTAGTTCAAGTTTCCCTCAAATTCCCCTCAGGTCTAGTGAG
ATGGCCTTAAAAATATTAGAGCAGCTTGATAAATTGACCCCTCCAAAAGAAAAATCTTCGGAACTAAAGTTGCATAGTGTGAGGAATAACTCACCCATGAAGTTATCACC
ATCAATGTTGCATGGGCCAGCTCTTAGAAGTCTGGAAGATGTGGATTCGGCTAAGTATTTGGAAAATGTTGAAGACATTTGGTCTAATGATGGCCGTGATCTTACTTCGA
AAAAGAACGATAAGTTTGAGGATAGTAGTTTGTTAAAATCTAAAGTACCCAGTGATAAATCTATTTCTACAGGTGGTGGTGTAGGTTCTTCAGTGCCTTCAAAGGATACT
GTATCTAGTTCTGGTCTGCAGGTTTCATTTGTTGGCCCGTCCTCACTAACAAAATGTGCGTTCCAGATGAGTGTACAAGAGGATTTTGTCGATATGGATGACGAAGAATA
TTCTAATGGGCCAGTAGCTGCTAAATCATTTGAGAGGCGAGAAAAAGTTGACGACTCATTAGTGGCAGTGGGTAAGCCGAGTGATACTGAAGCCATCACAGTAGATAAAC
CTCAGGCTTCAATTCAGGCTAAACCATCCCCTGTCTCTGAAATGAAGAAAATAAATGACCAAGCAAAATCTGATGTTCCTGTGACTACTGAAAAGAGTTCCATTTTTTCC
TTTCCAACAGCCTCTCCATCTAGCACTACAGCCAATATGATAGAACCGGAATCAACCACGAGACCTGAAAAAATTGCTTCGTCTGAGGTACCAAAAGCAGCTGCTGCCCC
TATATTTGGCTTTGGAGAAAAGTTGCCATCACAGAAGGATCCGGTATTTTCTTCTCCCACCTTTACGTTTGGAAACAAGGTTACCACCTCAACAAATGAACAAAATGCTG
TTCCTGCTGTAACTTCTGAAGGCAATGTTGCACCTACTCTACAAGCTTCTGCTCCTACCACATTTAAATTTGGAGATAAAGCTACATTTCCTATTCCAGCAAGTACCGCC
ACCGAAAATGGAAATAGTGAGGCCGGATCTCCGTTTAAGTTTGCATCTTCTTTAGTTAACGAAAAAGAAGGTGCTAAAGCAGGCAGTGCTTCAGTTTTTAAATCAGAGAG
TTCTAGCAGCAGCACCCTGTCATTTGGAGTTCCGAAAGAGTCGATTTCGGAGAAAGCTGGCGATAAGAAGAGTTCAAGTGCCGGACTCTCTGTTGGCACATCTGGGAATT
TGCTTTTGTCATCTGTCTCATCAACACCAACTCCCAGTTTGTTTTCTTTTAGCTCCCCTACCACTAATTCAAATCTTATTAACGGATCTCTTGGTTCCACCCCATCTACT
TTTCCCTCCCCATCCAACACCTTTCCTAGTAATATAACAAATCAAAATTCATCCATCAAACCATCTCTCAATGCTGCCACTAGCAATAGCGAACCCGTCACCACTACTAG
TCTTTCTACATCTTCTCCTATGCCATCTTTTTCAGCTGCACCAATTTTCAAGTTTGGGAGCTCCAGTGTTCCTTCGAGTTCAGCACCGAGCGGAGTTGGATCTGTAGAAA
CCAAGACCAAGCAAGAGACAACACCCTTTGGCAATGTAAGTGGCATTTCTCCGAGCGACACATCTGCTGCTAAAGTATTTAGTACTGGAAGCAGTGTTTTTCAGTTTGGA
GCTGCGTCTACTACTTCAGATTCTAATAAACAACCCGAAAAGTCAACCTTCGCTCCGGTCAGTGTACCTTCATTTGGTGCTCCAGTTTTGCCTGCAAGTAGTGGGGTTGC
TTCTTCTACTCAGAGTACACCTGTTTCGCCGTTCAGTTCATCATCTACATCATTTGGTTTGACAGGGAATACGGGTTTGGCCTCCGGTAACACTTTGGTTGGTTCTTCAG
CTCCCGCGTCTAATTTGTTCACTTCAGGTGCCACTTTTGGGTTTGGTTCCTCCAGTTCTGCTAATAATTCAGTCAGCTCCGGTGCTGGTACTAGTTCTAGCTTCTTTAAC
TGGCAGGCATCCTCCGCGCCATCATTTTCTTCTGGATTCGGCTCAACTCCAACGGGAGGATTTTCCTTTGGCCTTGCATCTTCTTCCGCTGCTTCTAGTTCCCCTATGCT
CTTTGGATCATCGACAACCGGTGCAGCATCAACAACCTCGATGTTCTCATTTACTTCAGCTGCAACTGCTGCGTCGTCACAGCCTGCTTTTGGTAATTCTAATCATGGCT
TCACCTTTGGTTCAACACCTCCTGCAAATAATGATCATGCAAATATGGAGGATAGCATGGCTGAGGATACCGTCCAGACAGTCGCATCGCCAACGCCTATGCCGAGTTTC
GGGCAACAACCCCTTACGCCACCTCCATCATCAGGGTTCGTGTTTGGTTCAACTGCTCCTTCTCCGCTAGGAGCAAATCCTTTCCAGTTTGGTGGTAGCCAACAAAATGT
ACCTACCCCACAAAATCCCAATCCATTTCAGGCTTCGGGTAGCTTAGACTTCAATGCCAGTGCTGGAGGAAGCTTCTCACTAGGCGCTGGTGGCGGCGACAAATCGAACC
GAAAATTCGTGAAAGTTAAAAGCAAATCAAGAAAGAAGTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CTCTGTATCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTTTCTGCGCGTGGTCTAATAAAAACCCTAATTTGCTGAATTCCCTACTTTTTTTCCTCCCCCTTTCAACAATTTCCTCGGT
ATTCCGGCATTGAAGAGAAGACCTCAACTCTGTGTTGTTAATGGCGACAGAGCGTGAGGAGGTTCGTTATGAAGGAGGAAGAGGTGGGAAGTTCCAGAAAAGGCCTCTCA
GAAGGTCGCATACGACGCCGTATGATCGGCCGCCGACTGCTCTGAGAAACTCTGCTGGAAAAGGATGGCTCTCTAAGCTTGTCGATCCGGCGCAGAAGCTCATCACCTCC
AGTGCGCATAGGCTGTTTTCTAGCGTGTTTCGTAAACGCCTTCCCCCTCCGCCGCCGTCATTGCCAATTTCTCGAGAGGCTAACGATGAGACGGAAATTAAGAACCTGGA
AGAAGTTGCAGCTGATCCTCCTGGAACTCAAGAAGGGACTAATAATGATTTTGTTCCAAGCATCAATTCTAATAACATACATGGGGTGAGTGACCTCGAGAAAATTTTGA
AGGAGAAGACCTTTACAAGATTTGAGATTGATCGCTTGACTGAACTTCTGAAATCAAGAGTTGCTGATGTTCCAAGCGGGGTTGAATCGAGGAAATTTGAAATGGTTTCT
TCAACACCTGTTATCAGTTATGACATACAGGAAGGGTCTCCAAAATTTCCAGCTCAAGAGGGAGTTAGGCCTCATATGGTTCCAACTCATGTCGTGAATGCAAATGTCCC
TGATGAGGATGTTGCTTCACCTGCAGAGATTGCAAAGGCGTTCATGGGTAGCAGGCCTCCAAAAGCAACTCCGTTGAGTATGGTGGCCCATAGTCAAAAGTTTGGGGATA
CTTTTGCTTTAGGCAATCCCACAAAGTCCTCTACTTTATCTCTTGTGCCAAGGTCTCCTGGAAATTTTGATGTTGAAAATGATTTTGTCACCCCAAGATCTCGTGGCAGA
TCTGCTCTATACAGTATGGCTCGAATGCCATATTCAAGAGTTCGTGCAACCCCCAGCATAAAGAATAGTGTAGCAACAACAGATTCTTACAGGGCCACTGTGACCTCATC
ATCTCAGTCAGCATGGGAGCAAGGGAGACTTTTGGAGTCTAATCAAGGGGCTTTGAAACGCCGAAGCTCAGTTTTAGATGATGAAATAGGATCTGTTGGTCCTATTCGAA
GAATTCGCCATAAATCCAATCTCCTTTTCCCAAAAGGTTTGAGTTTACCAAGCAGTTCCACTTCTATTCCAGTTAGTGGAATTGGTTCCGAGACTTCTCAGCATTTGCAG
TCCACAAAAGTTTATCCATTTTCGTCTACTGCTGGGAAGGCACCTTATTCAAGTGAGACCAAGCGTAATTTGTTCAAAATGTCTGCAGTGTCTGAAAATGATAGGACACC
TAGTTCAAGTTTCCCTCAAATTCCCCTCAGGTCTAGTGAGATGGCCTTAAAAATATTAGAGCAGCTTGATAAATTGACCCCTCCAAAAGAAAAATCTTCGGAACTAAAGT
TGCATAGTGTGAGGAATAACTCACCCATGAAGTTATCACCATCAATGTTGCATGGGCCAGCTCTTAGAAGTCTGGAAGATGTGGATTCGGCTAAGTATTTGGAAAATGTT
GAAGACATTTGGTCTAATGATGGCCGTGATCTTACTTCGAAAAAGAACGATAAGTTTGAGGATAGTAGTTTGTTAAAATCTAAAGTACCCAGTGATAAATCTATTTCTAC
AGGTGGTGGTGTAGGTTCTTCAGTGCCTTCAAAGGATACTGTATCTAGTTCTGGTCTGCAGGTTTCATTTGTTGGCCCGTCCTCACTAACAAAATGTGCGTTCCAGATGA
GTGTACAAGAGGATTTTGTCGATATGGATGACGAAGAATATTCTAATGGGCCAGTAGCTGCTAAATCATTTGAGAGGCGAGAAAAAGTTGACGACTCATTAGTGGCAGTG
GGTAAGCCGAGTGATACTGAAGCCATCACAGTAGATAAACCTCAGGCTTCAATTCAGGCTAAACCATCCCCTGTCTCTGAAATGAAGAAAATAAATGACCAAGCAAAATC
TGATGTTCCTGTGACTACTGAAAAGAGTTCCATTTTTTCCTTTCCAACAGCCTCTCCATCTAGCACTACAGCCAATATGATAGAACCGGAATCAACCACGAGACCTGAAA
AAATTGCTTCGTCTGAGGTACCAAAAGCAGCTGCTGCCCCTATATTTGGCTTTGGAGAAAAGTTGCCATCACAGAAGGATCCGGTATTTTCTTCTCCCACCTTTACGTTT
GGAAACAAGGTTACCACCTCAACAAATGAACAAAATGCTGTTCCTGCTGTAACTTCTGAAGGCAATGTTGCACCTACTCTACAAGCTTCTGCTCCTACCACATTTAAATT
TGGAGATAAAGCTACATTTCCTATTCCAGCAAGTACCGCCACCGAAAATGGAAATAGTGAGGCCGGATCTCCGTTTAAGTTTGCATCTTCTTTAGTTAACGAAAAAGAAG
GTGCTAAAGCAGGCAGTGCTTCAGTTTTTAAATCAGAGAGTTCTAGCAGCAGCACCCTGTCATTTGGAGTTCCGAAAGAGTCGATTTCGGAGAAAGCTGGCGATAAGAAG
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AAATCTTATTAACGGATCTCTTGGTTCCACCCCATCTACTTTTCCCTCCCCATCCAACACCTTTCCTAGTAATATAACAAATCAAAATTCATCCATCAAACCATCTCTCA
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Protein sequence

Show/hide protein sequence

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Carg01664 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome