; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg01976 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg01976
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionzinc finger HIT domain-containing protein 2
Genome locationCarg_Chr04:8257893..8259821
RNA-Seq ExpressionCarg01976
SyntenyCarg01976
Gene Ontology termsGO:0000398 - mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
GO:0005681 - spliceosomal complex (cellular component)
GO:0004386 - helicase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR007009 - Shq1 protein domain
IPR007529 - Zinc finger, HIT-type
IPR039646 - Zinc finger HIT domain-containing protein 2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601145.1 Zinc finger HIT domain-containing protein 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.5e-22599.75Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED

Query:  DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTP
        DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTP
Subjt:  DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTP

Query:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
        LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEAL SCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
Subjt:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL

Query:  LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSSD
        LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSSD
Subjt:  LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSSD

Query:  KVLIEEIK
        KVLIEEIK
Subjt:  KVLIEEIK

KAG7031944.1 Zinc finger HIT domain-containing protein 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.9e-225100Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED

Query:  DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTP
        DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTP
Subjt:  DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTP

Query:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
        LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
Subjt:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL

Query:  LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSSD
        LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSSD
Subjt:  LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSSD

Query:  KVLIEEIK
        KVLIEEIK
Subjt:  KVLIEEIK

XP_022957526.1 zinc finger HIT domain-containing protein 2 isoform X1 [Cucurbita moschata]4.4e-22298.3Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRT+CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGL+ED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED

Query:  DSTLSEETIEKVL---AGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGP
        DSTLSEETIEKVL   AGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGP
Subjt:  DSTLSEETIEKVL---AGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGP

Query:  DTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV
        +TPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV
Subjt:  DTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV

Query:  AILLSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAK
        AILLSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAK
Subjt:  AILLSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAK

Query:  SSDKVLIEEIK
         SDKVLIEEIK
Subjt:  SSDKVLIEEIK

XP_022957527.1 zinc finger HIT domain-containing protein 2 isoform X2 [Cucurbita moschata]1.1e-22399.02Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRT+CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGL+ED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED

Query:  DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTP
        DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGP+TP
Subjt:  DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTP

Query:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
        LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
Subjt:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL

Query:  LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSSD
        LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAK SD
Subjt:  LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSSD

Query:  KVLIEEIK
        KVLIEEIK
Subjt:  KVLIEEIK

XP_023514271.1 zinc finger HIT domain-containing protein 2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.2e-22098.04Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDD TKRKTLDILKRFHSEEEME L+ED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED

Query:  DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTP
        DSTLSEETIEKVLAG QLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGT LVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPR PDTP
Subjt:  DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTP

Query:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
        LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLS+IDDVAIL
Subjt:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL

Query:  LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSSD
        LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAK SD
Subjt:  LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSSD

Query:  KVLIEEIK
        KVLIEEIK
Subjt:  KVLIEEIK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KV24 HIT-type domain-containing protein4.5e-20490.44Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLN-E
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRT+CHVCHKQFSQY+CPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDS KRKTLDILKRFH+EEEME L+ E
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLN-E

Query:  DDSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDT
        DDSTLSEET EKVLAGDQLSFDDLS EEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWW KPSARTISLSKEGTPLVQLHA ++ T SLTS  E  QSS IP+ PDT
Subjt:  DDSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDT

Query:  PLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAI
        PLP LSKLS+A+PSPLLAVHL+DIIYSYCFTLRLYNGDWQSDA GSALVVLS+SSVLGQ+G+PETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV+ 
Subjt:  PLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAI

Query:  LLSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSS
        LLSLG PALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRR+KS+WSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSE WSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSK KS 
Subjt:  LLSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSS

Query:  DKVLIEEI
        DKVLI+EI
Subjt:  DKVLIEEI

A0A6J1GZD0 zinc finger HIT domain-containing protein 2 isoform X25.1e-22499.02Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRT+CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGL+ED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED

Query:  DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTP
        DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGP+TP
Subjt:  DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTP

Query:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
        LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
Subjt:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL

Query:  LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSSD
        LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAK SD
Subjt:  LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSSD

Query:  KVLIEEIK
        KVLIEEIK
Subjt:  KVLIEEIK

A0A6J1GZG3 zinc finger HIT domain-containing protein 2 isoform X12.1e-22298.3Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRT+CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGL+ED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED

Query:  DSTLSEETIEKVL---AGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGP
        DSTLSEETIEKVL   AGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGP
Subjt:  DSTLSEETIEKVL---AGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGP

Query:  DTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV
        +TPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV
Subjt:  DTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV

Query:  AILLSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAK
        AILLSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAK
Subjt:  AILLSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAK

Query:  SSDKVLIEEIK
         SDKVLIEEIK
Subjt:  SSDKVLIEEIK

A0A6J1JND7 zinc finger HIT domain-containing protein 2 isoform X16.5e-21997.32Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRT+CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEME L+ED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED

Query:  DSTLSEETIEKVLA---GDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGP
        DSTLSEETIEKVLA   G QLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPR P
Subjt:  DSTLSEETIEKVLA---GDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGP

Query:  DTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV
        DTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV
Subjt:  DTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV

Query:  AILLSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAK
        AILLSLG PALVCLLCDLQRLIQAGERDLKS KRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFE+HKMSTKMDSKAK
Subjt:  AILLSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAK

Query:  SSDKVLIEEIK
        SSDKVLIEEIK
Subjt:  SSDKVLIEEIK

A0A6J1JTY4 zinc finger HIT domain-containing protein 2 isoform X21.5e-22098.04Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRT+CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEME L+ED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNED

Query:  DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTP
        DSTLSEETIEKVLAG QLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPR PDTP
Subjt:  DSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTP

Query:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
        LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
Subjt:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL

Query:  LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSSD
        LSLG PALVCLLCDLQRLIQAGERDLKS KRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFE+HKMSTKMDSKAKSSD
Subjt:  LSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSSD

Query:  KVLIEEIK
        KVLIEEIK
Subjt:  KVLIEEIK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2TBW5 Zinc finger HIT domain-containing protein 26.2e-1727.02Show/hide
Query:  CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNEDDSTLSEETIEKVLAGDQLSFDD
        C     Q ++YTCPRCN  YCSL+CY++H + C E F R+ V+ ELR      S     L  L++    E+  G    D+ L        L+G    ++ 
Subjt:  CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNEDDSTLSEETIEKVLAGDQLSFDD

Query:  LSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSK------------EGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTPLPLLSKLSSA
        L+  EK  F R ++ GE  +++ PW  WW    A    L +            E +P        +   +    V  +     P    T +P L+ LS  
Subjt:  LSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSK------------EGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTPLPLLSKLSSA

Query:  KPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQS---GQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAILLSLGGPA
        + SPL+   L +++++Y  TL LY+G  ++        +L VS  LG        E  L+A +  LE     A  H  G       + + A +L   GPA
Subjt:  KPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQS---GQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAILLSLGGPA

Query:  -----LVCLLCDL-QRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHE
              +  L DL Q L +A ++ +  E+R           +L  A +K  F++ W +E
Subjt:  -----LVCLLCDL-QRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHE

Q9QY66 Zinc finger HIT domain-containing protein 22.1e-1726.84Show/hide
Query:  SQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNEDDSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKR
        ++YTCPRCN+ YCSL+CY++H   C E F R+ V   LR+LR   ++  +    L+R   + E E    +++ L        L+G    ++ L+  EK  
Subjt:  SQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNEDDSTLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKR

Query:  FLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQ---STISLTSGVEA--------NQSSEIPRGPDTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVH
        F R ++ GE  +++ PW  WW         L +      +  AE +   +  +L SG +A        +  +  P      +P L+ LS +  SPL+   
Subjt:  FLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQ---STISLTSGVEA--------NQSSEIPRGPDTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVH

Query:  LVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGS--ALVVLSVSSVLGQS---GQPETVLEALSSCLEQTCSP--------AYRHVGGLQLGLSLIDDVAILLSLGGP
        L +++++Y  TL LY+G    DA+ S     +L VS  LG     G  E  L+A +  LE    P        A + V  + LG   ++     L+  G 
Subjt:  LVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGS--ALVVLSVSSVLGQS---GQPETVLEALSSCLEQTCSP--------AYRHVGGLQLGLSLIDDVAILLSLGGP

Query:  ALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHE
            L    ++ +  GERD                 +L  A +K  F++ W +E
Subjt:  ALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHE

Q9UHR6 Zinc finger HIT domain-containing protein 28.9e-1626.24Show/hide
Query:  CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNEDDSTLSEETIEKVLAGDQLSFDD
        C     Q ++YTCPRCN+ YCSL+CY++H   C E+F R+ V+ ELR      S     L  L++    E+  G    ++ LS       L+G    ++ 
Subjt:  CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNEDDSTLSEETIEKVLAGDQLSFDD

Query:  LSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSK----EGTPLVQLHAEQQST----ISLTSGVEANQSSEI---PRGPDTP-----LPLLSK
        L+  EK  F R ++ GE  +++ PW  WW    A    L +     G+   +L      T    +   S  E   +  +     G  TP     +P +  
Subjt:  LSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSK----EGTPLVQLHAEQQST----ISLTSGVEANQSSEI---PRGPDTP-----LPLLSK

Query:  LSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQS---GQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAILLSL
        LS    SPL+   L +++++Y  TL LY+G   +        +L VS  LG        E  L+A +  LE     A  H  G       + +VA +L  
Subjt:  LSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQS---GQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAILLSL

Query:  GGPA-----LVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHE
         GP       +  L DL + +    +   + + R           L  A +K  F++ W +E
Subjt:  GGPA-----LVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G63830.1 HIT-type Zinc finger family protein1.4e-12055.64Show/hide
Query:  RTSVDSSSSVNLPL-----RTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEE-----ME
        +T + S SS + PL     R +CHVC+KQFSQYTCPRCN RYCSL CYKSHS +CTESFMR+NV +EL+Q+R+DD TKRK L+ILKRFH EEE     ++
Subjt:  RTSVDSSSSVNLPL-----RTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEE-----ME

Query:  GLNEDDS-TLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIP
         + +D+  +L EE I+K++ GD++S DDLS EE+K F RA+ASGELSKMI+PW+ WW   SARTI+L   GT LVQ   +++ T  +         SEIP
Subjt:  GLNEDDS-TLSEETIEKVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIP

Query:  RGPDTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHV-GGLQLGLSL
        RGPDTPL  LSKL+S  PSPLL +HL+DI YSYCFTLR+YNG+WQSD++G+A +VL+VSSVLG +GQPET+ E LS CLEQTCS AY+++ GGL+ GL+L
Subjt:  RGPDTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHV-GGLQLGLSL

Query:  IDDVAILLSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMD
        +DDV   LSLG  A+VCLL DLQRLI    +++KS   R      D+  KLK A+RK+F++MCWV+EQ SE W  LE  V+ EK+S++E  +++   +M 
Subjt:  IDDVAILLSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMD

Query:  SK--AKSSDKVLIEEIK
         K   +    V+IEEI+
Subjt:  SK--AKSSDKVLIEEIK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGAGGAGATACGAACCTCTGTTGATTCGTCTTCTTCCGTCAATCTTCCTTTGCGGACCGTCTGTCATGTGTGCCACAAGCAATTTTCACAGTATACGTGTCCTCG
TTGTAATTCTCGGTACTGTTCTCTGCAATGTTACAAGTCTCATAGTAATCGTTGTACCGAATCCTTTATGCGAGAAAATGTTGTTGAGGAGCTGCGGCAATTGCGGACGG
ATGATAGTACTAAACGGAAAACGCTTGACATTTTGAAAAGATTTCATTCGGAAGAGGAAATGGAAGGCTTGAATGAGGATGATTCAACTTTATCTGAGGAAACTATTGAA
AAAGTTCTTGCAGGTGACCAACTCAGTTTTGATGATCTGTCTGCGGAGGAGAAGAAACGTTTCTTAAGAGCTATGGCATCAGGAGAGTTGAGCAAGATGATTGAACCTTG
GGAAGCTTGGTGGACGAAACCTTCTGCTAGAACCATATCTCTGAGCAAAGAAGGAACACCACTTGTTCAACTCCATGCTGAGCAGCAATCGACAATTTCACTAACAAGTG
GAGTAGAAGCGAACCAATCAAGTGAAATTCCTCGAGGACCCGATACCCCATTACCTCTGCTTAGCAAGCTTAGTTCTGCAAAGCCATCACCTCTGTTGGCTGTTCATCTG
GTTGATATCATCTATAGTTACTGTTTTACACTCCGTTTGTATAATGGAGACTGGCAGTCAGATGCTATAGGATCAGCTCTGGTTGTTTTGAGTGTCTCCTCTGTCTTGGG
CCAAAGTGGTCAACCAGAAACAGTTCTAGAAGCCCTATCATCTTGCTTGGAACAAACCTGCTCCCCCGCTTATCGACACGTGGGGGGCTTGCAGCTTGGATTGAGTCTTA
TCGACGATGTTGCAATCCTGCTTTCTCTGGGCGGTCCTGCTTTAGTGTGCTTGCTTTGCGACTTGCAGAGGCTTATTCAAGCTGGGGAAAGAGATTTGAAATCAGAAAAG
AGGAGAAAAAAATCTAGATGGTCAGACATAGGTACTAAGCTTAAACACGCTGACAGGAAGATCTTTTTCATCATGTGCTGGGTTCACGAGCAGCCAAGTGAAGCTTGGTC
AACTTTGGAGAACATTGTGAAAATGGAGAAGAGTTCAATAATGGAGTTTGAGAATCATAAAATGTCTACAAAAATGGATAGCAAGGCAAAAAGCAGCGATAAAGTTTTGA
TAGAGGAGATAAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTGGATATGGAGGAGGAGATACGAACCTCTGTTGATTCGTCTTCTTCCGTCAATCTTCCTTTGCGGACCGTCTGTCATGTGTGCCACAAGCAATTTTCACAGTATACGTG
TCCTCGTTGTAATTCTCGGTACTGTTCTCTGCAATGTTACAAGTCTCATAGTAATCGTTGTACCGAATCCTTTATGCGAGAAAATGTTGTTGAGGAGCTGCGGCAATTGC
GGACGGATGATAGTACTAAACGGAAAACGCTTGACATTTTGAAAAGATTTCATTCGGAAGAGGAAATGGAAGGCTTGAATGAGGATGATTCAACTTTATCTGAGGAAACT
ATTGAAAAAGTTCTTGCAGGTGACCAACTCAGTTTTGATGATCTGTCTGCGGAGGAGAAGAAACGTTTCTTAAGAGCTATGGCATCAGGAGAGTTGAGCAAGATGATTGA
ACCTTGGGAAGCTTGGTGGACGAAACCTTCTGCTAGAACCATATCTCTGAGCAAAGAAGGAACACCACTTGTTCAACTCCATGCTGAGCAGCAATCGACAATTTCACTAA
CAAGTGGAGTAGAAGCGAACCAATCAAGTGAAATTCCTCGAGGACCCGATACCCCATTACCTCTGCTTAGCAAGCTTAGTTCTGCAAAGCCATCACCTCTGTTGGCTGTT
CATCTGGTTGATATCATCTATAGTTACTGTTTTACACTCCGTTTGTATAATGGAGACTGGCAGTCAGATGCTATAGGATCAGCTCTGGTTGTTTTGAGTGTCTCCTCTGT
CTTGGGCCAAAGTGGTCAACCAGAAACAGTTCTAGAAGCCCTATCATCTTGCTTGGAACAAACCTGCTCCCCCGCTTATCGACACGTGGGGGGCTTGCAGCTTGGATTGA
GTCTTATCGACGATGTTGCAATCCTGCTTTCTCTGGGCGGTCCTGCTTTAGTGTGCTTGCTTTGCGACTTGCAGAGGCTTATTCAAGCTGGGGAAAGAGATTTGAAATCA
GAAAAGAGGAGAAAAAAATCTAGATGGTCAGACATAGGTACTAAGCTTAAACACGCTGACAGGAAGATCTTTTTCATCATGTGCTGGGTTCACGAGCAGCCAAGTGAAGC
TTGGTCAACTTTGGAGAACATTGTGAAAATGGAGAAGAGTTCAATAATGGAGTTTGAGAATCATAAAATGTCTACAAAAATGGATAGCAAGGCAAAAAGCAGCGATAAAG
TTTTGATAGAGGAGATAAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTVCHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEGLNEDDSTLSEETIE
KVLAGDQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRGPDTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHL
VDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAILLSLGGPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSEK
RRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFENHKMSTKMDSKAKSSDKVLIEEIK