; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg01992 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg01992
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionTwo-component response regulator
Genome locationCarg_Chr04:8188978..8189534
RNA-Seq ExpressionCarg01992
SyntenyCarg01992
Gene Ontology termsGO:0000160 - phosphorelay signal transduction system (biological process)
GO:0016310 - phosphorylation (biological process)
GO:0016301 - kinase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001789 - Signal transduction response regulator, receiver domain
IPR011006 - CheY-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601130.1 Two-component response regulator ORR9, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.0e-4899.02Show/hide
Query:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK
        MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK
Subjt:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK

Query:  AS
         S
Subjt:  AS

KAG7031928.1 Two-component response regulator ARR8 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.8e-54100Show/hide
Query:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK
        MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK
Subjt:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK

Query:  ASFFFFSKHKA
        ASFFFFSKHKA
Subjt:  ASFFFFSKHKA

XP_022956694.1 LOW QUALITY PROTEIN: two-component response regulator ORR11-like [Cucurbita moschata]5.3e-4596.08Show/hide
Query:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK
        MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSP+SPENH+HQ HQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK
Subjt:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK

Query:  AS
         S
Subjt:  AS

XP_023526911.1 two-component response regulator ORR4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.4e-4797.06Show/hide
Query:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK
        MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPF PENH+HQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK
Subjt:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK

Query:  AS
         S
Subjt:  AS

XP_038892701.1 two-component response regulator ORR4-like [Benincasa hispida]2.1e-4186.67Show/hide
Query:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENH---NHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLR
        MAL+S+  +FHVLAVDDSL+DRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGS HSP SPENH   +H HHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLR
Subjt:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENH---NHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLR

Query:  KIKAS
        KIK S
Subjt:  KIKAS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KV44 Response regulatory domain-containing protein4.4e-3784.62Show/hide
Query:  MALVSSN-AQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIH-SPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRK
        M+L+SS+  +FHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVT VDSGSKALELLGLVRERNG+ H SP SPE+H  QHHQEIEVNLIITDYCMPEMTG+DLLRK
Subjt:  MALVSSN-AQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIH-SPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRK

Query:  IKAS
        IK S
Subjt:  IKAS

A0A1S3BH64 two-component response regulator ORR9-like2.1e-3986.54Show/hide
Query:  MALVSSN-AQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIH-SPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRK
        M+L+SS+  +FHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNG+ H SP SPENH   HHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRK
Subjt:  MALVSSN-AQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIH-SPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRK

Query:  IKAS
        IK S
Subjt:  IKAS

A0A5A7SZL1 Two-component response regulator ORR9-like2.1e-3986.54Show/hide
Query:  MALVSSN-AQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIH-SPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRK
        M+L+SS+  +FHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNG+ H SP SPENH   HHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRK
Subjt:  MALVSSN-AQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIH-SPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRK

Query:  IKAS
        IK S
Subjt:  IKAS

A0A6J1CBT9 two-component response regulator ORR4-like4.1e-3581.73Show/hide
Query:  ALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNG---SIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRK
        A+VS+ AQFHVLAVDDSL+DRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVR+RNG   SIHS  SP       HQEIEVN+IITDYCMPEMTGYDLLRK
Subjt:  ALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNG---SIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRK

Query:  IKAS
        IK S
Subjt:  IKAS

A0A6J1GZT5 LOW QUALITY PROTEIN: two-component response regulator ORR11-like2.6e-4596.08Show/hide
Query:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK
        MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSP+SPENH+HQ HQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK
Subjt:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK

Query:  AS
         S
Subjt:  AS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80366 Two-component response regulator ARR95.8e-2662.75Show/hide
Query:  VSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKASF
        +++ +QFHVLAVDDSL DRKLIERLL+ SS  VT VDSGSKALE LGL +  + +  + FS    N   HQ +EVNLIITDYCMP MTGYDLL+K+K S 
Subjt:  VSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKASF

Query:  FF
         F
Subjt:  FF

Q2RAP3 Two-component response regulator ORR94.4e-2666.34Show/hide
Query:  VSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKASF
        V+  A FHVLAVDDSL DRKLIERLLKTSSF VT VDSGSKALE LGL    +    SP S ++      QE+ VNLIITDYCMP MTGYDLL+KIK S 
Subjt:  VSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKASF

Query:  F
        +
Subjt:  F

Q4GZK2 Two-component response regulator ORR94.4e-2666.34Show/hide
Query:  VSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKASF
        V+  A FHVLAVDDSL DRKLIERLLKTSSF VT VDSGSKALE LGL    +    SP S ++      QE+ VNLIITDYCMP MTGYDLL+KIK S 
Subjt:  VSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKASF

Query:  F
        +
Subjt:  F

Q4GZK7 Two-component response regulator ORR41.2e-2865.69Show/hide
Query:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK
        M +V + ++FHVLAVDDSL+DRKLIE LLK SS+ VT VDSGSKALELLGL  E + S  SP S    +   HQEI+VNLIITDYCMP MTGYDLL+++K
Subjt:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK

Query:  AS
         S
Subjt:  AS

Q942A1 Two-component response regulator ORR41.2e-2865.69Show/hide
Query:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK
        M +V + ++FHVLAVDDSL+DRKLIE LLK SS+ VT VDSGSKALELLGL  E + S  SP S    +   HQEI+VNLIITDYCMP MTGYDLL+++K
Subjt:  MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIK

Query:  AS
         S
Subjt:  AS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10470.1 response regulator 41.1e-1954.64Show/hide
Query:  QFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKASFFF
        + HVLAVDDSLVDR +IERLL+ +S  VTAVDSG +ALE LGL  E+  +                 ++V+LIITDYCMP MTGY+LL+KIK S  F
Subjt:  QFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKASFFF

AT1G74890.1 response regulator 151.8e-1953.06Show/hide
Query:  SSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKAS
        SS+ + HVLAVDDS VDRK+IERLLK S+  VT V+SG++AL+ LGL  + NGS               ++++VNLI+TDY MP +TGY+LL+KIK S
Subjt:  SSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKAS

AT2G41310.1 response regulator 39.1e-2760.95Show/hide
Query:  LVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKAS
        ++ + ++FHVLAVDDSL DRK+IERLL+ SS  VT VDSGSKALE LGL  + N       SP     Q HQE+E+NLIITDYCMP MTGYDLL+K+K S
Subjt:  LVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKAS

Query:  FFFFS
          F S
Subjt:  FFFFS

AT3G48100.1 response regulator 53.7e-2050.98Show/hide
Query:  VSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKASF
        ++S    HVLAVDDS+VDRK IERLL+ SS  VT VDS ++AL+ LGL  E N S+              +++++NLI+TDY MP MTGY+LL+KIK S 
Subjt:  VSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKASF

Query:  FF
         F
Subjt:  FF

AT3G57040.1 response regulator 94.1e-2762.75Show/hide
Query:  VSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKASF
        +++ +QFHVLAVDDSL DRKLIERLL+ SS  VT VDSGSKALE LGL +  + +  + FS    N   HQ +EVNLIITDYCMP MTGYDLL+K+K S 
Subjt:  VSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKASF

Query:  FF
         F
Subjt:  FF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCTTGTCTCTTCTAATGCTCAGTTCCATGTCTTGGCTGTTGATGACAGCCTTGTTGACAGGAAGCTGATTGAAAGGCTGCTCAAAACTTCCTCCTTCAATGTTAC
GGCTGTGGATTCTGGAAGCAAGGCTTTGGAGCTTCTGGGTTTGGTTAGAGAGAGAAATGGAAGCATCCATTCTCCTTTTTCCCCTGAAAATCATAATCATCAACATCATC
AAGAGATTGAAGTTAATCTCATCATTACAGATTACTGTATGCCAGAAATGACAGGCTATGATCTTCTAAGAAAGATCAAGGCAAGTTTCTTCTTCTTTTCAAAACATAAG
GCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCAATTCCCATGGCCCTTGTCTCTTCTAATGCTCAGTTCCATGTCTTGGCTGTTGATGACAGCCTTGTTGACAGGAAGCTGATTGAA
AGGCTGCTCAAAACTTCCTCCTTCAATGTTACGGCTGTGGATTCTGGAAGCAAGGCTTTGGAGCTTCTGGGTTTGGTTAGAGAGAGAAATGGAAGCATCCATTCTCCTTT
TTCCCCTGAAAATCATAATCATCAACATCATCAAGAGATTGAAGTTAATCTCATCATTACAGATTACTGTATGCCAGAAATGACAGGCTATGATCTTCTAAGAAAGATCA
AGGCAAGTTTCTTCTTCTTTTCAAAACATAAGGCTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALVSSNAQFHVLAVDDSLVDRKLIERLLKTSSFNVTAVDSGSKALELLGLVRERNGSIHSPFSPENHNHQHHQEIEVNLIITDYCMPEMTGYDLLRKIKASFFFFSKHK
A