| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6601044.1 putative RNA-binding protein ARP1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 9.1e-88 | 97.6 | Show/hide |
Query: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Subjt: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Query: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEG
GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHP QAVPFYGYSPSPTYIATDISYNH G
Subjt: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEG
|
|
| KAG7031855.1 putative RNA-binding protein ARP1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 1.1e-146 | 100 | Show/hide |
Query: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Subjt: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Query: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEGGVYERRALRADISGAGHGGGEHIDADVPGVSLP
GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEGGVYERRALRADISGAGHGGGEHIDADVPGVSLP
Subjt: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEGGVYERRALRADISGAGHGGGEHIDADVPGVSLP
Query: SITGDGDAGTHIPAKSDGGWAISGGSTHFHYVETRIRWPQPRSVFSSISVLSYCVLLG
SITGDGDAGTHIPAKSDGGWAISGGSTHFHYVETRIRWPQPRSVFSSISVLSYCVLLG
Subjt: SITGDGDAGTHIPAKSDGGWAISGGSTHFHYVETRIRWPQPRSVFSSISVLSYCVLLG
|
|
| XP_022957201.1 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X1 [Cucurbita moschata] | 4.2e-85 | 95.81 | Show/hide |
Query: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFK+AESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Subjt: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Query: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEG
GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWY PAGTHPTAFHH P QAVPFYGYSPSPTYIATDISYNH G
Subjt: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEG
|
|
| XP_022957203.1 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X3 [Cucurbita moschata] | 4.2e-85 | 95.81 | Show/hide |
Query: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFK+AESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Subjt: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Query: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEG
GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWY PAGTHPTAFHH P QAVPFYGYSPSPTYIATDISYNH G
Subjt: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEG
|
|
| XP_022957204.1 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X4 [Cucurbita moschata] | 4.2e-85 | 95.81 | Show/hide |
Query: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFK+AESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Subjt: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Query: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEG
GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWY PAGTHPTAFHH P QAVPFYGYSPSPTYIATDISYNH G
Subjt: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEG
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1GYI1 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X2 | 2.0e-85 | 93.64 | Show/hide |
Query: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFK+AESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Subjt: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Query: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNH---VTEGGVY
GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWY PAGTHPTAFHH P QAVPFYGYSPSPTYIATDISYNH GG Y
Subjt: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNH---VTEGGVY
|
|
| A0A6J1GYK4 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X1 | 2.0e-85 | 95.81 | Show/hide |
Query: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFK+AESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Subjt: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Query: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEG
GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWY PAGTHPTAFHH P QAVPFYGYSPSPTYIATDISYNH G
Subjt: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEG
|
|
| A0A6J1GYL2 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X6 | 2.0e-85 | 93.64 | Show/hide |
Query: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFK+AESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Subjt: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Query: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNH---VTEGGVY
GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWY PAGTHPTAFHH P QAVPFYGYSPSPTYIATDISYNH GG Y
Subjt: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNH---VTEGGVY
|
|
| A0A6J1GZW6 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X5 | 2.0e-85 | 95.81 | Show/hide |
Query: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFK+AESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Subjt: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Query: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEG
GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWY PAGTHPTAFHH P QAVPFYGYSPSPTYIATDISYNH G
Subjt: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEG
|
|
| A0A6J1H1A2 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X4 | 2.0e-85 | 95.81 | Show/hide |
Query: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFK+AESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Subjt: MFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQ
Query: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEG
GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWY PAGTHPTAFHH P QAVPFYGYSPSPTYIATDISYNH G
Subjt: GPQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVTEG
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q5ZJX4 RNA-binding protein 38 | 2.1e-23 | 59.09 | Show/hide |
Query: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSS
DTT TK+FVGGL + T ++R +FE FGDI EAV+ITD+ TG+S+GYGFVT D +A++AC+D PII+GR+AN NLA LGA+ S
Subjt: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSS
|
|
| Q6GQD3 RNA-binding protein 24-A | 2.8e-23 | 60 | Show/hide |
Query: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
DTT TK+FVGGL + T ++R +FE FGDI EAV+ITD+ TG+S+GYGFVT D +A++AC+D PII+GR+AN NLA LGA+
Subjt: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
|
|
| Q6P8A7 RNA-binding protein 24 | 2.8e-23 | 60 | Show/hide |
Query: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
DTT TK+FVGGL + T ++R +FE FGDI EAV+ITD+ TG+S+GYGFVT D +A++AC+D PII+GR+AN NLA LGA+
Subjt: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
|
|
| Q9I8B3 RNA-binding protein 24-B | 2.8e-23 | 60 | Show/hide |
Query: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
DTT TK+FVGGL + T ++R +FE FGDI EAV+ITD+ TG+S+GYGFVT D +A++AC+D PII+GR+AN NLA LGA+
Subjt: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
|
|
| Q9M1S3 Probable RNA-binding protein ARP1 | 6.2e-47 | 60.82 | Show/hide |
Query: FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQG
FGDT LTKVFVGGLAW+T KEAM DHF K+GDILEAVII+DKLT RSKGYGFVTFKDA++A +ACEDS PIINGRRANCNLASLG R +P QG
Subjt: FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQG
Query: PQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVT--EGGVY
P+ G+ R T GNH QWY P+G QAVPFYGY PS Y+A ++++N GG Y
Subjt: PQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVT--EGGVY
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G20880.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 9.5e-35 | 55.56 | Show/hide |
Query: FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQG
FGDTT TKVFVGGLAWET E +R HF+++GDILEAV+ITDK TGRSKGYGFVTF+D E+A++AC D PII+GRRANCNLASLG R A P
Subjt: FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQG
Query: PQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTY
P G R S G+ VQ P G H F HP P Y Y Y
Subjt: PQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTY
|
|
| AT1G22910.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.5e-37 | 53.59 | Show/hide |
Query: GDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQGP
GDTT TKVFVGGLAWET KE M+ HFE+FG+ILEAV+ITDK +GRSKGYGFVTF++AE+A+ AC D+ P+I+GRRANCNLASLG +RS P P
Subjt: GDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQGP
Query: QPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSP-SPTY
G G + + P P F H+P + +GYSP SP Y
Subjt: QPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSP-SPTY
|
|
| AT1G22910.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.5e-37 | 53.59 | Show/hide |
Query: GDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQGP
GDTT TKVFVGGLAWET KE M+ HFE+FG+ILEAV+ITDK +GRSKGYGFVTF++AE+A+ AC D+ P+I+GRRANCNLASLG +RS P P
Subjt: GDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQGP
Query: QPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSP-SPTY
G G + + P P F H+P + +GYSP SP Y
Subjt: QPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSP-SPTY
|
|
| AT1G22910.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.3e-36 | 39.77 | Show/hide |
Query: GDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQGP
GDTT TKVFVGGLAWET KE M+ HFE+FG+ILEAV+ITDK +GRSKGYGFVTF++AE+A+ AC D+ P+I+GRRANCNLASLG +RS P P
Subjt: GDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQGP
Query: QPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSP-SPTYIATDISYNHV---TEGGVYERRALRADISGAGHGGGEHIDADVPGVS
G G + + P P F H+P + +GYSP SP Y + + + T GG Y + G + GG + A +
Subjt: QPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSP-SPTYIATDISYNHV---TEGGVYERRALRADISGAGHGGGEHIDADVPGVS
Query: LPSITGDGDAGTHIPAKSDGGWAISGGSTHFHYVETRIRWPQPRSVFSSISVLSYCVLL
G G G +S + H HY Q S S SY + L
Subjt: LPSITGDGDAGTHIPAKSDGGWAISGGSTHFHYVETRIRWPQPRSVFSSISVLSYCVLL
|
|
| AT3G54770.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.4e-48 | 60.82 | Show/hide |
Query: FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQG
FGDT LTKVFVGGLAW+T KEAM DHF K+GDILEAVII+DKLT RSKGYGFVTFKDA++A +ACEDS PIINGRRANCNLASLG R +P QG
Subjt: FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGDILEAVIITDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRSSRSASATPPQG
Query: PQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVT--EGGVY
P+ G+ R T GNH QWY P+G QAVPFYGY PS Y+A ++++N GG Y
Subjt: PQPGSNGGAPRTTSAAAGNHVQWYCPAGTHPTAFHHHPLQAVPFYGYSPSPTYIATDISYNHVT--EGGVY
|
|
