; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg02353 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg02353
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionCASP-like protein
Genome locationCarg_Chr15:1946284..1946723
RNA-Seq ExpressionCarg02353
SyntenyCarg02353
Gene Ontology termsGO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006702 - Casparian strip membrane protein domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7016239.1 CASP-like protein 4D1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.6e-55100Show/hide
Query:  MGTYYTLNDSYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAF
        MGTYYTLNDSYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAF
Subjt:  MGTYYTLNDSYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAF

Query:  FCSAAVSILSSFAFSKRP
        FCSAAVSILSSFAFSKRP
Subjt:  FCSAAVSILSSFAFSKRP

XP_022939491.1 CASP-like protein 4D1 [Cucurbita moschata]8.7e-4693.58Show/hide
Query:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSIL
        +YRY+LATIIV +VFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFF KAYA SALLLFAFFCSAAVSIL
Subjt:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSIL

Query:  SSFAFSKRP
        SSFA SKRP
Subjt:  SSFAFSKRP

XP_022939492.1 CASP-like protein 4D1 [Cucurbita moschata]3.6e-3984.4Show/hide
Query:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSIL
        +YRY+LATII+GVVFNLLQIAFSL NIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLAT TAAGFG+SVDLQ T DP+D FGTFF KAYA SALLLFAFFCSAAVSI+
Subjt:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSIL

Query:  SSFAFSKRP
        SSFA SKRP
Subjt:  SSFAFSKRP

XP_022992767.1 CASP-like protein 4D1 [Cucurbita maxima]5.5e-4085.32Show/hide
Query:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSIL
        +YRY+LATII+G+VFNLLQIAFSLFNIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLAT TAAGFG+SVDLQ T DP+D FGTFF KAYA SALLLFAFFCSAAVSIL
Subjt:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSIL

Query:  SSFAFSKRP
        SSFA SKRP
Subjt:  SSFAFSKRP

XP_023549516.1 CASP-like protein 4D1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.4e-4084.4Show/hide
Query:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSIL
        +YRY+LATII+G+VFNLLQIAFSLFNIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLAT TAAGFG+SVDLQ T DP+D FGTFF KAYA SALLLFAFFCSAAVSI+
Subjt:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSIL

Query:  SSFAFSKRP
        SSFA SKRP
Subjt:  SSFAFSKRP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KU83 CASP-like protein8.0e-3782.24Show/hide
Query:  YRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSILS
        +RYMLATII+G+VFNLLQIAFSLFNIVKN +GTILFDFFGDKFLSYLLAT  AAGFGV VDL++  DP+DLF  FF KAYA S LLLFAFFCSAAVSILS
Subjt:  YRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSILS

Query:  SFAFSKR
        SFA SKR
Subjt:  SFAFSKR

A0A1S3C9H1 CASP-like protein1.1e-3885.05Show/hide
Query:  YRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSILS
        +RYMLATII+G+VFNLLQIAFSLFNIVKN +GTILFDFFGDKFLSYLLAT  AAGFGV VDL++ KDP+DLF TFF KAYA SALLLFAFFCSAAVSILS
Subjt:  YRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSILS

Query:  SFAFSKR
        SFA SKR
Subjt:  SFAFSKR

A0A6J1FG26 CASP-like protein4.2e-4693.58Show/hide
Query:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSIL
        +YRY+LATIIV +VFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFF KAYA SALLLFAFFCSAAVSIL
Subjt:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSIL

Query:  SSFAFSKRP
        SSFA SKRP
Subjt:  SSFAFSKRP

A0A6J1FGY1 CASP-like protein1.7e-3984.4Show/hide
Query:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSIL
        +YRY+LATII+GVVFNLLQIAFSL NIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLAT TAAGFG+SVDLQ T DP+D FGTFF KAYA SALLLFAFFCSAAVSI+
Subjt:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSIL

Query:  SSFAFSKRP
        SSFA SKRP
Subjt:  SSFAFSKRP

A0A6J1JQU5 CASP-like protein2.7e-4085.32Show/hide
Query:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSIL
        +YRY+LATII+G+VFNLLQIAFSLFNIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLAT TAAGFG+SVDLQ T DP+D FGTFF KAYA SALLLFAFFCSAAVSIL
Subjt:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAAVSIL

Query:  SSFAFSKRP
        SSFA SKRP
Subjt:  SSFAFSKRP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B9SXY8 CASP-like protein 4D11.2e-1843.36Show/hide
Query:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLF-----NIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSA
        +YRYMLATI++G+ + +LQIAF+L+     N + + +G + FDFFGDK +SY+L T  AAGF  + D++        F  F  K YA+++LLL  F C+A
Subjt:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLF-----NIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSA

Query:  AVSILSSFAFSKR
         +S+ SS+A  K+
Subjt:  AVSILSSFAFSKR

C6T1Z6 CASP-like protein 4D11.0e-1747.15Show/hide
Query:  GTYYTLND--SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVK-NR----NGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSA
        G     ND  +YRYM++TII+G  +NLLQ+A S+F +V  NR    +G  LFDFFGDK +SYLL + +AAGFGV+V+L R         +F  KA A+++
Subjt:  GTYYTLND--SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVK-NR----NGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSA

Query:  LLLFAFFCSAAVSILSSFAFSKR
        LLL AF  +A  S  +SFA  K+
Subjt:  LLLFAFFCSAAVSILSSFAFSKR

D7LD60 CASP-like protein 4D12.6e-1642.74Show/hide
Query:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTI--LFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRT------KDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFF
        +YRYML+  ++G+++ ++Q+  ++          +   F+F+GDK +SYLLAT +AAGFGVS DL+ T       D  D    FF K YA+++LLLFAF 
Subjt:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTI--LFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRT------KDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFF

Query:  CSAAVSILSSFAFSKRP
          A +S+ SS A SKRP
Subjt:  CSAAVSILSSFAFSKRP

Q56X75 CASP-like protein 4D21.8e-1746.15Show/hide
Query:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNI---VKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRT------KDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAF
        +YRYML+  ++G+V+ ++Q+ F++      VKN     L DF+GDK +SYL+AT +AAGFGV+ DL+ T       D  D    FF K YA+++LLLFAF
Subjt:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNI---VKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRT------KDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAF

Query:  FCSAAVSILSSFAFSKR
         C A +S+ SSFA +KR
Subjt:  FCSAAVSILSSFAFSKR

Q8GWD5 CASP-like protein 4D14.7e-1847.86Show/hide
Query:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQ--IAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTK------DPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFF
        +YRYML+  ++G+V+ ++Q  +  S F   K    T  FDF+GDK +SYLLAT +AAGFGVS DL+ T       D  D    FF K YA+++LLLFAF 
Subjt:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQ--IAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTK------DPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFF

Query:  CSAAVSILSSFAFSKRP
          A +S+ SS A SKRP
Subjt:  CSAAVSILSSFAFSKRP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39518.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)1.3e-1846.15Show/hide
Query:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNI---VKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRT------KDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAF
        +YRYML+  ++G+V+ ++Q+ F++      VKN     L DF+GDK +SYL+AT +AAGFGV+ DL+ T       D  D    FF K YA+++LLLFAF
Subjt:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNI---VKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRT------KDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAF

Query:  FCSAAVSILSSFAFSKR
         C A +S+ SSFA +KR
Subjt:  FCSAAVSILSSFAFSKR

AT2G39530.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)3.3e-1947.86Show/hide
Query:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQ--IAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTK------DPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFF
        +YRYML+  ++G+V+ ++Q  +  S F   K    T  FDF+GDK +SYLLAT +AAGFGVS DL+ T       D  D    FF K YA+++LLLFAF 
Subjt:  SYRYMLATIIVGVVFNLLQ--IAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTK------DPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFF

Query:  CSAAVSILSSFAFSKRP
          A +S+ SS A SKRP
Subjt:  CSAAVSILSSFAFSKRP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTACATATTATACACTAAATGATTCTTATAGGTACATGCTTGCTACTATCATCGTCGGGGTTGTATTCAACCTCTTGCAGATCGCGTTCTCCCTCTTTAAT
ATCGTTAAGAATCGAAACGGTACCATACTATTTGATTTCTTTGGCGACAAGTTTTTGTCGTATCTTCTAGCAACAAGCACAGCAGCTGGGTTTGGAGTTTCAGTG
GATTTGCAAAGAACAAAGGACCCAGAGGATTTGTTTGGAACGTTCTTTGGTAAGGCATATGCAACCTCAGCTCTTCTCTTATTTGCATTCTTTTGTTCTGCCGCT
GTCTCTATTCTCTCTTCCTTTGCGTTCTCAAAAAGACCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTACATATTATACACTAAATGATTCTTATAGGTACATGCTTGCTACTATCATCGTCGGGGTTGTATTCAACCTCTTGCAGATCGCGTTCTCCCTCTTTAAT
ATCGTTAAGAATCGAAACGGTACCATACTATTTGATTTCTTTGGCGACAAGTTTTTGTCGTATCTTCTAGCAACAAGCACAGCAGCTGGGTTTGGAGTTTCAGTG
GATTTGCAAAGAACAAAGGACCCAGAGGATTTGTTTGGAACGTTCTTTGGTAAGGCATATGCAACCTCAGCTCTTCTCTTATTTGCATTCTTTTGTTCTGCCGCT
GTCTCTATTCTCTCTTCCTTTGCGTTCTCAAAAAGACCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGTYYTLNDSYRYMLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFGDKFLSYLLATSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKAYATSALLLFAFFCSAA
VSILSSFAFSKRP