CuGenDBv2

Gene ID	Carg02363
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	40S ribosomal protein S15a
Genome location	Carg_Chr15:1993769..1995730
RNA-Seq Expression	Carg02363
Synteny	Carg02363
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0005840 - ribosome (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domains	IPR000630 - Ribosomal protein S8 IPR035987 - Ribosomal protein S8 superfamily

Homology

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GenBank top hits

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KJB83794.1 hypothetical protein B456_013G265000 [Gossypium raimondii]

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MBA0574627.1 hypothetical protein [Gossypium lobatum]

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XP_022134546.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Momordica charantia]

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A0A1U8NNK5 40S ribosomal protein S15a-1

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A0A6J1BY30 40S ribosomal protein S15a-1

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A0A6J1FJB0 40S ribosomal protein S15a-1

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A0A6J1I5M1 40S ribosomal protein S15a-1-like

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A0A6J1JX40 40S ribosomal protein S15a-1

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O80646 40S ribosomal protein S15a-3

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P42798 40S ribosomal protein S15a-1

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Q00332 40S ribosomal protein S15a

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Q9AT34 40S ribosomal protein S15a

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Q9LX88 40S ribosomal protein S15a-4

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AT1G07770.1 ribosomal protein S15A

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AT1G07770.2 ribosomal protein S15A

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AT2G39590.1 Ribosomal protein S8 family protein

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AT3G46040.1 ribosomal protein S15A D

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AT5G59850.1 Ribosomal protein S8 family protein

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

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AAGTTTCTTCTTGTTATGCAGAAGCATGGATACATTGGGGAATTTGAGTATGTTGATGATCATAGGTCAGGGAAAATCGTCGTTGAACTGAATGGGAGACTCAAC
AAATGTGGTGTCATTAGTCCCCGTTTTGATGTGGGTGTCAAGGAGATTGAAGGTTGGACTGCAAGGTTGCTACCCTCAAGACAGTTTGGATTCATTGTGTTGACA
ACATCTGCGGGAATCATGGATCATGAAGAGGCCAGAAGAAAGAACGTTGGTGGTAAAGTGCTTGGCTTCTTCTACTAA

mRNA sequence

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TCATTTTCTATCGCTACTGACGTTGTAATCTAGAAATTTGTTTTGTCTTTCATCTTTTATGTTCAATTACTTGTTCTAGTTGATGGTTTAAGTATATACGTCGAA
TTTATATACTGTTCGAGAGAGAACTTGGAAGTCGCCGGACAGGGTTGATTGCATGATTTGTTGATTAATCTCATAGATTTTCTTGTTATTTAATGGTTCCCATTA
AAACTAGGGTTTTAGGAATTGGGAACGATATACACATTATTCGGTTCCAAGAGTGGTGGCTGGCAGTTTGTATAGGACGATATAGTGATTCTTGTAAGCCGTCAG
TCGATGAAGGGTTGATTGTATGGTTTGTTAATTAATCTTATGGCTTGTTTTGTTATTTAATGATTCCCATTTGAACTAGGGTTTTACGAATTGGGAACGATATTC
GCATTATTTGGGTCTAAGAGTGGTGACTGCCAGTTTGTAAGATGATAAAATGATCTTTCTAGTTGTTAAGTCTAATTTTGCGACATACTTAACTTGAAATGTGGG
GATTTACGTATTTGCAGTAACAATGGTGCGTGTGAGTGTTCTGAATGATGCTCTTAAAAGCATGTACAATGCTGAGAAACGGGGGAAGCGCCAGGTCATGATAAG
GCCATCTTCCAAAGTTATCATCAAGTTTCTTCTTGTTATGCAGAAGCATGGATACATTGGGGAATTTGAGTATGTTGATGATCATAGGTCAGGGAAAATCGTCGT
TGAACTGAATGGGAGACTCAACAAATGTGGTGTCATTAGTCCCCGTTTTGATGTGGGTGTCAAGGAGATTGAAGGTTGGACTGCAAGGTTGCTACCCTCAAGACA
GTTTGGATTCATTGTGTTGACAACATCTGCGGGAATCATGGATCATGAAGAGGCCAGAAGAAAGAACGTTGGTGGTAAAGTGCTTGGCTTCTTCTACTAAGCAAT
GCCATGAGATTTATTTCTTCATTCGGTATTTTCTGCACCTTTGAACTTAAATGGGAAGCAGTAGAGAGTCCTGTTTTGTTTTAGTTGCCGTTTTGGTTAGTGGGA
GGATACAGGATTTGGCCTGCATTCTTTTTGAAGACGTTGATATTGTTTAATGAGCCTTTTCTTAATCTATTAGTTCTATTTGTTTTACCATACTGAACTGAAATT
GTTGTAGTTGGTCAAGCTTCTGAATTGATTGCAATTTTCTCGAACCACATTGATCTTCCCACACCATCGATTTGTTTGTCGTATAGCGCCTATGCGTATGGTTTC
GGCATTTCGCATAAGCAAGTGTTTATGGTCATTTTTGCTTGAATGAATCATGGTTAAGACATACGTTATCTACTGATTGATTAGTAAAAGAAAATAAAGCATTCC
AGCTGATGATCACTACTAGGAAGTGATCTGCCTTTCTGGACAACTAGGTGCCATGGTTGATATAAATCATAGAGCTCATAATCGCGGTATTAAAGGATTTCTTGT
TATTTTGTAGCTCAATTATGAAGAGATTTGAACTGTTGATCTCTTAATGAAGAGAAGAGGGATGTCTTGACTAATCGAGTTAAGTGAAACTTGATAACTCTTTAC
TGCATATCCATGCTATTGACAGGTTTCATTATCTGTACAGTTATATTTATAATTATCTAGACTTTAAACTTTCTAATTAGATCTTAAACTTAATT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MVRVSVLNDALKSMYNAEKRGKRQVMIRPSSKVIIKFLLVMQKHGYIGEFEYVDDHRSGKIVVELNGRLNKCGVISPRFDVGVKEIEGWTARLLPSRQFGFIVLT
TSAGIMDHEEARRKNVGGKVLGFFY

Carg02363 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome