; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg02428 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg02428
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionRibosomal protein S14
Genome locationCarg_Chr15:2332042..2332347
RNA-Seq ExpressionCarg02428
SyntenyCarg02428
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0015935 - small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001209 - Ribosomal protein S14
IPR018271 - Ribosomal protein S14, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032953.1 Ribosomal protein S14, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.2e-4999.01Show/hide
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XP_022134507.1 uncharacterized protein LOC111006733 [Momordica charantia]8.8e-4796.04Show/hide
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XP_022938933.1 uncharacterized protein LOC111444996 [Cucurbita moschata]1.1e-49100Show/hide
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XP_023550870.1 uncharacterized protein LOC111808878 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-4999.01Show/hide
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A0A0A0LSR8 Uncharacterized protein3.7e-4386.14Show/hide
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A0A1S4E169 ribosomal protein S14, mitochondrial5.8e-4487.13Show/hide
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A0A5D3CKB3 Ribosomal protein S145.8e-4487.13Show/hide
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A0A6J1C264 uncharacterized protein LOC1110067334.3e-4796.04Show/hide
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A0A6J1FKA4 uncharacterized protein LOC1114449965.4e-50100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P05716 Ribosomal protein S14, mitochondrial3.3e-3673.47Show/hide
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P14875 Ribosomal protein S14, mitochondrial3.5e-3874.49Show/hide
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P26873 Ribosomal protein S14, mitochondrial1.1e-3169.15Show/hide
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P46752 Ribosomal protein S14, mitochondrial5.6e-2056.52Show/hide
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P49387 Ribosomal protein S14, mitochondrial2.1e-3571.43Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34520.1 mitochondrial ribosomal protein S147.5e-3671.13Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CAACGATGTGCGTGAAGAGCATCGTTATAAGCTGTCGAAGTTGCCAAGAAATAGTTCGTTCACTCGATTGAGGAATCGCTGCATTTTCACCGGTCGGCCTAGGGGTGTCT
ACCAGCTTTTCCGTGTTTCTCGTATCGTTTTCCGTGATCTGGCGTCCAAAGGTCTTATAATGGGCGTCAAGAAATCTTCTTGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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