; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg02439 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg02439
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionzinc finger protein ZAT5-like
Genome locationCarg_Chr15:2402466..2403306
RNA-Seq ExpressionCarg02439
SyntenyCarg02439
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578792.1 Zinc finger protein ZAT5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.9e-12699.15Show/hide
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KAG7016322.1 Zinc finger protein ZAT5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.1e-141100Show/hide
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XP_022939503.1 zinc finger protein ZAT5-like [Cucurbita moschata]2.0e-14099.61Show/hide
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XP_022992979.1 zinc finger protein ZAT5-like [Cucurbita maxima]5.6e-10686.01Show/hide
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         R NLLCLELDLNLPAAEEDKRD+SGVVSMAAMD VSSHYREH
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XP_038885865.1 zinc finger protein ZAT5-like [Benincasa hispida]6.3e-7363.95Show/hide
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        M+PN FSE PN ELLG+C    N SSSSSS  G  GG      +D+ EDVA CLILL+QGLPA SQPSSS+ KF   P+GQNGA KAA+C AYECKTC R
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        TFPSF+ALGGHRSSHKN AMAA D  K ISGT+  YK QQQRLNN  S+ FD LRM+R+ YY+         K HE SVCG++F S QAL GHMRRHRRG
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        CG   RDS EI  R P++ RSNLL L+LDLN PA E+DKRD+SGVV+MAA + V  HY
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LQC1 Uncharacterized protein6.6e-3652.55Show/hide
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        N +++G C+   + SS       G   GG+D+ ED+A CLILL+QG P  ASQPSS S+ KF    P+GQNGA KAA+  AYECKTC RTFPSF+ALGGH
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        RSSH +      P     +  SIS TSP  K  QQR   NN +S+  D +RM+RT YY+         K HE SVCG+DF S QAL GHMRRHRRG
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A0A1S3C335 zinc finger protein ZAT5-like1.5e-5655.43Show/hide
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        M PN  SE    N E++G      NLSSSS+S   G   G   G ++E ED+A CLILL+QG P ASQPSS S+ KFI  P+GQNGA KAA+C  Y+CKT
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        C RTFPSF+ALGGHRSS  HKN A+ A   D K IS TSPA K  +QR   NN +S+  D +RM+R+ YY+          K HE SVCG+DF S QAL 
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        GHMRRHRRGCG   RDS EI  R  ++ RSNLLCL+L+LNLPA E DKR+  G V+M A + V  HY
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A0A5D3BNW6 Zinc finger protein ZAT5-like5.2e-4149.06Show/hide
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        M PN  SE    N E++G      NLSSSS+S   G   G   G ++E ED+A CLILL+QG P ASQPSS S+ KFI  P+GQN               
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                 ALGGHRSS  HKN A+ A   D K IS TSPA K  +QR   NN +S+  D +RM+R+ YY+          K HE SVCG+DF S QAL 
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        GHMRRHRRGCG   RDS EI  R  ++ RSNLLCL+L+LNLPA E DKR+  G V+M A + V  HY
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A0A6J1FLT9 zinc finger protein ZAT5-like9.9e-14199.61Show/hide
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        ALGGHRSSHKNPAMAAGDQKSISGTSPAYKHQQQRLNNTISSPFDPLRMNRTGYYHKTHEFSVCGS FTSVQALSGHMRRHRRGCGRDSGEIAHRRPQRH
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A0A6J1JYY6 zinc finger protein ZAT5-like2.7e-10686.01Show/hide
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        RALGGHRSSHKNPAMAAGDQKSISGTSPAYKHQQQRLNNTISSPFD LRMNRTGYYHKTHE SVCGSDFTSVQALSGHMRRH RGCGRDSGEI HR    
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         R NLLCLELDLNLPAAEEDKRD+SGVVSMAAMD VSSHYREH
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q42453 Zinc finger protein ZAT71.7e-0933.1Show/hide
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        E++  AKCL+LLS+                   G+ G G   +   + CKTC + F SF+ALGGHR+SHK   +   D  S+ G+          L+N  
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Query:  SSPFDPLRMNRTGYYHKTHEFSVCGSDFTSVQALSGHMRRHR
               +  +T     +H   +CG  F   QAL GHMRRHR
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Q681X4 Zinc finger protein ZAT53.6e-2334.39Show/hide
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        ++S+SSS GG GG    S                 E+ED+A CLI+L++G     P     + I     Q  + + +  Y YECKTC+RTF SF+ALGGH
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Query:  RSSHKNPAMAAGDQKSISGTSPAYKHQQQRLNN---TISSPFDPLRMNRTGYYHKTHEFSVCGSDFTSVQALSGHMRRHRRGCGRDSGEIAHRRPQRH--
        R+SHK P  +  ++  +  T P     ++  N+      S       N     +K HE S+CGS+FTS QAL GHMRRHR      S   A     R+  
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Query:  ------------RSNLLCLELDLNLPAAEEDKRDR--SGVVSMAAMDRVSSHY
                          L LDLNLPA E+D R+    G+V  A    +  HY
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Q9LFG0 Zinc finger protein ZAT184.1e-1130.73Show/hide
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        D+ + L++LS+        S +VK I+    Q+   K      +ECKTC+R F SF+ALGGHR+SHK P +   DQ+ +       KH+ +         
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Query:  FDPLRMNRTGYYHKTHEFSVCGSDFTSVQALSGHMRRHRRGCGRDSG---EIAHRRPQRHRSNLLCLELDLNLPAAEED
                    +  H+ ++C   F + QAL GHMR+HR     +      + + RP  +R +     LDLNL   E D
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Q9M202 Zinc finger protein ZAT93.5e-1029.12Show/hide
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        +ED+A CL++LS+       S+  V    +  E  +G N   +A     Y+C+TC + F S++ALGGHR+SHK        +  +S      + + +  N
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Query:  NTISSPFDPLRMNRTGYYHKTHEFSVCGSDFTSVQALSGHMRRHRRGCGRDSGEIAHRRPQRHRSNLLCLELDLNLPAAEED
          + +              + HE  +C   F S QAL GH R H  G G  S  +  +R      ++    +DLNLPA  E+
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Q9SLD4 Zinc finger protein ZAT112.1e-1535.36Show/hide
Query:  DVAKCLILLSQGLPASQPSSSMVKFIEAPQGQNGAGKAAECYAYECKTCSRTFPSFRALGGHRSSHKNPAMAAGDQKSISGTSPAYKHQQQRLNNTISSP
        D+AKCL++L+Q        +SMVK I    G N   ++     +ECKTC++ F SF+ALGGHR+SHK P +   +QK +   S  YK             
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Query:  FDPLRMNRTGYYHKTHEFSVCGSDFTSVQALSGHMRRHRRGCGRDSGEIAHRRP-----QRHRSNLLCLELDLNLPAAEED
                  ++HK    S+C   F + QAL GHMRRHR     +   I+   P     +R  S+   L LDLNL   E D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G28200.1 C2H2-type zinc finger family protein2.6e-2434.39Show/hide
Query:  LSSSSSSIGGGGGGGGGSGG-------------EDEQEDVAKCLILLSQGLPASQPSSSMVKFIEAPQGQNGAGKAAECYAYECKTCSRTFPSFRALGGH
        ++S+SSS GG GG    S                 E+ED+A CLI+L++G     P     + I     Q  + + +  Y YECKTC+RTF SF+ALGGH
Subjt:  LSSSSSSIGGGGGGGGGSGG-------------EDEQEDVAKCLILLSQGLPASQPSSSMVKFIEAPQGQNGAGKAAECYAYECKTCSRTFPSFRALGGH

Query:  RSSHKNPAMAAGDQKSISGTSPAYKHQQQRLNN---TISSPFDPLRMNRTGYYHKTHEFSVCGSDFTSVQALSGHMRRHRRGCGRDSGEIAHRRPQRH--
        R+SHK P  +  ++  +  T P     ++  N+      S       N     +K HE S+CGS+FTS QAL GHMRRHR      S   A     R+  
Subjt:  RSSHKNPAMAAGDQKSISGTSPAYKHQQQRLNN---TISSPFDPLRMNRTGYYHKTHEFSVCGSDFTSVQALSGHMRRHRRGCGRDSGEIAHRRPQRH--

Query:  ------------RSNLLCLELDLNLPAAEEDKRDR--SGVVSMAAMDRVSSHY
                          L LDLNLPA E+D R+    G+V  A    +  HY
Subjt:  ------------RSNLLCLELDLNLPAAEEDKRDR--SGVVSMAAMDRVSSHY

AT2G37430.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein1.5e-1635.36Show/hide
Query:  DVAKCLILLSQGLPASQPSSSMVKFIEAPQGQNGAGKAAECYAYECKTCSRTFPSFRALGGHRSSHKNPAMAAGDQKSISGTSPAYKHQQQRLNNTISSP
        D+AKCL++L+Q        +SMVK I    G N   ++     +ECKTC++ F SF+ALGGHR+SHK P +   +QK +   S  YK             
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Query:  FDPLRMNRTGYYHKTHEFSVCGSDFTSVQALSGHMRRHRRGCGRDSGEIAHRRP-----QRHRSNLLCLELDLNLPAAEED
                  ++HK    S+C   F + QAL GHMRRHR     +   I+   P     +R  S+   L LDLNL   E D
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AT3G10470.1 C2H2-type zinc finger family protein4.8e-2331.73Show/hide
Query:  MNPNGFSEPNSELLGRCNLSSSSSSIGGGGGGGGGSGGEDEQEDVAKCLILLSQG--LPASQPS--------------------------SSMVKFIEAP
        +N N     N+ L+     SSS+SS          +  E++Q D+A CLILL+QG  LP  QP                           SS  +F+E  
Subjt:  MNPNGFSEPNSELLGRCNLSSSSSSIGGGGGGGGGSGGEDEQEDVAKCLILLSQG--LPASQPS--------------------------SSMVKFIEAP

Query:  QGQ----NGAGKAAECYAYECKTCSRTFPSFRALGGHRSSHKNPAMAAG-----DQKSISGTSPAYKHQQQRLNNT--ISSPFDPLRMNRTGYYHKTHEF
               NG G  A  Y Y+CKTC RTFPSF+ALGGHR+SHK P  A G     D K  +       H    L  T   +S    L +   G  +K HE 
Subjt:  QGQ----NGAGKAAECYAYECKTCSRTFPSFRALGGHRSSHKNPAMAAG-----DQKSISGTSPAYKHQQQRLNNT--ISSPFDPLRMNRTGYYHKTHEF

Query:  SVCGSDFTSVQALSGHMRRHR----RGCGRDSGEIA---------------------------HRRPQRHRSNLLCLELDLNLPAAEEDKRDRSGVVSMA
         +CG++FTS QAL GHMRRHR          +  ++                               +R RS ++ L+LDLNLPA E++ R     V+  
Subjt:  SVCGSDFTSVQALSGHMRRHR----RGCGRDSGEIA---------------------------HRRPQRHRSNLLCLELDLNLPAAEEDKRDRSGVVSMA

Query:  AMDRVSSHYREH
        +      H +EH
Subjt:  AMDRVSSHYREH

AT5G03510.1 C2H2-type zinc finger family protein1.7e-2034.56Show/hide
Query:  GGEDEQEDVAKCLILLSQGLPA--SQPSSSMVKF----IEAPQGQNGAGKAAECYAYECKTCSRTFPSFRALGGHRSSHKNPAMAAGDQKSISGTSPAYK
        G  DE ED+A CLILLSQG  A  S    SM +      + P    G G       Y+CKTC ++F SF+ALGGHR+SHK P + A   K +   + +  
Subjt:  GGEDEQEDVAKCLILLSQGLPA--SQPSSSMVKF----IEAPQGQNGAGKAAECYAYECKTCSRTFPSFRALGGHRSSHKNPAMAAGDQKSISGTSPAYK

Query:  HQQQRLNNTISSPFDPLRMNRTG---YYHKTHEFSVCGSDFTSVQALSGHMRRHR------RGCGRDSGEIAHRRPQRHRSNLL---CLELDLNLPAAEE
          +      + S F  L++  +       KTHE S+C ++F+S QAL GHMRRHR               I+      H  ++     L+LDLNLPA E+
Subjt:  HQQQRLNNTISSPFDPLRMNRTG---YYHKTHEFSVCGSDFTSVQALSGHMRRHR------RGCGRDSGEIAHRRPQRHRSNLL---CLELDLNLPAAEE

Query:  DKRDRSGVVSMAAMDRV
        ++       + A+ D++
Subjt:  DKRDRSGVVSMAAMDRV

AT5G04390.1 C2H2-type zinc finger family protein5.9e-2131.96Show/hide
Query:  NPNGFSEPNSELLGRCNLSSSSSSIGGGGGGGGGSGGEDEQEDVAKCLILLSQG---------LPASQPSS----SMVKFIEAPQGQNGAGKAAECYAYE
        N  G  E N +  G    SSSS+S          +  ++E +D+A CLILL+QG         LP S  ++    +  +F+E     N  GKA   Y Y+
Subjt:  NPNGFSEPNSELLGRCNLSSSSSSIGGGGGGGGGSGGEDEQEDVAKCLILLSQG---------LPASQPSS----SMVKFIEAPQGQNGAGKAAECYAYE

Query:  CKTCSRTFPSFRALGGHRSSHKNPAMAAGDQKSISGTSPAYKHQQQRLNNTISSPFDPLRMNRTGYY-----HKTHEFSVCGSDFTSVQALSGHMRRHR-
        CKTC RTFPSF+ALGGHR+SHK P  AA    ++      Y +    L +T ++ F          Y     +K HE  +CG++FTS QAL GHMRRHR 
Subjt:  CKTCSRTFPSFRALGGHRSSHKNPAMAAGDQKSISGTSPAYKHQQQRLNNTISSPFDPLRMNRTGYY-----HKTHEFSVCGSDFTSVQALSGHMRRHR-

Query:  -------------------------RGCGRDSGEIAHR----RPQRHRS-NLLCLELDLNLPAAEEDKRDRSGVVSMAAMDRVSSHYREHR
                                      D     H+     P + ++  ++ L+LDLNLPA E++ R     V+  +     +H +EH+
Subjt:  -------------------------RGCGRDSGEIAHR----RPQRHRS-NLLCLELDLNLPAAEEDKRDRSGVVSMAAMDRVSSHYREHR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATCCAAATGGTTTTAGTGAACCAAATTCTGAGCTTCTTGGTCGCTGTAATTTATCTTCTTCCTCCTCATCCATTGGCGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGAAGCGG
CGGCGAGGATGAGCAGGAGGATGTGGCGAAGTGCCTCATCCTTCTTTCTCAAGGCCTACCAGCTTCTCAACCGTCCTCTTCGATGGTAAAATTCATCGAAGCCCCACAAG
GTCAAAATGGCGCGGGCAAGGCAGCAGAGTGTTACGCATACGAGTGCAAAACCTGCAGCCGAACATTCCCATCATTTCGAGCCCTAGGCGGCCATCGGTCTAGCCACAAG
AACCCCGCCATGGCCGCCGGCGACCAGAAATCGATCTCCGGCACATCGCCGGCCTACAAACATCAACAACAGCGACTCAACAACACCATTTCAAGCCCTTTCGATCCACT
TCGTATGAACCGAACCGGTTATTATCACAAGACGCACGAGTTCTCCGTCTGTGGCTCCGACTTCACTTCCGTCCAGGCCCTCAGCGGCCACATGCGCCGCCACCGCCGTG
GCTGCGGCAGAGATTCCGGCGAAATTGCTCATCGTCGTCCTCAGAGGCATAGAAGTAATTTGTTGTGTTTGGAATTGGATCTCAATCTTCCAGCCGCTGAAGAGGATAAA
AGAGATCGATCCGGCGTCGTTTCAATGGCCGCCATGGATCGGGTAAGCTCCCATTATCGAGAACATCGAGCATTTCTAATTGAAAAATTTAGGTTAAATTACAATTTCTA
A
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAATCCAAATGGTTTTAGTGAACCAAATTCTGAGCTTCTTGGTCGCTGTAATTTATCTTCTTCCTCCTCATCCATTGGCGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGAAGCGG
CGGCGAGGATGAGCAGGAGGATGTGGCGAAGTGCCTCATCCTTCTTTCTCAAGGCCTACCAGCTTCTCAACCGTCCTCTTCGATGGTAAAATTCATCGAAGCCCCACAAG
GTCAAAATGGCGCGGGCAAGGCAGCAGAGTGTTACGCATACGAGTGCAAAACCTGCAGCCGAACATTCCCATCATTTCGAGCCCTAGGCGGCCATCGGTCTAGCCACAAG
AACCCCGCCATGGCCGCCGGCGACCAGAAATCGATCTCCGGCACATCGCCGGCCTACAAACATCAACAACAGCGACTCAACAACACCATTTCAAGCCCTTTCGATCCACT
TCGTATGAACCGAACCGGTTATTATCACAAGACGCACGAGTTCTCCGTCTGTGGCTCCGACTTCACTTCCGTCCAGGCCCTCAGCGGCCACATGCGCCGCCACCGCCGTG
GCTGCGGCAGAGATTCCGGCGAAATTGCTCATCGTCGTCCTCAGAGGCATAGAAGTAATTTGTTGTGTTTGGAATTGGATCTCAATCTTCCAGCCGCTGAAGAGGATAAA
AGAGATCGATCCGGCGTCGTTTCAATGGCCGCCATGGATCGGGTAAGCTCCCATTATCGAGAACATCGAGCATTTCTAATTGAAAAATTTAGGTTAAATTACAATTTCTA
A
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNPNGFSEPNSELLGRCNLSSSSSSIGGGGGGGGGSGGEDEQEDVAKCLILLSQGLPASQPSSSMVKFIEAPQGQNGAGKAAECYAYECKTCSRTFPSFRALGGHRSSHK
NPAMAAGDQKSISGTSPAYKHQQQRLNNTISSPFDPLRMNRTGYYHKTHEFSVCGSDFTSVQALSGHMRRHRRGCGRDSGEIAHRRPQRHRSNLLCLELDLNLPAAEEDK
RDRSGVVSMAAMDRVSSHYREHRAFLIEKFRLNYNF