; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg02744 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg02744
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein EMBRYO SAC DEVELOPMENT ARREST 3, chloroplastic
Genome locationCarg_Chr02:7078785..7082520
RNA-Seq ExpressionCarg02744
SyntenyCarg02744
Gene Ontology termsGO:0006468 - protein phosphorylation (biological process)
GO:0048564 - photosystem I assembly (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004672 - protein kinase activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0031072 - heat shock protein binding (molecular function)
GO:0047134 - protein-disulfide reductase activity (molecular function)
GO:0051082 - unfolded protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036410 - Heat shock protein DnaJ, cysteine-rich domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_016900745.1 PREDICTED: protein EMBRYO SAC DEVELOPMENT ARREST 3, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]4.2e-8789.67Show/hide
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XP_022958131.1 protein PHOTOSYSTEM I ASSEMBLY 2, chloroplastic [Cucurbita moschata]1.9e-100100Show/hide
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XP_022996228.1 protein PHOTOSYSTEM I ASSEMBLY 2, chloroplastic [Cucurbita maxima]3.4e-9797.28Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KX46 Uncharacterized protein1.6e-8789.73Show/hide
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A0A1S4DYE8 protein EMBRYO SAC DEVELOPMENT ARREST 3, chloroplastic isoform X12.0e-8789.67Show/hide
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A0A6J1DK36 protein EMBRYO SAC DEVELOPMENT ARREST 3, chloroplastic2.5e-8586.49Show/hide
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A0A6J1H182 protein PHOTOSYSTEM I ASSEMBLY 2, chloroplastic9.4e-101100Show/hide
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A0A6J1KA92 protein PHOTOSYSTEM I ASSEMBLY 2, chloroplastic1.7e-9797.28Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A1D6KL43 Protein PHOTOSYSTEM I ASSEMBLY 2, chloroplastic8.9e-4873.39Show/hide
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        GLLRRP+A++LLDKM+NG++LP S
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B5YAR4 Chaperone protein DnaJ6.4e-0631.33Show/hide
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        G+  E     ++  P C+  G   G+  V CDMC GTG+ + + +       + T CP C+G G+++   C  C GTG    K
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O64750 Protein PHOTOSYSTEM I ASSEMBLY 2, chloroplastic2.0e-5259.47Show/hide
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        M ASSSHL A+P    S + P LS  N   V +   S  +++S  + DS + S+     +G +  +SRR W   C+C+S  LI +    ++   A  +D 
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        KP  +CRNC GSGAVLCDMCGGTGKWKALNRKRAKDVYEFTECPNCYGRGKLVCPVCLGTGLPNNKGLLRRP AR+LL+KM+NGRLLP+S
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Q6YUA8 Protein PHOTOSYSTEM I ASSEMBLY 2, chloroplastic9.5e-5060.82Show/hide
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        S  RP+ +H  +K        +  D++     S   +   +  +   SRR CL CLC + TLI   G TM     +A+ M  KPA CRNC GSGAVLCDM
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        CGGTGKWKALNRKRAKDVY FTECPNCYGRGKLVCPVCLGTGLPNNKGLLRRPDA+KLLDKM+NG++LP+S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34860.1 DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein1.4e-5359.47Show/hide
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        M ASSSHL A+P    S + P LS  N   V +   S  +++S  + DS + S+     +G +  +SRR W   C+C+S  LI +    ++   A  +D 
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        KP  +CRNC GSGAVLCDMCGGTGKWKALNRKRAKDVYEFTECPNCYGRGKLVCPVCLGTGLPNNKGLLRRP AR+LL+KM+NGRLLP+S
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AT2G34860.2 DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein1.4e-5359.47Show/hide
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        M ASSSHL A+P    S + P LS  N   V +   S  +++S  + DS + S+     +G +  +SRR W   C+C+S  LI +    ++   A  +D 
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AT5G03870.1 Glutaredoxin family protein3.6e-0429.41Show/hide
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        G + E I     G   CR CGG   ++C +C G+ K +   +K         +C  C   G ++CP+C
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AT5G06130.1 chaperone protein dnaJ-related7.3e-0535.82Show/hide
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        K  C+ C G+G + C  C  +G   +++   R RA +    V     C NC G GK++CP CL TG+
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AT5G06130.2 chaperone protein dnaJ-related7.3e-0535.82Show/hide
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        K  C+ C G+G + C  C  +G   +++   R RA +    V     C NC G GK++CP CL TG+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGGCGTCTTCTTCTCATCTATCCGCCATTCCCCTGCGCTCCTCTTCCTCCTCTAGACCTTCCTTATCCCACTCTAACTCAAAGCCCGTTGTACTTCAAGTGACATC
AAATCTTGATGATGAAAGCTCTACTACTGGAGATTCAAGTACACCATCAAAACCGCTAAAGGGAACTCGAATCTTGATCTCTCGTCGATGGTGCCTCACATGTTTGTGTT
CGTCTCCGACATTGATAAAGGATTATGGGGGCACAATGGCTGAAGCTATTGCAAATACCATGGATGGAAAACCTGCGTGCAGAAACTGTGGAGGAAGTGGTGCCGTACTT
TGTGACATGTGCGGTGGTACAGGGAAATGGAAAGCTCTTAACAGAAAACGGGCGAAAGATGTCTACGAGTTCACAGAATGTCCTAATTGTTATGGTAGAGGAAAACTTGT
ATGTCCAGTATGTCTAGGAACTGGTTTACCAAACAACAAAGGTCTTTTACGAAGGCCGGACGCACGAAAATTGCTCGATAAGATGTTCAATGGTCGATTGTTACCAAATT
CTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTATTTGAGTGGCAGAACGAGTGGCGCACAGCAGAGAGAAGATGATGGCGTCTTCTTCTCATCTATCCGCCATTCCCCTGCGCTCCTCTTCCTCCTCTAGACCTTCCTTA
TCCCACTCTAACTCAAAGCCCGTTGTACTTCAAGTGACATCAAATCTTGATGATGAAAGCTCTACTACTGGAGATTCAAGTACACCATCAAAACCGCTAAAGGGAACTCG
AATCTTGATCTCTCGTCGATGGTGCCTCACATGTTTGTGTTCGTCTCCGACATTGATAAAGGATTATGGGGGCACAATGGCTGAAGCTATTGCAAATACCATGGATGGAA
AACCTGCGTGCAGAAACTGTGGAGGAAGTGGTGCCGTACTTTGTGACATGTGCGGTGGTACAGGGAAATGGAAAGCTCTTAACAGAAAACGGGCGAAAGATGTCTACGAG
TTCACAGAATGTCCTAATTGTTATGGTAGAGGAAAACTTGTATGTCCAGTATGTCTAGGAACTGGTTTACCAAACAACAAAGGTCTTTTACGAAGGCCGGACGCACGAAA
ATTGCTCGATAAGATGTTCAATGGTCGATTGTTACCAAATTCTTAAACTTCATGTCTCTATATGTATTGATGATAGATTTATAAGTTACATAATTGCGGCTTTTGTGGCA
GAATTCAGTGAGTGTAAAAACAAAGCTCTAAGTTATAGATGGCTATCTTCTTCAATGCTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MMASSSHLSAIPLRSSSSSRPSLSHSNSKPVVLQVTSNLDDESSTTGDSSTPSKPLKGTRILISRRWCLTCLCSSPTLIKDYGGTMAEAIANTMDGKPACRNCGGSGAVL
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