; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg02855 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg02855
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionPlant protein of unknown function (DUF868)
Genome locationCarg_Chr09:2055892..2056929
RNA-Seq ExpressionCarg02855
SyntenyCarg02855
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008586 - Protein of unknown function DUF868, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6591548.1 hypothetical protein SDJN03_13894, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.5e-19199.14Show/hide
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KAG7024433.1 hypothetical protein SDJN02_13248, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-192100Show/hide
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XP_022936246.1 uncharacterized protein LOC111442918 [Cucurbita moschata]5.5e-18998.26Show/hide
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XP_022975758.1 uncharacterized protein LOC111476229 [Cucurbita maxima]1.0e-18295.65Show/hide
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XP_023536134.1 uncharacterized protein LOC111797382 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.5e-18998.84Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L0G2 Uncharacterized protein4.4e-14478.63Show/hide
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           NDD+LGLSFSVD K VLEIKRLKWKFRGNERIEV G+P+DVYWDVY+W+FE EKE+RGNAVFMFRFE E +   + +QQN NLGL ELEWRRMR+SL
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        SSSS+S S STSSVGSSAGASSSVMEWAN EDSD IGAP GF LLIYAWRR
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A0A1S3BW34 uncharacterized protein LOC1034937696.6e-14882.05Show/hide
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        MS  FS+CFRPSS  RR SP   SG PNLTTCIYHTNFALF+LSWSQSLFSHSLLL+FH+NLNPFDSP NPS  SSSSSSSSISFRLLIR L PWKKHG 
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        SSSS+S S STSSVGSSAGASSSVMEWAN EDSD IGAP GF LLIYAWRR
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A0A5D3D939 DUF868 domain-containing protein6.6e-14882.05Show/hide
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        MS  FS+CFRPSS  RR SP   SG PNLTTCIYHTNFALF+LSWSQSLFSHSLLL+FH+NLNPFDSP NPS  SSSSSSSSISFRLLIR L PWKKHG 
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        SSSS+S S STSSVGSSAGASSSVMEWAN EDSD IGAP GF LLIYAWRR
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A0A6J1F6Z5 uncharacterized protein LOC1114429182.6e-18998.26Show/hide
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A0A6J1IK75 uncharacterized protein LOC1114762294.8e-18395.65Show/hide
Query:  MSAAFSACFRPSSANRRHSPPPDSGFPNLTTCIYHTNFALFTLSWSQSLFSHSLLLNFHRNLNPFDSPPNPSSSSSSSSSISFRLLIRALNPWKKHGCEK
        MSAAFSACFR SSANRRH PPPDSGFPNLTTCIYHTNFALFTLSWSQSLFSHSLLLNFHRN N FDSPPNP    SSSSSISFRLLIRALNPWKKHGCEK
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G04220.1 Plant protein of unknown function (DUF868)1.8e-3331.98Show/hide
Query:  TCIYHTNFALF----TLSWSQSLFSHSLLLNFHRNLNPFDSPPNPSSSSSSSSSISFRLLIRALNPWKKHGCEKL---SDSIHVFWDLRRARFSSSPEPY
        TCIY  + + F    T+ WS++L +HSL++                ++     +   ++ ++  + W K G +      + + V+WD R A+F+SSPEP 
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Query:  SGFFIAVVVEGEMTLLVGDMIKEASAKTRAAKSEIPQTLILKREHVIANKIYTTKAKFGGQIREIEIDCGLFEGNDDELGLSFSVDRKMVLEIKRLKWKF
        S F++A+V E E+ LLVGD  K+A  +T++  + +   L  K+E+V   K +TT+AKF  + +E EI          E  +  S+D  +++++K L+WKF
Subjt:  SGFFIAVVVEGEMTLLVGDMIKEASAKTRAAKSEIPQTLILKREHVIANKIYTTKAKFGGQIREIEIDCGLFEGNDDELGLSFSVDRKMVLEIKRLKWKF

Query:  RGNERIEVEGIPVDVYWDVYSWIFESEKENRGNAVFMFRFEAEEQSN
        RGN+ + V+  PV V+WDVY W+F       G+ +F+F+    E S+
Subjt:  RGNERIEVEGIPVDVYWDVYSWIFESEKENRGNAVFMFRFEAEEQSN

AT2G25200.1 Plant protein of unknown function (DUF868)1.4e-4937.33Show/hide
Query:  SAAFSACFRPSSANRRHSPP---PDSGFPN--------LTTCIYHTNFALFTLSWSQSLFSHSLLLNFHRNLNPFDSPPNPSSSSSSSSSISFRLLIRAL
        S+  SACF PS+       P   P    P+         TTC YHTN  +F LSWS+S    SL L+F+ + N  +   +       S   +FRL I+ L
Subjt:  SAAFSACFRPSSANRRHSPP---PDSGFPN--------LTTCIYHTNFALFTLSWSQSLFSHSLLLNFHRNLNPFDSPPNPSSSSSSSSSISFRLLIRAL

Query:  NPWKKHGCEKLS--DSIHVFWDLRRARFSSSPEPYSGFFIAVVVEGEMTLLVGDMIKEASAKTRAAKSEIPQTLILKREHVIANKIYTTKAKFGGQIREI
          W+K+G +KLS    I V WDL  A+F S P+P SGF++AV V GE+ LLVG      + K R  +    Q L+ K+E++  N++Y+TK    G++REI
Subjt:  NPWKKHGCEKLS--DSIHVFWDLRRARFSSSPEPYSGFFIAVVVEGEMTLLVGDMIKEASAKTRAAKSEIPQTLILKREHVIANKIYTTKAKFGGQIREI

Query:  EIDCGLFEGNDDELGLSFSVDRKMVLEIKRLKWKFRGNERIEVEGIPVDVYWDVYSWIF---ESEKENRGNAVFMFRFEAEEQSNPAARQQNLNLGLKEL
         ID  +    +D+  L FSVD K VL+I +L+WKFRGN +I ++G+ + + WDV++W+F   +  K ++  AVF+ RFE +E         N        
Subjt:  EIDCGLFEGNDDELGLSFSVDRKMVLEIKRLKWKFRGNERIEVEGIPVDVYWDVYSWIF---ESEKENRGNAVFMFRFEAEEQSNPAARQQNLNLGLKEL

Query:  EWRRMRSSL-----SSSSVSVSASTSSVGSSAGASSSVMEWAN--GEDSDVIGAPSGFCLLIYAWRR
          +R+R  +     +  + S  AST S  SS+   SSVMEW++   ED    G+ S F L+IYAWR+
Subjt:  EWRRMRSSL-----SSSSVSVSASTSSVGSSAGASSSVMEWAN--GEDSDVIGAPSGFCLLIYAWRR

AT3G04860.1 Plant protein of unknown function (DUF868)2.0e-3537.35Show/hide
Query:  NLTTCIYHTNF----ALFTLSWSQSLFSHSLLLNFHRNLNPFDSPPNPSSSSSSSSSISFRLLIRA-LNPW---KKHGCEKL---SDSIHVFWDLRRARF
        NL  CIY         L T++W+++L    + +    + N                    R L +  + PW   K+ G + L   + +I VFWDL  A+F
Subjt:  NLTTCIYHTNF----ALFTLSWSQSLFSHSLLLNFHRNLNPFDSPPNPSSSSSSSSSISFRLLIRA-LNPW---KKHGCEKL---SDSIHVFWDLRRARF

Query:  SSSPEPYSGFFIAVVVEGEMTLLVGDMIKEASAKTRAA-KSEIPQTLILKREHVIANKIYTTKAKFG--GQIREIEIDCGLFEGNDDELGLSFSVDRKMV
         SSPEP  GF++ VVV+ EM LL+GDM KEA  KT AA  S +    I K+EHV   + + TKA+F   G+  ++ I+C   + +  +  L   VD K++
Subjt:  SSSPEPYSGFFIAVVVEGEMTLLVGDMIKEASAKTRAA-KSEIPQTLILKREHVIANKIYTTKAKFG--GQIREIEIDCGLFEGNDDELGLSFSVDRKMV

Query:  LEIKRLKWKFRGNERIEVEGIPVDVYWDVYSWIFESEKENRGNAVFMFR
        ++++RL WKFRGN+ I V  I V+V WDV+SW F     + GNAVFMFR
Subjt:  LEIKRLKWKFRGNERIEVEGIPVDVYWDVYSWIFESEKENRGNAVFMFR

AT5G11000.1 Plant protein of unknown function (DUF868)1.4e-7042.56Show/hide
Query:  SANRRHSPPP---------DSGFPNLTTCIYHTNFALFTLSWSQS-LFSHSLLLNFH-RNLNPFDSPPNPSSSS-SSSSSISFRLLIRALNPWKKHGCEK
        +A+  H PP           SG PNLTTC+Y T+  +F L+WS++ L  HS+ L  H ++     SP + SS+  S SS++SF L +  L  WKK G   
Subjt:  SANRRHSPPP---------DSGFPNLTTCIYHTNFALFTLSWSQS-LFSHSLLLNFH-RNLNPFDSPPNPSSSS-SSSSSISFRLLIRALNPWKKHGCEK

Query:  LSDSIHVFWDLRRARFSSSPEPYSGFFIAVVVEGEMTLLVGDMIKEASAKTRAAKSEI-PQTLILKREHVIANKIYTTKAKFGGQIREIEIDCGLFEGND
        +S  I VFWDL +A+F S  EP SGF+IAVVV+GEM LLVGD +KEA A+ ++AK    PQ L+L++EHV   +++TTKA+FGG+ REI IDC +    D
Subjt:  LSDSIHVFWDLRRARFSSSPEPYSGFFIAVVVEGEMTLLVGDMIKEASAKTRAAKSEI-PQTLILKREHVIANKIYTTKAKFGGQIREIEIDCGLFEGND

Query:  DELGLSFSVDRKMVLEIKRLKWKFRGNERIEVEGIPVDVYWDVYSWIFESEKE-----NRGNAVFMFRFEAEEQSNPAA---------------------
        ++  L FSVD K VL+IKRL+WKFRGNE++E++G+ V + WDVY+W+F+S+         G+AVFMFRFE++ ++                         
Subjt:  DELGLSFSVDRKMVLEIKRLKWKFRGNERIEVEGIPVDVYWDVYSWIFESEKE-----NRGNAVFMFRFEAEEQSNPAA---------------------

Query:  -RQQNLNLGLKEL-EWRRMRSSLSSSSVSVSASTSSVGSSAGA-SSSVMEWANGEDSDVIGAPS----------GFCLLIYAW
         +Q   + G+K + EWR+MR     S  S S+S+ S+ S++ A SSSVMEWA+  D    G             GF LL+YAW
Subjt:  -RQQNLNLGLKEL-EWRRMRSSLSSSSVSVSASTSSVGSSAGA-SSSVMEWANGEDSDVIGAPS----------GFCLLIYAW

AT5G28150.1 Plant protein of unknown function (DUF868)1.2e-3736.26Show/hide
Query:  FSACFRPSS---ANRRHSPPPDSGFPNLTTCIYHTNF----ALFTLSWSQSLFSHSLLLNFHRNLNPFDSPPNPSSSSSSSSSISFRLLIRALNPW---K
        F +CF  +    A+   S        NL TCIY         L T++W+++L   S+ +    + N                     L    + PW   K
Subjt:  FSACFRPSS---ANRRHSPPPDSGFPNLTTCIYHTNF----ALFTLSWSQSLFSHSLLLNFHRNLNPFDSPPNPSSSSSSSSSISFRLLIRALNPW---K

Query:  KHGCEKL---SDSIHVFWDLRRARFSSSPEPYSGFFIAVVVEGEMTLLVGDMIKEASAKTRAAKSEIPQTLILKREHVIANKIYTTKAKF--GGQIREIE
        + G + L   S +I VFWDL  A+F S PE   GF++ VVV+ EM LL+GDM KEA  KT A+ S +    I K+EHV   +++ TKA+    G+  ++ 
Subjt:  KHGCEKL---SDSIHVFWDLRRARFSSSPEPYSGFFIAVVVEGEMTLLVGDMIKEASAKTRAAKSEIPQTLILKREHVIANKIYTTKAKF--GGQIREIE

Query:  IDCGLFEGNDDELGLSFSVDRKMVLEIKRLKWKFRGNERIEVEGIPVDVYWDVYSWIFESEKENRGNAVFMFR
        I+C   + N  +  L   VD K +L++KRLKWKFRGN+ I V  + V+V WDV+SW+F       GNAVFMFR
Subjt:  IDCGLFEGNDDELGLSFSVDRKMVLEIKRLKWKFRGNERIEVEGIPVDVYWDVYSWIFESEKENRGNAVFMFR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCGCCGCCTTCTCCGCCTGCTTCCGCCCATCCTCCGCCAATCGCCGCCACTCCCCGCCGCCAGATTCCGGCTTCCCCAATCTCACCACCTGCATTTACCACACTAA
TTTCGCTCTCTTTACCCTCTCATGGTCTCAATCCCTCTTCTCTCACTCCCTTCTCCTTAACTTTCACCGAAACCTTAATCCCTTTGATTCACCTCCAAATCCTTCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTTCTTCAATCTCTTTTCGTCTCCTTATTAGAGCTTTAAATCCATGGAAGAAACACGGCTGTGAGAAGCTTTCAGATAGTATCCATGTCTTTTGGGAT
CTCCGGCGAGCACGTTTCTCGTCGTCGCCGGAACCCTATTCCGGATTCTTTATCGCGGTGGTTGTGGAAGGAGAAATGACGCTTCTCGTCGGCGATATGATCAAAGAAGC
CTCTGCGAAAACCAGAGCGGCGAAATCCGAAATTCCTCAAACCCTAATTCTCAAAAGGGAACATGTGATTGCGAACAAAATCTACACTACGAAGGCGAAATTCGGCGGTC
AAATCCGAGAAATCGAAATAGACTGCGGCTTATTCGAAGGAAACGACGACGAATTAGGGCTGTCGTTCAGTGTTGACCGGAAAATGGTTTTGGAAATCAAACGGCTGAAA
TGGAAATTTAGGGGAAACGAAAGAATCGAAGTGGAAGGGATTCCGGTGGATGTGTATTGGGATGTTTACAGCTGGATTTTCGAATCGGAGAAAGAAAACAGAGGAAATGC
GGTGTTTATGTTCCGATTCGAAGCGGAAGAACAGAGCAATCCGGCGGCGCGACAGCAGAATCTAAACCTGGGATTGAAGGAATTGGAGTGGCGGAGGATGAGAAGTAGCT
TGTCGTCGTCATCGGTGTCGGTATCGGCGTCGACGTCGTCAGTCGGATCATCCGCCGGAGCTAGTTCATCGGTGATGGAATGGGCTAACGGCGAAGATAGCGATGTAATC
GGAGCTCCGTCGGGATTTTGTCTACTGATTTACGCTTGGAGAAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCCGCCGCCTTCTCCGCCTGCTTCCGCCCATCCTCCGCCAATCGCCGCCACTCCCCGCCGCCAGATTCCGGCTTCCCCAATCTCACCACCTGCATTTACCACACTAA
TTTCGCTCTCTTTACCCTCTCATGGTCTCAATCCCTCTTCTCTCACTCCCTTCTCCTTAACTTTCACCGAAACCTTAATCCCTTTGATTCACCTCCAAATCCTTCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTTCTTCAATCTCTTTTCGTCTCCTTATTAGAGCTTTAAATCCATGGAAGAAACACGGCTGTGAGAAGCTTTCAGATAGTATCCATGTCTTTTGGGAT
CTCCGGCGAGCACGTTTCTCGTCGTCGCCGGAACCCTATTCCGGATTCTTTATCGCGGTGGTTGTGGAAGGAGAAATGACGCTTCTCGTCGGCGATATGATCAAAGAAGC
CTCTGCGAAAACCAGAGCGGCGAAATCCGAAATTCCTCAAACCCTAATTCTCAAAAGGGAACATGTGATTGCGAACAAAATCTACACTACGAAGGCGAAATTCGGCGGTC
AAATCCGAGAAATCGAAATAGACTGCGGCTTATTCGAAGGAAACGACGACGAATTAGGGCTGTCGTTCAGTGTTGACCGGAAAATGGTTTTGGAAATCAAACGGCTGAAA
TGGAAATTTAGGGGAAACGAAAGAATCGAAGTGGAAGGGATTCCGGTGGATGTGTATTGGGATGTTTACAGCTGGATTTTCGAATCGGAGAAAGAAAACAGAGGAAATGC
GGTGTTTATGTTCCGATTCGAAGCGGAAGAACAGAGCAATCCGGCGGCGCGACAGCAGAATCTAAACCTGGGATTGAAGGAATTGGAGTGGCGGAGGATGAGAAGTAGCT
TGTCGTCGTCATCGGTGTCGGTATCGGCGTCGACGTCGTCAGTCGGATCATCCGCCGGAGCTAGTTCATCGGTGATGGAATGGGCTAACGGCGAAGATAGCGATGTAATC
GGAGCTCCGTCGGGATTTTGTCTACTGATTTACGCTTGGAGAAGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSAAFSACFRPSSANRRHSPPPDSGFPNLTTCIYHTNFALFTLSWSQSLFSHSLLLNFHRNLNPFDSPPNPSSSSSSSSSISFRLLIRALNPWKKHGCEKLSDSIHVFWD
LRRARFSSSPEPYSGFFIAVVVEGEMTLLVGDMIKEASAKTRAAKSEIPQTLILKREHVIANKIYTTKAKFGGQIREIEIDCGLFEGNDDELGLSFSVDRKMVLEIKRLK
WKFRGNERIEVEGIPVDVYWDVYSWIFESEKENRGNAVFMFRFEAEEQSNPAARQQNLNLGLKELEWRRMRSSLSSSSVSVSASTSSVGSSAGASSSVMEWANGEDSDVI
GAPSGFCLLIYAWRR