CuGenDBv2

Gene ID	Carg03573
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	Nudix hydrolase 23
Genome location	Carg_Chr14:1911851..1917257
RNA-Seq Expression	Carg03573
Synteny	Carg03573
Gene Ontology terms	GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR000086 - NUDIX hydrolase domain IPR015797 - NUDIX hydrolase-like domain superfamily IPR020084 - NUDIX hydrolase, conserved site IPR029401 - Nudix hydrolase, N-terminal

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6580804.1 Nudix hydrolase 23, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

5.1e-142

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KAG7017553.1 Nudix hydrolase 23, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

1.1e-149

100

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XP_022934288.1 nudix hydrolase 23, chloroplastic [Cucurbita moschata]

2.8e-140

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XP_022983042.1 nudix hydrolase 23, chloroplastic [Cucurbita maxima]

1.5e-138

87.5

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XP_023526942.1 nudix hydrolase 23, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]

6.3e-140

88.49

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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A1S3B6M8 nudix hydrolase 23, chloroplastic isoform X1

1.9e-126

79.35

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A0A1S3B747 nudix hydrolase 23, chloroplastic isoform X2

6.6e-127

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A0A5A7TPK7 Nudix hydrolase 23

6.6e-127

80.39

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A0A6J1F791 nudix hydrolase 23, chloroplastic

1.4e-140

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A0A6J1IY67 nudix hydrolase 23, chloroplastic

7.5e-139

87.5

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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

P93740 Nudix hydrolase 23, chloroplastic

2.5e-67

51.54

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        MLK+V + G SSG   +     +    +++FISS    +S + SS R             R  SFK    S+ S    D  + SP  +S         + 
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                + H IPD EEKLRAICT CGKI YQNPKM           +LLCKR I+PS+GLWTLPAGY+E+GESA  GA+RET EEA A VEV SPFAQ
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        LDIPLIGQTY+IF  KLK  HF+PGPES+EC LF+LD+IPF+SLAFSS+     LY+ED+K G++ FHYGTINKRPG+  SDI A++LDYHL+
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Q8G4U8 Nucleoside triphosphate pyrophosphatase/Nudix hydrolase fusion protein

2.8e-05

30.17

Show/hide

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        V GK+T+    +++  +       G W +P G    GES ++GA+RE+ EEAN    ++EV   + +   P    T   F    +KP  +  P     ES
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        +E C   +DD+P   L
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G42070.1 nudix hydrolase homolog 23

1.8e-68

51.54

Show/hide

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        MLK+V + G SSG   +     +    +++FISS    +S + SS R             R  SFK    S+ S    D  + SP  +S         + 
Subjt:  MLKSVHLFGCSSGFVSNLLKPNSIVGFSLNFISSKRLPTSSSCSSSRLSCASSGSMFLAPRTASFKAFCGSTCSEANQDGTSTSPLSMSESPPPSSSTVV

Query:  H-------SAHGIPDDEEKLRAICTVCGKITYQNPKM-----------ILLCKRKIEPSYGLWTLPAGYMEIGESAVDGAIRETLEEANAEVEVTSPFAQ
                + H IPD EEKLRAICT CGKI YQNPKM           +LLCKR I+PS+GLWTLPAGY+E+GESA  GA+RET EEA A VEV SPFAQ
Subjt:  H-------SAHGIPDDEEKLRAICTVCGKITYQNPKM-----------ILLCKRKIEPSYGLWTLPAGYMEIGESAVDGAIRETLEEANAEVEVTSPFAQ

Query:  LDIPLIGQTYIIFRGKLKKPHFSPGPESIECCLFSLDDIPFESLAFSSM-----LYVEDVKAGRVSFHYGTINKRPGTGASDIHAYTLDYHLR
        LDIPLIGQTY+IF  KLK  HF+PGPES+EC LF+LD+IPF+SLAFSS+     LY+ED+K G++ FHYGTINKRPG+  SDI A++LDYHL+
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCTAAAATCTGTTCATCTGTTCGGTTGTTCATCTGGGTTTGTTTCAAATCTTCTGAAACCCAATAGTATTGTTGGATTCAGTCTTAATTTCATCTCTTCCAAACGGTT
GCCAACGTCGTCTTCTTGTTCTTCTTCAAGATTGTCATGTGCTAGCAGCGGTTCCATGTTCTTGGCTCCTCGAACTGCTTCTTTCAAAGCGTTTTGTGGGTCTACATGTT
CTGAGGCAAATCAAGACGGCACTTCCACGTCTCCCTTGTCTATGTCAGAATCACCGCCGCCATCATCTTCAACTGTAGTCCACTCAGCTCATGGAATTCCTGATGATGAG
GAGAAACTGAGAGCTATTTGCACAGTTTGTGGGAAGATAACCTATCAGAATCCAAAAATGATCTTACTTTGCAAGAGGAAGATCGAGCCATCTTATGGCCTATGGACTCT
CCCAGCTGGTTACATGGAAATTGGGGAGTCAGCTGTTGATGGTGCAATTAGGGAAACCTTGGAAGAAGCAAATGCAGAAGTTGAAGTTACATCCCCTTTTGCTCAGCTAG
ACATCCCTCTAATTGGCCAAACGTATATAATTTTCAGGGGAAAGTTGAAGAAACCCCATTTCTCTCCCGGTCCCGAATCCATAGAATGTTGCCTTTTTTCTCTTGACGAT
ATACCTTTCGAGTCTCTTGCATTTTCATCCATGCTGTATGTTGAGGATGTCAAGGCAGGAAGAGTCTCATTCCATTATGGCACCATCAATAAAAGGCCTGGCACAGGTGC
TTCAGATATTCATGCCTATACTCTTGATTATCATCTAAGATTGTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AATGGATAAGAACATTACCGATGAGACGAACCCGAATATGATGTACGGACATCCCCAAAAAATTTGAGAGCCCGAATTCAACGCGAGATTTTCGTTCATCTTTGCGCCCG
CTGCGTGCTGACGGCTCTCATACCTCAATTGGAAAAATGGAAGAAAAGAGATGAAATGATATTCAAGTTCCTCATTGGAAGATCCTTTTGGTTGATTACGACTTCAAATT
CCATACCGATTCAAAGAAATTGAAGATTGATAATGCTAAAATCTGTTCATCTGTTCGGTTGTTCATCTGGGTTTGTTTCAAATCTTCTGAAACCCAATAGTATTGTTGGA
TTCAGTCTTAATTTCATCTCTTCCAAACGGTTGCCAACGTCGTCTTCTTGTTCTTCTTCAAGATTGTCATGTGCTAGCAGCGGTTCCATGTTCTTGGCTCCTCGAACTGC
TTCTTTCAAAGCGTTTTGTGGGTCTACATGTTCTGAGGCAAATCAAGACGGCACTTCCACGTCTCCCTTGTCTATGTCAGAATCACCGCCGCCATCATCTTCAACTGTAG
TCCACTCAGCTCATGGAATTCCTGATGATGAGGAGAAACTGAGAGCTATTTGCACAGTTTGTGGGAAGATAACCTATCAGAATCCAAAAATGATCTTACTTTGCAAGAGG
AAGATCGAGCCATCTTATGGCCTATGGACTCTCCCAGCTGGTTACATGGAAATTGGGGAGTCAGCTGTTGATGGTGCAATTAGGGAAACCTTGGAAGAAGCAAATGCAGA
AGTTGAAGTTACATCCCCTTTTGCTCAGCTAGACATCCCTCTAATTGGCCAAACGTATATAATTTTCAGGGGAAAGTTGAAGAAACCCCATTTCTCTCCCGGTCCCGAAT
CCATAGAATGTTGCCTTTTTTCTCTTGACGATATACCTTTCGAGTCTCTTGCATTTTCATCCATGCTGTATGTTGAGGATGTCAAGGCAGGAAGAGTCTCATTCCATTAT
GGCACCATCAATAAAAGGCCTGGCACAGGTGCTTCAGATATTCATGCCTATACTCTTGATTATCATCTAAGATTGTGACAAGTTAAAGGAGCTCAAAGGTGGGACTTGGA
ACTTTTGCTTGATGGCAGAAACATGGATCACTTACATTCAAATGGAGACGATACATCTGCAATTTTGAAACATTGATATGTCTGAATATTGTACAATTTTTGTATTGTTC
ATCATGCTACACTTGTTCAGGTTGTCAGTTTGTTGAAAACACAAGGAAAAATGAAGGATCATTGGCTCTTCAGGACAGCACATGATGCGTAGCCATGAGTATCAGACTGA
TAGAGAAAACAACCTTTTGGATAGCACACGTTGTCTAGCCATGAGTAACGACCATAAATGCT

Protein sequence

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IPFESLAFSSMLYVEDVKAGRVSFHYGTINKRPGTGASDIHAYTLDYHLRL

Carg03573 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome