; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg03658 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg03658
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description40S ribosomal protein S14
Genome locationCarg_Chr14:1428995..1430770
RNA-Seq ExpressionCarg03658
SyntenyCarg03658
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0048027 - mRNA 5'-UTR binding (molecular function)
GO:0070181 - small ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001971 - Ribosomal protein S11
IPR018102 - Ribosomal S11, conserved site
IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573353.1 hypothetical protein SDJN03_27240, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-75100Show/hide
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KAG6580713.1 Beta-fructofuranosidase, insoluble isoenzyme 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-75100Show/hide
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KAG7012516.1 40S ribosomal protein S14-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.3e-75100Show/hide
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KAG7017469.1 40S ribosomal protein S14-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.3e-75100Show/hide
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XP_004149195.1 40S ribosomal protein S14-2 [Cucumis sativus]2.3e-75100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGP6 Uncharacterized protein1.1e-75100Show/hide
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A0A1S3B682 40S ribosomal protein S14-21.1e-75100Show/hide
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A0A6J1F6L2 40S ribosomal protein S14-21.1e-75100Show/hide
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A0A6J1J4Y9 40S ribosomal protein S14-21.1e-75100Show/hide
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A0A6J1KQN4 40S ribosomal protein S14-2-like1.1e-75100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P19950 40S ribosomal protein S142.2e-7395.3Show/hide
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P19951 40S ribosomal protein S141.0e-7395.27Show/hide
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P42036 40S ribosomal protein S14-31.3e-7392.62Show/hide
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Q9CAX6 40S ribosomal protein S14-25.8e-7493.29Show/hide
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Q9SIH0 40S ribosomal protein S14-14.9e-7391.95Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36160.1 Ribosomal protein S11 family protein3.5e-7491.95Show/hide
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AT3G11510.1 Ribosomal protein S11 family protein4.1e-7593.29Show/hide
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AT3G52580.1 Ribosomal protein S11 family protein9.2e-7592.62Show/hide
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ATCG00750.1 ribosomal protein S112.1e-1031.72Show/hide
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        SR+ TR    + V   P         GV H+ ASFN+T + VTD+ GR       G    +  R   +P+AA  AA +  +   + G+    +++     
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           K PG G  +ALRA+ RSG+ +  + DVTP+P +  R    RR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AAGGTTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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