; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg03659 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg03659
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description40S ribosomal protein S14
Genome locationCarg_Chr14:1426475..1428585
RNA-Seq ExpressionCarg03659
SyntenyCarg03659
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0044038 - cell wall macromolecule biosynthetic process (biological process)
GO:0071555 - cell wall organization (biological process)
GO:0005887 - integral component of plasma membrane (cellular component)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0008963 - phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase activity (molecular function)
GO:0048027 - mRNA 5'-UTR binding (molecular function)
GO:0070181 - small ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001971 - Ribosomal protein S11
IPR018102 - Ribosomal S11, conserved site
IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6580713.1 Beta-fructofuranosidase, insoluble isoenzyme 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.0e-85100Show/hide
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KAG7017469.1 40S ribosomal protein S14-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-100100Show/hide
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XP_004149195.1 40S ribosomal protein S14-2 [Cucumis sativus]6.0e-76100Show/hide
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XP_022946789.1 40S ribosomal protein S14-2-like [Cucurbita moschata]7.8e-7699.33Show/hide
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XP_038903512.1 40S ribosomal protein S14-2-like isoform X2 [Benincasa hispida]1.3e-7599.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGP6 Uncharacterized protein2.9e-76100Show/hide
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A0A1S3B682 40S ribosomal protein S14-22.9e-76100Show/hide
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A0A5D3DNR5 40S ribosomal protein S14-2-like2.9e-76100Show/hide
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A0A6J1F6L2 40S ribosomal protein S14-22.9e-76100Show/hide
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A0A6J1J4Y9 40S ribosomal protein S14-22.9e-76100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P19950 40S ribosomal protein S145.8e-7495.33Show/hide
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P19951 40S ribosomal protein S149.9e-7495.27Show/hide
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P42036 40S ribosomal protein S14-33.4e-7492.67Show/hide
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Q9CAX6 40S ribosomal protein S14-21.5e-7493.33Show/hide
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Q9SIH0 40S ribosomal protein S14-11.3e-7392Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36160.1 Ribosomal protein S11 family protein9.2e-7592Show/hide
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AT3G11510.1 Ribosomal protein S11 family protein1.1e-7593.33Show/hide
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AT3G52580.1 Ribosomal protein S11 family protein2.4e-7592.67Show/hide
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ATCG00750.1 ribosomal protein S112.7e-1031.76Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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