; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg03695 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg03695
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionRAB6-interacting golgin
Genome locationCarg_Chr14:1217954..1219880
RNA-Seq ExpressionCarg03695
SyntenyCarg03695
Gene Ontology termsGO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
InterPro domainsIPR007033 - RAB6-interacting golgin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004137876.1 GRB10-interacting GYF protein 2 [Cucumis sativus]2.6e-6693.55Show/hide
Query:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI
        MVQN+TGSLSFSSHL KEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIR+ELEAL DPMRKEVAQ RKK+DAVNKELKPLGH 
Subjt:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI

Query:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        CQKKEKEY+EALEAFN+KNKEKVQLI KLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

XP_008442808.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486581 [Cucumis melo]5.9e-6692.9Show/hide
Query:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI
        MVQN+TGSLSFSSHL KEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIR+ELEAL DPMRKEVAQ RK++DAVNKELKPLGH 
Subjt:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI

Query:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        CQKKEKEY+EALEAFN+KNKEKVQLI KLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

XP_022935581.1 GRB10-interacting GYF protein 2-like [Cucurbita moschata]1.2e-71100Show/hide
Query:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI
        MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI
Subjt:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI

Query:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

XP_022983144.1 GRB10-interacting GYF protein 2-like [Cucurbita maxima]6.0e-7199.35Show/hide
Query:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI
        MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI
Subjt:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI

Query:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLI KLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

XP_038903091.1 GRB10-interacting GYF protein 2-like [Benincasa hispida]2.6e-6693.55Show/hide
Query:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI
        MVQN+TGSLSFSSHL KEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIR+ELEAL DPMRKEVAQ RKK+DAVNKELKPLGH 
Subjt:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI

Query:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        CQKKEKEY+EALEAFN+KNKEKVQLI KLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGI7 RAB6-interacting golgin1.3e-6693.55Show/hide
Query:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI
        MVQN+TGSLSFSSHL KEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIR+ELEAL DPMRKEVAQ RKK+DAVNKELKPLGH 
Subjt:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI

Query:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        CQKKEKEY+EALEAFN+KNKEKVQLI KLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

A0A1S3B6L6 RAB6-interacting golgin2.8e-6692.9Show/hide
Query:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI
        MVQN+TGSLSFSSHL KEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIR+ELEAL DPMRKEVAQ RK++DAVNKELKPLGH 
Subjt:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI

Query:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        CQKKEKEY+EALEAFN+KNKEKVQLI KLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

A0A5D3DPH8 RAB6-interacting golgin2.8e-6692.9Show/hide
Query:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI
        MVQN+TGSLSFSSHL KEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIR+ELEAL DPMRKEVAQ RK++DAVNKELKPLGH 
Subjt:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI

Query:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        CQKKEKEY+EALEAFN+KNKEKVQLI KLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

A0A6J1F531 RAB6-interacting golgin5.9e-72100Show/hide
Query:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI
        MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI
Subjt:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI

Query:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

A0A6J1J6H3 RAB6-interacting golgin2.9e-7199.35Show/hide
Query:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI
        MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI
Subjt:  MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHI

Query:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLI KLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  CQKKEKEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36410.1 Family of unknown function (DUF662)1.1e-5171.71Show/hide
Query:  TGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHICQKKE
        TGSLSFSSH+ +EDEE++RSALS FRAKE+EIE+++MEVRE++QAQLGRVE+ETKRL+ IR+ELE++ DPMRKEV+  RKK+D+VNKELKPLG   QKKE
Subjt:  TGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHICQKKE

Query:  KEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLME---LVSESERLRLKKLEELSKNIDTI
        +EY+EAL+ FNEKN+EKVQLI KLME   LV ESE+LR+ KLEELSK+I+T+
Subjt:  KEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLME---LVSESERLRLKKLEELSKNIDTI

AT2G36410.2 Family of unknown function (DUF662)2.7e-5373.15Show/hide
Query:  TGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHICQKKE
        TGSLSFSSH+ +EDEE++RSALS FRAKE+EIE+++MEVRE++QAQLGRVE+ETKRL+ IR+ELE++ DPMRKEV+  RKK+D+VNKELKPLG   QKKE
Subjt:  TGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHICQKKE

Query:  KEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI
        +EY+EAL+ FNEKN+EKVQLI KLMELV ESE+LR+ KLEELSK+I+T+
Subjt:  KEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI

AT2G36410.3 Family of unknown function (DUF662)3.9e-5272.48Show/hide
Query:  TGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHICQKKE
        TGSLSFSSH+ +EDEE++RSALS FRAKE+EIE+++MEVRE++QAQLGRVE+ETKRL+ IR+ELE++ DPMRKEV+  RKK+D+VNKELKPLG   QKK 
Subjt:  TGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHICQKKE

Query:  KEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI
         EY+EAL+ FNEKN+EKVQLI KLMELV ESE+LR+ KLEELSK+I+T+
Subjt:  KEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI

AT3G09980.1 Family of unknown function (DUF662)2.4e-5779.19Show/hide
Query:  TGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHICQKKE
        +GS+SFSS + KEDEE+SR+ALS FRAKEEEIE+KKME+RE+VQAQLGRVEEETKRLA IR+ELE L DPMRKEVA  RKK+D+VNKELKPLGH  QKKE
Subjt:  TGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHICQKKE

Query:  KEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI
        +EY+EALEAFNEKN+EKVQLI +LMELV ESE++R+KKLEELSKNID+I
Subjt:  KEYREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI

AT3G52920.2 Family of unknown function (DUF662)6.7e-5275.34Show/hide
Query:  SLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHICQKKEKE
        SLSFSS + KEDEE++RSALS FRAKE+EIE++KMEVRE+V+AQLGRVEEET+RLA IR+ELE + DPMRKEV   RKK+D+VNKELKPLG   QKKE+E
Subjt:  SLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHICQKKEKE

Query:  YREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDT
        Y+EAL+ FNEKN+EKVQLI KLMELV ESE+LRLKKL+ELS++IDT
Subjt:  YREALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGCAGAACAGCACAGGAAGCTTGAGCTTCAGCAGCCATTTGTGTAAGGAAGATGAAGAGATTTCGAGGTCGGCTCTGTCCACTTTCAGAGCCAAAGAAGAGGAGAT
CGAGCGGAAGAAGATGGAGGTCAGAGAAAAGGTTCAAGCCCAGTTAGGCCGTGTTGAAGAAGAAACCAAACGTCTCGCTTGCATCCGTCAGGAGCTCGAGGCGCTGACCG
ATCCAATGAGGAAGGAAGTGGCACAGTTTCGTAAGAAGGTCGACGCCGTAAACAAGGAATTGAAGCCTCTGGGACATATCTGTCAAAAGAAGGAAAAGGAGTACAGGGAA
GCCCTCGAAGCCTTCAACGAAAAGAACAAGGAAAAAGTTCAGCTAATCAACAAACTAATGGAGCTGGTGAGCGAAAGCGAGAGGTTGAGGCTGAAGAAGCTGGAGGAGCT
GAGTAAGAACATCGATACGATTCGATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGGGTTTTGTGGGTAAGGGAATGCAAATTGAATAGAGTGAGGAACAGAGGAAGAGCAGCCATAAATGGTGCAGAACAGCACA
GGAAGCTTGAGCTTCAGCAGCCATTTGTGTAAGGAAGATGAAGAGATTTCGAGGTCGGCTCTGTCCACTTTCAGAGCCAAAGAAGAGGAGATCGAGCGGAAGAAGATGGA
GGTCAGAGAAAAGGTTCAAGCCCAGTTAGGCCGTGTTGAAGAAGAAACCAAACGTCTCGCTTGCATCCGTCAGGAGCTCGAGGCGCTGACCGATCCAATGAGGAAGGAAG
TGGCACAGTTTCGTAAGAAGGTCGACGCCGTAAACAAGGAATTGAAGCCTCTGGGACATATCTGTCAAAAGAAGGAAAAGGAGTACAGGGAAGCCCTCGAAGCCTTCAAC
GAAAAGAACAAGGAAAAAGTTCAGCTAATCAACAAACTAATGGAGCTGGTGAGCGAAAGCGAGAGGTTGAGGCTGAAGAAGCTGGAGGAGCTGAGTAAGAACATCGATAC
GATTCGATAACCGTATCGTTTGAATGATCAGAACGACGGTTGACAAAGTGATAACCCTGTGTTTATTAGGTTTTGGCGTGTGATGTATTTAATCTAAAGAACAAAAAGGA
GCTGTGTTTGTGTATTAGTTGAAATGTTGGCGTTCCCTTTGTTTGTGTGTAATTTTCATAATTTGTCTTTCTTTATTTATTTTTCCTCTTCAGGAGTTAACTCAAAAAAC
ATTTTAACTCATTTTAGGAAAGGAAATGACTTATCTATCCTTTTGTTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVQNSTGSLSFSSHLCKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRQELEALTDPMRKEVAQFRKKVDAVNKELKPLGHICQKKEKEYRE
ALEAFNEKNKEKVQLINKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR