; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg03704 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg03704
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionRibosome production factor 2 homolog
Genome locationCarg_Chr14:1169603..1172036
RNA-Seq ExpressionCarg03704
SyntenyCarg03704
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0000463 - maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0032774 - RNA biosynthetic process (biological process)
GO:0005730 - nucleolus (cellular component)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007109 - Brix domain
IPR039770 - Ribosome biogenesis protein Rpf2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6580669.1 Ribosome production factor 2-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.6e-17499.38Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMA+PDKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
Subjt:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

KAG7017424.1 Ribosome production factor 2-like protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-174100Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
Subjt:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

XP_022934916.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita moschata]3.5e-17499.69Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMA+PDKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
Subjt:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

XP_022983029.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita maxima]2.3e-17398.76Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDHKIYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMA+PDKSKGVKRERREAKMK+
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
Subjt:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

XP_023540188.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-16593.17Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES+VKYSR+N+GIKPFE+GGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDH IYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD+FRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQKVGD+A+PDKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        +DD PASKKPKEDSEKPKE+SE
Subjt:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LAR1 Ribosome production factor 2 homolog7.5e-16291.93Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        ML+IRTPKN KV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTELYHLKKES+VKYSRKNDGIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSII+YGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        +NLVI RTY+  IYD+VEVGIENFKSMHSF YDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD FRGEVVENLNL+GLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMV+RRHRLP+DGLRKEAMKTAKD+AKKKEKNVS+D IQGKIGRIYIPDQKVGDMA+ DKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        +DDGPASKKPKEDSEKPKE+SE
Subjt:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

A0A6J1F357 Ribosome production factor 2 homolog1.7e-17499.69Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMA+PDKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
Subjt:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

A0A6J1FZZ6 Ribosome production factor 2 homolog9.4e-16592.86Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES+VKYSR+N+GIKPFE+GGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDH IYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD+FRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQKVGD+A+PDKSKGVKRER EAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        +D+GPASKK KEDSEKPKE+SE
Subjt:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

A0A6J1J655 Ribosome production factor 2 homolog1.1e-17398.76Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDHKIYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMA+PDKSKGVKRERREAKMK+
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
Subjt:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

A0A6J1KZU6 Ribosome production factor 2 homolog1.5e-16593.15Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES+VKYSR+N+GIKPFE+GGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDH IYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD+FRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQKVGD+A+PDKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENS
        +DD PASKKPKEDSEKPKE+S
Subjt:  KDDGPASKKPKEDSEKPKENS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2YDN6 Ribosome production factor 2 homolog3.8e-5441.48Show/hide
Query:  KIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        ++  PK  + +R LEKR PK+ E  K  +++ G   +  +  VL ++Y LKK   + Y +KN   +PFE    +SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVIGR YD+ + D++E+GIE F S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ + LK +L+D FRG  V N+ LAGL+ V   TA++  K++    
Subjt:  LVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKNKD
         L LKKSG   PR+EL E+GPS+D+V+RR  L SD L K +MK  K    KK+KN+S D      GRI++  Q +  +    K KG+K  +R A+ K +D
Subjt:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKNKD

Query:  DGPASKKPKED
        +   SK+ K++
Subjt:  DGPASKKPKED

Q9AWM9 Ribosome production factor 2 homolog4.7e-12170.51Show/hide
Query:  IRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNL
        IR P++ + +REL K APK+VETGKKTLILHGTKTS VLN+VL +L+HLK++++VKYS+KND I+PFESGG++SLEFFSLKTDCS+IVYGSHSKKRP+NL
Subjt:  IRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNL

Query:  VIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCA
        V+GRTYDH IYDLVEVG+EN+KS+ S+ YDKKL+P++GSKPF  FIGE FE+VEELKHLKEVLLDLF+GEVVENLNLAG+DRV+VCTAISP  V++ HCA
Subjt:  VIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCA

Query:  LRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKNKDD
        LRLK+SG+ +PR+ELVEVGPSMD+VVRRHR P + L+KEAMKTA D AKK  KNV++D + GK+G++YIPDQ++  M++ +  KG+KRERREAK KNKD 
Subjt:  LRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKNKDD

Query:  GPASKKPKEDSE
           SKK K + E
Subjt:  GPASKKPKEDSE

Q9H7B2 Ribosome production factor 2 homolog6.5e-5441.8Show/hide
Query:  KIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        ++  PK  + +R LEKR PK+ E  K  +++ G   +  +  VL ++Y LKK   V Y +KN   +PFE    +SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVIGR YD+ + D++E+GIENF S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ + LK +L+D FRG  V N+ LAGL+ V   TA++  K++    
Subjt:  LVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKNKD
         L LKKSG   PR+EL E+GPS+D+V+RR  L SD L K +MK  K    KK+KN+S D      GRI++  Q +  +    K KG+K  +R A+   +D
Subjt:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKNKD

Query:  DGPASKKPKED
            SK+ K++
Subjt:  DGPASKKPKED

Q9JJ80 Ribosome production factor 2 homolog2.0e-5542.77Show/hide
Query:  KIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        K+  PK  + +R LEKR PK+ E  K  +++ G   +  +  VL ++Y LKK   V Y +KN   +PFE    +SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVIGR YD+ + D++E+GIE F S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ + LK +L+D FRG  V N+ LAGL+ V   TA++  KV+    
Subjt:  LVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKNKD
         L LKKSG   PR+EL E+GPS+D+V+RR  L SD L K +MK  K    KK KN+SQD      GRI++  Q +  +    K KG+K  +R A+    D
Subjt:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKNKD

Query:  DGPASKKPKED
         G  SK+ K++
Subjt:  DGPASKKPKED

Q9LUG5 Ribosome production factor 2 homolog4.7e-12972.06Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        M++IRTPK GK +R LE RAPK+VETGKKTLILHGTKTS  L++V+TELY LKK  +++YSR+N+ I+PFESGG++SLEFFS KTDCSI VYGSH+KKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLV+GR YDH++YDL+EVGIENFKS+ +F+YDKK +P  G+KPFI FIGEGFENV ELKHLKEVL DLFRGEVV+NLNL GLDR YVC+AISP KVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCAL+LKKSGS+VPRMELVEVGPSMD+V+RR+RLP+D L KEAM+T+KD+ KKKEKNV QDA+ GK G+IY+PDQK+ +M + DKSKG KRER++AK+K+
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  KDDGPASKKPKEDSE
        K++   +KK K  SE
Subjt:  KDDGPASKKPKEDSE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23620.1 Ribosomal RNA processing Brix domain protein3.3e-13072.06Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        M++IRTPK GK +R LE RAPK+VETGKKTLILHGTKTS  L++V+TELY LKK  +++YSR+N+ I+PFESGG++SLEFFS KTDCSI VYGSH+KKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLV+GR YDH++YDL+EVGIENFKS+ +F+YDKK +P  G+KPFI FIGEGFENV ELKHLKEVL DLFRGEVV+NLNL GLDR YVC+AISP KVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN
        HCAL+LKKSGS+VPRMELVEVGPSMD+V+RR+RLP+D L KEAM+T+KD+ KKKEKNV QDA+ GK G+IY+PDQK+ +M + DKSKG KRER++AK+K+
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  KDDGPASKKPKEDSE
        K++   +KK K  SE
Subjt:  KDDGPASKKPKEDSE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGAAGATTAGAACTCCCAAGAATGGAAAAGTTAGACGAGAGCTTGAGAAACGTGCCCCCAAAATTGTTGAGACGGGGAAGAAGACGCTGATACTTCATGGCACAAA
AACAAGCGGCGTGTTGAATGCAGTACTGACGGAACTCTATCACCTGAAGAAAGAAAGTTCCGTGAAGTATTCTCGTAAGAATGATGGAATTAAACCATTTGAAAGTGGCG
GCGATTCGTCTTTGGAATTTTTCTCTCTCAAAACTGATTGCAGTATTATCGTGTATGGTTCTCACTCAAAGAAACGACCTGATAACCTTGTCATAGGGAGAACCTATGAT
CACAAAATCTATGACCTAGTTGAGGTTGGGATTGAAAATTTCAAGTCAATGCATTCTTTCACATATGATAAGAAACTCTCGCCACGGGTGGGGTCAAAGCCTTTCATTAC
TTTCATTGGGGAAGGATTTGAGAATGTGGAAGAGCTAAAGCATTTAAAGGAAGTTTTGCTTGATTTATTCCGGGGGGAGGTTGTAGAGAATTTAAATCTTGCAGGGTTGG
ACCGTGTGTATGTATGTACAGCCATCTCACCGAATAAAGTATTTCTCACTCATTGTGCATTGCGATTGAAGAAGTCAGGTTCAGTAGTTCCAAGAATGGAACTAGTTGAA
GTTGGTCCTTCCATGGATATGGTGGTTCGCCGCCACCGACTTCCTAGTGATGGTCTAAGGAAGGAAGCCATGAAAACAGCCAAGGATCAGGCTAAGAAGAAGGAGAAGAA
TGTTAGCCAGGATGCAATTCAGGGCAAGATCGGAAGGATCTATATTCCTGATCAAAAGGTTGGAGATATGGCTATGCCCGACAAATCAAAGGGAGTGAAGAGAGAACGAC
GTGAAGCGAAAATGAAAAATAAAGATGACGGACCAGCCTCTAAAAAACCAAAGGAAGATTCAGAAAAGCCGAAGGAAAATTCGGAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAAAGACGCCCGCGCCATAAAACCCACCAAAATCGGCGTCAGTTTGCAGTCGCCGGAAGTGTCGATATTCTTCTGAGCATCAAAACCCTAAATCATCTCCGTCATCTCGT
CGTTGTGGATCATGTTGAAGATTAGAACTCCCAAGAATGGAAAAGTTAGACGAGAGCTTGAGAAACGTGCCCCCAAAATTGTTGAGACGGGGAAGAAGACGCTGATACTT
CATGGCACAAAAACAAGCGGCGTGTTGAATGCAGTACTGACGGAACTCTATCACCTGAAGAAAGAAAGTTCCGTGAAGTATTCTCGTAAGAATGATGGAATTAAACCATT
TGAAAGTGGCGGCGATTCGTCTTTGGAATTTTTCTCTCTCAAAACTGATTGCAGTATTATCGTGTATGGTTCTCACTCAAAGAAACGACCTGATAACCTTGTCATAGGGA
GAACCTATGATCACAAAATCTATGACCTAGTTGAGGTTGGGATTGAAAATTTCAAGTCAATGCATTCTTTCACATATGATAAGAAACTCTCGCCACGGGTGGGGTCAAAG
CCTTTCATTACTTTCATTGGGGAAGGATTTGAGAATGTGGAAGAGCTAAAGCATTTAAAGGAAGTTTTGCTTGATTTATTCCGGGGGGAGGTTGTAGAGAATTTAAATCT
TGCAGGGTTGGACCGTGTGTATGTATGTACAGCCATCTCACCGAATAAAGTATTTCTCACTCATTGTGCATTGCGATTGAAGAAGTCAGGTTCAGTAGTTCCAAGAATGG
AACTAGTTGAAGTTGGTCCTTCCATGGATATGGTGGTTCGCCGCCACCGACTTCCTAGTGATGGTCTAAGGAAGGAAGCCATGAAAACAGCCAAGGATCAGGCTAAGAAG
AAGGAGAAGAATGTTAGCCAGGATGCAATTCAGGGCAAGATCGGAAGGATCTATATTCCTGATCAAAAGGTTGGAGATATGGCTATGCCCGACAAATCAAAGGGAGTGAA
GAGAGAACGACGTGAAGCGAAAATGAAAAATAAAGATGACGGACCAGCCTCTAAAAAACCAAAGGAAGATTCAGAAAAGCCGAAGGAAAATTCGGAATAGTTCAATATTA
GTGGAATAGTTTTGATCCGATTCTCCTCTTGCTAACTTGAGTCAGCTGTTGTGAGTTGCATGGTAGCACGCCAAATATATGGAGAGAGCAGACAAATTATTTATTGCTTA
TATACAATTTTGTTTTTGTTCTTCAATCTGATTCTTACATGCTGAGCCTATCTTTTATCATCTTAATCATTCAAGCTCTTTCAAAGTTTGATCGTGAACCTCATTGATTC
TGTTGTTGTGTAGCAAACAGAAGTTCTTTCAAAGTATGTATATGTTAGCAAGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNLVIGRTYD
HKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCALRLKKSGSVVPRMELVE
VGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMAMPDKSKGVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE