; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg03898 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg03898
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein TIFY 8
Genome locationCarg_Chr12:1908646..1912577
RNA-Seq ExpressionCarg03898
SyntenyCarg03898
Gene Ontology termsGO:0009611 - response to wounding (biological process)
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GO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR010399 - Tify domain
IPR040390 - TIFY/JAZ family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585439.1 Protein TIFY 8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.8e-23896.44Show/hide
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KAG7020359.1 Protein TIFY 8 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.6e-252100Show/hide
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A0A1S3BBZ1 protein TIFY 8-like isoform X13.2e-15066.18Show/hide
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A0A5A7VGV4 Protein TIFY 8-like isoform X14.6e-14966.04Show/hide
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A0A6J1EV71 protein TIFY 8-like isoform X12.5e-14766.88Show/hide
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A0A6J1GJZ0 LOW QUALITY PROTEIN: protein TIFY 81.5e-20384.43Show/hide
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        LEG+PFYGSRGD+STTEIHNRIIGNKRSM DSGFIGSYRDGVPHMASESHLMKTLRNGAGRELNRRANDDEVTLGMQQ MRPSAASVIFQPHIGSGSRLD
Subjt:  LEGVPFYGSRGDMSTTEIHNRIIGNKRSMLDSGFIGSYRDGVPHMASESHLMKTLRNGAGRELNRRANDDEVTLGMQQPMRPSAASVIFQPHIGSGSRLD

Query:  ADVTKWERSTLMNIGPAPAVQYSPRGTSMPFSPQLHTNRFRDANAIPSNISQSAADEGSRTGIKGPGILSSSYPGGGTSERNSSILLPSCSLQKPGTNIA
        ADVTKWERSTLMNIGPAPAVQYSPRGTSMPFSPQLHTNRFRDANAIP NISQSAADEGSRTGIKGPGILSSSYPGGGTSERNSSILLPSCSLQKPGTNIA
Subjt:  ADVTKWERSTLMNIGPAPAVQYSPRGTSMPFSPQLHTNRFRDANAIPSNISQSAADEGSRTGIKGPGILSSSYPGGGTSERNSSILLPSCSLQKPGTNIA

Query:  EHESSMPSRKMLVFVLLILRLVNRSRRGLISADRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSSGDRGQLTMQQNQLLGQLTKAKLQTENSTSVWQVTP
        EHESSMPS                SRRGLISADRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSS                + +++        V     
Subjt:  EHESSMPSRKMLVFVLLILRLVNRSRRGLISADRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSSGDRGQLTMQQNQLLGQLTKAKLQTENSTSVWQVTP

Query:  PRHLPKKL-IESCVAGSSAPIASSVERVTASAGAGKDVRNQVQAAADSSAEKKREL
             K+   + CVAGSSAPIA SVERV ASAGAGKDVRNQVQAAADSSAEKKREL
Subjt:  PRHLPKKL-IESCVAGSSAPIASSVERVTASAGAGKDVRNQVQAAADSSAEKKREL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q84MB2 Protein TIFY 83.3e-3532.63Show/hide
Query:  IFHDFLGMKNPSDSPLGFSPRTAADLRPSDPSPAASASRGP-----SSSGGRGPISTTSDLASDRQ-VGSHLEGVPFYGSRGDMSTTEIHNRIIGNKRSM
        +FHDFLG KNP+      +  + AD R    + AA A+  P     SS+GG G +S+TSDL       G+HL+G+  +G R D+S + + NR  GNKRS 
Subjt:  IFHDFLGMKNPSDSPLGFSPRTAADLRPSDPSPAASASRGP-----SSSGGRGPISTTSDLASDRQ-VGSHLEGVPFYGSRGDMSTTEIHNRIIGNKRSM

Query:  LDSGFIGSYRDGVPHMASESHLMKTLRNGAGRELNRRANDDEVTLGMQQPMRPSAASVIFQPHIGSGSRLDADVTKWERSTLMNIGPAPAVQYSPRGTSM
         DS F               H  K LRNG G                                                S  MN+ P         G   
Subjt:  LDSGFIGSYRDGVPHMASESHLMKTLRNGAGRELNRRANDDEVTLGMQQPMRPSAASVIFQPHIGSGSRLDADVTKWERSTLMNIGPAPAVQYSPRGTSM

Query:  PFSPQLHTNRFRDANAIPSNISQSAADEGSRTGIKGPGILSSSYPGGGTSERNSSILLPSCSLQKPGTNIAEHESSMPSRKMLVFVLLILRLVNRSRRGL
            QL T+RF+D N  PS I+Q+AADEGSRTG+KGPGIL             SS  +P         N ++ ES  PS                +R+ L
Subjt:  PFSPQLHTNRFRDANAIPSNISQSAADEGSRTGIKGPGILSSSYPGGGTSERNSSILLPSCSLQKPGTNIAEHESSMPSRKMLVFVLLILRLVNRSRRGL

Query:  ISADRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSSGDRGQLTMQQNQLLGQLTKAKLQTENSTS--------VWQVTPPRHLPKKLIESCVAGSSAPIA
         S+ +QMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSSG      +            K +++N+TS        +++    +  P+   E     S  P +
Subjt:  ISADRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSSGDRGQLTMQQNQLLGQLTKAKLQTENSTS--------VWQVTPPRHLPKKLIESCVAGSSAPIA

Query:  SSVERVTASAG---------AGKDVRNQV
        S+  R+    G          G+D+R+ V
Subjt:  SSVERVTASAG---------AGKDVRNQV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G17860.1 jasmonate-zim-domain protein 31.4e-0428.14Show/hide
Query:  DEGSRTGIKGPGILSSSYPGGGTS---ERNSSILLPSCSLQKPGTNIAEHESSMPSRKMLVFVLLILRLVNRSRRGLISADRQMTIFYGGQAHVFDDVHP
        +E +   +  PG  S  Y  GG S     N+S  L    +  P  +I     S+     +           RS    I +  Q+TIFY G   V+DD+ P
Subjt:  DEGSRTGIKGPGILSSSYPGGGTS---ERNSSILLPSCSLQKPGTNIAEHESSMPSRKMLVFVLLILRLVNRSRRGLISADRQMTIFYGGQAHVFDDVHP

Query:  NKADVIMALAGSSGDRGQL--TMQQNQLLGQLTKAKLQTENSTSVWQVTPPRHLPKKLIESCVAGSS
         KA  IM LAG+     Q+    Q +Q +   T+A + +          PP  +P     S  AGSS
Subjt:  NKADVIMALAGSSGDRGQL--TMQQNQLLGQLTKAKLQTENSTSVWQVTPPRHLPKKLIESCVAGSS

AT3G17860.2 jasmonate-zim-domain protein 31.4e-0428.14Show/hide
Query:  DEGSRTGIKGPGILSSSYPGGGTS---ERNSSILLPSCSLQKPGTNIAEHESSMPSRKMLVFVLLILRLVNRSRRGLISADRQMTIFYGGQAHVFDDVHP
        +E +   +  PG  S  Y  GG S     N+S  L    +  P  +I     S+     +           RS    I +  Q+TIFY G   V+DD+ P
Subjt:  DEGSRTGIKGPGILSSSYPGGGTS---ERNSSILLPSCSLQKPGTNIAEHESSMPSRKMLVFVLLILRLVNRSRRGLISADRQMTIFYGGQAHVFDDVHP

Query:  NKADVIMALAGSSGDRGQL--TMQQNQLLGQLTKAKLQTENSTSVWQVTPPRHLPKKLIESCVAGSS
         KA  IM LAG+     Q+    Q +Q +   T+A + +          PP  +P     S  AGSS
Subjt:  NKADVIMALAGSSGDRGQL--TMQQNQLLGQLTKAKLQTENSTSVWQVTPPRHLPKKLIESCVAGSS

AT3G17860.3 jasmonate-zim-domain protein 31.4e-0428.14Show/hide
Query:  DEGSRTGIKGPGILSSSYPGGGTS---ERNSSILLPSCSLQKPGTNIAEHESSMPSRKMLVFVLLILRLVNRSRRGLISADRQMTIFYGGQAHVFDDVHP
        +E +   +  PG  S  Y  GG S     N+S  L    +  P  +I     S+     +           RS    I +  Q+TIFY G   V+DD+ P
Subjt:  DEGSRTGIKGPGILSSSYPGGGTS---ERNSSILLPSCSLQKPGTNIAEHESSMPSRKMLVFVLLILRLVNRSRRGLISADRQMTIFYGGQAHVFDDVHP

Query:  NKADVIMALAGSSGDRGQL--TMQQNQLLGQLTKAKLQTENSTSVWQVTPPRHLPKKLIESCVAGSS
         KA  IM LAG+     Q+    Q +Q +   T+A + +          PP  +P     S  AGSS
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AT4G32570.1 TIFY domain protein 82.3e-3632.63Show/hide
Query:  IFHDFLGMKNPSDSPLGFSPRTAADLRPSDPSPAASASRGP-----SSSGGRGPISTTSDLASDRQ-VGSHLEGVPFYGSRGDMSTTEIHNRIIGNKRSM
        +FHDFLG KNP+      +  + AD R    + AA A+  P     SS+GG G +S+TSDL       G+HL+G+  +G R D+S + + NR  GNKRS 
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Query:  LDSGFIGSYRDGVPHMASESHLMKTLRNGAGRELNRRANDDEVTLGMQQPMRPSAASVIFQPHIGSGSRLDADVTKWERSTLMNIGPAPAVQYSPRGTSM
         DS F               H  K LRNG G                                                S  MN+ P         G   
Subjt:  LDSGFIGSYRDGVPHMASESHLMKTLRNGAGRELNRRANDDEVTLGMQQPMRPSAASVIFQPHIGSGSRLDADVTKWERSTLMNIGPAPAVQYSPRGTSM

Query:  PFSPQLHTNRFRDANAIPSNISQSAADEGSRTGIKGPGILSSSYPGGGTSERNSSILLPSCSLQKPGTNIAEHESSMPSRKMLVFVLLILRLVNRSRRGL
            QL T+RF+D N  PS I+Q+AADEGSRTG+KGPGIL             SS  +P         N ++ ES  PS                +R+ L
Subjt:  PFSPQLHTNRFRDANAIPSNISQSAADEGSRTGIKGPGILSSSYPGGGTSERNSSILLPSCSLQKPGTNIAEHESSMPSRKMLVFVLLILRLVNRSRRGL

Query:  ISADRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSSGDRGQLTMQQNQLLGQLTKAKLQTENSTS--------VWQVTPPRHLPKKLIESCVAGSSAPIA
         S+ +QMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSSG      +            K +++N+TS        +++    +  P+   E     S  P +
Subjt:  ISADRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSSGDRGQLTMQQNQLLGQLTKAKLQTENSTS--------VWQVTPPRHLPKKLIESCVAGSSAPIA

Query:  SSVERVTASAG---------AGKDVRNQV
        S+  R+    G          G+D+R+ V
Subjt:  SSVERVTASAG---------AGKDVRNQV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCACCACACTATGCTAACCAATGACCACACCGATTCCAACAAAGCCTATGTTCATAAAAATTCCACTGACCCACATCCACAATCATCTCCCAATCCAATTTTCCA
TGATTTCTTAGGCATGAAAAACCCCTCTGATTCTCCTCTGGGTTTTTCTCCCCGGACGGCGGCGGATTTGCGGCCGTCCGACCCATCTCCCGCTGCCTCCGCCTCTCGCG
GCCCTTCCTCTAGCGGCGGTCGTGGCCCCATCTCTACTACCTCAGATCTTGCTTCTGACCGACAGGTCGGGAGTCATCTCGAAGGCGTTCCATTCTATGGCTCGAGGGGC
GATATGTCTACAACGGAGATTCATAATAGGATCATAGGGAATAAGAGAAGTATGTTGGATTCTGGTTTTATCGGGTCGTATCGAGATGGAGTTCCACACATGGCTTCCGA
GTCGCATTTGATGAAGACATTACGAAATGGAGCAGGCAGGGAGCTTAACCGAAGAGCCAACGACGATGAAGTGACGCTTGGAATGCAGCAGCCAATGAGGCCGAGCGCTG
CGTCGGTTATCTTTCAACCTCATATCGGAAGTGGTAGTAGACTCGATGCTGATGTTACCAAGTGGGAGAGATCCACGCTTATGAACATCGGTCCTGCTCCAGCCGTACAG
TACTCTCCCCGTGGGACGAGTATGCCGTTTTCCCCTCAGTTACATACAAATAGATTCAGAGATGCCAATGCTATTCCTTCAAATATATCTCAATCAGCTGCAGATGAGGG
ATCTCGAACTGGAATCAAAGGTCCTGGAATCTTGAGTTCGAGTTATCCCGGTGGTGGAACCTCCGAACGGAACTCATCTATCCTGCTCCCGAGCTGCAGCTTGCAAAAGC
CCGGGACTAATATCGCCGAGCACGAATCCTCTATGCCTTCAAGGAAAATGCTAGTCTTCGTGCTACTTATCTTGCGACTGGTTAATCGCAGTCGACGTGGTCTTATATCT
GCTGATCGGCAGATGACGATATTTTATGGCGGTCAAGCTCATGTCTTTGACGACGTTCATCCAAACAAGGCCGATGTTATAATGGCCTTAGCCGGGTCAAGCGGGGATCG
TGGTCAGCTAACTATGCAACAAAATCAACTGCTCGGCCAGTTAACGAAAGCCAAACTCCAAACGGAGAACTCGACATCGGTATGGCAAGTGACACCACCTCGTCATTTGC
CAAAGAAGCTCATAGAAAGCTGTGTTGCCGGGAGTTCAGCTCCCATAGCCAGCTCGGTCGAGAGAGTCACAGCATCAGCAGGAGCTGGTAAGGATGTTAGAAACCAAGTT
CAAGCTGCTGCTGATTCGAGTGCGGAGAAGAAGAGAGAGTTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTCTTTTCACAAATCTTTAATTTCCCTCTCTTTCTTCCTCCTCTTCTCTCTGTTTCAGAGCGTGCGATGGGTGCCATTTTGATGGAGTGGATGAACCGCTCATAAATGG
CTCACCACACTATGCTAACCAATGACCACACCGATTCCAACAAAGCCTATGTTCATAAAAATTCCACTGACCCACATCCACAATCATCTCCCAATCCAATTTTCCATGAT
TTCTTAGGCATGAAAAACCCCTCTGATTCTCCTCTGGGTTTTTCTCCCCGGACGGCGGCGGATTTGCGGCCGTCCGACCCATCTCCCGCTGCCTCCGCCTCTCGCGGCCC
TTCCTCTAGCGGCGGTCGTGGCCCCATCTCTACTACCTCAGATCTTGCTTCTGACCGACAGGTCGGGAGTCATCTCGAAGGCGTTCCATTCTATGGCTCGAGGGGCGATA
TGTCTACAACGGAGATTCATAATAGGATCATAGGGAATAAGAGAAGTATGTTGGATTCTGGTTTTATCGGGTCGTATCGAGATGGAGTTCCACACATGGCTTCCGAGTCG
CATTTGATGAAGACATTACGAAATGGAGCAGGCAGGGAGCTTAACCGAAGAGCCAACGACGATGAAGTGACGCTTGGAATGCAGCAGCCAATGAGGCCGAGCGCTGCGTC
GGTTATCTTTCAACCTCATATCGGAAGTGGTAGTAGACTCGATGCTGATGTTACCAAGTGGGAGAGATCCACGCTTATGAACATCGGTCCTGCTCCAGCCGTACAGTACT
CTCCCCGTGGGACGAGTATGCCGTTTTCCCCTCAGTTACATACAAATAGATTCAGAGATGCCAATGCTATTCCTTCAAATATATCTCAATCAGCTGCAGATGAGGGATCT
CGAACTGGAATCAAAGGTCCTGGAATCTTGAGTTCGAGTTATCCCGGTGGTGGAACCTCCGAACGGAACTCATCTATCCTGCTCCCGAGCTGCAGCTTGCAAAAGCCCGG
GACTAATATCGCCGAGCACGAATCCTCTATGCCTTCAAGGAAAATGCTAGTCTTCGTGCTACTTATCTTGCGACTGGTTAATCGCAGTCGACGTGGTCTTATATCTGCTG
ATCGGCAGATGACGATATTTTATGGCGGTCAAGCTCATGTCTTTGACGACGTTCATCCAAACAAGGCCGATGTTATAATGGCCTTAGCCGGGTCAAGCGGGGATCGTGGT
CAGCTAACTATGCAACAAAATCAACTGCTCGGCCAGTTAACGAAAGCCAAACTCCAAACGGAGAACTCGACATCGGTATGGCAAGTGACACCACCTCGTCATTTGCCAAA
GAAGCTCATAGAAAGCTGTGTTGCCGGGAGTTCAGCTCCCATAGCCAGCTCGGTCGAGAGAGTCACAGCATCAGCAGGAGCTGGTAAGGATGTTAGAAACCAAGTTCAAG
CTGCTGCTGATTCGAGTGCGGAGAAGAAGAGAGAGTTGTGATATTCGTTCCCCGACTCAAACGAATGTTTCGAAATGCATCAAAGTCAGCTGTTGTAAGGCATTTCTCGT
GGCGCCCGTCCTTGTTTCAGTACTTTTTAGCTTCGATATTTGTTGTATTTTCTTACCGTTTCGTTTCGAGGGGAGGGGATTCGAGGTTTAAACTTGATGAGCAATGGAAA
TGAATTCCCTTTCTTTTTATGGAACTTAGCTGTTTAAGAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAHHTMLTNDHTDSNKAYVHKNSTDPHPQSSPNPIFHDFLGMKNPSDSPLGFSPRTAADLRPSDPSPAASASRGPSSSGGRGPISTTSDLASDRQVGSHLEGVPFYGSRG
DMSTTEIHNRIIGNKRSMLDSGFIGSYRDGVPHMASESHLMKTLRNGAGRELNRRANDDEVTLGMQQPMRPSAASVIFQPHIGSGSRLDADVTKWERSTLMNIGPAPAVQ
YSPRGTSMPFSPQLHTNRFRDANAIPSNISQSAADEGSRTGIKGPGILSSSYPGGGTSERNSSILLPSCSLQKPGTNIAEHESSMPSRKMLVFVLLILRLVNRSRRGLIS
ADRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSSGDRGQLTMQQNQLLGQLTKAKLQTENSTSVWQVTPPRHLPKKLIESCVAGSSAPIASSVERVTASAGAGKDVRNQV
QAAADSSAEKKREL