; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg03918 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg03918
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiontranscription factor HY5-like
Genome locationCarg_Chr12:2022036..2023035
RNA-Seq ExpressionCarg03918
SyntenyCarg03918
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR004827 - Basic-leucine zipper domain
IPR044280 - Transcriptional activator Hac1/HY5


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585461.1 Transcription factor HY5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-69100Show/hide
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NP_001284656.1 Transcription factor HY5-like [Cucumis melo]1.5e-6494.94Show/hide
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XP_022951770.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita moschata]3.4e-6999.37Show/hide
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XP_022996780.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita maxima]2.3e-6291.77Show/hide
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XP_023537989.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.8e-6998.73Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPK1 BZIP domain-containing protein7.1e-6594.94Show/hide
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A0A5A7VGC0 Transcription factor HY57.1e-6594.94Show/hide
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A0A6J1GJT7 transcription factor HY5-like1.6e-6999.37Show/hide
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A0A6J1KQQ4 transcription factor HY5-like1.6e-6999.37Show/hide
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F1DQG1 BZIP27.1e-6594.94Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O24646 Transcription factor HY52.4e-4974.68Show/hide
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        SAQQARERKKAYL++LE +VKDLE KN ELEERLSTLQNENQMLR ILKNTT ++R G
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Q54RZ9 Probable basic-leucine zipper transcription factor G1.8e-0445.76Show/hide
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        KE KR KRL++NR SA  +R+RK+  L DLE +V++L   ++++ + LS+L+NEN +L+
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Q54WN7 Probable basic-leucine zipper transcription factor F1.4e-0444.44Show/hide
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        ++  KR +RL++NR +AQ  R+R+KAY+ DLE KV DL   N E   R+  L +EN+++R+ L
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Q8W191 Transcription factor HY5-like4.4e-1951.39Show/hide
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        SL   +  SSSS+ H + K   ESDEE+  VPDM  E+AG++   +S  D G V  P+  Q        +R+RGR+P DKE + LKRLLRNRVSAQQARE
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        RKK Y++DLE +  +L+  N +LEE++STL NEN MLR++L NT
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Q9SM50 Transcription factor HY51.5e-4878.48Show/hide
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        MQE ATSS AASSLPSSSERSSSSALH E+KEGMESD+EIRRVP+M GE+ G TSASGRD  S AG  + Q S   QRKRGRSPADKE+KRLKRLLRNRV
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        SAQQARERKKAYL DLE +VK+LE KN ELEERLSTLQNENQMLR ILKNTT   + G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G17609.1 HY5-homolog5.1e-1544.68Show/hide
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        SL   +  SSSS+ H + K                G +   S+S  D   V  P+  Q        +R+RGR+P DKE + LKRLLRNRVSAQQARERKK
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         Y++DLE +  +L+  N +LEE++STL NEN MLR++L NT
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AT3G17609.2 HY5-homolog3.1e-2051.39Show/hide
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        SL   +  SSSS+ H + K   ESDEE+  VPDM  E+AG++   +S  D G V  P+  Q        +R+RGR+P DKE + LKRLLRNRVSAQQARE
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        RKK Y++DLE +  +L+  N +LEE++STL NEN MLR++L NT
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AT3G17609.3 HY5-homolog1.4e-1753.51Show/hide
Query:  VPDMVGESAGTS---ASGRDTGSVAGPDRVQVSR---DGQRKRGRSPADKESKRLKRLLRNRVSAQQARERKKAYLNDLEIKVKDLEKKNLELEERLSTL
        VPDM  E+AG++   +S  D G V  P+  Q        +R+RGR+P DKE + LKRLLRNRVSAQQARERKK Y++DLE +  +L+  N +LEE++STL
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         NEN MLR++L NT
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AT3G17609.4 HY5-homolog2.7e-1645.31Show/hide
Query:  LHLEVKEGMESDEEIRRVPDMVGESAGTSASGRDTGSVAGPDRVQVSR---DGQRKRGRSPADKESKRLKRLLRNRVSAQQARERKKAYLNDLEIKVKDL
        + L+   G  S     +     G +   S+S  D   V  P+  Q        +R+RGR+P DKE + LKRLLRNRVSAQQARERKK Y++DLE +  +L
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Query:  EKKNLELEERLSTLQNENQMLRQILKNT
        +  N +LEE++STL NEN MLR++L NT
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AT5G11260.1 Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein1.7e-5074.68Show/hide
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        MQE ATSS AASSLPSSSERSSSSA HLE+KEG+ESDEEIRRVP+  GE+ G   SGR++GS  G +R Q +  + QRKRGR+PA+KE+KRLKRLLRNRV
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        SAQQARERKKAYL++LE +VKDLE KN ELEERLSTLQNENQMLR ILKNTT ++R G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAGGAGCCGGCGACGAGTTCCGCCGCCGCTAGTTCCTTGCCTTCGAGCAGCGAGAGGTCGTCCAGTTCGGCTCTTCACCTCGAAGTCAAAGAAGGTATGGAGAGCGA
TGAAGAGATCCGGAGAGTGCCGGATATGGTTGGTGAATCAGCCGGAACATCCGCCTCCGGGAGGGACACCGGTTCAGTCGCCGGTCCGGACCGGGTTCAGGTGTCTCGGG
ATGGTCAAAGGAAGAGAGGGAGAAGTCCGGCTGACAAAGAAAGCAAGAGACTGAAGAGATTGCTGAGGAATAGAGTATCGGCACAGCAAGCGAGGGAGAGAAAAAAGGCG
TATTTGAATGATTTAGAGATAAAGGTGAAGGATTTGGAGAAGAAGAACTTGGAACTTGAAGAAAGGCTTTCCACCTTACAAAATGAGAATCAAATGCTTAGACAAATATT
GAAGAACACAACGACAAGTCGGAGAAGTGGGGAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAGGAGCCGGCGACGAGTTCCGCCGCCGCTAGTTCCTTGCCTTCGAGCAGCGAGAGGTCGTCCAGTTCGGCTCTTCACCTCGAAGTCAAAGAAGGTATGGAGAGCGA
TGAAGAGATCCGGAGAGTGCCGGATATGGTTGGTGAATCAGCCGGAACATCCGCCTCCGGGAGGGACACCGGTTCAGTCGCCGGTCCGGACCGGGTTCAGGTGTCTCGGG
ATGGTCAAAGGAAGAGAGGGAGAAGTCCGGCTGACAAAGAAAGCAAGAGACTGAAGAGATTGCTGAGGAATAGAGTATCGGCACAGCAAGCGAGGGAGAGAAAAAAGGCG
TATTTGAATGATTTAGAGATAAAGGTGAAGGATTTGGAGAAGAAGAACTTGGAACTTGAAGAAAGGCTTTCCACCTTACAAAATGAGAATCAAATGCTTAGACAAATATT
GAAGAACACAACGACAAGTCGGAGAAGTGGGGAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQEPATSSAAASSLPSSSERSSSSALHLEVKEGMESDEEIRRVPDMVGESAGTSASGRDTGSVAGPDRVQVSRDGQRKRGRSPADKESKRLKRLLRNRVSAQQARERKKA
YLNDLEIKVKDLEKKNLELEERLSTLQNENQMLRQILKNTTTSRRSGE