; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg04169 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg04169
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionglycine-rich protein-like
Genome locationCarg_Chr19:8021561..8022058
RNA-Seq ExpressionCarg04169
SyntenyCarg04169
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR010800 - Glycine rich protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572253.1 Glycine-rich protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.5e-51100Show/hide
Query:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
        MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
Subjt:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG

Query:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
        RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
Subjt:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
KAG7011884.1 Glycine-rich protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.5e-51100Show/hide
Query:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
        MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
Subjt:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG

Query:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
        RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
Subjt:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
XP_022952570.1 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.9e-4695.16Show/hide
Query:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
        MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGY      GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
Subjt:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG

Query:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
        RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
Subjt:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
XP_023554636.1 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-4491.94Show/hide
Query:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
        MSSKAFIFLG LFAL+L+ISSEVAARDLAETS KKENEAT ETNGVEDAKYGGYDGGYG     GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
Subjt:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG

Query:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
        RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
Subjt:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
XP_023554637.1 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-4491.94Show/hide
Query:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
        MSSKAFIFLG LFAL+L+ISSEVAARDLAETS KKENEAT ETNGVEDAKYGGYDGGYG     GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
Subjt:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG

Query:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
        RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
Subjt:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C180 cold and drought-regulated protein CORA-like1.8e-3484Show/hide
Query:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKY-GGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGY
        MSSKAF+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAET +K +NEAT ETNGVEDAKY GGYD GYGG GGYGRGGY GRGGY GRGGYGGRGGYG     GG GGY
Subjt:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKY-GGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGY

Query:  GRGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
        GRGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
Subjt:  GRGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
A0A5D3DE59 Cold and drought-regulated protein CORA-like3.5e-3584.8Show/hide
Query:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKY-GGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGY
        MSSKAF+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+K +NEAT ETNGVEDAKY GGYD GYGG GGYGRGGY GRGGY GRGGYGGRGGYG     GG GGY
Subjt:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKY-GGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGY

Query:  GRGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
        GRGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
Subjt:  GRGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
A0A6J1GKL6 glycine-rich protein-like isoform X21.6e-4086.29Show/hide
Query:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
        MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYD                 GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
Subjt:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG

Query:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
        RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
Subjt:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
A0A6J1GM55 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X19.0e-4795.16Show/hide
Query:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
        MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGY      GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
Subjt:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG

Query:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
        RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
Subjt:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
A0A6J1HZJ5 glycine-rich protein-like4.6e-4390.32Show/hide
Query:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
        MSSKAFIFLGLLFA +LLISSEVAARDLAETS  KE EAT ETNGVEDAKYGGYDGGYG     GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGG GGYG
Subjt:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG

Query:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
        RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
Subjt:  RGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
SwissProt top hitse value%identityAlignment
P23137 Glycine-rich protein1.8e-0445.67Show/hide
Query:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG
        M SKAF+FLGL  A   LISSEV A +LAETS   + +     NGV+                       GRGGY      GG G YGG  G GGGG   
Subjt:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYG

Query:  RGCRYGRC--GY----RCCSYAGEVVE
        RGCRYG C  GY    RCCSYAGE ++
Subjt:  RGCRYGRC--GY----RCCSYAGEVVE
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G05530.1 Glycine-rich protein family1.1e-0449.22Show/hide
Query:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGY-GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGY
        M+SKA +  GL    VLL+ +EVAA   A  + K E+  T + +         Y+GG+GG GGY G GGY G GG+ G GGY G GGY G GG+GG  GY
Subjt:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGY-GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGY

Query:  GRGCRYGRC--GY----RCCSYAGEVVE
           CRYG C  GY    RCCSYAGE V+
Subjt:  GRGCRYGRC--GY----RCCSYAGEVVE
AT2G05540.1 Glycine-rich protein family9.6e-0953.73Show/hide
Query:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGR--GGYGGR-GGYGGR-GGYGGR-GGYGG
        M+SKA +FL L+  +VLLI+SEV ARDLAE S +++N    E    E  ++GG+ G  GG GG+  GGYGG   GGYG R GGY  R GGYG R GGYG 
Subjt:  MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGR--GGYGGR-GGYGGR-GGYGGR-GGYGG

Query:  -GGGYGRGCRYGRC--GY-----RCCSYAGEVVE
         GGGY   CRYG C  GY     RCC+YAG+ V+
Subjt:  -GGGYGRGCRYGRC--GY-----RCCSYAGEVVE

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTTCCAAGGCCTTTATTTTTCTCGGTCTTCTCTTCGCCCTCGTTCTCCTAATCTCTTCGGAGGTGGCCGCGAGAGACCTCGCAGAGACCTCCACAAAGAAGGAGAA
CGAAGCCACGGCGGAGACCAATGGCGTAGAGGATGCCAAGTATGGAGGATATGATGGAGGTTATGGCGGGCGTGGTGGGTACGGTCGTGGTGGGTATGGTGGTCGTGGTG
GGTATGGTGGTCGAGGTGGGTATGGTGGTCGAGGTGGGTATGGTGGACGTGGTGGGTACGGTGGCGGAGGTGGGTATGGAAGGGGTTGCCGGTATGGACGATGCGGGTAC
AGGTGCTGCAGCTACGCCGGTGAAGTGGTGGAGGGCGCAAAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTACTCATCCCGTCTTCAAAATTTAGTCTCTTCCTAAACACAAAAATGAGTTCCAAGGCCTTTATTTTTCTCGGTCTTCTCTTCGCCCTCGTTCTCCTAATCTCTTCGGA
GGTGGCCGCGAGAGACCTCGCAGAGACCTCCACAAAGAAGGAGAACGAAGCCACGGCGGAGACCAATGGCGTAGAGGATGCCAAGTATGGAGGATATGATGGAGGTTATG
GCGGGCGTGGTGGGTACGGTCGTGGTGGGTATGGTGGTCGTGGTGGGTATGGTGGTCGAGGTGGGTATGGTGGTCGAGGTGGGTATGGTGGACGTGGTGGGTACGGTGGC
GGAGGTGGGTATGGAAGGGGTTGCCGGTATGGACGATGCGGGTACAGGTGCTGCAGCTACGCCGGTGAAGTGGTGGAGGGCGCAAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSKAFIFLGLLFALVLLISSEVAARDLAETSTKKENEATAETNGVEDAKYGGYDGGYGGRGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGGGYGRGCRYGRCGY
RCCSYAGEVVEGAK