; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg04208 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg04208
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionLeucine-rich repeat extensin-like protein 3
Genome locationCarg_Chr01:759034..759477
RNA-Seq ExpressionCarg04208
SyntenyCarg04208
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606823.1 hypothetical protein SDJN03_00165, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.6e-6797.96Show/hide
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KAG7036530.1 hypothetical protein SDJN02_00148, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.9e-70100Show/hide
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XP_022948489.1 extensin-1-like [Cucurbita moschata]1.9e-6697.28Show/hide
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XP_022998307.1 extensin-1-like [Cucurbita maxima]2.3e-6797.96Show/hide
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XP_023523988.1 extensin-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.5e-6697.28Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWW6 Uncharacterized protein1.2e-5079.19Show/hide
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          F PPPLVPEVPDIPQDP PFVSAPPAPDTGFNEPL+PLPPEP FT P
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A0A1S3BZA5 extensin-like1.4e-5181.08Show/hide
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        VPPPLVPS  PPPPL  TPTPSTWFPPPLV SPPPL S P PL+TFSPP+P+F +PP V DLPPP +FTPDQPPFIPI PPPLVSIPT+P PFTF   P 
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         FLPPPLVPEVPDIPQ+PFPFVSAPPAPD GFNEPLVPLPPEPPFT P
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A0A2P5E641 Uncharacterized protein6.5e-1244.5Show/hide
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        PPP    PSPPPPPPL+ S P PS   PPPLVPSPPP    P P+                   I  SPP+      P+F +PP  PDLPP  +FTP   
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              PP  P+LP  PP    PTEP          P    P IFLPPP    +P  PQ+P PF S PP+PD  FNEP+  LPP  PF TP
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A0A6J1GA21 extensin-1-like9.2e-6797.28Show/hide
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A0A6J1K7K9 extensin-1-like1.1e-6797.96Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81765 Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 46.3e-0441.1Show/hide
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        P +F PPP         Q P P V +PP      N P V  PP  P
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Q9LK03 Proline-rich receptor-like protein kinase PERK24.8e-0441.06Show/hide
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        PP  +P PPPP PL ++ P P T  PP L P PPP    PA      PP P  +VPP+ P  P PP   TP   P  P  P PPL   PT PSP    P+
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           PPP +   P +   P  P P   +PP P      P  PL P PP ++P
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Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 37.9e-0743.05Show/hide
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        +PPP +PSPPPP P+ STP P+   PPP  P PPP++S P P     PP P +S PP  P  PPP  ++P  PP  P  PPP+ S P  PSP    P ++
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         PPP  P  P  P     P P  S+PP P +    P+     PP PP + P
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Q9XIL9 Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 34.8e-0441.33Show/hide
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        PPP V SPPPPPP+ S P P    PPP+   PPP+ S P P+   SPP P  S PP V   PPP   +P       PP +   PPP+ S P  P   +  
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        P +F PPP V   P     P P V +PP P        V  PP PP  +P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12040.1 leucine-rich repeat/extensin 12.2e-0437.25Show/hide
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        PPP V S PPPP + S+P P   +  PPP  PSPPP    S+P P + +  P+ + S PP  P   PP   +P  PP  P+  PP+ + P  PSP  + P
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        + + PPP      P+V   P  P P        +PP P   +  P+ P PP P
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AT2G15880.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein3.4e-0541.33Show/hide
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        PPP V SPPPPPP+ S P P    PPP+   PPP+ S P P+   SPP P  S PP V   PPP   +P       PP +   PPP+ S P  P   +  
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        P +F PPP V   P     P P V +PP P        V  PP PP  +P
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AT3G19020.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein4.5e-0539.74Show/hide
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        PPP V SPPP    PPP + +P P    PPP V SPPP   +P P +   PP P FS PP  P   PP       PP +   PPP V  P  P      P
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Query:  IIFLPPPLVPEVPDI--PQDPFPFVSAPPAPDTGFNEPLVPLPPEPPFTTP
        +   PPP+    P +  P  P P  S PP     F+ P  P+ P PP T+P
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AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein5.6e-0843.05Show/hide
Query:  VPPPLVPSPPPPPPLLSTPTPSTWFPPPLVPSPPPLFSNPAPLITFSPPLPEFSVPPLVPDLPPPFDFTPDQPPFIPILPPPLVSIPTEPSPFTFRPIIF
        +PPP +PSPPPP P+ STP P+   PPP  P PPP++S P P     PP P +S PP  P  PPP  ++P  PP  P  PPP+ S P  PSP    P ++
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Query:  LPPPLVPEVPDIP---QDPFPFVSAPPAPDTGFNEPL--VPLPPEPPFTTP
         PPP  P  P  P     P P  S+PP P +    P+     PP PP + P
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AT4G33970.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein4.5e-0541.1Show/hide
Query:  PPPLVPSPPPPPPLLSTPTPSTWFPPP-----LVPSPPPLFSNPAPLITFSPPLPEFSVPPLVPDLPPPFDFTPDQPPFIPILPPPLVSIPTEPSPFTFR
        PPP V SPPPPPP + +P P    PPP       P PPP+ S P P+  FSPP P +S PP V   PPP   +P  P  +   PPP+ S P  P  ++  
Subjt:  PPPLVPSPPPPPPLLSTPTPSTWFPPP-----LVPSPPPLFSNPAPLITFSPPLPEFSVPPLVPDLPPPFDFTPDQPPFIPILPPPLVSIPTEPSPFTFR

Query:  PIIFLPPPLVPEVPDIPQDPFPFVSAPPAPDTGFNEPLVPLPPEPP
        P +F PPP         Q P P V +PP      N P V  PP  P
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTTCCACCTCCCTTGGTTCCATCACCGCCACCGCCACCGCCATTACTATCTACTCCAACACCTTCAACCTGGTTTCCACCACCTCTGGTTCCTTCACCACCACCACT
GTTTTCTAATCCAGCACCTTTAATAACCTTCTCACCACCTCTGCCAGAATTTTCAGTACCTCCACTGGTGCCTGATCTGCCACCTCCGTTTGATTTCACACCAGATCAAC
CACCGTTCATCCCCATATTACCTCCACCACTGGTATCAATCCCGACAGAACCATCGCCTTTCACATTTCGTCCCATCATCTTTCTTCCACCTCCCCTGGTTCCTGAAGTT
CCAGATATTCCTCAGGATCCATTTCCCTTTGTGTCTGCACCACCAGCACCAGATACCGGTTTCAATGAACCATTAGTGCCCCTGCCACCTGAACCGCCCTTCACTACTCC
ATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTTCCACCTCCCTTGGTTCCATCACCGCCACCGCCACCGCCATTACTATCTACTCCAACACCTTCAACCTGGTTTCCACCACCTCTGGTTCCTTCACCACCACCACT
GTTTTCTAATCCAGCACCTTTAATAACCTTCTCACCACCTCTGCCAGAATTTTCAGTACCTCCACTGGTGCCTGATCTGCCACCTCCGTTTGATTTCACACCAGATCAAC
CACCGTTCATCCCCATATTACCTCCACCACTGGTATCAATCCCGACAGAACCATCGCCTTTCACATTTCGTCCCATCATCTTTCTTCCACCTCCCCTGGTTCCTGAAGTT
CCAGATATTCCTCAGGATCCATTTCCCTTTGTGTCTGCACCACCAGCACCAGATACCGGTTTCAATGAACCATTAGTGCCCCTGCCACCTGAACCGCCCTTCACTACTCC
ATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVPPPLVPSPPPPPPLLSTPTPSTWFPPPLVPSPPPLFSNPAPLITFSPPLPEFSVPPLVPDLPPPFDFTPDQPPFIPILPPPLVSIPTEPSPFTFRPIIFLPPPLVPEV
PDIPQDPFPFVSAPPAPDTGFNEPLVPLPPEPPFTTP