; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg04268 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg04268
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionPeroxin-2
Genome locationCarg_Chr01:473998..478284
RNA-Seq ExpressionCarg04268
SyntenyCarg04268
Gene Ontology termsGO:0005777 - peroxisome (cellular component)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR006845 - Pex, N-terminal
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR017907 - Zinc finger, RING-type, conserved site
IPR018957 - Zinc finger, C3HC4 RING-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606758.1 Peroxisome biogenesis protein 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.7e-11899.54Show/hide
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KAG7036473.1 Peroxisome biogenesis protein 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.9e-147100Show/hide
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XP_022948765.1 peroxisome biogenesis protein 2-like [Cucurbita moschata]3.3e-11799.53Show/hide
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XP_022997964.1 peroxisome biogenesis protein 2 [Cucurbita maxima]9.5e-11799.07Show/hide
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XP_023524869.1 peroxisome biogenesis protein 2 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.3e-11799.07Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DI27 Peroxin-23.1e-11394.88Show/hide
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A0A6J1GAT9 Peroxin-21.6e-11799.53Show/hide
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A0A6J1GUS7 Peroxin-25.8e-11296.21Show/hide
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A0A6J1IUI0 Peroxin-21.5e-11296.68Show/hide
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A0A6J1KD15 Peroxin-24.6e-11799.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P24392 Peroxisome biogenesis factor 22.7e-2132.35Show/hide
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        +L+W+ F+E L+ LLPL+N   ++  L  +    +S++  D +       C +C   PT+P   + C+H +CYYC+++  +    F C +C   V ++Q 
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           G
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P51021 Peroxisomal biogenesis factor 25.9e-2131.9Show/hide
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        VW+ F+E LL +LPL+  +  R +L   + K K   S      AE+         +  C IC                               T P+  +
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        PC   YC+ CL TR      + + C RC E V
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Q06438 Peroxisome biogenesis factor 29.1e-2233.33Show/hide
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Query:  QLVWNEFSEMLLLLLPLLN----SSSVRNFLCPFSKEKSSSSAEDDSA--CPICLASPTIPFLALPCQHRYCYYCLRTRCMAAQSFRCSRCSEPVVAMQR
        +L+W+ F+E L+ LLPL+N     + + ++  P +   SS SA   S   C +C   PT+P   + C+H +CYYC+++  +    F C +C   V ++Q 
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Query:  YVEG
           G
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Q75JQ3 Peroxisome biogenesis factor 22.0e-3233.18Show/hide
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        LT+ QK    +  +GG+++WTR+  +     W +     + ++ W  +   E  YKA A  N L FL+ G+Y  LV R+L  RLVY  P ++R +SFEYM
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        NR LVW+ F+E +L ++PL+N   +++FL     + S   SS   +++A                       CPIC+  P     +  C H +CYYC++T
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Query:  RCMAAQSFRCSRCSEPVVAMQRY
         CM   SF C RC+  +  ++R+
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Q9CA86 Peroxisome biogenesis protein 29.9e-9377.83Show/hide
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        NR+VSFEYMNRQLVWNEFSEMLLLLLPLLNSS+V+N L PF+K+KSSS+ ED   CPIC   P IPF+ALPCQHRYCYYC+RTRC +A SFRC RC+EPV
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        VA+QR  EG S+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G79810.1 Pex2/Pex12 N-terminal domain-containing protein / zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein7.0e-9477.83Show/hide
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        NR+VSFEYMNRQLVWNEFSEMLLLLLPLLNSS+V+N L PF+K+KSSS+ ED   CPIC   P IPF+ALPCQHRYCYYC+RTRC +A SFRC RC+EPV
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        VA+QR  EG S+
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AT1G79810.2 Pex2/Pex12 N-terminal domain-containing protein / zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein7.0e-9477.83Show/hide
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        VA+QR  EG S+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGTTGAGAATTAAAACTGTAGCAACCATGGAACTGCTGTTGTCAAATCTTCATAGCAATGTGTGGCAGTCACTTATTAATTCCTTTATTGAAAACTATAATCAATT
TTTTCTGGCTCTGGACTTCTTCTGCAATACAGTCAGAACTGGATTGGAAGGACCTGGCCTCACAGTTGCTCAAAAGATTTGGTATTGCGTGGCCACTGTGGGTGGTCAAT
ACATTTGGACTCGGTTACAATCATTTTCTGCTTTTCGTAGATGGGGAGATTCAGAGCAGAGGTCCTTGGCGAGGCGAGCATGGCTTTTGATTCAGCGCATTGAAGGAATA
TACAAAGCTGCTGCATTTGGCAACTTGCTCATATTTCTTTACACAGGAAGGTATAGAAATCTTGTCGAGAGAGTTCTCAGAGCCAGGCTTGTTTATGGGAGTCCTAATAT
GAACAGGGCTGTCAGCTTTGAGTATATGAATCGCCAGTTAGTGTGGAATGAATTCTCGGAAATGTTGCTGTTGCTTCTTCCTCTTCTAAATTCTTCCTCTGTTAGAAACT
TTCTTTGTCCATTTTCCAAGGAGAAGTCCTCAAGCTCGGCCGAGGATGACAGTGCTTGTCCAATTTGCCTGGCAAGTCCAACGATTCCATTTCTGGCTTTGCCTTGTCAA
CACAGATACTGTTACTATTGCCTCCGAACACGATGCATGGCAGCTCAATCATTTAGATGTTCAAGATGCAGCGAGCCTGTGGTGGCCATGCAGCGGTATGTGGAAGGCAC
TAGTGCAAATCCCAAATGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGTTGAGAATTAAAACTGTAGCAACCATGGAACTGCTGTTGTCAAATCTTCATAGCAATGTGTGGCAGTCACTTATTAATTCCTTTATTGAAAACTATAATCAATT
TTTTCTGGCTCTGGACTTCTTCTGCAATACAGTCAGAACTGGATTGGAAGGACCTGGCCTCACAGTTGCTCAAAAGATTTGGTATTGCGTGGCCACTGTGGGTGGTCAAT
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GAACAGGGCTGTCAGCTTTGAGTATATGAATCGCCAGTTAGTGTGGAATGAATTCTCGGAAATGTTGCTGTTGCTTCTTCCTCTTCTAAATTCTTCCTCTGTTAGAAACT
TTCTTTGTCCATTTTCCAAGGAGAAGTCCTCAAGCTCGGCCGAGGATGACAGTGCTTGTCCAATTTGCCTGGCAAGTCCAACGATTCCATTTCTGGCTTTGCCTTGTCAA
CACAGATACTGTTACTATTGCCTCCGAACACGATGCATGGCAGCTCAATCATTTAGATGTTCAAGATGCAGCGAGCCTGTGGTGGCCATGCAGCGGTATGTGGAAGGCAC
TAGTGCAAATCCCAAATGGTAATCCCTGGGCAGAGGGAGCAAATACAATTTATAGTGATTATAATAAGAAAAAGGAAAATTGCTTCAATGTTGCAATTAATTTTTTTTTG
TTGCTTGAAGCATAAATGCTTATAGAAAATCAAATTCCCTGGAAAAGCATATGTTGTATTGTGTAGTAGCCGTAGGGGGGCTCATTCTTTTTAACTTTCCTAGTACATTT
GTAGTATAGGTACTCGCTGATTATCTTGTGATTAATTCCCTGCAGTTACAAGAGGAAACATTATGCTTTCTTTCTTTCTTTTTCCTTTTTTTCTTATAAAGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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