; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg04282 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg04282
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionOxidative stress 3, putative isoform 2
Genome locationCarg_Chr01:425172..425867
RNA-Seq ExpressionCarg04282
SyntenyCarg04282
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606744.1 hypothetical protein SDJN03_00086, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-8098.77Show/hide
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KAG7036459.1 hypothetical protein SDJN02_00076 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-82100Show/hide
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XP_022949011.1 uncharacterized protein LOC111452482 [Cucurbita moschata]2.7e-7796.93Show/hide
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XP_022997869.1 uncharacterized protein LOC111492699 [Cucurbita maxima]7.3e-7593.37Show/hide
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XP_023524906.1 uncharacterized protein LOC111788696 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-7796.43Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BH50 uncharacterized protein LOC1034899765.8e-4671.25Show/hide
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A0A5D3CBD2 Oxidative stress 3, putative isoform 25.8e-4671.25Show/hide
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A0A6J1DLD1 uncharacterized protein LOC1110211147.9e-4363.54Show/hide
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A0A6J1GAT2 uncharacterized protein LOC1114524821.3e-7796.93Show/hide
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A0A6J1KCR8 uncharacterized protein LOC1114926993.5e-7593.37Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G43850.1 unknown protein7.6e-0646.43Show/hide
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        L+SSTSS     NS DD        SS  NG L+    L   LPIKR +S FY+GKS+SF SLS   S  ++DL K  + YS R
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AT4G26288.1 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown3.0e-1043.09Show/hide
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        ++SS+S    SS+ ++DA SS+S+SSS SNG  +D ++L +QLPI    K GLS +Y+GKSQSFTSL++V S++DL K+     SR   C  + Y  G  
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AT5G21940.1 unknown protein2.5e-0436.9Show/hide
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        +D   SS+D       +   SP  G LE    L   LP+++G+S +Y GKS+SFT        +L+S  S++DL K  +PYS R
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AT5G56550.1 oxidative stress 32.4e-1245.24Show/hide
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        E D + + S SS   S  + DD     S+SS  SNG LED ++L + LPIKRGLS FYEGKSQSFTSL +V+S+EDL K   K   Y ++    +S  G 
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        LD      ++ PKA   KK + + SS
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTGGATTGCTTCATCAACCTTGTTCTGTTGCTCTGTGCAAAGGGTTCCATGAAGATGATTGGGGCAAGGGCGGTGAGTATGACTACAACCTTGCCTCTTCCACATC
TTCCTTCGAAGATTCAAGCAATTCGTCGGATGATGCGTGTTCATCCACTTCAAATTCTTCATCTCCATCCAATGGAGCGTTGGAGGATTTTACAGAGCTTTTTGCCCAAC
TCCCAATCAAGAGAGGACTGTCCATGTTCTATGAAGGGAAATCCCAGTCGTTTACATCGCTATCAAGTGTAAGAAGCATAGAAGACCTTCCGAAGAAGAGAAGCCCTTAC
AGCAGTAGATTGAGTGGATGTAAGAGCTATGCAGGAGGGTTGGACACCCACAAATGTGCTGCTTATACTCTTCCCAAGGCTCCCAGTTTTAAGAAGGCATCATCATCATC
ATCATCATCCAAAAAGATCTCTGTCTCTTGTCCCGGTTATGAGAGGCAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCTCTGTTTCTCTCTGTTTGTGTTGCTGCTGTTCTTCATCTTCTTCTTGAATATGGGTGGATTGCTTCATCAACCTTGTTCTGTTGCTCTGTGCAAAGGGTTCCATGAAG
ATGATTGGGGCAAGGGCGGTGAGTATGACTACAACCTTGCCTCTTCCACATCTTCCTTCGAAGATTCAAGCAATTCGTCGGATGATGCGTGTTCATCCACTTCAAATTCT
TCATCTCCATCCAATGGAGCGTTGGAGGATTTTACAGAGCTTTTTGCCCAACTCCCAATCAAGAGAGGACTGTCCATGTTCTATGAAGGGAAATCCCAGTCGTTTACATC
GCTATCAAGTGTAAGAAGCATAGAAGACCTTCCGAAGAAGAGAAGCCCTTACAGCAGTAGATTGAGTGGATGTAAGAGCTATGCAGGAGGGTTGGACACCCACAAATGTG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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