; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg04299 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg04299
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionGlutamate receptor
Genome locationCarg_Chr01:327791..328162
RNA-Seq ExpressionCarg04299
SyntenyCarg04299
Gene Ontology termsGO:0007186 - G protein-coupled receptor signaling pathway (biological process)
GO:0034220 - ion transmembrane transport (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0004930 - G protein-coupled receptor activity (molecular function)
GO:0015276 - ligand-gated ion channel activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606727.1 Glutamate receptor 2.7, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.4e-6199.19Show/hide
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KAG7036442.1 Glutamate receptor 2.8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-61100Show/hide
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XP_022948814.1 glutamate receptor 2.7-like [Cucurbita moschata]6.5e-5297.27Show/hide
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        EN+DE RDE+
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XP_022997901.1 glutamate receptor 2.7-like [Cucurbita maxima]3.9e-5791.47Show/hide
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XP_023523601.1 glutamate receptor 2.7-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.8e-5794.31Show/hide
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        E +DE RDESREAHPSP+ DSNY
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFU4 Glutamate receptor1.2e-3566.67Show/hide
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        ME+GVLQ+IE+KWFK NISSPDPNSLISTTLGLESFWGLFL+ GAVS SA++IALA F++E RH   LST S+WKR LLL++ F++KD +SPA R+  +D
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        E   E +D   E HPSPSCDS+Y
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A0A5A7V5V8 Glutamate receptor2.1e-3565.85Show/hide
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        ME+G+LQ+IE+KWFK NISSPDPNSLISTTLGLESFWGLFL++GAVS  A+I ALA F++E RH   LST SMWKRFLLL+K FD+KD +SPA R+  +D
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        E  +         HPSPSCDS+Y
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A0A6J1D4Y3 Glutamate receptor1.3e-3768.29Show/hide
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        ME+GVL++IE++WFK NISSPDPNSLISTTLGLESFWGLFL+SGA S SA+I+ALA F+H+++H   LST SMW+RFLLL+K+FDQKD  SPA R+N  D
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        E+  E +D   E HPSPSCDS+Y
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A0A6J1GB16 Glutamate receptor3.2e-5297.27Show/hide
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        EN+DE RDE+
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A0A6J1K8T1 Glutamate receptor1.9e-5791.47Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04660 Glutamate receptor 2.13.1e-0432.14Show/hide
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        E+     +EN WFK         +++PDPN  +S   LG +SFW LFL++  V   A++  + +F+ E  +  NL    +W++F
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O81078 Glutamate receptor 2.94.0e-1238.38Show/hide
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        +N V Q IE++WF      PDP  +L S  L L SF GLFL++G     ++++ +A F++E RH   + S DS+W++   L K FD+KD  S  F+ ++
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Q8LGN0 Glutamate receptor 2.79.6e-1445.26Show/hide
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        +Q IENKWFK   + PD N SL S  L L SFWGLFL++G  S  A++I +A F++E +H  F+ S +S   +   L++NFD+KD  S  F+ N+
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Q9C5V5 Glutamate receptor 2.83.3e-1442.11Show/hide
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        +Q IENKWF      PDP + +S+  L L SFWGLFL++G  S  A++I +  F++E RH   + S DS+W++   L +NFD+KD  S  F+ ++
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Q9C8E7 Glutamate receptor 3.36.2e-0529.6Show/hide
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        ENG LQ I +KW   N  + +   L S  L L+SFWGLFL+ G   L A+ +   + +                ++ HD +    +  +RFL LM   ++
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Query:  KDHTSPAFRRNSRDENQDEGRDESR
          H S   R+     N   G   SR
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G42540.1 glutamate receptor 3.34.4e-0629.6Show/hide
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        ENG LQ I +KW   N  + +   L S  L L+SFWGLFL+ G   L A+ +   + +                ++ HD +    +  +RFL LM   ++
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Query:  KDHTSPAFRRNSRDENQDEGRDESR
          H S   R+     N   G   SR
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AT2G29100.1 glutamate receptor 2.92.9e-1338.38Show/hide
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        +N V Q IE++WF      PDP  +L S  L L SF GLFL++G     ++++ +A F++E RH   + S DS+W++   L K FD+KD  S  F+ ++
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AT2G29110.1 glutamate receptor 2.82.3e-1542.11Show/hide
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AT2G29120.1 glutamate receptor 2.76.8e-1545.26Show/hide
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AT5G27100.1 glutamate receptor 2.12.2e-0532.14Show/hide
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        E+     +EN WFK         +++PDPN  +S   LG +SFW LFL++  V   A++  + +F+ E  +  NL    +W++F
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAATGGAGTTCTGCAAGATATTGAAAACAAATGGTTTAAGAGCAATATCAGCAGCCCTGACCCCAATAGCTTGATTTCCACCACACTTGGGCTCGAAAGCTTTTG
GGGGTTGTTTCTTCTTTCAGGAGCTGTATCTTTATCTGCAGTCATTATAGCCCTGGCCAGATTTGTCCATGAACGCAGACATGACTTCAACCTTTCCACTGACTCAATGT
GGAAAAGGTTTCTTCTTCTCATGAAAAATTTCGACCAGAAAGACCACACTTCACCCGCGTTTAGAAGGAATTCTCGAGACGAAAACCAAGACGAAGGCCGAGACGAAAGC
CGGGAAGCTCATCCCAGCCCTTCCTGTGATTCAAACTACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGAATGGAGTTCTGCAAGATATTGAAAACAAATGGTTTAAGAGCAATATCAGCAGCCCTGACCCCAATAGCTTGATTTCCACCACACTTGGGCTCGAAAGCTTTTG
GGGGTTGTTTCTTCTTTCAGGAGCTGTATCTTTATCTGCAGTCATTATAGCCCTGGCCAGATTTGTCCATGAACGCAGACATGACTTCAACCTTTCCACTGACTCAATGT
GGAAAAGGTTTCTTCTTCTCATGAAAAATTTCGACCAGAAAGACCACACTTCACCCGCGTTTAGAAGGAATTCTCGAGACGAAAACCAAGACGAAGGCCGAGACGAAAGC
CGGGAAGCTCATCCCAGCCCTTCCTGTGATTCAAACTACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MENGVLQDIENKWFKSNISSPDPNSLISTTLGLESFWGLFLLSGAVSLSAVIIALARFVHERRHDFNLSTDSMWKRFLLLMKNFDQKDHTSPAFRRNSRDENQDEGRDES
REAHPSPSCDSNY