CuGenDBv2

Gene ID	Carg04515
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	40S ribosomal protein S15a
Genome location	Carg_Chr04:20052076..20054350
RNA-Seq Expression	Carg04515
Synteny	Carg04515
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domains	IPR000630 - Ribosomal protein S8 IPR035987 - Ribosomal protein S8 superfamily

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG7033038.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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PPR86702.1 hypothetical protein GOBAR_AA33985 [Gossypium barbadense]

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XP_022134546.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Momordica charantia]

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XP_022922996.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Cucurbita moschata]

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XP_022990484.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Cucurbita maxima]

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A0A2P5W6J6 Uncharacterized protein

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A0A6J1BY30 40S ribosomal protein S15a-1

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A0A6J1E5M9 40S ribosomal protein S15a-1

3.7e-65

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A0A6J1I5M1 40S ribosomal protein S15a-1-like

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A0A6J1JS60 40S ribosomal protein S15a-1

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SwissProt top hits

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O80646 40S ribosomal protein S15a-3

1.1e-61

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P42798 40S ribosomal protein S15a-1

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Q00332 40S ribosomal protein S15a

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Q9AT34 40S ribosomal protein S15a

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Q9LX88 40S ribosomal protein S15a-4

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Arabidopsis top hits

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AT1G07770.1 ribosomal protein S15A

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AT1G07770.2 ribosomal protein S15A

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AT2G39590.1 Ribosomal protein S8 family protein

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AT3G46040.1 ribosomal protein S15A D

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AT5G59850.1 Ribosomal protein S8 family protein

3.0e-67

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGTTCGTGTGAGTGTTCTGAATGATGCTCTTAAAAGCATGTATAATGCTGAGAAACGTGGGAAGCGCCAGGTCATGATAAGGCCATCTTCTAAAGTTATCATCAAGTT
TCTTAATGTCATGCAAAAGCATGGATACATTGGTGAGTTTGAGTACGTTGACGATCATAGGTCAGGGAAAATTGTTGTTGAACTGAATGGGAGACTCAACAAATGTGGTG
TCATCAGTCCTCGTTTTGATATTGGTGTCAAGGAGATTGAAGGTTGGACTGCACGGTTGCTTCCCTCGAGACAGTTTGGTTTCATTGTGTTGACAACTTCTGCGGGAATC
ATGGACCACGAAGAGGCCCGAAGAAAGAACGTTGGTGGTAAAGTGCTTGAACTGGAATATAGAGTTCTCCTGACCGTCTACAATGGCGACTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AAATCTATTTAATTAAACTTACTATAAATACGTTAGGGTTTCCTGCTTTCTCTCTTCTCTCCGCTTGAACCCTGGAAAGAAGCCCTAGTTCCCGCCCCTGCTCGTCGAAC
TTCTCGAAGTCGCCTCTGCAATTGCCTAACAATGGTTCGTGTGAGTGTTCTGAATGATGCTCTTAAAAGCATGTATAATGCTGAGAAACGTGGGAAGCGCCAGGTCATGA
TAAGGCCATCTTCTAAAGTTATCATCAAGTTTCTTAATGTCATGCAAAAGCATGGATACATTGGTGAGTTTGAGTACGTTGACGATCATAGGTCAGGGAAAATTGTTGTT
GAACTGAATGGGAGACTCAACAAATGTGGTGTCATCAGTCCTCGTTTTGATATTGGTGTCAAGGAGATTGAAGGTTGGACTGCACGGTTGCTTCCCTCGAGACAGTTTGG
TTTCATTGTGTTGACAACTTCTGCGGGAATCATGGACCACGAAGAGGCCCGAAGAAAGAACGTTGGTGGTAAAGTGCTTGAACTGGAATATAGAGTTCTCCTGACCGTCT
ACAATGGCGACTGA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MVRVSVLNDALKSMYNAEKRGKRQVMIRPSSKVIIKFLNVMQKHGYIGEFEYVDDHRSGKIVVELNGRLNKCGVISPRFDIGVKEIEGWTARLLPSRQFGFIVLTTSAGI
MDHEEARRKNVGGKVLELEYRVLLTVYNGD

Carg04515 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome