; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg04602 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg04602
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionRibosomal protein S14
Genome locationCarg_Chr04:19458619..19458924
RNA-Seq ExpressionCarg04602
SyntenyCarg04602
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0015935 - small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001209 - Ribosomal protein S14
IPR018271 - Ribosomal protein S14, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032953.1 Ribosomal protein S14, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-49100Show/hide
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XP_022134507.1 uncharacterized protein LOC111006733 [Momordica charantia]2.0e-4695.05Show/hide
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XP_022938933.1 uncharacterized protein LOC111444996 [Cucurbita moschata]2.5e-4999.01Show/hide
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XP_023550870.1 uncharacterized protein LOC111808878 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.2e-4998.02Show/hide
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XP_038884392.1 ribosomal protein S14, mitochondrial [Benincasa hispida]2.3e-4794.06Show/hide
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A0A0A0LSR8 Uncharacterized protein1.3e-4387.13Show/hide
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A0A1S4E169 ribosomal protein S14, mitochondrial2.0e-4488.12Show/hide
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A0A5D3CKB3 Ribosomal protein S142.0e-4488.12Show/hide
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A0A6J1C264 uncharacterized protein LOC1110067339.5e-4795.05Show/hide
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A0A6J1FKA4 uncharacterized protein LOC1114449961.2e-4999.01Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P05716 Ribosomal protein S14, mitochondrial7.3e-3672.45Show/hide
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P14875 Ribosomal protein S14, mitochondrial7.8e-3873.47Show/hide
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P26873 Ribosomal protein S14, mitochondrial2.4e-3168.09Show/hide
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P46752 Ribosomal protein S14, mitochondrial1.2e-1955.43Show/hide
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P49387 Ribosomal protein S14, mitochondrial4.7e-3570.41Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34520.1 mitochondrial ribosomal protein S141.7e-3570.1Show/hide
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ATCG00330.1 chloroplast ribosomal protein S146.6e-0837.78Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATCAGCTTTTCCGTGTTTCTCGTATCGTCTTCCGTGATCTGGCATCCAAAGGTCTTATTATGGGTGTCAAGAAATCTTCTTGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACGGAGGACAAGCGGAACATTCTTGACCATTATCGTCGACAGCTAGCTGCGAAGTTTGAGTTGAAGCGGAAGCTTTTCAAAGCCGTTTGCAATGATCCGAGTCTTCC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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