; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg04683 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg04683
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionPlant/F14G9-20 protein
Genome locationCarg_Chr11:13044013..13045099
RNA-Seq ExpressionCarg04683
SyntenyCarg04683
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6589314.1 hypothetical protein SDJN03_17879, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-7774.09Show/hide
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KAG7023013.1 hypothetical protein SDJN02_16749, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.5e-149100Show/hide
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XP_022147989.1 uncharacterized protein LOC111016783 [Momordica charantia]1.1e-6457.25Show/hide
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        SG ERDW V   CL+ADDMK VANAYGFLRD G   + G    +++     +  + L +             ++ PKKWGLSGS  YALI+FLGG SFLL
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         +DIDIRPNLLALLGL FLDSILLG TCLAQISSYWPPY+R         L  +YL+G PI GVILD IVAM++GI
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XP_023511731.1 uncharacterized protein LOC111776502 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-6259.11Show/hide
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        RD G   + G    +++     +  + L +             ++ PKKWGLSGS RYALI+ LGG SFLL QDIDIRPNL ALLGL FLDSILLG TCL
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        AQISS WPPY+R         L  +YL+G PI GVILD IVAM++GI
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XP_038888049.1 uncharacterized protein LOC120077976 isoform X1 [Benincasa hispida]9.4e-6461.22Show/hide
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        +KHF+  RHQRLLPL RAL E QDY++AVKRKDLAEAL         SAI PI+D A A SA SAL NPRLSG ERDW V   CL+ADDMK VA+AYGFL
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        RD G     LP    F N  +   + +T             ++ PKKWG+SGS RYALI+FLGG SFLL QDIDIRPNLLALLGL FLDSILLG TCLAQ
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        ISSYWPPY+R         L  +YL+G PI GVILD IVAM++GI
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BH83 uncharacterized protein LOC103489633 isoform X16.6e-6360.73Show/hide
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        FL+D G     LP        ++  Q  +T             ++ PKKWGLSGS RYALI+FLGG SFLL QDIDIRPNLLALLGL FLDSILLG TCL
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        AQISSYWPPY+R         L  +YL+G PI GVILD IVAM++GI
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A0A5A7U732 Uncharacterized protein6.6e-6360.73Show/hide
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        +KHFH  RH  QRLLPL RALRE QDY++AVKRKDLAEAL         SAI PI+D A A SA SA+GN RLSG ERDW V   CL+ADDMK VANAY 
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        FL+D G     LP        ++  Q  +T             ++ PKKWGLSGS RYALI+FLGG SFLL QDIDIRPNLLALLGL FLDSILLG TCL
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A0A6J1D1P2 uncharacterized protein LOC1110167835.4e-6557.25Show/hide
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        SG ERDW V   CL+ADDMK VANAYGFLRD G   + G    +++     +  + L +             ++ PKKWGLSGS  YALI+FLGG SFLL
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A0A6J1HWB9 uncharacterized protein LOC111468437 isoform X21.5e-6261.22Show/hide
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        ++HFH  RHQRLL LPRA+RE Q+Y++AVKRKDLAEAL         SAI P +D A ADSA SALGNPRLSG ERDW V   CL+ADDMK VANAYGFL
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        RD G     LP                  NF    C + V ++ PKKWGLSGS RYALI+ LGG SFLL QDIDIRPNL ALLGL FLDSILLG TCLAQ
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        ISS WPPY+R         L  +YL+G PI GVILD IVAM++GI
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A0A6J1HZW5 uncharacterized protein LOC111468437 isoform X18.6e-6359.11Show/hide
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Query:  RDGG---HIGTILPMLMFSNGSIIHTQLMTYLNFPDPPCYSSVQVDPKKWGLSGSFRYALISFLGGASFLLFQDIDIRPNLLALLGLPFLDSILLGSTCL
        RD G   + G    +++     +  + L +             ++ PKKWGLSGS RYALI+ LGG SFLL QDIDIRPNL ALLGL FLDSILLG TCL
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        AQISS WPPY+R         L  +YL+G PI GVILD IVAM++GI
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56180.1 unknown protein4.4e-4344.3Show/hide
Query:  PRALRESQDYQQAVKRKDLAEALSAIVPISDPAAADSASSALGNPRLSG-----RERDWAVPGACLDADDMKPVANAYGFLRDGG---HIGTILPMLMFS
        P ALRE ++Y+ AVKRKDLA AL  +  I +    DS  S +   +LSG      ERDW V  ACL+ADDM+ V +A+ FL++ G   + G    +++  
Subjt:  PRALRESQDYQQAVKRKDLAEALSAIVPISDPAAADSASSALGNPRLSG-----RERDWAVPGACLDADDMKPVANAYGFLRDGG---HIGTILPMLMFS

Query:  NGSIIHTQLMTYLNFPDPPCYSSVQVDPKKWGLSGSFRYALISFLGGASFLLFQDIDIRPNLLALLGLPFLDSILLGSTCLAQISSYWPPYKR-------
           +  T L +             ++ PKKWGLSG    AL + LGG S+LL Q+ID+RPNL  +LGL +LDS+ LG TCLAQ+S YWPP+KR       
Subjt:  NGSIIHTQLMTYLNFPDPPCYSSVQVDPKKWGLSGSFRYALISFLGGASFLLFQDIDIRPNLLALLGLPFLDSILLGSTCLAQISSYWPPYKR-------

Query:  --LSPSYLVGSPICGVILDAIVAMEVGI
          L  +YL+G PI GVILD +VAM++G+
Subjt:  --LSPSYLVGSPICGVILDAIVAMEVGI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCGATGTATTCCGTCTCATTGCAATCCTCACCTTACCCAAACTCCAAATTTCCTCTTCAACTCTCCAATTCCAACCTTTCCGTTACCCGATTCTCTTTCATTTTCAG
CGATAAGCATTTCCATTTCGGGCGCCATCAGCGTCTCCTACCCCTGCCTCGTGCTCTTCGCGAATCACAGGACTACCAACAGGCTGTGAAGCGCAAGGATCTCGCTGAAG
CTCTCAGCGCAATCGTACCCATTAGTGATCCGGCGGCTGCTGATTCAGCTTCCTCCGCTCTTGGGAATCCGCGGTTGTCTGGCCGGGAGAGGGACTGGGCGGTACCAGGC
GCTTGTTTGGATGCTGATGATATGAAACCTGTTGCCAATGCTTATGGGTTTCTCAGGGATGGAGGGCACATTGGCACAATTTTGCCAATGCTTATGTTTTCGAATGGATC
TATTATTCATACTCAACTTATGACTTACTTAAATTTTCCTGATCCCCCGTGTTATTCCAGTGTCCAAGTTGATCCAAAGAAGTGGGGTCTTTCAGGCAGCTTTCGTTATG
CTTTGATTTCTTTTCTTGGTGGAGCATCATTTCTTCTCTTCCAGGACATAGATATTAGGCCGAACCTGTTGGCACTGCTGGGGCTGCCATTTTTGGACTCTATCCTCCTT
GGTAGTACTTGTCTCGCTCAAATATCAAGCTATTGGCCACCATATAAGCGGTTGAGTCCTTCTTACCTCGTGGGTAGCCCAATTTGTGGAGTGATTTTGGATGCAATTGT
TGCTATGGAAGTGGGGATATACAAGGGCAGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCGATGTATTCCGTCTCATTGCAATCCTCACCTTACCCAAACTCCAAATTTCCTCTTCAACTCTCCAATTCCAACCTTTCCGTTACCCGATTCTCTTTCATTTTCAG
CGATAAGCATTTCCATTTCGGGCGCCATCAGCGTCTCCTACCCCTGCCTCGTGCTCTTCGCGAATCACAGGACTACCAACAGGCTGTGAAGCGCAAGGATCTCGCTGAAG
CTCTCAGCGCAATCGTACCCATTAGTGATCCGGCGGCTGCTGATTCAGCTTCCTCCGCTCTTGGGAATCCGCGGTTGTCTGGCCGGGAGAGGGACTGGGCGGTACCAGGC
GCTTGTTTGGATGCTGATGATATGAAACCTGTTGCCAATGCTTATGGGTTTCTCAGGGATGGAGGGCACATTGGCACAATTTTGCCAATGCTTATGTTTTCGAATGGATC
TATTATTCATACTCAACTTATGACTTACTTAAATTTTCCTGATCCCCCGTGTTATTCCAGTGTCCAAGTTGATCCAAAGAAGTGGGGTCTTTCAGGCAGCTTTCGTTATG
CTTTGATTTCTTTTCTTGGTGGAGCATCATTTCTTCTCTTCCAGGACATAGATATTAGGCCGAACCTGTTGGCACTGCTGGGGCTGCCATTTTTGGACTCTATCCTCCTT
GGTAGTACTTGTCTCGCTCAAATATCAAGCTATTGGCCACCATATAAGCGGTTGAGTCCTTCTTACCTCGTGGGTAGCCCAATTTGTGGAGTGATTTTGGATGCAATTGT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ACLDADDMKPVANAYGFLRDGGHIGTILPMLMFSNGSIIHTQLMTYLNFPDPPCYSSVQVDPKKWGLSGSFRYALISFLGGASFLLFQDIDIRPNLLALLGLPFLDSILL
GSTCLAQISSYWPPYKRLSPSYLVGSPICGVILDAIVAMEVGIYKGR