; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg04880 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg04880
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionBRO1 domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr13:8780952..8782875
RNA-Seq ExpressionCarg04880
SyntenyCarg04880
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR038898 - BRO1 domain-containing protein BROX


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572998.1 hypothetical protein SDJN03_26885, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-6076.02Show/hide
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KAG7019880.1 hypothetical protein SDJN02_18845, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.7e-79100Show/hide
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XP_022923662.1 uncharacterized protein LOC111431305 [Cucurbita moschata]1.1e-5398.21Show/hide
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XP_023001786.1 uncharacterized protein LOC111495822 [Cucurbita maxima]2.5e-5397.32Show/hide
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XP_023520253.1 uncharacterized protein LOC111783557 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-5398.21Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LTW5 BRO1 domain-containing protein8.0e-5394.64Show/hide
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A0A6J1E6R1 uncharacterized protein LOC1114313055.5e-5498.21Show/hide
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A0A6J1JYN4 uncharacterized protein LOC111490057 isoform X23.0e-5293.75Show/hide
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A0A6J1K0R5 uncharacterized protein LOC111490057 isoform X13.0e-5293.75Show/hide
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A0A6J1KJL4 uncharacterized protein LOC1114958221.2e-5397.32Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17940.1 Endosomal targeting BRO1-like domain-containing protein8.2e-4277.27Show/hide
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        PV+LGL KDG
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AT1G73390.1 Endosomal targeting BRO1-like domain-containing protein6.7e-4478.18Show/hide
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AT1G73390.2 Endosomal targeting BRO1-like domain-containing protein6.7e-4478.18Show/hide
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AT1G73390.3 Endosomal targeting BRO1-like domain-containing protein6.7e-4478.18Show/hide
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AT1G73390.4 Endosomal targeting BRO1-like domain-containing protein6.7e-4478.18Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TGGGGATATGGGATGCCTTGCTTCAAAACCGGCAGATTCTGGTGGAAACAGGCGGAGGCCGGGAAACATTGGGGAAGTTTCTGTCTATGTTCCTGGTCTGCGTATTCCTA
AACCAGTAGATTTCTCTTTGGCACTTGGCGATCATCTCTCTAAAAATATAGTTGAACGTCTATCAGCTTTGAGGACTCGTATAGTTGTAATGGCTGGCCAAGAAGGTCCA
ACAATTACTAGAACGCGGAGAAAAACTGCTACCCAACATGGTGGTTCAACAATAGCTGATCTTCAGCAGGCTCTGGAAGATTATTTGCCTGTTCTTTTGGGATTAGTTAA
AGATGGTAAGCGGGATTTTGACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AGATGGTAAGCGGGATTTTGACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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TITRTRRKTATQHGGSTIADLQQALEDYLPVLLGLVKDGKRDFD