| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6592929.1 RNA-binding KH domain-containing protein PEPPER, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.1e-169 | 93.41 | Show/hide |
Query: MQSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKI
MQSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKI
Subjt: MQSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKI
Query: ADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLP
ADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLP
Subjt: ADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLP
Query: LCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATI
LCASAHESDRVVQISGDV AVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATI
Subjt: LCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATI
Query: K---------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
K VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTA+
Subjt: K---------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
|
|
| KAG7025337.1 RNA-binding KH domain-containing protein PEPPER [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 4.0e-184 | 100 | Show/hide |
Query: MQSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKI
MQSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKI
Subjt: MQSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKI
Query: ADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLP
ADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLP
Subjt: ADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLP
Query: LCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATI
LCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATI
Subjt: LCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATI
Query: KVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAIMDMEGEFVMIFGKMW
KVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAIMDMEGEFVMIFGKMW
Subjt: KVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAIMDMEGEFVMIFGKMW
|
|
| XP_022960112.1 flowering locus K homology domain-like isoform X1 [Cucurbita moschata] | 1.1e-168 | 93.12 | Show/hide |
Query: MQSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKI
MQSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSK GHAVTGKRRREDDPIV YSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKI
Subjt: MQSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKI
Query: ADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLP
ADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLP
Subjt: ADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLP
Query: LCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATI
LCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATI
Subjt: LCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATI
Query: K---------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
K VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTA+
Subjt: K---------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
|
|
| XP_022960113.1 flowering locus K homology domain-like isoform X2 [Cucurbita moschata] | 2.0e-167 | 93.08 | Show/hide |
Query: SGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIAD
SGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSK GHAVTGKRRREDDPIV YSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIAD
Subjt: SGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIAD
Query: AVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLC
AVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLC
Subjt: AVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLC
Query: ASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIK-
ASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIK
Subjt: ASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIK-
Query: --------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTA+
Subjt: --------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
|
|
| XP_023514318.1 poly(rC)-binding protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.0e-167 | 91.78 | Show/hide |
Query: MQSGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKA
MQSGDIPVYPSMPAKAPL PLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIV PSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKA
Subjt: MQSGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKA
Query: TIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAP
TIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAE ALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANT+RLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAP
Subjt: TIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAP
Query: NQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNES
NQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNES
Subjt: NQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNES
Query: GATIK---------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
GATIK VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTA+
Subjt: GATIK---------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1H4F3 flowering locus K homology domain-like | 2.2e-156 | 86.69 | Show/hide |
Query: MQSGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKA
MQ GDIP+YPSMPA APL PLPGT+LVS GH VTGKRRREDD IV SEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRI+VPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKA
Subjt: MQSGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKA
Query: TIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAP
TIKIADAVARYEERVIIISSKD EN+VTDAE ALQ IAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGA++TILAP
Subjt: TIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAP
Query: NQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNES
NQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNA+HPPQSY+DPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNES
Subjt: NQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNES
Query: GATIK---------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
GATIK VALAKQRVDEYIYSQL+RQAGVQ TA+
Subjt: GATIK---------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
|
|
| A0A6J1H6G7 flowering locus K homology domain-like isoform X1 | 5.2e-169 | 93.12 | Show/hide |
Query: MQSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKI
MQSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSK GHAVTGKRRREDDPIV YSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKI
Subjt: MQSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKI
Query: ADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLP
ADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLP
Subjt: ADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLP
Query: LCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATI
LCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATI
Subjt: LCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATI
Query: K---------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
K VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTA+
Subjt: K---------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
|
|
| A0A6J1H7W9 flowering locus K homology domain-like isoform X2 | 9.7e-168 | 93.08 | Show/hide |
Query: SGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIAD
SGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSK GHAVTGKRRREDDPIV YSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIAD
Subjt: SGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIAD
Query: AVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLC
AVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLC
Subjt: AVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLC
Query: ASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIK-
ASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIK
Subjt: ASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIK-
Query: --------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTA+
Subjt: --------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
|
|
| A0A6J1KS32 poly(RC)-binding protein 4-like isoform X2 | 3.1e-166 | 91.74 | Show/hide |
Query: SGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATI
SGDIPVYPSMPAKAPL PLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDV APKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATI
Subjt: SGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATI
Query: KIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQ
KIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAE ALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQ
Subjt: KIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQ
Query: LPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGA
LPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNA+HPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGA
Subjt: LPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGA
Query: TIK---------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
TIK VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTA+
Subjt: TIK---------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
|
|
| A0A6J1KTT5 poly(RC)-binding protein 4-like isoform X1 | 1.7e-167 | 91.78 | Show/hide |
Query: MQSGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKA
MQSGDIPVYPSMPAKAPL PLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDV APKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKA
Subjt: MQSGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKPGHAVTGKRRREDDPIVPYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKA
Query: TIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAP
TIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAE ALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAP
Subjt: TIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAP
Query: NQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNES
NQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNA+HPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNES
Subjt: NQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNES
Query: GATIK---------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
GATIK VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTA+
Subjt: GATIK---------------------VALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTAI
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| F4KDN0 KH domain-containing protein HEN4 | 2.9e-12 | 31.58 | Show/hide |
Query: DVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVI-IISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRL
DV+F+I+ ++ G VIG G ++ + ET A I + + + EER+I + +S++ E + A+ A+ I + + + I + G ++ T RL
Subjt: DVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVI-IISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRL
Query: LIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLR
++ SQ G ++G G + ++R ++GA++ IL Q P C S E+D+VVQI+G+ P V +A+ I ++LR
Subjt: LIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLR
|
|
| P57723 Poly(rC)-binding protein 4 | 1.5e-11 | 25.91 | Show/hide |
Query: RIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAAN--TIRLLIA
R+++ K++G +IGK G ++++RE++ A I I++ S ++ T+T + A+ ++I + + G+V+ T+RL+I
Subjt: RIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAAN--TIRLLIA
Query: GSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN----------------
SQ GSLIG +G I+++R ++GA V + A + LP + ++R V +SG A++ + +I + +PP+ I P+ +
Subjt: GSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN----------------
Query: -YNAIHPPQ-SYMDPTSVNYVTF------------------EMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
Y A+ P + + + S + V F E L+ L+G +IG G IS IR SGA IK+
Subjt: -YNAIHPPQ-SYMDPTSVNYVTF------------------EMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
|
|
| P57724 Poly(rC)-binding protein 4 | 1.9e-11 | 26.18 | Show/hide |
Query: RIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAAN--TIRLLIA
R+++ K++G +IGK G ++++RE++ A I I++ S ++ T+T + A+ ++I + + G V+ T+RL+I
Subjt: RIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAAN--TIRLLIA
Query: GSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN----------------
SQ GSLIG +G I+++R ++GA V + A + LP + ++R V +SG A++ + +I + +PP+ I P+ +
Subjt: GSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN----------------
Query: -YNAIHPPQ--------------------SYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
Y A+ P + MDP S + E L+ L+G +IG G IS IR SGA IK+
Subjt: -YNAIHPPQ--------------------SYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
|
|
| Q9SR13 Flowering locus K homology domain | 2.8e-15 | 31.4 | Show/hide |
Query: EDDPIVP-YSEAVDVSAPKRQAKA-----------HDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDK-ENTVTDA
ED+ +P + E++ S P+ A + +FR++VP++++G +IG+ G I+K+ EET+A IKI D ER +++S K++ E+++ +
Subjt: EDDPIVP-YSEAVDVSAPKRQAKA-----------HDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDK-ENTVTDA
Query: EIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALE
L ++ I+ DG E + + RLL+ SQAGSLIG G ++ ++ +S V +L LP+ A + DRVV++ G+ +V +ALE
Subjt: EIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALE
Query: EIGNQLR
I + LR
Subjt: EIGNQLR
|
|
| Q9SZH4 RNA-binding KH domain-containing protein PEPPER | 2.6e-16 | 32.75 | Show/hide |
Query: DVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDG-TSIEELKVGTGHVAANTIRL
D +FR++VP ++G +IG+ G I+K+ EET+A IK+ D +R+++IS K++ A+ + + + G ++ V +++RL
Subjt: DVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDG-TSIEELKVGTGHVAANTIRL
Query: LIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLR
L+A +QA +LIG G I+ + +SGASV IL+ + P A+ + +R+V + G+ +LKALE I LR
Subjt: LIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G14170.1 RNA-binding KH domain-containing protein | 1.1e-19 | 28.83 | Show/hide |
Query: AHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKE--NTVTDAEIALQQIAALIL----------KEDGTSIEELK
+ D ++R + P K+ G +IGK G +++R ETK+ ++I +A+ EERV+ + S ++E + D E+ + AL ++DGT +
Subjt: AHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKE--NTVTDAEIALQQIAALIL----------KEDGTSIEELK
Query: VGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN
G T+R+L+ Q G +IG GQ I+ LRN + A + ++ + LP CA D ++ I G+ V +AL ++ + L NP R Q + +S +
Subjt: VGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN
Query: YNAIHPPQSYMDPTSV-----NYVTFE-----------MLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVALAKQRVDEYI
+++H P + + ++ NY + VGG+IG GG I++IR E+GATI+V ++ D+ I
Subjt: YNAIHPPQSYMDPTSV-----NYVTFE-----------MLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVALAKQRVDEYI
|
|
| AT1G14170.2 RNA-binding KH domain-containing protein | 1.4e-20 | 29.29 | Show/hide |
Query: HDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKE--NTVTDAEIALQQIAALIL----------KEDGTSIEELKV
HD ++R + P K+ G +IGK G +++R ETK+ ++I +A+ EERV+ + S ++E + D E+ + AL ++DGT +
Subjt: HDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKE--NTVTDAEIALQQIAALIL----------KEDGTSIEELKV
Query: GTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYNY
G T+R+L+ Q G +IG GQ I+ LRN + A + ++ + LP CA D ++ I G+ V +AL ++ + L NP R Q + +S +
Subjt: GTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYNY
Query: NAIHPPQSYMDPTSV-----NYVTFE-----------MLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVALAKQRVDEYI
+++H P + + ++ NY + VGG+IG GG I++IR E+GATI+V ++ D+ I
Subjt: NAIHPPQSYMDPTSV-----NYVTFE-----------MLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVALAKQRVDEYI
|
|
| AT1G14170.3 RNA-binding KH domain-containing protein | 1.1e-19 | 28.83 | Show/hide |
Query: AHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKE--NTVTDAEIALQQIAALIL----------KEDGTSIEELK
+ D ++R + P K+ G +IGK G +++R ETK+ ++I +A+ EERV+ + S ++E + D E+ + AL ++DGT +
Subjt: AHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKE--NTVTDAEIALQQIAALIL----------KEDGTSIEELK
Query: VGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN
G T+R+L+ Q G +IG GQ I+ LRN + A + ++ + LP CA D ++ I G+ V +AL ++ + L NP R Q + +S +
Subjt: VGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN
Query: YNAIHPPQSYMDPTSV-----NYVTFE-----------MLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVALAKQRVDEYI
+++H P + + ++ NY + VGG+IG GG I++IR E+GATI+V ++ D+ I
Subjt: YNAIHPPQSYMDPTSV-----NYVTFE-----------MLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVALAKQRVDEYI
|
|
| AT5G15270.1 RNA-binding KH domain-containing protein | 1.9e-22 | 30.96 | Show/hide |
Query: DVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSK--------DKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHV
D +FR + P K+IG VIG+ G ++++R +T++ I+I +A+ +ERVI I S D E ++ A+ AL +I ++ +D S E+ G V
Subjt: DVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSK--------DKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHV
Query: AANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNA----
T +LL+ Q G ++G GQ ++ +R+ +GA + I+ +PLCA SD ++QISG+V V KAL +I ++L NP R +S + Y A
Subjt: AANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNA----
Query: -----------------------------IHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISET-LVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
PP++ DP + + F L+S + +IG GG I+++R E+ ATIKV
Subjt: -----------------------------IHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISET-LVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
|
|
| AT5G15270.2 RNA-binding KH domain-containing protein | 1.9e-22 | 30.96 | Show/hide |
Query: DVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSK--------DKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHV
D +FR + P K+IG VIG+ G ++++R +T++ I+I +A+ +ERVI I S D E ++ A+ AL +I ++ +D S E+ G V
Subjt: DVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSK--------DKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHV
Query: AANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNA----
T +LL+ Q G ++G GQ ++ +R+ +GA + I+ +PLCA SD ++QISG+V V KAL +I ++L NP R +S + Y A
Subjt: AANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNA----
Query: -----------------------------IHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISET-LVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
PP++ DP + + F L+S + +IG GG I+++R E+ ATIKV
Subjt: -----------------------------IHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISET-LVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
|
|
