| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6575278.1 RGG repeats nuclear RNA binding protein B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.0e-286 | 77.65 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK+VAAVT+P PKKG AQ KP +QQNKPASLPSKPLPP+QAVREARNEG RGGRGSGRG GRGYGRGREG GF
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
Query: RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
R N+EN SA EDGE GKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEA DGERPRRVFERHSGTG GNE+KREG+GRGNWGRP +EFAE EEAVNE EKN+GD
Subjt: RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
Query: EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
EKPVQE++ GVN EN AKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLE+KRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLS KKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
Subjt: EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
Query: SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGA-----------------------------NLEMATVNPFDL
SLSINEFL+PAEGERHY GGRGRGR GRGSRGGY G+SISNV APSIEDPGQFPTL + EMAT NPFDL
Subjt: SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGA-----------------------------NLEMATVNPFDL
Query: LGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGP--VQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGR-GGGRGYGRGREGSGFNRG-SFNNES
LGDDDAEDPSQLIAAK A +KG Q K AA A+QNK A+LPSKPLPPAQAVREA+NE RGGRGSGR GGG GYGRGR GFNR +N+ S
Subjt: LGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGP--VQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGR-GGGRGYGRGREGSGFNRG-SFNNES
Query: -SSAAEDGETGKTTERR-GYAGPRGRGGRRGGFNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNETEKNMGDEKPVQE
SS EDGETG+TTE+R GY GPRGRGGRRGGFNNGEA+DGER R FER SGTG+GN+FKREG GRGNWGRPT+EF+E AEE VNET+K +GDEKPV E
Subjt: -SSAAEDGETGKTTERR-GYAGPRGRGGRRGGFNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNETEKNMGDEKPVQE
Query: DDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLSINE
DD ENSA++ EE EPEDKEMTLEEYEKL EEKRKALL LKTE RKVDPKEFASMQQLS KK+N D+FIKLGS+KDKRKEIA+KE+RTKKSLSINE
Subjt: DDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLSINE
Query: FLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNSTIN---VATPSIEDPGQFPTL
FLKPAEGERHY PGGRGRGRGRGSRGG G S NS+++ A PSIEDPGQFPTL
Subjt: FLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNSTIN---VATPSIEDPGQFPTL
|
|
| KAG6592943.1 RGG repeats nuclear RNA binding protein B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 5.9e-185 | 99.44 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGPVQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGS
MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGP QTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGS
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGPVQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGS
Query: FNNESSSAAEDGETGKTTERRGYAGPRGRGGRRGGFNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNETEKNMGDEKP
FNNESSSAAEDGETGKTTERRGYAGPRGRGGRRGGFNNGEA DGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNETEKNMGDEKP
Subjt: FNNESSSAAEDGETGKTTERRGYAGPRGRGGRRGGFNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNETEKNMGDEKP
Query: VQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLS
VQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLS
Subjt: VQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLS
Query: INEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTLGAK
INEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTLGAK
Subjt: INEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| KAG6592944.1 RGG repeats nuclear RNA binding protein B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.5e-183 | 98.89 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNE GGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
Query: RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
Subjt: RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
Query: EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKAL+ALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
Subjt: EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
Query: SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGA
SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGA
Subjt: SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGA
|
|
| KAG7011066.1 RGG repeats nuclear RNA binding protein B [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 8.2e-288 | 76.29 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK+VAAVT+P PKKG AQ KP +QQNKPASLPSKPLPP+QAVREARNEG RGGRGSGRG GRGYGRGREG GF
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
Query: RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
R N+EN SA EDGE GKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEA DGERPRRVFERHSGTG GNE+KREG+GRGNWGRP +EFAE EEAVNE EKN+GD
Subjt: RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
Query: EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
EKPVQE++ GVN EN AKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLE+KRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLS KKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
Subjt: EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
Query: SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGA-----------------------------------------
SLSINEFL+PAEGERHY GGRGRGR GRGSRGGY G+SISNV APSIEDPGQFPTLGA
Subjt: SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGA-----------------------------------------
Query: --------NLEMATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGP--VQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGR-GGGRG
+ EMAT NPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK A +KG Q K AA A+QNK A+LPSKPLPPAQAVREA+NE RGGRGSGR GGG G
Subjt: --------NLEMATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGP--VQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGR-GGGRG
Query: YGRGREGSGFNRG-SFNNES-SSAAEDGETGKTTERR-GYAGPRGRGGRRGGFNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEA
YGRGR GFNR +N+ S SS EDGETG+TTE+R GY GPRGRGGRRGGFNNGEA+DGER R FER SGTG+GN+FKREGSGRGNWGRPT+EF+E
Subjt: YGRGREGSGFNRG-SFNNES-SSAAEDGETGKTTERR-GYAGPRGRGGRRGGFNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEA
Query: AEEAVNETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKD
AEE VNET+K +GDEKPV EDD ENSA++ EE EPEDKEMTLEEYEKL EEKRKALL LKTE RKVDPKEFASMQQLS KK+N D+FIKLGS+KD
Subjt: AEEAVNETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKD
Query: KRKEIAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTLGAK
KRKEIA+KE+RTKKSLSINEFLKPAEGERHY PGGRGRGRGRGSRGG G S +S + A PSIEDPGQFPTLGAK
Subjt: KRKEIAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| KAG7025351.1 RGG repeats nuclear RNA binding protein B [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 0.0e+00 | 100 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
Query: RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
Subjt: RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
Query: EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
Subjt: EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
Query: SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGANLEMATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGPVQ
SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGANLEMATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGPVQ
Subjt: SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGANLEMATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGPVQ
Query: TKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGSFNNESSSAAEDGETGKTTERRGYAGPRGRGGRRGGFNN
TKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGSFNNESSSAAEDGETGKTTERRGYAGPRGRGGRRGGFNN
Subjt: TKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGSFNNESSSAAEDGETGKTTERRGYAGPRGRGGRRGGFNN
Query: GEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLE
GEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLE
Subjt: GEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLE
Query: EKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNS
EKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNS
Subjt: EKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNS
Query: TINVATPSIEDPGQFPTLGAK
TINVATPSIEDPGQFPTLGAK
Subjt: TINVATPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1EYL1 RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like isoform X2 | 5.6e-157 | 86.91 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK+VAAVT+P PKKG AQ KP +QQNKPASLPSKPLPP+QAVREARNEG RGGRGSGRG GRGYGRGREG GF
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
Query: RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
R N+EN SA EDGE GKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEA DGERPRRVFERHSGTG GNE KREG+GRGNWGRP +EFAE EEAVNE EKN+GD
Subjt: RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
Query: EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
EKPVQE++ GVN+EN AKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLE+KRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLS KKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
Subjt: EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
Query: SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGA
SLSINEFL+PAEGERHY GGRGRGR GRGSRGGY G+SISNV APSIEDPGQFPTLGA
Subjt: SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGA
|
|
| A0A6J1H5P3 RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like | 7.2e-181 | 97.77 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGPVQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGS
MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGP QTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGS
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGPVQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGS
Query: FNNESSSAAEDGETGKTTERRGYAGPRGRGGRRGGFNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNETEKNMGDEKP
FNNESSSAAEDGETGKTTERRGYAGPRGRGGRRG FNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNE EKNMGDEKP
Subjt: FNNESSSAAEDGETGKTTERRGYAGPRGRGGRRGGFNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNETEKNMGDEKP
Query: VQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLS
VQEDD G VNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTE RKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKE+RTKK LS
Subjt: VQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLS
Query: INEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTLGAK
INEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTLGAK
Subjt: INEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| A0A6J1H755 RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like | 2.0e-183 | 98.05 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
Query: RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAE EEAVNEMEKNMGD
Subjt: RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
Query: EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
EKPVQED+A GVN EN+AKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKAL+ALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
Subjt: EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
Query: SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGA
SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGA
Subjt: SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGA
|
|
| A0A6J1KTS3 RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like | 8.8e-179 | 96.66 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGPVQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGS
MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGP QTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGR GGRGYGRGREG+GFNRGS
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGPVQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGS
Query: FNNESSSAAEDGETGKTTERRGYAGPRGRGGRRGGFNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNETEKNMGDEKP
FNNESSSAAEDGETGKTTERR YAGPRGRGGRRGGFNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNETEKN+GDEKP
Subjt: FNNESSSAAEDGETGKTTERRGYAGPRGRGGRRGGFNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNETEKNMGDEKP
Query: VQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLS
VQEDD G VNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTE RKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLG+EKDKRKEIA+KE+RTKKSLS
Subjt: VQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLS
Query: INEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTLGAK
INEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNSTI VATPSIEDPGQFPTLGAK
Subjt: INEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| A0A6J1KVE4 RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like | 1.9e-181 | 97.49 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAA+TSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPA+LPSKPLPPAQAVREARNE GRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARNEGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSGFV
Query: RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGY GPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRP+EEF+ETVEEAVNEMEKNMGD
Subjt: RGSFNNENISAAEDGETGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAETVEEAVNEMEKNMGD
Query: EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKAL+ALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEER KK
Subjt: EKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKK
Query: SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGA
SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGR GRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGA
Subjt: SLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRGGYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLGA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O23523 RGG repeats nuclear RNA binding protein A | 1.6e-76 | 56.5 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGPVQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGS
MAT+NPFDLL DDDAEDPSQL A + + K G V + PA A LPSKPLPPAQAVREAR+++ RGG G G G+ RGR G+NR
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGPVQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGS
Query: FNNESSSA----AEDGETGKTT-ERRGYAG-PRGR---------GGRRGGFNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAE
NN S + +G+ K++ ERRG G PRG GGRRGGF+N E DGERPRR FER SGTG G++FKR+GSGRGNWG P EE A E
Subjt: FNNESSSA----AEDGETGKTT-ERRGYAG-PRGR---------GGRRGGFNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAE
Query: EAVN-ETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDK
ETEK++G EKP +D D N E++ EE EPEDKEMTL+EYEK+LEEK+KAL +L T RKVD K F SMQQLS KK N++IFIKLGS+KDK
Subjt: EAVN-ETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDK
Query: RKEIAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNS--TINVATPSIEDPGQFPTLGAK
RK+ +KE++ KK++SINEFLKPAEG +Y GGRG GRGRG RG GG SG S N A P+I D QFP+LG K
Subjt: RKEIAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNS--TINVATPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| O23593 RGG repeats nuclear RNA binding protein B | 2.6e-63 | 51.17 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK--KVVAAPPKKGPVQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNR
MA+VNPFDLL DDDAEDPSQ++A+K KVVA PVQT K+ +P+KP PP+QAVREARN + GGRG+GRGG YGRG G G NR
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK--KVVAAPPKKGPVQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNR
Query: GSFNNESSSAAEDGETG---KTTE----RRGYAGPRG--RGGRRGGFNN-GEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAV
S NN+ A E+G G ++ E RRG GP G RG RRG ++N G++ D ERPR+ ++RHS T +GNE KR+G+GR NWG ++ EE+
Subjt: GSFNNESSSAAEDGETG---KTTE----RRGYAGPRG--RGGRRGGFNN-GEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAV
Query: NETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENND-IFIKLGSEKDKRKE
+KN+ EK E + D E A++ EE +PEDKEMTLEEYEK+LEEK+KAL K E RKVD K F +MQQLS KK NND +FIKLG+EKDKR
Subjt: NETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENND-IFIKLGSEKDKRKE
Query: IAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGG--RGRGRGRGSR-------------GGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTLG
I E+E++T+KSLSINEFLKPA+G+ +Y P G +G GRG R GG G + TP+I D QFPTLG
Subjt: IAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGG--RGRGRGRGSR-------------GGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTLG
|
|
| Q9LVT8 RGG repeats nuclear RNA binding protein C | 5.5e-61 | 50.26 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARN--EGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSG
MA++NPFDLLG DDAEDPSQL A + + AA Q K A P+KP PP+QAVRE+RN +GGRGG G GRG G+ RGR G
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARN--EGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSG
Query: FVRGSFNNE---NISAAEDG-----ETGKTTERRG-YGGPRGRGG----RRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAE
+ R + NN+ N + G E R G GG R GG RRGG NGE+ D ERP R ++RHS TGHG KR G GRGNWG ++
Subjt: FVRGSFNNE---NISAAEDG-----ETGKTTERRG-YGGPRGRGG----RRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAE
Query: TVEEAVNEMEKNMGDEKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPED---KEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKE-NNDIFIKL
T EE E+EK+ EK ED E A+E + E E+ +EMTLEEYEK+LEEK+KAL A K EERKVD K F SMQQLS KK + +IFIKL
Subjt: TVEEAVNEMEKNMGDEKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPED---KEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKE-NNDIFIKL
Query: GSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRG-GYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLG
GS+K+KRK D E+ KKSLSINEFLKPA+G+R+ G GG RGRGGRG RG G + AP+I D QFP+LG
Subjt: GSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRG-GYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLG
|
|
| Q9SQ56 RGG repeats nuclear RNA binding protein A (Fragment) | 2.1e-68 | 59.41 | Show/hide |
Query: GGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGSFNNESSSAA-----------EDGETGKTTERR-GYAGPRG--RGGRRGGFNNGEAT--DGERPRRVFERHSGTG
GGRG RGGGRG G GR G GFN+ S ++E++ + EDGE+GK +ERR GY GPRG GGRRGGFNNG+A +GERPRRVF+R SGTG
Subjt: GGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGSFNNESSSAA-----------EDGETGKTTERR-GYAGPRG--RGGRRGGFNNGEAT--DGERPRRVFERHSGTG
Query: HGNEF-KREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVD-P
GNE+ KREGSGRGNWG P ++ A+ E VN+ EK + EK +++ D N +++A EPEE EPE+KEMTLEEYEKL+EEKRKALL LK E RKV+
Subjt: HGNEF-KREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVNETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVD-P
Query: KEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTL
KE SMQ LS KK +++IFIKLGSEK+KRKE EK +K+ SINEFLKPAEGE + GGRGRG GRG G GGG GN + + PSIED GQFP+L
Subjt: KEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTL
Query: GAK
AK
Subjt: GAK
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT4G16830.1 Hyaluronan / mRNA binding family | 1.1e-77 | 56.5 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGPVQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGS
MAT+NPFDLL DDDAEDPSQL A + + K G V + PA A LPSKPLPPAQAVREAR+++ RGG G G G+ RGR G+NR
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVVAAPPKKGPVQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGS
Query: FNNESSSA----AEDGETGKTT-ERRGYAG-PRGR---------GGRRGGFNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAE
NN S + +G+ K++ ERRG G PRG GGRRGGF+N E DGERPRR FER SGTG G++FKR+GSGRGNWG P EE A E
Subjt: FNNESSSA----AEDGETGKTT-ERRGYAG-PRGR---------GGRRGGFNNGEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAE
Query: EAVN-ETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDK
ETEK++G EKP +D D N E++ EE EPEDKEMTL+EYEK+LEEK+KAL +L T RKVD K F SMQQLS KK N++IFIKLGS+KDK
Subjt: EAVN-ETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDK
Query: RKEIAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNS--TINVATPSIEDPGQFPTLGAK
RK+ +KE++ KK++SINEFLKPAEG +Y GGRG GRGRG RG GG SG S N A P+I D QFP+LG K
Subjt: RKEIAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNS--TINVATPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| AT4G16830.2 Hyaluronan / mRNA binding family | 3.9e-54 | 62.27 | Show/hide |
Query: DGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVN-ETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKR
DGERPRR FER SGTG G++FKR+GSGRGNWG P EE A E ETEK++G EKP +D D N E++ EE EPEDKEMTL+EYEK+LEEK+
Subjt: DGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVN-ETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKR
Query: KALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNS--T
KAL +L T RKVD K F SMQQLS KK N++IFIKLGS+KDKRK+ +KE++ KK++SINEFLKPAEG +Y GGRG GRGRG RG GG SG S
Subjt: KALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNS--T
Query: INVATPSIEDPGQFPTLGAK
N A P+I D QFP+LG K
Subjt: INVATPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| AT4G16830.3 Hyaluronan / mRNA binding family | 1.9e-61 | 56.23 | Show/hide |
Query: VREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGSFNNESSSA----AEDGETGKTT-ERRGYAG-PRGR---------GGRRGGFNNGEATDGERPRR
VREAR+++ RGG G G G+ RGR G+NR NN S + +G+ K++ ERRG G PRG GGRRGGF+N E DGERPRR
Subjt: VREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNRGSFNNESSSA----AEDGETGKTT-ERRGYAG-PRGR---------GGRRGGFNNGEATDGERPRR
Query: VFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVN-ETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLK
FER SGTG G++FKR+GSGRGNWG P EE A E ETEK++G EKP +D D N E++ EE EPEDKEMTL+EYEK+LEEK+KAL +L
Subjt: VFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAVN-ETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLK
Query: TEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNS--TINVATPS
T RKVD K F SMQQLS KK N++IFIKLGS+KDKRK+ +KE++ KK++SINEFLKPAEG +Y GGRG GRGRG RG GG SG S N A P+
Subjt: TEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENNDIFIKLGSEKDKRKEIAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGGRGRGRGRGSRGGGGGYSGNS--TINVATPS
Query: IEDPGQFPTLGAK
I D QFP+LG K
Subjt: IEDPGQFPTLGAK
|
|
| AT4G17520.1 Hyaluronan / mRNA binding family | 1.9e-64 | 51.17 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK--KVVAAPPKKGPVQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNR
MA+VNPFDLL DDDAEDPSQ++A+K KVVA PVQT K+ +P+KP PP+QAVREARN + GGRG+GRGG YGRG G G NR
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK--KVVAAPPKKGPVQTKPAALGAQQNKAASLPSKPLPPAQAVREARNESSRGGRGSGRGGGRGYGRGREGSGFNR
Query: GSFNNESSSAAEDGETG---KTTE----RRGYAGPRG--RGGRRGGFNN-GEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAV
S NN+ A E+G G ++ E RRG GP G RG RRG ++N G++ D ERPR+ ++RHS T +GNE KR+G+GR NWG ++ EE+
Subjt: GSFNNESSSAAEDGETG---KTTE----RRGYAGPRG--RGGRRGGFNN-GEATDGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAEAAEEAV
Query: NETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENND-IFIKLGSEKDKRKE
+KN+ EK E + D E A++ EE +PEDKEMTLEEYEK+LEEK+KAL K E RKVD K F +MQQLS KK NND +FIKLG+EKDKR
Subjt: NETEKNMGDEKPVQEDDTGDVNAENSAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLTLKTEGRKVDPKEFASMQQLSCKKENND-IFIKLGSEKDKRKE
Query: IAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGG--RGRGRGRGSR-------------GGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTLG
I E+E++T+KSLSINEFLKPA+G+ +Y P G +G GRG R GG G + TP+I D QFPTLG
Subjt: IAEKEDRTKKSLSINEFLKPAEGERHYAPGG--RGRGRGRGSR-------------GGGGGYSGNSTINVATPSIEDPGQFPTLG
|
|
| AT5G47210.1 Hyaluronan / mRNA binding family | 3.9e-62 | 50.26 | Show/hide |
Query: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARN--EGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSG
MA++NPFDLLG DDAEDPSQL A + + AA Q K A P+KP PP+QAVRE+RN +GGRGG G GRG G+ RGR G
Subjt: MATVNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKKVAAVTSPAPKKGPAQNKPAALGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVREARN--EGGRGGRGSGRGVGRGYGRGREGSG
Query: FVRGSFNNE---NISAAEDG-----ETGKTTERRG-YGGPRGRGG----RRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAE
+ R + NN+ N + G E R G GG R GG RRGG NGE+ D ERP R ++RHS TGHG KR G GRGNWG ++
Subjt: FVRGSFNNE---NISAAEDG-----ETGKTTERRG-YGGPRGRGG----RRGGFNNGEAADGERPRRVFERHSGTGHGNEFKREGSGRGNWGRPTEEFAE
Query: TVEEAVNEMEKNMGDEKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPED---KEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKE-NNDIFIKL
T EE E+EK+ EK ED E A+E + E E+ +EMTLEEYEK+LEEK+KAL A K EERKVD K F SMQQLS KK + +IFIKL
Subjt: TVEEAVNEMEKNMGDEKPVQEDNAEGVNTENAAKEPEETEPED---KEMTLEEYEKLLEEKRKALMALKTEERKVDPKEFASMQQLSCKKE-NNDIFIKL
Query: GSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRG-GYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLG
GS+K+KRK D E+ KKSLSINEFLKPA+G+R+ G GG RGRGGRG RG G + AP+I D QFP+LG
Subjt: GSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLKPAEGERHYGSGGRGRGRGGRGSRG-GYSGNSISNVPAPSIEDPGQFPTLG
|
|
