; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg05179 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg05179
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCarg_Chr07:3343555..3347073
RNA-Seq ExpressionCarg05179
SyntenyCarg05179
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604940.1 hypothetical protein SDJN03_02257, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-66100Show/hide
Query:  MIKNSPNFGLISTPFCVLISLPFSLWLSRFKLFICIIPPLEHYFTHSHQVGLHFSTTITNSPYSVPQDLSPRSPLILSFLLFALLFRCFAPLLSKESEIN
        MIKNSPNFGLISTPFCVLISLPFSLWLSRFKLFICIIPPLEHYFTHSHQVGLHFSTTITNSPYSVPQDLSPRSPLILSFLLFALLFRCFAPLLSKESEIN
Subjt:  MIKNSPNFGLISTPFCVLISLPFSLWLSRFKLFICIIPPLEHYFTHSHQVGLHFSTTITNSPYSVPQDLSPRSPLILSFLLFALLFRCFAPLLSKESEIN

Query:  RQKGCQPRVFDLQPDQLFPLRSYRLID
        RQKGCQPRVFDLQPDQLFPLRSYRLID
Subjt:  RQKGCQPRVFDLQPDQLFPLRSYRLID
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
No hits found
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCAAGAACAGCCCTAATTTTGGTTTGATTTCAACCCCATTCTGTGTACTCATCTCCCTCCCCTTCTCTCTCTGGCTGTCGAGATTCAAGCTTTTCATATGCATTAT
ACCGCCATTGGAGCACTACTTCACACATTCTCATCAAGTTGGTCTCCACTTTTCAACCACCATTACCAACTCTCCATACTCAGTTCCGCAGGATCTCTCTCCTCGCTCGC
CATTGATTCTTTCCTTCCTCCTCTTCGCACTGTTATTCCGTTGTTTTGCTCCACTGTTAAGCAAAGAATCAGAAATAAATCGACAAAAGGGTTGTCAACCAAGGGTTTTT
GATCTGCAGCCGGACCAGCTTTTCCCCTTGAGGAGTTATAGATTGATTGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATCAAGAACAGCCCTAATTTTGGTTTGATTTCAACCCCATTCTGTGTACTCATCTCCCTCCCCTTCTCTCTCTGGCTGTCGAGATTCAAGCTTTTCATATGCATTAT
ACCGCCATTGGAGCACTACTTCACACATTCTCATCAAGTTGGTCTCCACTTTTCAACCACCATTACCAACTCTCCATACTCAGTTCCGCAGGATCTCTCTCCTCGCTCGC
CATTGATTCTTTCCTTCCTCCTCTTCGCACTGTTATTCCGTTGTTTTGCTCCACTGTTAAGCAAAGAATCAGAAATAAATCGACAAAAGGGTTGTCAACCAAGGGTTTTT
GATCTGCAGCCGGACCAGCTTTTCCCCTTGAGGAGTTATAGATTGATTGATTGATTGATTGATTGTGTAGTTCATCTGACTCAGTTTTGAACTCTTTGAGAAGCTTCCAT
GGCTGACAAGTTGAAGCGGAAACAAAGTAAATTGTCCGTGTACCTTTACGTTCCCAATATTATTGGTTATATAAGGGTTCTCATGAACATTGTTGCCTTTGCCCTATGCT
TCTCAAATAAAATAATTTTCTCAGTCCTCTATTTTGTCAGCTTTGTATGCGATGGTATTGACGGTTGGTGTGCTCGCAAATTCAATCAAGTTTCCACCTTTGGGGCTGTG
CTGGACATGGTAACAGACCGGTACAATCTTCGTTAACCTTTGTATTTATATATATTTTGGCATCTAAGATATGGAAATTTGATATACTACTGGATTTGTTATACTCGTAA
CTTTATATTGATATCAAGTCCCTCAGGGCATACAACCTTGCCCTTGATTGACAATTTTGATCAGAATCTGCTGTATCACAGGATTAGCACTGCTTGTCTACTAGTAATTC
TATCCCAAGTATACAGGCCTGGTTTGACTTTCTTATCACTTCTTGCCTTGGATATTGCTAGTCACTGGCTTCAAATGTACAGTACCTTTTTGCTAGGCAAAGCCAGTCAT
AAAGATGTCAAAGACAGCACCAATTGGCTGTTTAAGGCATATTATGGAAATAGGACATTTATGGCTTACTGTTGTGTGTCATGCGAGGTTCTTTACATTACTCTATTTCT
GCTGGCGGAGAAGCAAAATGAGAAATTGATGGATGTTATATTACACTCGATACAACAAAAGACACTTCTATCACTTTTGGTCGTAATTAGCTTGTTTGGATGGGCAGTGA
AGCAAGCTGTTAATGTCATACAGATGAAGACGGCGGCGGATGTTTGTGTCCTTCACGATACCAACAAAAAACAGAAGCCATGATGAGACCTTTGTAAAATTTGTTTCAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIKNSPNFGLISTPFCVLISLPFSLWLSRFKLFICIIPPLEHYFTHSHQVGLHFSTTITNSPYSVPQDLSPRSPLILSFLLFALLFRCFAPLLSKESEINRQKGCQPRVF
DLQPDQLFPLRSYRLID